<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762495.5	1	AATGCTAGCAATGAGTCCCTTAAGCCCAGAATTACATACTGCATTAGGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	112884	AATGCTAGCAATGAGTCCCTTAAGCCCAGAATTACATACTGCATTAGGCT	112933

CR762495.5	51	CTGTTATGACGTGAACAAACAAAGGATACCACCTGACCCTCTCCAACTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	112934	CTGTTATGACGTGAACAAACAAAGGATACCACCTGACCCTCTCCAACTCC	112983

CR762495.5	101	AGCACCTGACATGGTAAGCATCCAGATGATGCTTGGTGTACAGAGGACTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	112984	AGCACCTGACATGGTAAGCATCCAGATGATGCTTGGTGTACAGAGGACTC	113033

CR762495.5	151	CAGCAGGGGAAACCGCTGTTCTTGGACCGCTGTTGCTACACAGCCACAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113034	CAGCAGGGGAAACCGCTGTTCTTGGACCGCTGTTGCTACACAGCCACAAA	113083

CR762495.5	201	CTGATACAATCTGGTTTGATACAGGTGGGCATCAGAGGAGCCACTGGGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113084	CTGATACAATCTGGTTTGATACAGGTGGGCATCAGAGGAGCCACTGGGAT	113133

CR762495.5	251	GAGTTGCAAGCAGCCTGGTTAATAGTCACATATGAGCCTGGCCCCTGGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113134	GAGTTGCAAGCAGCCTGGTTAATAGTCACATATGAGCCTGGCCCCTGGTT	113183

CR762495.5	301	CTTTGCACTGATAGCTGAGCTGTATTCAAAGGCCTAATTATGTGGCTGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113184	CTTTGCACTGATAGCTGAGCTGTATTCAAAGGCCTAATTATGTGGCTGGC	113233

CR762495.5	351	TCAACAGGAACTAGAAAAGTGGATGATTATGCACAAACCTATATGGGGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113234	TCAACAGGAACTAGAAAAGTGGATGATTATGCACAAACCTATATGGGGCA	113283

CR762495.5	401	TGAACATGTGGCAAGACATACGGAAAAAGCCGCAAAGCCTTGTGGCTGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113284	TGAACATGTGGCAAGACATACGGAAAAAGCCGCAAAGCCTTGTGGCTGAT	113333

CR762495.5	451	TTAACTGTATTTCAGGTGACTGCACATAAAAACCACTCAGTTCCACAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113334	TTAACTGTATTTCAGGTGACTGCACATAAAAACCACTCAGTTCCACAAAA	113383

CR762495.5	501	CATGGAAGCTAAAACCCTAAAAAAAATTAGAAGCATCATGCCAGCTCAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113384	CATGGAAGCTAAAACCCTAAAAAAAATTAGAAGCATCATGCCAGCTCAGG	113433

CR762495.5	551	CCTCTGAACTATTGACCTGGGTACATAACAAAAGTGGTCACAGAAGTGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113434	CCTCTGAACTATTGACCTGGGTACATAACAAAAGTGGTCACAGAAGTGCA	113483

CR762495.5	601	AGAGTAGGCTGGGAGACAGTCAAGGAAGCAGGATTACTCTTAAAATGTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113484	AGAGTAGGCTGGGAGACAGTCAAGGAAGCAGGATTACTCTTAAAATGTAG	113533

CR762495.5	651	TGACCAGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113534	TGACCAGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	113583

CR762495.5	701	GGCCGAGGCGGGCAAATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGCTTGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113584	GGCCGAGGCGGGCAAATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGCTTGAC	113633

CR762495.5	751	CAACATGGAGAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113634	CAACATGGAGAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTG	113683

CR762495.5	801	GTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113684	GTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAC	113733

CR762495.5	851	TGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACGCCATTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113734	TGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACGCCATTG	113783

CR762495.5	901	CACTCCAGCCAGGGCAATAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113784	CACTCCAGCCAGGGCAATAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAA	113833

CR762495.5	951	AAATATATATATATATATATATATATATATATATAGTGACCTAGTCCTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113834	AAATATATATATATATATATATATATATATATATAGTGACCTAGTCCTGG	113883

CR762495.5	1001	TACAGTGGCTCACACATGGGGAGGCCATGGTGGGACGATTGCTTGGGGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113884	TACAGTGGCTCACACATGGGGAGGCCATGGTGGGACGATTGCTTGGGGCC	113933

CR762495.5	1051	AGGAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATATCGAGATCCCATCTCCACAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113934	AGGAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATATCGAGATCCCATCTCCACAAC	113983

CR762495.5	1101	AACAACAAAAAATATATAGTGCCTTCCCAACAGCTCTTACAAATTGTTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	113984	AACAACAAAAAATATATAGTGCCTTCCCAACAGCTCTTACAAATTGTTTA	114033

CR762495.5	1151	CCATGTTCTCTATTGTAGATCATATTGAGCAGGACACATTCAGATATTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114034	CCATGTTCTCTATTGTAGATCATATTGAGCAGGACACATTCAGATATTCA	114083

CR762495.5	1201	GAAGGCTGTCCACCATGTAACAGATTGGCAAGTGGATTATTTAGATACTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114084	GAAGGCTGTCCACCATGTAACAGATTGGCAAGTGGATTATTTAGATACTG	114133

CR762495.5	1251	TCCCTGTAAGCCAAGGAAATAAATACATGTTAACCTGCATGGACACCGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114134	TCCCTGTAAGCCAAGGAAATAAATACATGTTAACCTGCATGGACACCGCT	114183

CR762495.5	1301	ACTGGACTGCTGCAAGATTCTCCCTATAAGCAAGCTAATCAAGCCAGTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114184	ACTGGACTGCTGCAAGATTCTCCCTATAAGCAAGCTAATCAAGCCAGTAC	114233

CR762495.5	1351	TATTAAAGGCTTAGAGGCTCTCAGTACTATGTATGGATATATCTGGCACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114234	TATTAAAGGCTTAGAGGCTCTCAGTACTATGTATGGATATATCTGGCACA	114283

CR762495.5	1401	TTGACAGTGACCGAGGGACCCATTTCGCTGGATATGACATGCAGGACTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114284	TTGACAGTGACCGAGGGACCCATTTCGCTGGATATGACATGCAGGACTGG	114333

CR762495.5	1451	GCCAGGAAACATGATACACTATGGCACTTTTATCTCCCATAGAACCTCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114334	GCCAGGAAACATGATACACTATGGCACTTTTATCTCCCATAGAACCTCCA	114383

CR762495.5	1501	AGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAAATACCAGTCTGTTGAAAGCACAAATTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114384	AGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAAATACCAGTCTGTTGAAAGCACAAATTC	114433

CR762495.5	1551	AAACTCTAATTTGGGAAACCTACCTTGCATAGGCAGATGAATGTGTTATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114434	AAACTCTAATTTGGGAAACCTACCTTGCATAGGCAGATGAATGTGTTATC	114483

CR762495.5	1601	TCCAACCTTTATTTCTTTAAATTCAGCCAAAGCAGGGACGCCTGCCCCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114484	TCCAACCTTTATTTCTTTAAATTCAGCCAAAGCAGGGACGCCTGCCCCAT	114533

CR762495.5	1651	GTGACCGTCTAGGACAACGGTCCCCCAAGCCTACCACTGTTCCCATAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114534	GTGACCGTCTAGGACAACGGTCCCCCAAGCCTACCACTGTTCCCATAGGG	114583

CR762495.5	1701	GTAATTGAGACGACTGCTTTGCTTGCTCCCAGACCTCATTGACAACCAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114584	GTAATTGAGACGACTGCTTTGCTTGCTCCCAGACCTCATTGACAACCAGT	114633

CR762495.5	1751	GTCTTTTGCACATGAAGATGCCAGCAGATATACTACCGAGGAGGAAACAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114634	GTCTTTTGCACATGAAGATGCCAGCAGATATACTACCGAGGAGGAAACAC	114683

CR762495.5	1801	ACCGAGCTTGGAACGACAAATAGCCCCAGGCTGGATAGGCTATTTCCTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114684	ACCGAGCTTGGAACGACAAATAGCCCCAGGCTGGATAGGCTATTTCCTGC	114733

CR762495.5	1851	TAGAGAGTGACAACACCCTAAATAAAGAACAAAACAACCTGATACCCAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114734	TAGAGAGTGACAACACCCTAAATAAAGAACAAAACAACCTGATACCCAAA	114783

CR762495.5	1901	AACAGGCTGGGTTTATTTGGTTAATTCCGTCTTTTGGCCATGTTAGTCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114784	AACAGGCTGGGTTTATTTGGTTAATTCCGTCTTTTGGCCATGTTAGTCAA	114833

CR762495.5	1951	CTTGCTCCTCAGTCTTGGGAACAAATGAATCATTCTAAAGATACTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759747.7	114834	CTTGCTCCTCAGTCTTGGGAACAAATGAATCATTCTAAAGATACTTGGCC	114883

Overview

Query
CR762495.5 - 35296 bps
Hit
CR759747.7 - 114883 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link