<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759787.4	1	GGCCAGCTCCGGAAGTCAAAGTTGTAGTTGGCAAGCTGCCTCTGCAGTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	81850	GGCCAGCTCCGGAAGTCAAAGTTGTAGTTGGCAAGCTGCCTCTGCAGTGG	81899

CR759787.4	51	GCACGAGAGGCAAAGGGGTACTGAGAACTCAGGGGAGGCTCTCCTACCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	81900	GCACGAGAGGCAAAGGGGTACTGAGAACTCAGGGGAGGCTCTCCTACCCA	81949

CR759787.4	101	CCCTCAACAACACCTTCGTTATCCAGGGGTCTGATCCCCACACATCATGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	81950	CCCTCAACAACACCTTCGTTATCCAGGGGTCTGATCCCCACACATCATGG	81999

CR759787.4	151	GGAAACCAAGCGGAGGTCAATACCCTCCCAATTCTCAGATGGAAAATTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82000	GGAAACCAAGCGGAGGTCAATACCCTCCCAATTCTCAGATGGAAAATTCT	82049

CR759787.4	201	AACAGGACCAGAAAATCAGGGGAGATGGTATGCCCCATCAGGTATCAGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82050	AACAGGACCAGAAAATCAGGGGAGATGGTATGCCCCATCAGGTATCAGGA	82099

CR759787.4	251	CTGGCCTGTCTGCCCTCTTCCAAGCTAAGAACCTAACACTCTGCTTTTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82100	CTGGCCTGTCTGCCCTCTTCCAAGCTAAGAACCTAACACTCTGCTTTTCT	82149

CR759787.4	301	AAAAAACTAAGTCTGACCCATCCCCAGGAGGAGTGGCTGAAGGTGCTAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82150	AAAAAACTAAGTCTGACCCATCCCCAGGAGGAGTGGCTGAAGGTGCTAGT	82199

CR759787.4	351	GCTTTTGAGTGACGGGTAGTAGGGGTCGCTGGCTGGTCACGGTCTATTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82200	GCTTTTGAGTGACGGGTAGTAGGGGTCGCTGGCTGGTCACGGTCTATTCC	82249

CR759787.4	401	CCACCTGGGTCCCTTATAGGGTGCTGTCTTAGAAGCTTAGAAATCTCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82250	CCACCTGGGTCCCTTATAGGGTGCTGTCTTAGAAGCTTAGAAATCTCCCA	82299

CR759787.4	451	GCAGATCACACTGACAGACCCAAGGTTGAGTGAGACAGAGAGGAGGGAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82300	GCAGATCACACTGACAGACCCAAGGTTGAGTGAGACAGAGAGGAGGGAAG	82349

CR759787.4	501	TCACGCCCACAGTGGGCTCCTCTGCCATGTGGGGCCACCCGTTGAAGGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82350	TCACGCCCACAGTGGGCTCCTCTGCCATGTGGGGCCACCCGTTGAAGGAA	82399

CR759787.4	551	GCTCTGACTTCCATCCTCACAACTACATCCCTTCCTCAACTCCTGCAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82400	GCTCTGACTTCCATCCTCACAACTACATCCCTTCCTCAACTCCTGCAGCC	82449

CR759787.4	601	ATGGATCAGTGTTGCCCTACAGCCCATCCGAACCTCGGGCCACCCCACTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82450	ATGGATCAGTGTTGCCCTACAGCCCATCCGAACCTCGGGCCACCCCACTG	82499

CR759787.4	651	AGCCAGTCCACATGCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTCTCGTGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82500	AGCCAGTCCACATGCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTCTCGTGCTG	82549

CR759787.4	701	TTGCCCAGGCTGGAATGCAGTTGGTGCAATCATAGCTCACTGCAGCCTCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82550	TTGCCCAGGCTGGAATGCAGTTGGTGCAATCATAGCTCACTGCAGCCTCA	82599

CR759787.4	751	AACTCCCAGGCCCAAGTGATCCTCCTACCTTAGCCTCTGGAGTAGCTGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82600	AACTCCCAGGCCCAAGTGATCCTCCTACCTTAGCCTCTGGAGTAGCTGGG	82649

CR759787.4	801	ACTACAGACATGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTAAAATTTTCTTTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82650	ACTACAGACATGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTAAAATTTTCTTTAG	82699

CR759787.4	851	AGACAAGGTCTTACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82700	AGACAAGGTCTTACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTGA	82749

CR759787.4	901	AGCGATCCTCCTGCCTTGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82750	AGCGATCCTCCTGCCTTGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAA	82799

CR759787.4	951	CCACCTCACCAGCTCCACGTTTTTTGACGGCAGTGGGAGCTGTGTCTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82800	CCACCTCACCAGCTCCACGTTTTTTGACGGCAGTGGGAGCTGTGTCTTTT	82849

CR759787.4	1001	TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82850	TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG	82899

CR759787.4	1051	TGCAGTGGCACGATCTCGGATCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGCTTCACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82900	TGCAGTGGCACGATCTCGGATCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGCTTCACG	82949

CR759787.4	1101	CCATTCTCCCGCCTCAGCCTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCTGCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	82950	CCATTCTCCCGCCTCAGCCTCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCTGCCA	82999

CR759787.4	1151	CCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTACCTTTAGCAGAGATGGGGTTTCACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83000	CCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTACCTTTAGCAGAGATGGGGTTTCACC	83049

CR759787.4	1201	ATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83050	ATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTC	83099

CR759787.4	1251	GGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83100	GGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTA	83149

CR759787.4	1301	GCTGTGTCTTAATACTTGACTATATTCGTCCCCCACCCCCTGAGCTCCTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83150	GCTGTGTCTTAATACTTGACTATATTCGTCCCCCACCCCCTGAGCTCCTA	83199

CR759787.4	1351	GCACTCTATTTTGAGGGTTTTTATTTTCTGCACAGAAATTTTTTGACATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83200	GCACTCTATTTTGAGGGTTTTTATTTTCTGCACAGAAATTTTTTGACATT	83249

CR759787.4	1401	TCAAAAATAATTTGACTAACAGAGAGCAATAGAAAAATTATACAAAAAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83250	TCAAAAATAATTTGACTAACAGAGAGCAATAGAAAAATTATACAAAAAGG	83299

CR759787.4	1451	TAAATGGCAAAACAAAACAAGATGACTAAAAGCAAATTTCAGGCAGGCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83300	TAAATGGCAAAACAAAACAAGATGACTAAAAGCAAATTTCAGGCAGGCTT	83349

CR759787.4	1501	TGCTCAGACCTGCTCTCAAATCTGGACTTAGCCACTTTCTTGCTCTATGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83350	TGCTCAGACCTGCTCTCAAATCTGGACTTAGCCACTTTCTTGCTCTATGA	83399

CR759787.4	1551	CTCCGAATGGGTCACTTAACCTCTTTTTGCCTCTGTTTTCTCACATTTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83400	CTCCGAATGGGTCACTTAACCTCTTTTTGCCTCTGTTTTCTCACATTTAC	83449

CR759787.4	1601	AAATAAAGGTAATAATGCCACCTCACTCAGCTGTTGTGAGGATCAGAAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83450	AAATAAAGGTAATAATGCCACCTCACTCAGCTGTTGTGAGGATCAGAAAG	83499

CR759787.4	1651	GGTGTGTGCCAAATGCTTCAGCCAGTAGCATAGTACAGGGCATCATTACG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83500	GGTGTGTGCCAAATGCTTCAGCCAGTAGCATAGTACAGGGCATCATTACG	83549

CR759787.4	1701	CAGCTCCATAGTGTGGAGTAGCCAGGAATGTGATGATGGTGGTCATAGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83550	CAGCTCCATAGTGTGGAGTAGCCAGGAATGTGATGATGGTGGTCATAGCT	83599

CR759787.4	1751	GTTTGATCCTAGAAACCTCCCATAACAGAAAAGAGCTCTATGGGGCCCCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83600	GTTTGATCCTAGAAACCTCCCATAACAGAAAAGAGCTCTATGGGGCCCCA	83649

CR759787.4	1801	AAGCCCATCCTCAAAGATAATCACAGTCCAGCACCAGCCGGCTTGGCATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83650	AAGCCCATCCTCAAAGATAATCACAGTCCAGCACCAGCCGGCTTGGCATA	83699

CR759787.4	1851	ATTCCCAAGACACTGAGCCCTAGCTTTTCTCCCTCCTGGCACCATGCTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83700	ATTCCCAAGACACTGAGCCCTAGCTTTTCTCCCTCCTGGCACCATGCTGT	83749

CR759787.4	1901	ACTCCCAGGCATAGGAGTGGACACACCTGTCCACCTTGTCCCATCCACAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83750	ACTCCCAGGCATAGGAGTGGACACACCTGTCCACCTTGTCCCATCCACAA	83799

CR759787.4	1951	ACAAGGATAGCATGGTATTCAATGCATACAACAAAATTAAACATTTATAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759761.9	83800	ACAAGGATAGCATGGTATTCAATGCATACAACAAAATTAAACATTTATAG	83849

Overview

Query
CR759787.4 - 113650 bps
Hit
CR759761.9 - 83849 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link