<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759790.7	1	AAGAATAAAGACCAAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125281	AAGAATAAAGACCAAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTTT	125330

CR759790.7	51	GAGAAGTGTTAATAGAACTGAAAATACCAGCAAGGAAAAACGCCCTCGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125331	GAGAAGTGTTAATAGAACTGAAAATACCAGCAAGGAAAAACGCCCTCGAG	125380

CR759790.7	101	GAATAGAGTTAATTGGATCTCCAAAATGTTGTCATGAAAGGTGCATTCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125381	GAATAGAGTTAATTGGATCTCCAAAATGTTGTCATGAAAGGTGCATTCCT	125430

CR759790.7	151	GGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125431	GGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCT	125480

CR759790.7	201	CTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125481	CTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGA	125530

CR759790.7	251	GGCATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125531	GGCATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCA	125580

CR759790.7	301	AAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125581	AAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAACA	125630

CR759790.7	351	CTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125631	CTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC	125680

CR759790.7	401	AGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATCCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125681	AGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATCCCG	125730

CR759790.7	451	GCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125731	GCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGG	125780

CR759790.7	501	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125781	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGC	125830

CR759790.7	551	CATTGCACTCCAGCCAGGGAAATGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125831	CATTGCACTCCAGCCAGGGAAATGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAA	125880

CR759790.7	601	ACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCTTCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125881	ACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCTTCAA	125930

CR759790.7	651	GAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAAGACCTACTGCTGCCGCTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125931	GAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAAGACCTACTGCTGCCGCTAG	125980

CR759790.7	701	TCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCCTAAGTGTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	125981	TCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCCTAAGTGTGG	126030

CR759790.7	751	ATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126031	ATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGC	126080

CR759790.7	801	ACGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126081	ACGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATG	126130

CR759790.7	851	CCGGCGGGAGGAGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126131	CCGGCGGGAGGAGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTG	126180

CR759790.7	901	TAAGAGCTGGAGGCCGCCTGCGGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126181	TAAGAGCTGGAGGCCGCCTGCGGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCA	126230

CR759790.7	951	CCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAATGTGTCGTCGCCATCTTTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126231	CCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAATGTGTCGTCGCCATCTTTCA	126280

CR759790.7	1001	GTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCTTTATCCACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126281	GTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCTTTATCCACA	126330

CR759790.7	1051	ACAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126331	ACAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAG	126380

CR759790.7	1101	TTGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126381	TTGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCC	126430

CR759790.7	1151	AGCCACGTGAGTTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126431	AGCCACGTGAGTTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAG	126480

CR759790.7	1201	TCGCACGGCCCTTTGGTCTCTGCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126481	TCGCACGGCCCTTTGGTCTCTGCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCC	126530

CR759790.7	1251	ATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGCCCTGGTGGGCGCTCCTGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126531	ATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGCCCTGGTGGGCGCTCCTGGC	126580

CR759790.7	1301	CCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGGGCGCCCAGATCCGGAACCCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126581	CCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGGGCGCCCAGATCCGGAACCCCA	126630

CR759790.7	1351	GCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126631	GCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTCG	126680

CR759790.7	1401	CCTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATGCGCTTATGTGCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126681	CCTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATGCGCTTATGTGCTC	126730

CR759790.7	1451	AGAAACGGTCCCATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCCGCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126731	AGAAACGGTCCCATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCCGCCCA	126780

CR759790.7	1501	GAATCTTCCTTCTGGGATGCCGACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126781	GAATCTTCCTTCTGGGATGCCGACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTT	126830

CR759790.7	1551	CCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAGTGGACAGGGCACCTGGATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126831	CCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAGTGGACAGGGCACCTGGATA	126880

CR759790.7	1601	CACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGGTTGGAAGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126881	CACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGGTTGGAAGCC	126930

CR759790.7	1651	CCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126931	CCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAG	126980

CR759790.7	1701	GAGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	126981	GAGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCC	127030

CR759790.7	1751	CCGCCGCCGCTCTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	127031	CCGCCGCCGCTCTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGG	127080

CR759790.7	1801	CACAGGGTCTCCCGGGGACCAGCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	127081	CACAGGGTCTCCCGGGGACCAGCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCG	127130

CR759790.7	1851	CAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCACCCCGGCCCCGCCCTCTTCCGCTCCCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	127131	CAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCACCCCGGCCCCGCCCTCTTCCGCTCCCTC	127180

CR759790.7	1901	CCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGATGAGAGGGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	127181	CCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGATGAGAGGGTG	127230

CR759790.7	1951	AGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759766.5	127231	AGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCC	127280

Overview

Query
CR759790.7 - 44002 bps
Hit
CR759766.5 - 127280 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link