<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR450689.6	118559	AGTACAAATTAGGTATACTGTATATTACAGGTATATGTCAGCTTTTAAAC	118608
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1	AGTACAAATTAGGTATACTGTATATTACAGGTATATGTCAGCTTTTAAAC	50

CR450689.6	118609	TTGTCCAGCAACATCGCAGCAATGTTAGTCTAGCTTTGATTGTTTTTTGT	118658
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	51	TTGTCCAGCAACATCGCAGCAATGTTAGTCTAGCTTTGATTGTTTTTTGT	100

CR450689.6	118659	GCTGTTAAGCCTGGCAGTTGTACCTTCCAGCAAGGCAATCTCTCTAAAAT	118708
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	101	GCTGTTAAGCCTGGCAGTTGTACCTTCCAGCAAGGCAATCTCTCTAAAAT	150

CR450689.6	118709	ACAATAACCAGGTAATTGTTTGCAGAGTGGATGGATCAATCCATCATTTT	118758
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	151	ACAATAACCAGGTAATTGTTTGCAGAGTGGATGGATCAATCCATCATTTT	200

CR450689.6	118759	AAATCAGTCTTTAGGTGTTCAGTTGTAAAATGAGTCATCCACTAAAAGAA	118808
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	201	AAATCAGTCTTTAGGTGTTCAGTTGTAAAATGAGTCATCCACTAAAAGAA	250

CR450689.6	118809	AAGTAGAGGGATCCCAAGCTATGTCTATGTCAAATCTAAAACAGTAGAGC	118858
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	251	AAGTAGAGGGATCCCAAGCTATGTCTATGTCAAATCTAAAACAGTAGAGC	300

CR450689.6	118859	ATACACATTTCCAAAAATAGAACCACCACTGGGGATTTCCAAAACATCTG	118908
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	301	ATACACATTTCCAAAAATAGAACCACCACTGGGGATTTCCAAAACATCTG	350

CR450689.6	118909	TCGGCAGAAACCAACTGAACTTGTGTTACAAAGGTGACAGTAAGTCAAAT	118958
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	351	TCGGCAGAAACCAACTGAACTTGTGTTACAAAGGTGACAGTAAGTCAAAT	400

CR450689.6	118959	TAAATTATCTCATCTTACTGGGAGTAAAATATGAATGCATTTATAATGAA	119008
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	401	TAAATTATCTCATCTTACTGGGAGTAAAATATGAATGCATTTATAATGAA	450

CR450689.6	119009	TCATCGGATGTGCAAGATTAGAGTGGGTGAAGCAACTGGTTGAGCAAGAC	119058
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	451	TCATCGGATGTGCAAGATTAGAGTGGGTGAAGCAACTGGTTGAGCAAGAC	500

CR450689.6	119059	CTTCCATTTTCCAGAATTGAATAGCTGGAATGTAGGTATACTGCAGTAAA	119108
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	501	CTTCCATTTTCCAGAATTGAATAGCTGGAATGTAGGTATACTGCAGTAAA	550

CR450689.6	119109	ATAAATAAATTATAAAGCTTAGAACACCAGCATCAGACCAGGTTATTAAA	119158
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	551	ATAAATAAATTATAAAGCTTAGAACACCAGCATCAGACCAGGTTATTAAA	600

CR450689.6	119159	ACAAAGGGTTTGTTATGCATAACTGATTATTATGCCATAATAGGGTTACC	119208
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	601	ACAAAGGGTTTGTTATGCATAACTGATTATTATGCCATAATAGGGTTACC	650

CR450689.6	119209	TTAACATATAAAAAAGGGCCACCTGCAATTTTCTAAACCTTTTTCCATAC	119258
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	651	TTAACATATAAAAAAGGGCCACCTGCAATTTTCTAAACCTTTTTCCATAC	700

CR450689.6	119259	ATTAAGTGAATCTTCAGTAATTGGTCCATATCATTTTTTTAAAGGATTTT	119308
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	701	ATTAAGTGAATCTTCAGTAATTGGTCCATATCATTTTTTTAAAGGATTTT	750

CR450689.6	119309	AAAGTACCTGTAAAGGGGAGGTCTTGTAGGCGAATAGGATTAATTATATT	119358
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	751	AAAGTACCTGTAAAGGGGAGGTCTTGTAGGCGAATAGGATTAATTATATT	800

CR450689.6	119359	TGTCCCCAGGACTCTGTTGGACCAGACAGTCAGAATTAATCCAGGTTTTG	119408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	801	TGTCCCCAGGACTCTGTTGGACCAGACAGTCAGAATTAATCCAGGTTTTG	850

CR450689.6	119409	ATTTCTCTTATTTGGAAGGCTAAGTTATAAAATTCAAGTTTAGGAAAATT	119458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	851	ATTTCTCTTATTTGGAAGGCTAAGTTATAAAATTCAAGTTTAGGAAAATT	900

CR450689.6	119459	TTAGATCTCTATCTAATTTCTTATGTTGCATGGTCTTGAGTGTGATTCAG	119508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	901	TTAGATCTCTATCTAATTTCTTATGTTGCATGGTCTTGAGTGTGATTCAG	950

CR450689.6	119509	GGCATTTTATTCACCAAATAAATTTAAAAATGGCTGTATTAAGTTCCTTG	119558
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	951	GGCATTTTATTCACCAAATAAATTTAAAAATGGCTGTATTAAGTTCCTTG	1000

CR450689.6	119559	TAAAATGTAAAGGTGGCTGAAAAAGAATCAATCAAGAACAATCACTCTGA	119608
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1001	TAAAATGTAAAGGTGGCTGAAAAAGAATCAATCAAGAACAATCACTCTGA	1050

CR450689.6	119609	ACAGTAAGAAAATGGGCCAATGAATGCCTATGAGTTGGCTGAGCTCATCC	119658
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1051	ACAGTAAGAAAATGGGCCAATGAATGCCTATGAGTTGGCTGAGCTCATCC	1100

CR450689.6	119659	TCATGTGCTGGTGAATAAACATTAGTAAAGTATATAACCAGTGAATGCAG	119708
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1101	TCATGTGCTGGTGAATAAACATTAGTAAAGTATATAACCAGTGAATGCAG	1150

CR450689.6	119709	AGCAAGCTATTAAACTTTTGCAGCCAACCCTCAGCTATCAGCTGGAGACC	119758
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1151	AGCAAGCTATTAAACTTTTGCAGCCAACCCTCAGCTATCAGCTGGAGACC	1200

CR450689.6	119759	CAGCTGCTGTGGCCACAGAGACCCATGCCTCTGTTCCGTCTTCGGTAAAC	119808
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1201	CAGCTGCTGTGGCCACAGAGACCCATGCCTCTGTTCCGTCTTCGGTAAAC	1250

CR450689.6	119809	GCGGGTTACATTTGTAATCGGGACATTTCCCTTCAGTAGGAACTTCAACG	119858
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1251	GCGGGTTACATTTGTAATCGGGACATTTCCCTTCAGTAGGAACTTCAACG	1300

CR450689.6	119859	TGTGTCGCCGAAGTGTTTACGCAGATGATAGGTTGTATAGTTTCCCATGC	119908
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1301	TGTGTCGCCGAAGTGTTTACGCAGATGATAGGTTGTATAGTTTCCCATGC	1350

CR450689.6	119909	CACTTGTTCCAAAAGTTCCAATAGTAAGTAAGTAATGTGCATTCATGTAG	119958
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1351	CACTTGTTCCAAAAGTTCCAATAGTAAGTAAGTAATGTGCATTCATGTAG	1400

CR450689.6	119959	GGCATTTATTGTGAATGATGATTGGGAGGCCATGATAGGTAAAGGCCAAT	120008
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1401	GGCATTTATTGTGAATGATGATTGGGAGGCCATGATAGGTAAAGGCCAAT	1450

CR450689.6	120009	GGAGGGAATTTTGGACAGGATTACCAATGGTGAAGTAAAAAAGCAGAGGT	120058
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1451	GGAGGGAATTTTGGACAGGATTACCAATGGTGAAGTAAAAAAGCAGAGGT	1500

CR450689.6	120059	GACAAGGACACTCTTGCCGACTAAGAGCAAATGAAGATGATGTTATAGTG	120108
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1501	GACAAGGACACTCTTGCCGACTAAGAGCAAATGAAGATGATGTTATAGTG	1550

CR450689.6	120109	CTGAGTAGAACCTGTGCCGAACTGCAGTTACAAAGAGTTTTGACCATTTT	120158
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1551	CTGAGTAGAACCTGTGCCGAACTGCAGTTACAAAGAGTTTTGACCATTTT	1600

CR450689.6	120159	GATAAATCCCTGCCCAAACGCACTCTCTGCGTCCAGTGAGATGACCGCTG	120208
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1601	GATAAATCCCTGCCCAAACGCACTCTCTGCGTCCAGTGAGATGACCGCTG	1650

CR450689.6	120209	AGGAAGCCAGATATAACTGGACTTATTTAATTTATTTATTGAATTATTAT	120258
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1651	AGGAAGCCAGATATAACTGGACTTATTTAATTTATTTATTGAATTATTAT	1700

CR450689.6	120259	AACATAGAAGTCTCCTAATGTTATCAGAAGCAAATTGATCTTTGAGAACA	120308
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1701	AACATAGAAGTCTCCTAATGTTATCAGAAGCAAATTGATCTTTGAGAACA	1750

CR450689.6	120309	CAGGACTTAAATTTATCCATGCATTATCTATATAAGCTAGCATTTTAGCA	120358
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1751	CAGGACTTAAATTTATCCATGCATTATCTATATAAGCTAGCATTTTAGCA	1800

CR450689.6	120359	AAGAGTTTAGCATCTGTAATTTATAAAACTAACAGACCAATTGGCCCATT	120408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1801	AAGAGTTTAGCATCTGTAATTTATAAAACTAACAGACCAATTGGCCCATT	1850

CR450689.6	120409	CTAAGGGATATTTGAGCTTGTTAAAAGGGTTATTTGAGCTGTGTTTTGAT	120458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1851	CTAAGGGATATTTGAGCTTGTTAAAAGGGTTATTTGAGCTGTGTTTTGAT	1900

CR450689.6	120459	CTCTGAGGAAAGGCCCATTCTCAATTGCGTAATTAAAAGAGTTTAGGATA	120508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1901	CTCTGAGGAAAGGCCCATTCTCAATTGCGTAATTAAAAGAGTTTAGGATA	1950

CR450689.6	120509	AGTGATCATATTATATCCCAATATGGCGGAAGTTAATTCAGGGGGAATTC	120558
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753887.12	1951	AGTGATCATATTATATCCCAATATGGCGGAAGTTAATTCAGGGGGAATTC	2000

Overview

Query
CR450689.6 - 120558 bps
Hit
CR753887.12 - 39741 bps
Total alignments
19
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194720001185591205581120001
288.1516827616467167421426845371
389.39881331066381067701426843991
485.03771505424254391-1426844141
590.2170245113136113380-1426845121
689.271472271962819854-1426945011
786.2134581950819565-1456446211
8100323374702747341501550471
983.1542897558075668-1501751051
1077.8911342148335487551512155361
1191.5344591289712955113409134671
1293.146584852848585-113410134671
1386.07152288118070118357-122012222911
1481.951203477240072746-122380227281
1582.481143459915999503122447227941
1686.8749931124311335-132393324911
1782.76732231094711169-132674329051
1885.26721451957719721136245364001
1986.141152261651716742-136271365081
Short-link