<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759763.2	1	GGCCGGAAGGACAGGACACAGTGAAATGGCACCAGTGAGTCAGAGGCCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38073	GGCCGGAAGGACAGGACACAGTGAAATGGCACCAGTGAGTCAGAGGCCAA	38122

CR759763.2	51	AGGAGGATTTCTGGCCCCAGCGCGCAGGATGTGCTTTGTTATAGTGGGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38123	AGGAGGATTTCTGGCCCCAGCGCGCAGGATGTGCTTTGTTATAGTGGGGT	38172

CR759763.2	101	TGGGATAGCGGAGCGGAGGCAAGGACACTCTGGGAATAAATGGCGAGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38173	TGGGATAGCGGAGCGGAGGCAAGGACACTCTGGGAATAAATGGCGAGAAA	38222

CR759763.2	151	AAGTGCGCTAGGGAGGATCCAAAGCCTTCAGACTTCTTCCTTTCCTTCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38223	AAGTGCGCTAGGGAGGATCCAAAGCCTTCAGACTTCTTCCTTTCCTTCCT	38272

CR759763.2	201	GTTGGGTGGGAGGGGACCAACATGGTCCCTGGTGGGGAGGTCCGTGGGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38273	GTTGGGTGGGAGGGGACCAACATGGTCCCTGGTGGGGAGGTCCGTGGGAT	38322

CR759763.2	251	GCAGAGAATGGGGTCGCTGCAAAGGGGCGTTGCGCGCCCCACGCAAGGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38323	GCAGAGAATGGGGTCGCTGCAAAGGGGCGTTGCGCGCCCCACGCAAGGCT	38372

CR759763.2	301	TCTGGCACTCTTCTCCTAGCTACTACTGATGAGTTCAAACTAGCAGGAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38373	TCTGGCACTCTTCTCCTAGCTACTACTGATGAGTTCAAACTAGCAGGAGA	38422

CR759763.2	351	CTAAGACGTGTCCTTTGCAATGTAGACTCCATATCTTGCACTTCGGCTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38423	CTAAGACGTGTCCTTTGCAATGTAGACTCCATATCTTGCACTTCGGCTGG	38472

CR759763.2	401	TTTACTAAATCCATCTTAATAAAACACAAAAACAAAGAACCAAATTCTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38473	TTTACTAAATCCATCTTAATAAAACACAAAAACAAAGAACCAAATTCTGC	38522

CR759763.2	451	GTGTGATATTTCTGACCTCTAGAAGGTCCTCCCTCTCCCCATTCCTCGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38523	GTGTGATATTTCTGACCTCTAGAAGGTCCTCCCTCTCCCCATTCCTCGTG	38572

CR759763.2	501	GGCTCCCTTCTTGCCCCGCCCCCTCCGCTTTGTCTCCACTTCTCCATCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38573	GGCTCCCTTCTTGCCCCGCCCCCTCCGCTTTGTCTCCACTTCTCCATCCC	38622

CR759763.2	551	TGTCCATCTCTGGACCCCGCTCCTGAGTATCTCCCCCCTTCTTCAGAGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38623	TGTCCATCTCTGGACCCCGCTCCTGAGTATCTCCCCCCTTCTTCAGAGGA	38672

CR759763.2	601	CTTCCCCTCATGGAGTACAGACTCCTCCACCTCCAGGAAAAAGAGACAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38673	CTTCCCCTCATGGAGTACAGACTCCTCCACCTCCAGGAAAAAGAGACAAA	38722

CR759763.2	651	GTCCACTGAGAAGGAACTGAGAGACTCCTGTTACTCCACCCCTGAAGTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38723	GTCCACTGAGAAGGAACTGAGAGACTCCTGTTACTCCACCCCTGAAGTCA	38772

CR759763.2	701	GCCTGTCCCACAACGCTCACTCAGGCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGCCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38773	GCCTGTCCCACAACGCTCACTCAGGCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGCCTG	38822

CR759763.2	751	TGTGTGTGTGCCCGTGTGTGTGAATCTGTGTGTGAGAGTGTGTCTAAATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38823	TGTGTGTGTGCCCGTGTGTGTGAATCTGTGTGTGAGAGTGTGTCTAAATA	38872

CR759763.2	801	TGTGTGTGAATGTGTGTGCGACTGTGTGTGCCTGTGTGTATCAGTTAGCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38873	TGTGTGTGAATGTGTGTGCGACTGTGTGTGCCTGTGTGTATCAGTTAGCG	38922

CR759763.2	851	TGTGTATCTGTATATGAGAGAGAGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38923	TGTGTATCTGTATATGAGAGAGAGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTG	38972

CR759763.2	901	CGTGAATGAGAGTCAAAGTGCTAAACCTGGCATCCAGGAAACCTCCCCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	38973	CGTGAATGAGAGTCAAAGTGCTAAACCTGGCATCCAGGAAACCTCCCCAC	39022

CR759763.2	951	CTTGGCACTGCACGCAGGAGTCAGTGTTATGTGCACCTGTGCTTTTATTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39023	CTTGGCACTGCACGCAGGAGTCAGTGTTATGTGCACCTGTGCTTTTATTT	39072

CR759763.2	1001	CAGGAGCTGAGACAATTGTATTAATCAGATGTGCAGAGAGCCAAGGGCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39073	CAGGAGCTGAGACAATTGTATTAATCAGATGTGCAGAGAGCCAAGGGCCC	39122

CR759763.2	1051	CACGCTGGAAAGCATCAGAGAGGAGGGTGAGATTGGAGGAGCCCCTGACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39123	CACGCTGGAAAGCATCAGAGAGGAGGGTGAGATTGGAGGAGCCCCTGACT	39172

CR759763.2	1101	CCAAGTCTCTTGATCACTCTTACACAGGGATCTTGAAAAAAAAGTGCAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39173	CCAAGTCTCTTGATCACTCTTACACAGGGATCTTGAAAAAAAAGTGCAGG	39222

CR759763.2	1151	ACACTCCGTTCTCTCCTGGGAGTGACAGGGAAGCCAGAGCCACTGTGCGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39223	ACACTCCGTTCTCTCCTGGGAGTGACAGGGAAGCCAGAGCCACTGTGCGT	39272

CR759763.2	1201	GTCAAATTCCATCAAAGAAAAACCATTATAGCAAAACTTCCATGTCACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39273	GTCAAATTCCATCAAAGAAAAACCATTATAGCAAAACTTCCATGTCACAG	39322

CR759763.2	1251	TTTTAAGCCTGCACAATGACTCAAATAGAACCAATACCAAAAAAACAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39323	TTTTAAGCCTGCACAATGACTCAAATAGAACCAATACCAAAAAAACAAAT	39372

CR759763.2	1301	TCCTAGCTCAGGTGAGGTCAGTGAAGTTGGCTGTCAGGTGTAAAGGAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39373	TCCTAGCTCAGGTGAGGTCAGTGAAGTTGGCTGTCAGGTGTAAAGGAAAC	39422

CR759763.2	1351	TGCAGGTATAAAGAAGGACACCTGTAGATAGGGCTGCAGCCCAGTCGCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39423	TGCAGGTATAAAGAAGGACACCTGTAGATAGGGCTGCAGCCCAGTCGCCC	39472

CR759763.2	1401	CTGCATCTTAGGGCGCCTGGAAAGGACTGTCTCCATTCAATAGTGCAGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39473	CTGCATCTTAGGGCGCCTGGAAAGGACTGTCTCCATTCAATAGTGCAGGG	39522

CR759763.2	1451	TGAGGACATTTTGGGGGAGAAATATAGACTGTCCTTAGACCCCTGGGGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39523	TGAGGACATTTTGGGGGAGAAATATAGACTGTCCTTAGACCCCTGGGGTT	39572

CR759763.2	1501	TGTACATTTACTTTCTGACTTTTTAGCTGTTGACTTCATTTTTGAACAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39573	TGTACATTTACTTTCTGACTTTTTAGCTGTTGACTTCATTTTTGAACAAA	39622

CR759763.2	1551	TTACAGTTACATAAATTTGCTTTGACTTTAAGTGTAAAACAGGAAAATAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39623	TTACAGTTACATAAATTTGCTTTGACTTTAAGTGTAAAACAGGAAAATAT	39672

CR759763.2	1601	TCCTGAAACAGGAAACAAGGGCCAAGTGACCTGCACTGTCACCCCCCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39673	TCCTGAAACAGGAAACAAGGGCCAAGTGACCTGCACTGTCACCCCCCTCT	39722

CR759763.2	1651	GTGGCTCCCTGATGCAACACAATTGTGAGCCAACAAATCTATGGCTAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39723	GTGGCTCCCTGATGCAACACAATTGTGAGCCAACAAATCTATGGCTAGGG	39772

CR759763.2	1701	AAACAGTCAACTCCATTTCTGCAAATGTTTCAGATGTTCCTTCTTGCTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39773	AAACAGTCAACTCCATTTCTGCAAATGTTTCAGATGTTCCTTCTTGCTGA	39822

CR759763.2	1751	GTAATGTTCTAGTTTTACCCCAGCCTTAATATTTTAAGTCTATATTTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39823	GTAATGTTCTAGTTTTACCCCAGCCTTAATATTTTAAGTCTATATTTTCC	39872

CR759763.2	1801	CAGCTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGAGAAGGAGTCTCATTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39873	CAGCTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGAGAAGGAGTCTCATTCT	39922

CR759763.2	1851	GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39923	GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCC	39972

CR759763.2	1901	GCCTCTCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	39973	GCCTCTCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGG	40022

CR759763.2	1951	ATTACAGGGGCCCGCCACCACGCTTGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759762.5	40023	ATTACAGGGGCCCGCCACCACGCTTGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGA	40072

Overview

Query
CR759763.2 - 110503 bps
Hit
CR759762.5 - 40072 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link