<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936239.2	1	CGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67014	CGGCCTCTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTC	67063

CR936239.2	51	AGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67064	AGGCTGGTCTCGACCTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCC	67113

CR936239.2	101	CAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGCCTGGCCTCAATTTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67114	CAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGCCTGGCCTCAATTTTT	67163

CR936239.2	151	ATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67164	ATACTTTCAGTAGAGATGAGGTTTCATCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGA	67213

CR936239.2	201	ACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCTCCTAATGTGCTGGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67214	ACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCTCGCCTTGGCCTCCTAATGTGCTGGAA	67263

CR936239.2	251	TTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTCTCTATGGGTCAGGGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67264	TTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCGCCATTCTCTATGGGTCAGGGT	67313

CR936239.2	301	GAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGATATTGTGGGCAGGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67314	GAGAGGCCTGGAAAGGGGCAGAGTAGGGTGGAGGATATTGTGGGCAGGGA	67363

CR936239.2	351	AGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAGACTGTGGAGGGGAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67364	AGCTTACAAAGTCTTCTGTTGGAAGAGCCCACCAGACTGTGGAGGGGAAG	67413

CR936239.2	401	CCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACTACCTCCCTCCCATCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67414	CCTCTCTTTGGGGCACAGGGACAGGGCCCCTCACTACCTCCCTCCCATCC	67463

CR936239.2	451	CTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATGCTTCTCCTGCCCTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67464	CTCTGGTCTGGCCCTTACTACAGCCTCCATCGATGCTTCTCCTGCCCTCT	67513

CR936239.2	501	GTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATTCTGATGCTGCTGCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67514	GTGCCCCTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATTCTGATGCTGCTGCTC	67563

CR936239.2	551	ACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAGCATCGTGCTCTGGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67564	ACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAGCATCGTGCTCTGGAG	67613

CR936239.2	601	GCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGTCCCTCCCTCCCCGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67614	GCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCAGAGGTGAGTCCCTCCCTCCCCGGG	67663

CR936239.2	651	GAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGCTAGGCTCACACCCCG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67664	GAAAGAAGAGGGCACATGGGTGGGAGGCAAAGGGCTAGGCTCACACCCCG	67713

CR936239.2	701	CCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGAGGAACACGGCTCTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67714	CCTCTGTACCCCACCTCCTCTAGGGGAGGGGGCGAGGAACACGGCTCTAA	67763

CR936239.2	751	GTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGGCTCCTTCTCCCCAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67764	GTTGTCTGCTGACTTCTCTTCTGTATCCCTGATGGCTCCTTCTCCCCAGA	67813

CR936239.2	801	TGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGGTCTATGAGAACATCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67814	TGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGGTCTATGAGAACATCC	67863

CR936239.2	851	ATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAACAGAGGCTTAAATCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67864	ATTTGGCCCGTCTTGGGTGAGGAACAGCTAGGGAACAGAGGCTTAAATCC	67913

CR936239.2	901	TGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTTGGGTTGGGGATGGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67914	TGGAGGGGACTGGGGATGGAGAGGAAACACGGGTTGGGTTGGGGATGGGC	67963

CR936239.2	951	CCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCCTTAATCTGTCTCTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	67964	CCTCGTTCCTGAGGATGTGAAAAGTAGAGGTATCCTTAATCTGTCTCTCT	68013

CR936239.2	1001	GGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAGGTGATTTTGGTGACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68014	GGAAAACCCCACAGCCCACCTGCCCACAAGCCCAGGTGATTTTGGTGACA	68063

CR936239.2	1051	TCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCCATCTGGCACCTGGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68064	TCTGCTGGGAAGTGTGACCTGCTGTCTCGCTGGCCATCTGGCACCTGGAA	68113

CR936239.2	1101	GATTCCTCGACAACCTTAGCAAGGGGGGCGGGACTGAGAGTTCGACTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68114	GATTCCTCGACAACCTTAGCAAGGGGGGCGGGACTGAGAGTTCGACTTCA	68163

CR936239.2	1151	CCATCCAGCTGGCCTCCAGCAGCCACCAAGCTGTGTATGGGGAGGGGTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68164	CCATCCAGCTGGCCTCCAGCAGCCACCAAGCTGTGTATGGGGAGGGGTGG	68213

CR936239.2	1201	GGGACTGAAGGAAAGGAGGAGCATTATTCTGTGATGTAACCTACAAAAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68214	GGGACTGAAGGAAAGGAGGAGCATTATTCTGTGATGTAACCTACAAAAAG	68263

CR936239.2	1251	GTTTGGTCTCCTGTCTTGTAGCAGCAGTGGAGGGATGGCCCTGAGCCCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68264	GTTTGGTCTCCTGTCTTGTAGCAGCAGTGGAGGGATGGCCCTGAGCCCAT	68313

CR936239.2	1301	AGTACTGTGGGGTTGAGGGGAGCCTGAGGTTGCTGGTGGGGGCAAGGAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68314	AGTACTGTGGGGTTGAGGGGAGCCTGAGGTTGCTGGTGGGGGCAAGGAGG	68363

CR936239.2	1351	ATGGGTGTGCACAGGGAGGAGACAGGAATCTGGAGACTTGAGCAATGGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68364	ATGGGTGTGCACAGGGAGGAGACAGGAATCTGGAGACTTGAGCAATGGTG	68413

CR936239.2	1401	AGGAATCCATTGCAGTGGAGCTGAAGGACAAATGGGGAAAACGGGGGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68414	AGGAATCCATTGCAGTGGAGCTGAAGGACAAATGGGGAAAACGGGGGAAG	68463

CR936239.2	1451	AGAGAGAAGGGAAGAGACTCAAGTCAGAGAAAGTGGAAAGAGATGGACAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68464	AGAGAGAAGGGAAGAGACTCAAGTCAGAGAAAGTGGAAAGAGATGGACAG	68513

CR936239.2	1501	AGGGAGAAAAATAGAAGCACAAAGTGGGAGGATGGAGGGACAGAGAAAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68514	AGGGAGAAAAATAGAAGCACAAAGTGGGAGGATGGAGGGACAGAGAAAAT	68563

CR936239.2	1551	GGAAAGCCTCAACCCATCTCTAAATTAAGCCAGACCCCCACTACCCCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68564	GGAAAGCCTCAACCCATCTCTAAATTAAGCCAGACCCCCACTACCCCATG	68613

CR936239.2	1601	TCTCATCCTCACAAAGAAGAGAGGGAACAGGCATATTTAATCAACCCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68614	TCTCATCCTCACAAAGAAGAGAGGGAACAGGCATATTTAATCAACCCCAG	68663

CR936239.2	1651	ACTTCCTCACATGCAAGGGGAGGGAACTGAGTCAGGATAGAGATGCCTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68664	ACTTCCTCACATGCAAGGGGAGGGAACTGAGTCAGGATAGAGATGCCTGT	68713

CR936239.2	1701	GCTCAGCTCCCACCCGGGGCCCCCTCCTTATCCTTCCTTATCCTAGGCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68714	GCTCAGCTCCCACCCGGGGCCCCCTCCTTATCCTTCCTTATCCTAGGCAC	68763

CR936239.2	1751	ACACTCTTCCCTGTGGCGCCTTACCGGGGCATTCAGAGCATGTGAGCAGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68764	ACACTCTTCCCTGTGGCGCCTTACCGGGGCATTCAGAGCATGTGAGCAGC	68813

CR936239.2	1801	TATCGCCACTCTGGCACTTCCTTCCTGCTGCCCTGAGGTCACACCCTATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68814	TATCGCCACTCTGGCACTTCCTTCCTGCTGCCCTGAGGTCACACCCTATT	68863

CR936239.2	1851	TCTCGGGGGCAGAGGGAGTGTCTACTCAGGCTGGCAGGCCCAGTGGGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68864	TCTCGGGGGCAGAGGGAGTGTCTACTCAGGCTGGCAGGCCCAGTGGGGGT	68913

CR936239.2	1901	ATGTTATTTATTGGGCCGGGGCCATGCTGGGATGTCTGTGAACCATGGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68914	ATGTTATTTATTGGGCCGGGGCCATGCTGGGATGTCTGTGAACCATGGGC	68963

CR936239.2	1951	GAGTCTGGGCTGGTGAAGCGAGGGAGGATATTGATGCTCCCAACTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753842.3	68964	GAGTCTGGGCTGGTGAAGCGAGGGAGGATATTGATGCTCCCAACTTGGCC	69013

Overview

Query
CR936239.2 - 43381 bps
Hit
CR753842.3 - 69013 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link