<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR942185.8	1	TTTTAGATCTTAGAAAGCAATGAGCATCTGATAAGTCTTTGGGGAAATAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80193	TTTTAGATCTTAGAAAGCAATGAGCATCTGATAAGTCTTTGGGGAAATAG	80242

CR942185.8	51	GAAAGGAGGAAAATCTAATAAAGACAAAGATCAGCAAAAGAAAAACAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80243	GAAAGGAGGAAAATCTAATAAAGACAAAGATCAGCAAAAGAAAAACAAAG	80292

CR942185.8	101	AGAGGCTACAAAATGCAGTTATCTACCTGGAATTATAAGAGAGGGGCTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80293	AGAGGCTACAAAATGCAGTTATCTACCTGGAATTATAAGAGAGGGGCTAA	80342

CR942185.8	151	ATGTAGTCATCTCCTCTTTTTGGAGATCAGAAGGTCTCTGGGAAAAGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80343	ATGTAGTCATCTCCTCTTTTTGGAGATCAGAAGGTCTCTGGGAAAAGAGA	80392

CR942185.8	201	AGAACCAATTTTTCAGAAAATAACTAGGGTCACAGAATGAACAAGTGGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80393	AGAACCAATTTTTCAGAAAATAACTAGGGTCACAGAATGAACAAGTGGAA	80442

CR942185.8	251	TTAGAGAGCCAGTGATGGACGTGAGGAAACAGCTGTGTAGGTTTTGACCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80443	TTAGAGAGCCAGTGATGGACGTGAGGAAACAGCTGTGTAGGTTTTGACCA	80492

CR942185.8	301	GTGAGCAGGTGGTGGTAATAGTATCACAGGGTTGCTACTTACTGAATCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80493	GTGAGCAGGTGGTGGTAATAGTATCACAGGGTTGCTACTTACTGAATCAC	80542

CR942185.8	351	TGCTACAACATGCAAGGAACTGTGCTAGACTTTACAGAATGATTCCTAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80543	TGCTACAACATGCAAGGAACTGTGCTAGACTTTACAGAATGATTCCTAAT	80592

CR942185.8	401	CATTGAAGCAACCCTCACAAGGTAGGCATTATTATCATCCCAGTTTCACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80593	CATTGAAGCAACCCTCACAAGGTAGGCATTATTATCATCCCAGTTTCACA	80642

CR942185.8	451	GAGGAGGACATCGAGGCTACCAAGTTAAGTAGCTTGTCCTGGTTTCACAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80643	GAGGAGGACATCGAGGCTACCAAGTTAAGTAGCTTGTCCTGGTTTCACAG	80692

CR942185.8	501	CCAGCAAGTGACAGGGTCAAGAGAGGGACCCACATCGGCCAGACACTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80693	CCAGCAAGTGACAGGGTCAAGAGAGGGACCCACATCGGCCAGACACTGAA	80742

CR942185.8	551	GTCAGGATGTTTTCCACATTCCTACTTCCCCATATTACAAATTTCACAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80743	GTCAGGATGTTTTCCACATTCCTACTTCCCCATATTACAAATTTCACAGA	80792

CR942185.8	601	GGGTTTAGGTGAGAATGACTTGGAAGTTTACAAAGTCCCAGTGAGGGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80793	GGGTTTAGGTGAGAATGACTTGGAAGTTTACAAAGTCCCAGTGAGGGTTA	80842

CR942185.8	651	AAGAACAACAAGGAGATTCAGATGTGAGCAGGATATTTATAAGTGTCACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80843	AAGAACAACAAGGAGATTCAGATGTGAGCAGGATATTTATAAGTGTCACA	80892

CR942185.8	701	GGAAAATTATTGGATCCTGCCTCCCAGGATTTCTAGGGGATGGAAAGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80893	GGAAAATTATTGGATCCTGCCTCCCAGGATTTCTAGGGGATGGAAAGAAG	80942

CR942185.8	751	ACAGGGATTATGGTGGGAGGTGATTTTGATTGGAGGATTTCTTTGAGGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80943	ACAGGGATTATGGTGGGAGGTGATTTTGATTGGAGGATTTCTTTGAGGGA	80992

CR942185.8	801	GGGAACTGGCAGAAGGAGTCAGGCCCTACGGTGGCCCTAGGCAGAAATCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	80993	GGGAACTGGCAGAAGGAGTCAGGCCCTACGGTGGCCCTAGGCAGAAATCC	81042

CR942185.8	851	GGTAGTTGGGGTGGACCTGGGGCCTGACGTCGCAGACCATGCCAAGAAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81043	GGTAGTTGGGGTGGACCTGGGGCCTGACGTCGCAGACCATGCCAAGAAGC	81092

CR942185.8	901	TGGGCCAGGACACGCTCTCGGTTTCTCTGCTGGGAGCTCTGCATGCCCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81093	TGGGCCAGGACACGCTCTCGGTTTCTCTGCTGGGAGCTCTGCATGCCCTG	81142

CR942185.8	951	CACCTGGCGCCTTGTAGCCTGCTCCACCTCAGCAGACAGGTTCCCCTGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81143	CACCTGGCGCCTTGTAGCCTGCTCCACCTCAGCAGACAGGTTCCCCTGGG	81192

CR942185.8	1001	AGCCCATGGCCTGGGGGGTAGGGAGAGGGGTGGAAGAGAGAAAGGGAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81193	AGCCCATGGCCTGGGGGGTAGGGAGAGGGGTGGAAGAGAGAAAGGGAAAA	81242

CR942185.8	1051	GCAGAAACAGACAAGGGTCCAGGCATATGAGGGGAAAGATCCTGAAACAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81243	GCAGAAACAGACAAGGGTCCAGGCATATGAGGGGAAAGATCCTGAAACAA	81292

CR942185.8	1101	AGCCTAGAAGAAAGGCCCTCTCAGAAACCACCCCCATCCCACAGAAATAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81293	AGCCTAGAAGAAAGGCCCTCTCAGAAACCACCCCCATCCCACAGAAATAT	81342

CR942185.8	1151	CCCAACACCAAAGAGATCAACACAGTCCCCTTTCCCCTTAGACCTAACAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81343	CCCAACACCAAAGAGATCAACACAGTCCCCTTTCCCCTTAGACCTAACAT	81392

CR942185.8	1201	GCAACTTCATACTAAAACAGACCGTAATATCCCCACCACCTCACCATCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81393	GCAACTTCATACTAAAACAGACCGTAATATCCCCACCACCTCACCATCCA	81442

CR942185.8	1251	TGACCATAAAACTCTACCCTCCACCACAAATGTTAATCATACTCCACATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81443	TGACCATAAAACTCTACCCTCCACCACAAATGTTAATCATACTCCACATA	81492

CR942185.8	1301	GATGTTATACTTTACACAGACTGTGGCATTCCGCCCACAAGCTCTATGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81493	GATGTTATACTTTACACAGACTGTGGCATTCCGCCCACAAGCTCTATGTG	81542

CR942185.8	1351	GCCTTCAAAACTCCCAGACTCTCCTACATATCATCACAAAGTTTCACCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81543	GCCTTCAAAACTCCCAGACTCTCCTACATATCATCACAAAGTTTCACCAA	81592

CR942185.8	1401	TGTTGTGGTCCCTGCCAGGGTCCCCTCAGCCTCAGCCCTCTGCCACCATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81593	TGTTGTGGTCCCTGCCAGGGTCCCCTCAGCCTCAGCCCTCTGCCACCATA	81642

CR942185.8	1451	TTTTCTTGTTGAGTCACCCTTACACACCTCACTAGATGCACCCACCAACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81643	TTTTCTTGTTGAGTCACCCTTACACACCTCACTAGATGCACCCACCAACT	81692

CR942185.8	1501	TGCAGTGGGGTCTCATCCCGACTCTGCCTCAACTCACCGCCTGCTGCTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81693	TGCAGTGGGGTCTCATCCCGACTCTGCCTCAACTCACCGCCTGCTGCTTG	81742

CR942185.8	1551	CTCTGGAATTCGTGCTCTCGCTCTCTGCGGTATTGCTCCACCTCCATCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81743	CTCTGGAATTCGTGCTCTCGCTCTCTGCGGTATTGCTCCACCTCCATCTG	81792

CR942185.8	1601	TGCCTCCTCCTTTGCCTGCTTCAGTCGCCGGGCCTTCCCTGGAGGCAGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81793	TGCCTCCTCCTTTGCCTGCTTCAGTCGCCGGGCCTTCCCTGGAGGCAGAA	81842

CR942185.8	1651	GAAAGGACAGTGAGTGGGGATGGACCCACACACACACAATGTAATAGCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81843	GAAAGGACAGTGAGTGGGGATGGACCCACACACACACAATGTAATAGCAG	81892

CR942185.8	1701	GAGTCAGTCCCTTCCAGAAAGTTATACAGCCTTCTCTCAGCCAACCAGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81893	GAGTCAGTCCCTTCCAGAAAGTTATACAGCCTTCTCTCAGCCAACCAGGT	81942

CR942185.8	1751	GCCAGATTCTAATATCCATCCATTTCTTCCCTCCTAACCAGCCTCCAGAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81943	GCCAGATTCTAATATCCATCCATTTCTTCCCTCCTAACCAGCCTCCAGAC	81992

CR942185.8	1801	CCTAGCTGTCTTCCCGCCAGCCTTGGGTTTTCCCAAAATGTTTGCTGTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	81993	CCTAGCTGTCTTCCCGCCAGCCTTGGGTTTTCCCAAAATGTTTGCTGTCC	82042

CR942185.8	1851	CCCACCCCCAATTTTCTTTCCAAACTCCTAAGGGAGGAAAGAGGAGACTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	82043	CCCACCCCCAATTTTCTTTCCAAACTCCTAAGGGAGGAAAGAGGAGACTC	82092

CR942185.8	1901	ACTCTTTCTGGCATCTGCCACCTTCTCAGCTGCCCGCTTCTCAGCTTGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	82093	ACTCTTTCTGGCATCTGCCACCTTCTCAGCTGCCCGCTTCTCAGCTTGCA	82142

CR942185.8	1951	GAAGCTGCTGGATACCTTGGGACTGACTGGCCATTTCTGTTGTTATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753864.4	82143	GAAGCTGCTGGATACCTTGGGACTGACTGGCCATTTCTGTTGTTATGGCC	82192

Overview

Query
CR942185.8 - 55481 bps
Hit
CR753864.4 - 82192 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link