<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR812479.6	1	TGGGGGCTGTGTGCTTTATCCTGTTTTGTCCTCAAAGCATCTTTCCAGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105021	TGGGGGCTGTGTGCTTTATCCTGTTTTGTCCTCAAAGCATCTTTCCAGAG	105070

CR812479.6	51	AGTTGCACATCCTCACGATGAACTAGGAGGATGTGCAACTCTCACAGGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105071	AGTTGCACATCCTCACGATGAACTAGGAGGATGTGCAACTCTCACAGGGA	105120

CR812479.6	101	CTTTGTGAAATTATGCTGGCAAGTAAAAGTCAGCTTCTGACATTTACTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105121	CTTTGTGAAATTATGCTGGCAAGTAAAAGTCAGCTTCTGACATTTACTAC	105170

CR812479.6	151	TTTGTCTCACAGTGTGAAATACTATCGCATTGTAGGGCCGATTTGCATTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105171	TTTGTCTCACAGTGTGAAATACTATCGCATTGTAGGGCCGATTTGCATTT	105220

CR812479.6	201	TCCTGATGGTTAATGATGTTGAACATGTTTCCACGTGCTTATTGGCCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105221	TCCTGATGGTTAATGATGTTGAACATGTTTCCACGTGCTTATTGGCCTTT	105270

CR812479.6	251	TGTATATTTTCACTGGAGAACTGTAAATCCAAATCCTTTATTTTTAAATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105271	TGTATATTTTCACTGGAGAACTGTAAATCCAAATCCTTTATTTTTAAATT	105320

CR812479.6	301	TGATTATTTGCCTTTTTACTATTGAGTTATAACCGGTTTTATATATTATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105321	TGATTATTTGCCTTTTTACTATTGAGTTATAACCGGTTTTATATATTATA	105370

CR812479.6	351	GACAAAATTTTCTCTTTTACCATATGTATGATTTGCAAAAATTTTCTCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105371	GACAAAATTTTCTCTTTTACCATATGTATGATTTGCAAAAATTTTCTCCC	105420

CR812479.6	401	ATTCTGTGGGGTTTTTTTTTTTCACTTTCTTGATGGCATCTGTAAACATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105421	ATTCTGTGGGGTTTTTTTTTTTCACTTTCTTGATGGCATCTGTAAACATA	105470

CR812479.6	451	CAAAAGTTTTTAAATGCGATGACGTCCAGTTTATCTTTTTCTTCTTTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105471	CAAAAGTTTTTAAATGCGATGACGTCCAGTTTATCTTTTTCTTCTTTTTT	105520

CR812479.6	501	TGCTTATGCTTTTGGTGTCACATTTAAGATTAGGTGCCTTTACTTAATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105521	TGCTTATGCTTTTGGTGTCACATTTAAGATTAGGTGCCTTTACTTAATCC	105570

CR812479.6	551	AAAGCCATGAAGATTTATGCCTATGTTTTATTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105571	AAAGCCATGAAGATTTATGCCTATGTTTTATTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	105620

CR812479.6	601	TTTCTTCTTCCTCTCTTCCTCCCTTCCTTCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105621	TTTCTTCTTCCTCTCTTCCTCCCTTCCTTCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTC	105670

CR812479.6	651	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTACTTTCTTTCCTTTTTTTTCCTTGAGACACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105671	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTACTTTCTTTCCTTTTTTTTCCTTGAGACACA	105720

CR812479.6	701	GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCACGGTTCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105721	GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCACGGTTCAT	105770

CR812479.6	751	TGCAGCCTCAACTTCCTCAGGCTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105771	TGCAGCCTCAACTTCCTCAGGCTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCT	105820

CR812479.6	801	GAGTAGGTGAAACTACAGGTGCATGCCACCACACCCGGCTAAATTTTGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105821	GAGTAGGTGAAACTACAGGTGCATGCCACCACACCCGGCTAAATTTTGTA	105870

CR812479.6	851	TTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGCTGCCCAGTTTGGTCTACCAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105871	TTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGCTGCCCAGTTTGGTCTACCAAC	105920

CR812479.6	901	TCCTGGGCTCAAGCAATCTGCCCACTTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105921	TCCTGGGCTCAAGCAATCTGCCCACTTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATT	105970

CR812479.6	951	ACAGACATGAGCCATCGTGCCTGGCCTGTTTCCTTCTAAGAGTTTTCTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	105971	ACAGACATGAGCCATCGTGCCTGGCCTGTTTCCTTCTAAGAGTTTTCTAA	106020

CR812479.6	1001	TGTTAACTCTTTCACTTAGGTCTTTGATACATTTTGAGCTACTTTTTATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106021	TGTTAACTCTTTCACTTAGGTCTTTGATACATTTTGAGCTACTTTTTATA	106070

CR812479.6	1051	TATAGTTTCAAGATTTTCATTTTTCATTTTTCATTCATTGATACTGTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106071	TATAGTTTCAAGATTTTCATTTTTCATTTTTCATTCATTGATACTGTATA	106120

CR812479.6	1101	GAAACACAATTGATTTTTATATTTTGATTTTGTATCCTGCCAATGTGATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106121	GAAACACAATTGATTTTTATATTTTGATTTTGTATCCTGCCAATGTGATA	106170

CR812479.6	1151	AAATTCTTTAGTTGTAATGCTTTTTTAAAGTAAATTCTTTTGGATTTCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106171	AAATTCTTTAGTTGTAATGCTTTTTTAAAGTAAATTCTTTTGGATTTCTA	106220

CR812479.6	1201	TGTATAAGATCATATCATCTGTAACGAAGGTAGTTTTACTTCTTTCTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106221	TGTATAAGATCATATCATCTGTAACGAAGGTAGTTTTACTTCTTTCTTTT	106270

CR812479.6	1251	CAATTCAGATGAGCTTTATTTTATTTTCTTGTTCATTGTAGCAAAAAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106271	CAATTCAGATGAGCTTTATTTTATTTTCTTGTTCATTGTAGCAAAAAATT	106320

CR812479.6	1301	CAACTATTCTATTTATAATGCCCTGTTACTTGATGTTTTTTATTTATATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106321	CAACTATTCTATTTATAATGCCCTGTTACTTGATGTTTTTTATTTATATT	106370

CR812479.6	1351	GTGAACATCTCACCAATTTCATAGAGAAAGCTTGAGCTCATCATTTTAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106371	GTGAACATCTCACCAATTTCATAGAGAAAGCTTGAGCTCATCATTTTAAA	106420

CR812479.6	1401	CCCTAATTCCATAGTATTTTGCATGCAACTGCTTCTCTAGTGTAAATATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106421	CCCTAATTCCATAGTATTTTGCATGCAACTGCTTCTCTAGTGTAAATATT	106470

CR812479.6	1451	CAGATGGTTTCCTTTAGTTGTCACTACACTGAATGTCCACTGCACAGACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106471	CAGATGGTTTCCTTTAGTTGTCACTACACTGAATGTCCACTGCACAGACA	106520

CR812479.6	1501	TCTTTACACACATATCCTTACAGCCATCCCAGAGTTTTCTGATTTCCCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106521	TCTTTACACACATATCCTTACAGCCATCCCAGAGTTTTCTGATTTCCCAC	106570

CR812479.6	1551	AGCACTACATGATAGTGGTTAATCTGATGATCTAACTGACTAGCTAGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106571	AGCACTACATGATAGTGGTTAATCTGATGATCTAACTGACTAGCTAGGCA	106620

CR812479.6	1601	GACTGACTGACTGACAATCCCATTGCTTCTGTATATAAAGTCAGTAACTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106621	GACTGACTGACTGACAATCCCATTGCTTCTGTATATAAAGTCAGTAACTA	106670

CR812479.6	1651	CATTTGGAACTCAGCTTCTCTAGGCCCAGCCACGCTTACTTTCCTAGTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106671	CATTTGGAACTCAGCTTCTCTAGGCCCAGCCACGCTTACTTTCCTAGTCT	106720

CR812479.6	1701	TAGAGGTTCCCTCTCTGCCTCTAAATTTCTCTGTCCCTGAAACCACCCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106721	TAGAGGTTCCCTCTCTGCCTCTAAATTTCTCTGTCCCTGAAACCACCCTT	106770

CR812479.6	1751	GTACTCCAGCCCAAGAGCGCTTGCAAACAGGTAGAAGGTATCATCTGGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106771	GTACTCCAGCCCAAGAGCGCTTGCAAACAGGTAGAAGGTATCATCTGGAG	106820

CR812479.6	1801	AAGGTAAGTAAGAGACTTATCTCCATTCCCTTCATATCTAATTACCAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106821	AAGGTAAGTAAGAGACTTATCTCCATTCCCTTCATATCTAATTACCAAAT	106870

CR812479.6	1851	CTTCCATCTAGCTCAGTCAGGTTGAGTTGAAAACATCTTGACTTTAGTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106871	CTTCCATCTAGCTCAGTCAGGTTGAGTTGAAAACATCTTGACTTTAGTCA	106920

CR812479.6	1901	TTTAGCCACTGAGCACATCATAGCTCTTTTCATACCTCAGTCTTATTCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106921	TTTAGCCACTGAGCACATCATAGCTCTTTTCATACCTCAGTCTTATTCAA	106970

CR812479.6	1951	ATATTTAATTTATCAAGCTCACTTATAAATGCCAAGCCTCTCATTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759281.4	106971	ATATTTAATTTATCAAGCTCACTTATAAATGCCAAGCCTCTCATTTGGCC	107020

Overview

Query
CR812479.6 - 65104 bps
Hit
CR759281.4 - 107020 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link