<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753803.4	1	GGCCAGAGGACATTGATACCCTAAAATTACAGTGTCCGGATCAGGGCAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94091	GGCCAGAGGACATTGATACCCTAAAATTACAGTGTCCGGATCAGGGCAAG	94140

CR753803.4	51	GAATTCTTTGCTGAATGAACAAATTGGCCCATTGGTGAGAAAGGTCTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94141	GAATTCTTTGCTGAATGAACAAATTGGCCCATTGGTGAGAAAGGTCTGTT	94190

CR753803.4	101	CCTATTCCTATTCCAATAGTGGGCTTCCAGAGTGTGCAGTCGACGCGCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94191	CCTATTCCTATTCCAATAGTGGGCTTCCAGAGTGTGCAGTCGACGCGCTG	94240

CR753803.4	151	CCCCTCACTGCCTTCTGTCTTCCTTCACGGCCCCTAGTCAACTCCACAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94241	CCCCTCACTGCCTTCTGTCTTCCTTCACGGCCCCTAGTCAACTCCACAGA	94290

CR753803.4	201	GAAAGCACACTACCAGGAATCAGGGACGCAGAAAAATTCTCTTCAACAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94291	GAAAGCACACTACCAGGAATCAGGGACGCAGAAAAATTCTCTTCAACAGA	94340

CR753803.4	251	TTTCAAAAGAGGGTCCAATTCCTTTGTCGTGAAGAACTTTGCTACTCAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94341	TTTCAAAAGAGGGTCCAATTCCTTTGTCGTGAAGAACTTTGCTACTCAAG	94390

CR753803.4	301	GGGCGTGATCATGGGCCAGCAGCATCCGCATCATTTCTTGTTGGAAATGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94391	GGGCGTGATCATGGGCCAGCAGCATCCGCATCATTTCTTGTTGGAAATGC	94440

CR753803.4	351	AGAATCTCTGGCCCTAGCCCAAACCTGTTGAACCCCAATCTGCCTCTTAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94441	AGAATCTCTGGCCCTAGCCCAAACCTGTTGAACCCCAATCTGCCTCTTAG	94490

CR753803.4	401	CAAGATCCCCAAGCATGGAAACGTGCAAAAGAAGCCCGGCTGGTGAGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94491	CAAGATCCCCAAGCATGGAAACGTGCAAAAGAAGCCCGGCTGGTGAGAAT	94540

CR753803.4	451	ATTTTTGTTTTCATGAAGTTGCAGAGAAAGCAACATCTTCTAGGGCCATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94541	ATTTTTGTTTTCATGAAGTTGCAGAGAAAGCAACATCTTCTAGGGCCATC	94590

CR753803.4	501	TTCCTCACTCACAAACACTCACCTGTCACACCCACGGTGGACACCGGGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94591	TTCCTCACTCACAAACACTCACCTGTCACACCCACGGTGGACACCGGGCC	94640

CR753803.4	551	CACACGCCGCCCCTCGTGGAGGCCGTACAGGTGCATCTTGTATTTGCGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94641	CACACGCCGCCCCTCGTGGAGGCCGTACAGGTGCATCTTGTATTTGCGCC	94690

CR753803.4	601	CGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGACCTCGCTCTCCTCGCCCCTGACACGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94691	CGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGACCTCGCTCTCCTCGCCCCTGACACGC	94740

CR753803.4	651	ATCACCTGGGGCCGCCCGTCCCTGTCCTTGTACTGCACGGTGAAGGAGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94741	ATCACCTGGGGCCGCCCGTCCCTGTCCTTGTACTGCACGGTGAAGGAGTC	94790

CR753803.4	701	GAAGTGGCCCTGGGGGATGGTCCAGGAGAGGCTCAGCGAGTCAGGGGAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94791	GAAGTGGCCCTGGGGGATGGTCCAGGAGAGGCTCAGCGAGTCAGGGGAGG	94840

CR753803.4	751	ATCCTGTCACTGTCAGCTCCCCCAGGAGCGGCTCCTCAGGGGGCTCCGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94841	ATCCTGTCACTGTCAGCTCCCCCAGGAGCGGCTCCTCAGGGGGCTCCGGG	94890

CR753803.4	801	GCCTCAGTGCTGAGTTCCGTGGGGCTGGGGGTCTCTTCCTCTGCAGCTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94891	GCCTCAGTGCTGAGTTCCGTGGGGCTGGGGGTCTCTTCCTCTGCAGCTGA	94940

CR753803.4	851	GAAAAGGAGATATAGAGAGGATGCCAGGTGCCTGGGGGATGTGCTCAGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94941	GAAAAGGAGATATAGAGAGGATGCCAGGTGCCTGGGGGATGTGCTCAGGT	94990

CR753803.4	901	CTTCAAGGGAAGGAGGGAGAAACCATGGCCACTACTGGGTATGTGAGGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	94991	CTTCAAGGGAAGGAGGGAGAAACCATGGCCACTACTGGGTATGTGAGGTC	95040

CR753803.4	951	ATTTCAGAAAAGCCCATTCTTGGGGCTGGGTGGTCCTGCTCAACTGACAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95041	ATTTCAGAAAAGCCCATTCTTGGGGCTGGGTGGTCCTGCTCAACTGACAG	95090

CR753803.4	1001	CTAACACACATGACAAGTTCCAGGGTCAGCTGTGGGGGACCTGGGACAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95091	CTAACACACATGACAAGTTCCAGGGTCAGCTGTGGGGGACCTGGGACAGT	95140

CR753803.4	1051	CACCAGCACAGCAGAACTCCTGATGGCCCCTCCCTGCTCAGGAGGAGCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95141	CACCAGCACAGCAGAACTCCTGATGGCCCCTCCCTGCTCAGGAGGAGCCA	95190

CR753803.4	1101	GGGGTCAGCCTCAGAGGAAGGCCCAAGGGGAGCCCCAGCCACAAGCAGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95191	GGGGTCAGCCTCAGAGGAAGGCCCAAGGGGAGCCCCAGCCACAAGCAGGT	95240

CR753803.4	1151	CTGTGGTGCTGACCGGACCCCTGGCCCATTCCCCACCAGTCATCACCAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95241	CTGTGGTGCTGACCGGACCCCTGGCCCATTCCCCACCAGTCATCACCAAA	95290

CR753803.4	1201	GAGCAAGAGGGTGACCCTCCCACGGCTCCCACCCTGGGGCTGCCATCATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95291	GAGCAAGAGGGTGACCCTCCCACGGCTCCCACCCTGGGGCTGCCATCATC	95340

CR753803.4	1251	CACTCACCCGTCACCCCAATGACAGAGATGGGGCCCACGCGCTGGCCACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95341	CACTCACCCGTCACCCCAATGACAGAGATGGGGCCCACGCGCTGGCCACC	95390

CR753803.4	1301	GTGGAAGCCGTACAGGTTCATCTTGTATTTATGGTCTGGCTCCAGGCCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95391	GTGGAAGCCGTACAGGTTCATCTTGTATTTATGGTCTGGCTCCAGGCCTG	95440

CR753803.4	1351	AGATGGTGACCCCGTCCTCGTGCCCCGGCACCCGCACCGCCTTGGGCTGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95441	AGATGGTGACCCCGTCCTCGTGCCCCGGCACCCGCACCGCCTTGGGCTGC	95490

CR753803.4	1401	CCATCCCCATTCCTGTACTGGACCAGGAAGTGGTCAAACTGGCCCTCGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95491	CCATCCCCATTCCTGTACTGGACCAGGAAGTGGTCAAACTGGCCCTCGGG	95540

CR753803.4	1451	AACCGTCCAGGACAGGCTGAGGGAGTCAGGGGTGGCATCTGTCATGGTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95541	AACCGTCCAGGACAGGCTGAGGGAGTCAGGGGTGGCATCTGTCATGGTCA	95590

CR753803.4	1501	GCTCCCCCAGGCGAGGCTTGATGGGGGGCTCAGGGGTCATGGTAGGCACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95591	GCTCCCCCAGGCGAGGCTTGATGGGGGGCTCAGGGGTCATGGTAGGCACT	95640

CR753803.4	1551	GCTTGGGTGGTCTCGGCTTCATCCTCTGGAGTTGGACAGACACGTGTGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95641	GCTTGGGTGGTCTCGGCTTCATCCTCTGGAGTTGGACAGACACGTGTGGG	95690

CR753803.4	1601	GACAGTGAGGTCCCTGGCTCCTCAGTTCAGCATAGAAAGGATGTGTCACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95691	GACAGTGAGGTCCCTGGCTCCTCAGTTCAGCATAGAAAGGATGTGTCACA	95740

CR753803.4	1651	AAACACAAAGTGCCCAAGAGCAGGACGATGCTGCCCACAGCCCCTCCAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95741	AAACACAAAGTGCCCAAGAGCAGGACGATGCTGCCCACAGCCCCTCCAGC	95790

CR753803.4	1701	ACAGCTCTTCATCCTCTCCTCTCCTGCGGCCTTTCCTATCCCTCACCCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95791	ACAGCTCTTCATCCTCTCCTCTCCTGCGGCCTTTCCTATCCCTCACCCTG	95840

CR753803.4	1751	ACCCTCCTGCCCTCAGCCCCCACCTCACCCCCACCTCCCAACACCCAGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95841	ACCCTCCTGCCCTCAGCCCCCACCTCACCCCCACCTCCCAACACCCAGGC	95890

CR753803.4	1801	CACCTCTCCCTGTCCCTCCAGCACCGCCTCTCTTTTGAGCACAGCCCCAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95891	CACCTCTCCCTGTCCCTCCAGCACCGCCTCTCTTTTGAGCACAGCCCCAC	95940

CR753803.4	1851	TCGGCCTCTGCACCCCTGGCCTCCCAGCACTGGGGTCTCTTCGCCATCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95941	TCGGCCTCTGCACCCCTGGCCTCCCAGCACTGGGGTCTCTTCGCCATCTT	95990

CR753803.4	1901	TTGTTCACTGGGCTTCTGTCTTTGCTCCGCAACAAGCTCAGCACACTCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	95991	TTGTTCACTGGGCTTCTGTCTTTGCTCCGCAACAAGCTCAGCACACTCCT	96040

CR753803.4	1951	CCCGAGGCCAGAGCCTGGGGTGTGTTCCTGGATCCAGCTCCTCACCAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753845.11	96041	CCCGAGGCCAGAGCCTGGGGTGTGTTCCTGGATCCAGCTCCTCACCAGCT	96090

Overview

Query
CR753803.4 - 104677 bps
Hit
CR753845.11 - 96090 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link