<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753309.2	1	GGCCGCAGGCCTCACAGCTGCTGCCACTGATGGGTCAGAGCCACCCTGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	5806	GGCCGCAGGCCTCACAGCTGCTGCCACTGATGGGTCAGAGCCACCCTGCA	5855

CR753309.2	51	AACTTGGGAGGCATGGGGAGGTGGCCTCTGGCTCCAGGGCAGGGCTGCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	5856	AACTTGGGAGGCATGGGGAGGTGGCCTCTGGCTCCAGGGCAGGGCTGCAG	5905

CR753309.2	101	GGGCAGGCGGGCTGTGAAGCACCCAAGGCTGCGGCACCGCGGAGAGACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	5906	GGGCAGGCGGGCTGTGAAGCACCCAAGGCTGCGGCACCGCGGAGAGACTG	5955

CR753309.2	151	GCACGGCTGAGCGCCCACAAGTGCTCCCAAGTTCACGAGTGGCTGTGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	5956	GCACGGCTGAGCGCCCACAAGTGCTCCCAAGTTCACGAGTGGCTGTGGCA	6005

CR753309.2	201	GTCCTACTGCGGCTACCTCACCTGGCGCAGCATCCCGGCTGCCTTCCCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6006	GTCCTACTGCGGCTACCTCACCTGGCGCAGCATCCCGGCTGCCTTCCCCA	6055

CR753309.2	251	CCTACTGCAGCCCCCAACCATCCCCACGGAGCTTCCCTTTGGGCAGCGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6056	CCTACTGCAGCCCCCAACCATCCCCACGGAGCTTCCCTTTGGGCAGCGCT	6105

CR753309.2	301	GCTGTCCCCCAGGCCACAGGCCTAACCTGGGAACAGCTGCTGGCATCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6106	GCTGTCCCCCAGGCCACAGGCCTAACCTGGGAACAGCTGCTGGCATCAGC	6155

CR753309.2	351	ACCCCGGCTCAAGTCGTGGGCCTGGGACCCCAGGCTCCTCATGTGCAGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6156	ACCCCGGCTCAAGTCGTGGGCCTGGGACCCCAGGCTCCTCATGTGCAGGC	6205

CR753309.2	401	ATCAGTCTGGGTCACTCCAGTGACAAAGGTAGGATCCATAGCCCCTTCGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6206	ATCAGTCTGGGTCACTCCAGTGACAAAGGTAGGATCCATAGCCCCTTCGG	6255

CR753309.2	451	GAAGCCCGAGCGAGACCAGGTGACAGGCAGGCAGATAATATGTTATTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6256	GAAGCCCGAGCGAGACCAGGTGACAGGCAGGCAGATAATATGTTATTCTA	6305

CR753309.2	501	TCCTTGGCCCACAGATTTATGGTAGAGATAGTGGATTTCTTTATTCTCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6306	TCCTTGGCCCACAGATTTATGGTAGAGATAGTGGATTTCTTTATTCTCTT	6355

CR753309.2	551	CTTTGTAAAAGCAACCATTATCTTAAGCATTATGCACCTCAGTGGGATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6356	CTTTGTAAAAGCAACCATTATCTTAAGCATTATGCACCTCAGTGGGATAA	6405

CR753309.2	601	AGGATATTTCTAAGTTTGCTATGCATTATACAATAGAAGAAATGAATGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6406	AGGATATTTCTAAGTTTGCTATGCATTATACAATAGAAGAAATGAATGAA	6455

CR753309.2	651	GACACATCACTGGAAGACTTGCAGAAAATGATGGTTGTGGCTCTTTTATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6456	GACACATCACTGGAAGACTTGCAGAAAATGATGGTTGTGGCTCTTTTATA	6505

CR753309.2	701	CAGATTATTAATTTGTTTCTATGAGATAATTTGCATTTGGGGAGCAGGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6506	CAGATTATTAATTTGTTTCTATGAGATAATTTGCATTTGGGGAGCAGGTG	6555

CR753309.2	751	GAGCTACCCCAGGGAAGTTCCTGCTGGGCCTTTGAGTTGAGACATGTGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6556	GAGCTACCCCAGGGAAGTTCCTGCTGGGCCTTTGAGTTGAGACATGTGAT	6605

CR753309.2	801	ACATTAGTGCTTATTGCACCAAGTCAGGTTTTAGTGATGCCTTCCTCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6606	ACATTAGTGCTTATTGCACCAAGTCAGGTTTTAGTGATGCCTTCCTCAAA	6655

CR753309.2	851	TGTTAGCATTACAACGAGCTTTGATCAAGAATTTTTTGATTGCTTCTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6656	TGTTAGCATTACAACGAGCTTTGATCAAGAATTTTTTGATTGCTTCTTTT	6705

CR753309.2	901	TTTCCCTGCTTATATCACACTGCTGTTTTTTCAGCATAATTGAACAGCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6706	TTTCCCTGCTTATATCACACTGCTGTTTTTTCAGCATAATTGAACAGCCT	6755

CR753309.2	951	ATGACACTGTAGCAGGAACCATTGTGGTAAAAAGAAATGGGGTCAGATGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6756	ATGACACTGTAGCAGGAACCATTGTGGTAAAAAGAAATGGGGTCAGATGA	6805

CR753309.2	1001	TGCCCCCCAAAGCCCTGATTTCCACATGCTATAATAACGAGACTAAATTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6806	TGCCCCCCAAAGCCCTGATTTCCACATGCTATAATAACGAGACTAAATTA	6855

CR753309.2	1051	TGTATCAAGGCTATCAGTATCTCTAGGTTACACTAATTGATGATTTAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6856	TGTATCAAGGCTATCAGTATCTCTAGGTTACACTAATTGATGATTTAGAA	6905

CR753309.2	1101	ATTAAAGCAGTCACTCTAGTGTGATGCAGGTGACTACTCTGAAAGTATCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6906	ATTAAAGCAGTCACTCTAGTGTGATGCAGGTGACTACTCTGAAAGTATCG	6955

CR753309.2	1151	TTTTTACTTGAATGCCAAAGAATTTTTCCAGAAGAAAAACCTATTAAATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	6956	TTTTTACTTGAATGCCAAAGAATTTTTCCAGAAGAAAAACCTATTAAATT	7005

CR753309.2	1201	CAAGTATTAAAATTTTTAGATCAAAAAGGCAAATGATTATATAAACAATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7006	CAAGTATTAAAATTTTTAGATCAAAAAGGCAAATGATTATATAAACAATG	7055

CR753309.2	1251	GACAATATATACTTTCTTAAGATCTAAGAATTTGCTGAAAGCATTTTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7056	GACAATATATACTTTCTTAAGATCTAAGAATTTGCTGAAAGCATTTTCAG	7105

CR753309.2	1301	CTTTGAAATCTCCAAATGAAACTTTAAAATTTATTTTGGTTTATCCCAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7106	CTTTGAAATCTCCAAATGAAACTTTAAAATTTATTTTGGTTTATCCCAAA	7155

CR753309.2	1351	ATAATGGAAAATATCCAGTTGTGTTTTGTAAACACCTATGTAACTCATCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7156	ATAATGGAAAATATCCAGTTGTGTTTTGTAAACACCTATGTAACTCATCT	7205

CR753309.2	1401	TTTAGTTCACACTTCCTGGGGAGCCACCAAAGAAGGTCCCCACGGGAGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7206	TTTAGTTCACACTTCCTGGGGAGCCACCAAAGAAGGTCCCCACGGGAGTT	7255

CR753309.2	1451	AGGGGACCCTTACCCTCAGGAACAGTTGGTCTATTACTTGGAAGGTCTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7256	AGGGGACCCTTACCCTCAGGAACAGTTGGTCTATTACTTGGAAGGTCTAG	7305

CR753309.2	1501	TCTAAATTTAAAAGGTGTTACTGTACATACGAGAATAATTGACTCTGATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7306	TCTAAATTTAAAAGGTGTTACTGTACATACGAGAATAATTGACTCTGATT	7355

CR753309.2	1551	ATACTGGGGAGATTCAATTAGTTATTAGTTCCTTGACTCCGTGGTCTGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7356	ATACTGGGGAGATTCAATTAGTTATTAGTTCCTTGACTCCGTGGTCTGCC	7405

CR753309.2	1601	TCCCCAGGAGAAAGAATTGCTCACTTGTTGCTTTTACCTTATATAAAACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7406	TCCCCAGGAGAAAGAATTGCTCACTTGTTGCTTTTACCTTATATAAAACT	7455

CR753309.2	1651	AGGAAGCAGCACAGTGAAAAGAACAGGAGGCTTTGGTAACACTAATCCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7456	AGGAAGCAGCACAGTGAAAAGAACAGGAGGCTTTGGTAACACTAATCCAG	7505

CR753309.2	1701	CAGGAAAGGCTGTATATTGGGTTAATCAAGTGTCTGGCAAAAGACCTATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7506	CAGGAAAGGCTGTATATTGGGTTAATCAAGTGTCTGGCAAAAGACCTATT	7555

CR753309.2	1751	TGCACAGTAACTATACAGGGAAAAGATTTTGAAGGACTAGTAGACACTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7556	TGCACAGTAACTATACAGGGAAAAGATTTTGAAGGACTAGTAGACACTGG	7605

CR753309.2	1801	AGCTGATGTCTCTATTATTGCTATAAATCAATGGCCTGGCTCTGGCCTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7606	AGCTGATGTCTCTATTATTGCTATAAATCAATGGCCTGGCTCTGGCCTAA	7655

CR753309.2	1851	GCAAAAGGCATCCATTGGTATTGTTGGAGTAGGAGCTGCCTCAGAAGTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7656	GCAAAAGGCATCCATTGGTATTGTTGGAGTAGGAGCTGCCTCAGAAGTTT	7705

CR753309.2	1901	TTCAAAGTTCCTTGATTTTACCATGTCAAGGACCAGATGGTCAGGAAGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7706	TTCAAAGTTCCTTGATTTTACCATGTCAAGGACCAGATGGTCAGGAAGAG	7755

CR753309.2	1951	ACAATTCAGCCTATCGTAATACCTATTCCTGTTAATCTATGGGGTAGAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753841.3	7756	ACAATTCAGCCTATCGTAATACCTATTCCTGTTAATCTATGGGGTAGAGA	7805

Overview

Query
CR753309.2 - 107898 bps
Hit
CR753841.3 - 7805 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link