<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759801.4	1	AGAAGGGCATTGCAGGCACAGGTAACAGCTTTGCAACAGCCTAGAGGCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108504	AGAAGGGCATTGCAGGCACAGGTAACAGCTTTGCAACAGCCTAGAGGCAA	108553

CR759801.4	51	GAACAATTTGGGCTAATTTAAGCAAAGTTGACACATGATGAGTTAGGAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108554	GAACAATTTGGGCTAATTTAAGCAAAGTTGACACATGATGAGTTAGGAGT	108603

CR759801.4	101	AAAGATGGCACAAGATAATAATGAAGACGTAGGCAGAGACTAGAGCAAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108604	AAAGATGGCACAAGATAATAATGAAGACGTAGGCAGAGACTAGAGCAAGT	108653

CR759801.4	151	GAAATCTTAAGTTTTAGTAGTGGAATAAACAAGAGTGGAATGGGGGAGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108654	GAAATCTTAAGTTTTAGTAGTGGAATAAACAAGAGTGGAATGGGGGAGAC	108703

CR759801.4	201	CCAGGGTCACTACCTGCTAATGGCATTCCCAGAGTTGTATACGGCAGTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108704	CCAGGGTCACTACCTGCTAATGGCATTCCCAGAGTTGTATACGGCAGTCA	108753

CR759801.4	251	TCCCAAAGAGAGAAAACTATGCCAGTAATTTAGGTGAGAAAGGATGATGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108754	TCCCAAAGAGAGAAAACTATGCCAGTAATTTAGGTGAGAAAGGATGATGG	108803

CR759801.4	301	CTTGAGATAGTGGGATCCAGTGGAGCTGAAAATGAGCAGGCCAATTTGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108804	CTTGAGATAGTGGGATCCAGTGGAGCTGAAAATGAGCAGGCCAATTTGAA	108853

CR759801.4	351	GTGTATTTTGTAGATAGAATTGACAAAAACATTGAAGTGGCCTTTGGGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108854	GTGTATTTTGTAGATAGAATTGACAAAAACATTGAAGTGGCCTTTGGGTG	108903

CR759801.4	401	ATGAGGGAGGGGAAAATCAATCATGAATTTCTAATTTCTGGAATGGATGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108904	ATGAGGGAGGGGAAAATCAATCATGAATTTCTAATTTCTGGAATGGATGA	108953

CR759801.4	451	CTGTGTAATTGCAAGGCTGTTACAGAAATGGGCTACATACTTAATGAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	108954	CTGTGTAATTGCAAGGCTGTTACAGAAATGGGCTACATACTTAATGAGCT	109003

CR759801.4	501	TTGGATGTTGAGATGGGATCACAAGAGAGGGGGTAAAGACAAAGTGATGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109004	TTGGATGTTGAGATGGGATCACAAGAGAGGGGGTAAAGACAAAGTGATGA	109053

CR759801.4	551	GATATTTTGTTTCAGTTGGACCACAGTCCACAATAACTGCTTCTCCTCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109054	GATATTTTGTTTCAGTTGGACCACAGTCCACAATAACTGCTTCTCCTCTC	109103

CR759801.4	601	TGCAGAATATTCACTAACATGCACGAGACCTGTTTGCTCTGTCCTTCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109104	TGCAGAATATTCACTAACATGCACGAGACCTGTTTGCTCTGTCCTTCTCT	109153

CR759801.4	651	CCTTCCTCCCTGCCCTCCCCTTCATCATTTTCTCCTTTTTATTCTCTGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109154	CCTTCCTCCCTGCCCTCCCCTTCATCATTTTCTCCTTTTTATTCTCTGTC	109203

CR759801.4	701	CTTTCTTTCTGTTCTGTAGTCATCCTATTTCCTTGACAGAATCGAAGCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109204	CTTTCTTTCTGTTCTGTAGTCATCCTATTTCCTTGACAGAATCGAAGCCT	109253

CR759801.4	751	CAGCCAGTGAGATAGATGGAGTGTAGGCAGCTAGAAATGGAAAGGATTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109254	CAGCCAGTGAGATAGATGGAGTGTAGGCAGCTAGAAATGGAAAGGATTCC	109303

CR759801.4	801	TGTGCTTCTGTGATTCACAGTCTCCCAGTGGGCCTTTAAACCATTTAACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109304	TGTGCTTCTGTGATTCACAGTCTCCCAGTGGGCCTTTAAACCATTTAACC	109353

CR759801.4	851	TCTGTTGTCCAGACCCCAGGAAGAGGGGAGGCTGGAAGAGGGAAAAGAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109354	TCTGTTGTCCAGACCCCAGGAAGAGGGGAGGCTGGAAGAGGGAAAAGAAC	109403

CR759801.4	901	TTGGACTGGAGCAGCAGGGGAGGCCCTGGAGGAAGGAGCAGGTATCATCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109404	TTGGACTGGAGCAGCAGGGGAGGCCCTGGAGGAAGGAGCAGGTATCATCC	109453

CR759801.4	951	TCCAGCAAATGGGCAATCCATTAGTCCAAACTCCTCATTTTAAAATTGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109454	TCCAGCAAATGGGCAATCCATTAGTCCAAACTCCTCATTTTAAAATTGAA	109503

CR759801.4	1001	AAAACTGAAGCCTTTGCCCATTTTGACTAAACCAGATAAGAAATTATACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109504	AAAACTGAAGCCTTTGCCCATTTTGACTAAACCAGATAAGAAATTATACA	109553

CR759801.4	1051	GTATGAAGGAACATTGACACCACTTAGAAACAGTAGGGTGTCAAGATTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109554	GTATGAAGGAACATTGACACCACTTAGAAACAGTAGGGTGTCAAGATTTG	109603

CR759801.4	1101	ACTTGACTCTTGTTAGTTTTGTGACTATAAAGTGAAAACAATTATATCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109604	ACTTGACTCTTGTTAGTTTTGTGACTATAAAGTGAAAACAATTATATCAA	109653

CR759801.4	1151	AAAATTTGTTTTAGGGATGATAAAAGTAATTTATACTTATTCGTTCAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109654	AAAATTTGTTTTAGGGATGATAAAAGTAATTTATACTTATTCGTTCAAAA	109703

CR759801.4	1201	GTACTTATTAAGGACCTACTATGTGCAGATACAGTGTTGAAAGCTAGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109704	GTACTTATTAAGGACCTACTATGTGCAGATACAGTGTTGAAAGCTAGGGA	109753

CR759801.4	1251	CTCAGTGGAGATCAACACAGACAGGAACCTGGCCTCATGGGAATTCTAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109754	CTCAGTGGAGATCAACACAGACAGGAACCTGGCCTCATGGGAATTCTAAA	109803

CR759801.4	1301	CTCTAGCGGGGAGAACAGCTCATTAACAAATAAATAAGTGTAATGTATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109804	CTCTAGCGGGGAGAACAGCTCATTAACAAATAAATAAGTGTAATGTATGG	109853

CR759801.4	1351	TAGGTACCACGAAGCAACATAAAGCTGGGAAGAAAGACACAAATGCTAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109854	TAGGTACCACGAAGCAACATAAAGCTGGGAAGAAAGACACAAATGCTAGC	109903

CR759801.4	1401	ATAGTTTTCTCTCTTTGGGATGACTGCCTTATACAACTCTGGGGAATGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109904	ATAGTTTTCTCTCTTTGGGATGACTGCCTTATACAACTCTGGGGAATGCC	109953

CR759801.4	1451	ATTAGCAAGTAGTGGCCTCGGATCTTCCCCCATTGCACTCTTGCCTATTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	109954	ATTAGCAAGTAGTGGCCTCGGATCTTCCCCCATTGCACTCTTGCCTATTC	110003

CR759801.4	1501	CACTACTAAAACCTAAGTTTTTGCTTGCTCTAATCTCTAAGTCTTCATTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110004	CACTACTAAAACCTAAGTTTTTGCTTGCTCTAATCTCTAAGTCTTCATTA	110053

CR759801.4	1551	TTATCTTGTGCCATCTTTACTCCCAACTCATCATGCGTCAACTTTGCTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110054	TTATCTTGTGCCATCTTTACTCCCAACTCATCATGCGTCAACTTTGCTTA	110103

CR759801.4	1601	AATTAGCCCAAATTGTTCTTGCCTCTAGGTTGATGCAAAGCTGTTACCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110104	AATTAGCCCAAATTGTTCTTGCCTCTAGGTTGATGCAAAGCTGTTACCTG	110153

CR759801.4	1651	TGCCTGGGATGCCCTTCTCTCCTCTCTGAGCATGATGATCTCTTATTCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110154	TGCCTGGGATGCCCTTCTCTCCTCTCTGAGCATGATGATCTCTTATTCAT	110203

CR759801.4	1701	CTCTCAGGTCTGCCCTTAAATATCACCTAGAGAGATGGGCCTTCTCAATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110204	CTCTCAGGTCTGCCCTTAAATATCACCTAGAGAGATGGGCCTTCTCAATG	110253

CR759801.4	1751	CTGGATGGAGTGCTGGATGGAGTAGATAGAGTTACAATCTCAATAGATTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110254	CTGGATGGAGTGCTGGATGGAGTAGATAGAGTTACAATCTCAATAGATTC	110303

CR759801.4	1801	TATTTGAGCAAAGATTTGAAGGTGGTAAGAGAAGTCGTCAAGTGCTTATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110304	TATTTGAGCAAAGATTTGAAGGTGGTAAGAGAAGTCGTCAAGTGCTTATC	110353

CR759801.4	1851	TGAAGGAAGGATCATCCAGATGAAAGGAAAGGCAGAGGCAAAGGCTGTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110354	TGAAGGAAGGATCATCCAGATGAAAGGAAAGGCAGAGGCAAAGGCTGTGA	110403

CR759801.4	1901	TGCTGAAGCTGCTGATGTGTTTGAGATTTAACATGAGGCCATGTGGCTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110404	TGCTGAAGCTGCTGATGTGTTTGAGATTTAACATGAGGCCATGTGGCTGG	110453

CR759801.4	1951	AGCAGAGGGAGCAGCGGGTGTGGAGTAGGAAGTCAGAGATGGGACTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759763.2	110454	AGCAGAGGGAGCAGCGGGTGTGGAGTAGGAAGTCAGAGATGGGACTGGCC	110503

Overview

Query
CR759801.4 - 21233 bps
Hit
CR759763.2 - 110503 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link