<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR942274.1	1	AAAACCCTGTAGTTGATGTTTACTGGACGTTATTCTTAATGATGAAAGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	121753	AAAACCCTGTAGTTGATGTTTACTGGACGTTATTCTTAATGATGAAAGAC	121802

CR942274.1	51	TGGATGGTTTCACCCCAGAGGAAGAACTAGGTGAGGATGTCAGCTCTCAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	121803	TGGATGGTTTCACCCCAGAGGAAGAACTAGGTGAGGATGTCAGCTCTCAC	121852

CR942274.1	101	TACTTGTATTCAGCATCCTATGGAGAGTCTAGCAGTGCAAAGGGCTCCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	121853	TACTTGTATTCAGCATCCTATGGAGAGTCTAGCAGTGCAAAGGGCTCCTT	121902

CR942274.1	151	CCTTTAGTAGACTCAGATTTCCATCTGGAGTCATTATTCTCCTGCTAGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	121903	CCTTTAGTAGACTCAGATTTCCATCTGGAGTCATTATTCTCCTGCTAGAT	121952

CR942274.1	201	GGATGTCCTTTACCATTTCTCAATCTGTACATCTCCTGGTGATGATTTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	121953	GGATGTCCTTTACCATTTCTCAATCTGTACATCTCCTGGTGATGATTTCT	122002

CR942274.1	251	TTCATCTTTTGTCAATCTGAAAACCTCTTTATTCTGCCTTTTTATTGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122003	TTCATCTTTTGTCAATCTGAAAACCTCTTTATTCTGCCTTTTTATTGGAA	122052

CR942274.1	301	AACAAAATTTTGACTGTGTAAAGAATTCTAGGTTGGCATTTTTTTCTTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122053	AACAAAATTTTGACTGTGTAAAGAATTCTAGGTTGGCATTTTTTTCTTTA	122102

CR942274.1	351	AAAAAAATACTTCCATACAACTTGCAATTTTCCAACAAGAAATCTGCTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122103	AAAAAAATACTTCCATACAACTTGCAATTTTCCAACAAGAAATCTGCTTT	122152

CR942274.1	401	GTATCTTTGATTCTCTGTACATATATGTCTTTTTCTTCTCTATCTAGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122153	GTATCTTTGATTCTCTGTACATATATGTCTTTTTCTTCTCTATCTAGCTG	122202

CR942274.1	451	CTTGTAGGAGGACTCAGCTTCTCGCAGATAGACATGTATGATAAAGATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122203	CTTGTAGGAGGACTCAGCTTCTCGCAGATAGACATGTATGATAAAGATGC	122252

CR942274.1	501	AGTAACTACATCAAGTGTGGTATTGTCCATGGATGGATAAATAGACTGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122253	AGTAACTACATCAAGTGTGGTATTGTCCATGGATGGATAAATAGACTGAT	122302

CR942274.1	551	GGAATAGAGCAGAGGGCCCACAGACAGACCCACAAGAGTCCAACTGTGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122303	GGAATAGAGCAGAGGGCCCACAGACAGACCCACAAGAGTCCAACTGTGAT	122352

CR942274.1	601	TGATCACCAAGGAGGAGCGTGATGGTGAAGGACTGTGCTTGTTATAATGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122353	TGATCACCAAGGAGGAGCGTGATGGTGAAGGACTGTGCTTGTTATAATGT	122402

CR942274.1	651	GCTGGGGCCTTTGGATAACCACTGACTAAGTGGGCCAAGTGGCCTTTTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122403	GCTGGGGCCTTTGGATAACCACTGACTAAGTGGGCCAAGTGGCCTTTTGG	122452

CR942274.1	701	CTTAGGCTGAAGCAGGATAATAATAACGTTATCTATTCATAGAATTGTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122453	CTTAGGCTGAAGCAGGATAATAATAACGTTATCTATTCATAGAATTGTTA	122502

CR942274.1	751	AAATTACCTGGTTTTATATTTGCAAAGTAATTAGAGCAGTATTGAGACAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122503	AAATTACCTGGTTTTATATTTGCAAAGTAATTAGAGCAGTATTGAGACAA	122552

CR942274.1	801	AGGGAATCTTCAGTGAACATTTCCTCTAGTCATAGTTTTTTCCACCACTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122553	AGGGAATCTTCAGTGAACATTTCCTCTAGTCATAGTTTTTTCCACCACTT	122602

CR942274.1	851	GACTTCCTGCCCTATTCAGAGTCTTATGTTTGCCAGGACTCAAGCACCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122603	GACTTCCTGCCCTATTCAGAGTCTTATGTTTGCCAGGACTCAAGCACCTC	122652

CR942274.1	901	CTTATGGGGCAGACTCCACAGGGCATGATATGGTTTGGATCTATGTTCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122653	CTTATGGGGCAGACTCCACAGGGCATGATATGGTTTGGATCTATGTTCCC	122702

CR942274.1	951	CACCCAAATCTCATGTCCATTTGTAATTTCCAGTATTGGAGGTTGGGCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122703	CACCCAAATCTCATGTCCATTTGTAATTTCCAGTATTGGAGGTTGGGCCT	122752

CR942274.1	1001	GGTGGGAGGTGATTGAATCATGGAGGCAGATTTTCCCCTCTGTGCTGCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122753	GGTGGGAGGTGATTGAATCATGGAGGCAGATTTTCCCCTCTGTGCTGCTC	122802

CR942274.1	1051	TCATTATAGTGAGTGAGTGCTCACCAGATCTGATTGTTTCAAAGTGTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122803	TCATTATAGTGAGTGAGTGCTCACCAGATCTGATTGTTTCAAAGTGTATA	122852

CR942274.1	1101	GCACCTCTCCCATTGCTCTATTCCTGCTGTTCCTGCCATGTGAAGACGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122853	GCACCTCTCCCATTGCTCTATTCCTGCTGTTCCTGCCATGTGAAGACGTA	122902

CR942274.1	1151	CCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122903	CCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCC	122952

CR942274.1	1201	CCAGCCATGCTTCCTGTACAGCCTGTCAAACTGTCAGCCAATTAATCCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	122953	CCAGCCATGCTTCCTGTACAGCCTGTCAAACTGTCAGCCAATTAATCCTC	123002

CR942274.1	1251	TTTTCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGATATTTCTTTATAGCAGTGTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123003	TTTTCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGATATTTCTTTATAGCAGTGTGAG	123052

CR942274.1	1301	AATGGACCAATACAGGGCATCATGGTCAGTCCTGGGGAACAGCTTCCTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123053	AATGGACCAATACAGGGCATCATGGTCAGTCCTGGGGAACAGCTTCCTGG	123102

CR942274.1	1351	AGTGGGAGGAGCTCAGTCCTGGTAACCTGCTGTTCCCTTGCCTGAAACCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123103	AGTGGGAGGAGCTCAGTCCTGGTAACCTGCTGTTCCCTTGCCTGAAACCC	123152

CR942274.1	1401	CTTGTTTCCTCCACCTTCCATCTCATTCAACAAAGCTCTTGGGAGAACAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123153	CTTGTTTCCTCCACCTTCCATCTCATTCAACAAAGCTCTTGGGAGAACAA	123202

CR942274.1	1451	CTTTAAGGACTCCCTATGCCTCTTCCTTCAAAGGTAGCCAGCCAAGAAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123203	CTTTAAGGACTCCCTATGCCTCTTCCTTCAAAGGTAGCCAGCCAAGAAGT	123252

CR942274.1	1501	AGATGGCTGGTTGAGCCATACTGACTACCATGGACAGCAGCAACAGAAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123253	AGATGGCTGGTTGAGCCATACTGACTACCATGGACAGCAGCAACAGAAGG	123302

CR942274.1	1551	TCAAAGGCAAAGGTCAGGTATTCTTTTCCTGGCAGGTACACAAGGACAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123303	TCAAAGGCAAAGGTCAGGTATTCTTTTCCTGGCAGGTACACAAGGACAAC	123352

CR942274.1	1601	TAAGGGCAGGCCCCAAACGAGGAAGCTGATGGCCACAAAGCGGACAATGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123353	TAAGGGCAGGCCCCAAACGAGGAAGCTGATGGCCACAAAGCGGACAATGT	123402

CR942274.1	1651	GGTAGATCCGGATGGGTGAACAGTTCTTCAGGCAGTACAGGCTCCTGATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123403	GGTAGATCCGGATGGGTGAACAGTTCTTCAGGCAGTACAGGCTCCTGATG	123452

CR942274.1	1701	ATCAAAGTCAGGCTGGAAATGCCCACCACAAGACAAATAAGCATGTGAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123453	ATCAAAGTCAGGCTGGAAATGCCCACCACAAGACAAATAAGCATGTGAAA	123502

CR942274.1	1751	TATTATAAAGCCTGCCTGAAATTGGTCACATGCCAGGCCCTTCTCCCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123503	TATTATAAAGCCTGCCTGAAATTGGTCACATGCCAGGCCCTTCTCCCATT	123552

CR942274.1	1801	ACTCACAAACCTGGCTAACCACATGCAAAGAAAGGGCCAGGGCCCAGCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123553	ACTCACAAACCTGGCTAACCACATGCAAAGAAAGGGCCAGGGCCCAGCTC	123602

CR942274.1	1851	AGGATGCTCATCACAGCAGAGGTGTGCTTTGGGCGGTGGCAGCACCAGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123603	AGGATGCTCATCACAGCAGAGGTGTGCTTTGGGCGGTGGCAGCACCAGGT	123652

CR942274.1	1901	GGGACAGAGGACACACAGAAAGCTCTCAATATTCATGGCCACCAGGAGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123653	GGGACAGAGGACACACAGAAAGCTCTCAATATTCATGGCCACCAGGAGAC	123702

CR942274.1	1951	AGAGACTCACTGTGTCAGAGAAATAGGACACAGGCTCCAGAAACATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759768.2	123703	AGAGACTCACTGTGTCAGAGAAATAGGACACAGGCTCCAGAAACATGGCC	123752

Overview

Query
CR942274.1 - 19628 bps
Hit
CR759768.2 - 123752 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link