<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR752645.3	1	GGCCAAATAACTGTTCTAATGCCCTTCATTCCAATAAAAGGTTTGTAGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45547	GGCCAAATAACTGTTCTAATGCCCTTCATTCCAATAAAAGGTTTGTAGCA	45596

CR752645.3	51	GCTTACAGAGATAATTTAAAACAATTTTTAAAAGAAGAAAACAACACTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45597	GCTTACAGAGATAATTTAAAACAATTTTTAAAAGAAGAAAACAACACTGG	45646

CR752645.3	101	GTCAGAGAGAAAATATGGTTAAGAAAAGTAAGTGAAGCCAAGGAGTGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45647	GTCAGAGAGAAAATATGGTTAAGAAAAGTAAGTGAAGCCAAGGAGTGAAA	45696

CR752645.3	151	CTAATGGAAACTAATGGACAACGTGAATATCTTAAAAAAAAAAAAAAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45697	CTAATGGAAACTAATGGACAACGTGAATATCTTAAAAAAAAAAAAAAAGT	45746

CR752645.3	201	GGTGCGCTGTCTTATACTGGCTAGCAAGAGCAGATTGCAAAGTATTCAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45747	GGTGCGCTGTCTTATACTGGCTAGCAAGAGCAGATTGCAAAGTATTCAGG	45796

CR752645.3	251	ATTTTTGAAGACAGTTGTTAACTATTGGTAACTTGATATTGACCACTATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45797	ATTTTTGAAGACAGTTGTTAACTATTGGTAACTTGATATTGACCACTATG	45846

CR752645.3	301	GAAGTATTTATACTATAGAAATCAGCAATGCTACAAGTCAGAAGCATTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45847	GAAGTATTTATACTATAGAAATCAGCAATGCTACAAGTCAGAAGCATTGT	45896

CR752645.3	351	TTTTCTTCAGAGAGCCGGTTTAACAGGACACATATTTATCAGCCAACTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45897	TTTTCTTCAGAGAGCCGGTTTAACAGGACACATATTTATCAGCCAACTAT	45946

CR752645.3	401	AAATGGATAAAAAATAATTGGCTCCAGGCCATAGGATAGTGAAAGCAAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45947	AAATGGATAAAAAATAATTGGCTCCAGGCCATAGGATAGTGAAAGCAAAG	45996

CR752645.3	451	AAGGAAATAAAATGAGGTACAAGATTCATAAAATTCATTTTTTAAAAGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	45997	AAGGAAATAAAATGAGGTACAAGATTCATAAAATTCATTTTTTAAAAGTT	46046

CR752645.3	501	GCCAGAAAACCAAAAATTATATATAATAGTTCAAGCCACACAGAACATTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46047	GCCAGAAAACCAAAAATTATATATAATAGTTCAAGCCACACAGAACATTT	46096

CR752645.3	551	ACTCAAATAGGACATGCATCATTCCATAAAGGTAACGCCAATAAATTCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46097	ACTCAAATAGGACATGCATCATTCCATAAAGGTAACGCCAATAAATTCCA	46146

CR752645.3	601	GAGTATCGGTATCTTAGAAACTATCTATATTCTAGGCCAGGAGCAGTGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46147	GAGTATCGGTATCTTAGAAACTATCTATATTCTAGGCCAGGAGCAGTGGC	46196

CR752645.3	651	TCATGCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCAGATCCCTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46197	TCATGCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCAGATCCCTA	46246

CR752645.3	701	GAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCCGTCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46247	GAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCCGTCTC	46296

CR752645.3	751	TACAAAAAATTTAGCTGGATGGGGTGCACCTGTAATCCCAACTAGTCAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46297	TACAAAAAATTTAGCTGGATGGGGTGCACCTGTAATCCCAACTAGTCAGA	46346

CR752645.3	801	AGGCTAGACGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46347	AGGCTAGACGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAG	46396

CR752645.3	851	CTGAGATTGTGCCACTGCCCTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACACTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46397	CTGAGATTGTGCCACTGCCCTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACACTGT	46446

CR752645.3	901	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAACTATATTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46447	CTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAACTATATTC	46496

CR752645.3	951	TGCAACCATACTGTAATAAAATTAGAACTTGATAACTAAAATATACTTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46497	TGCAACCATACTGTAATAAAATTAGAACTTGATAACTAAAATATACTTAA	46546

CR752645.3	1001	AATTGTAAGTGAACAAATATATTTATCAGTAACATGGATTTAAAAGGCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46547	AATTGTAAGTGAACAAATATATTTATCAGTAACATGGATTTAAAAGGCAG	46596

CR752645.3	1051	TCGTGGATGGGAGCATCGCTGGAGTCCAGAAGATGGAGGCTGCAGTGAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46597	TCGTGGATGGGAGCATCGCTGGAGTCCAGAAGATGGAGGCTGCAGTGAGG	46646

CR752645.3	1101	CATGATTGCGTCACTGCACTCCAGCCTCAGCAATAGAGTGGGACCCTGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46647	CATGATTGCGTCACTGCACTCCAGCCTCAGCAATAGAGTGGGACCCTGTG	46696

CR752645.3	1151	TCAAATAAATAAACAGCAGTTATAAAGAAAATTAACTCTTTTAGAACCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46697	TCAAATAAATAAACAGCAGTTATAAAGAAAATTAACTCTTTTAGAACCAG	46746

CR752645.3	1201	GTGTTAAAAATGTTACACATAAAATATACATATAAAATAATATTATAATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46747	GTGTTAAAAATGTTACACATAAAATATACATATAAAATAATATTATAATT	46796

CR752645.3	1251	TCAAATACATTTATTAGAACAAGAAAAGTTAAAATAAAGGACCTAGAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46797	TCAAATACATTTATTAGAACAAGAAAAGTTAAAATAAAGGACCTAGAAAT	46846

CR752645.3	1301	TCTACTCAAAAATTTGGAAAAAGAGAAGTTGAGCAAACCTAAAGAAATAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46847	TCTACTCAAAAATTTGGAAAAAGAGAAGTTGAGCAAACCTAAAGAAATAC	46896

CR752645.3	1351	GAAGAAAAGGAGTTATAAAGATAAGAATAGAAAGCAATGAAACAGAAATA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46897	GAAGAAAAGGAGTTATAAAGATAAGAATAGAAAGCAATGAAACAGAAATA	46946

CR752645.3	1401	GAGAACAAAAAACTAGGTAGTGAAAATTAACATACTTTTGATTCCAAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46947	GAGAACAAAAAACTAGGTAGTGAAAATTAACATACTTTTGATTCCAAAAG	46996

CR752645.3	1451	CTGCTTACTTAAAAATATTTGTAAGATATTCAGAGTTACAACAAGGCCGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	46997	CTGCTTACTTAAAAATATTTGTAAGATATTCAGAGTTACAACAAGGCCGA	47046

CR752645.3	1501	TTATGGATAAAGGGAGAAAAAATGAATAAACAAATACATAATGAAAAAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47047	TTATGGATAAAGGGAGAAAAAATGAATAAACAAATACATAATGAAAAAGG	47096

CR752645.3	1551	GGGAACAGCTACAGATATGACACAGATATAAAGCATAGAGTGTTATGAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47097	GGGAACAGCTACAGATATGACACAGATATAAAGCATAGAGTGTTATGAAC	47146

CR752645.3	1601	AAGTATATGCTAATAAATTTGAAAACCTAGGTGAGATAAGCAAATTCCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47147	AAGTATATGCTAATAAATTTGAAAACCTAGGTGAGATAAGCAAATTCCTA	47196

CR752645.3	1651	GAAACATTTAATCTATCAAAATTAGCACAAAAAGAAATACAAAACTTGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47197	GAAACATTTAATCTATCAAAATTAGCACAAAAAGAAATACAAAACTTGAC	47246

CR752645.3	1701	TATACCAATGAGTATTAAAGCAATTTTTAAAGTTATCAATGGCATCTAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47247	TATACCAATGAGTATTAAAGCAATTTTTAAAGTTATCAATGGCATCTAAT	47296

CR752645.3	1751	AAAAAAATATATTTTTGAAAATGCCCAGATGGTTTCACAGATGAGTTCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47297	AAAAAAATATATTTTTGAAAATGCCCAGATGGTTTCACAGATGAGTTCTA	47346

CR752645.3	1801	TCAAACATTCAAGGAACATGAAACTTCTATATTATATACTTTTTCCAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47347	TCAAACATTCAAGGAACATGAAACTTCTATATTATATACTTTTTCCAGAA	47396

CR752645.3	1851	AACAGAAAAAAACTAAACCTGATTAGCTAATTTTATCAGCCGAGTGTAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47397	AACAGAAAAAAACTAAACCTGATTAGCTAATTTTATCAGCCGAGTGTAAT	47446

CR752645.3	1901	CTTGACTCCAAATTGAGTTGTGGAAAACTCAAGGAAAAAAAAATAATAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47447	CTTGACTCCAAATTGAGTTGTGGAAAACTCAAGGAAAAAAAAATAATAGA	47496

CR752645.3	1951	CCCATTTCACCTTGAACACAGATGGGAGAAAAAAATAATTATTTATGAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753889.4	47497	CCCATTTCACCTTGAACACAGATGGGAGAAAAAAATAATTATTTATGAAC	47546

Overview

Query
CR752645.3 - 95556 bps
Hit
CR753889.4 - 47546 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link