<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR388229.14	1	GGCCACTCCCCCTACGCCTCGCTCCCGGCCCCGCCTCTGCCCCTGACCGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79419	GGCCACTCCCCCTACGCCTCGCTCCCGGCCCCGCCTCTGCCCCTGACCGC	79468

CR388229.14	51	GCCTGCGCAAGGCGGGCGCCCTAAAGTCCTATTTCACTCTGTTGGGAGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79469	GCCTGCGCAAGGCGGGCGCCCTAAAGTCCTATTTCACTCTGTTGGGAGGA	79518

CR388229.14	101	GGGGGAAAGGTGTACGCAGGCGCAGTGGCGTCTAAATTTGGGCCCACTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79519	GGGGGAAAGGTGTACGCAGGCGCAGTGGCGTCTAAATTTGGGCCCACTAA	79568

CR388229.14	151	ATGCGTCGGAGCATCTCCGCGCCCAGGCGGCTCCTCCTCACTGCGGCAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79569	ATGCGTCGGAGCATCTCCGCGCCCAGGCGGCTCCTCCTCACTGCGGCAAC	79618

CR388229.14	201	CCGGGAAAACTTGTGAACTAATCAGAAAAAGTGGAAGGCGGGAGATCTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79619	CCGGGAAAACTTGTGAACTAATCAGAAAAAGTGGAAGGCGGGAGATCTTG	79668

CR388229.14	251	GGGCGCTGTCCAATGGCGCGGAAGAGAACAAATGAGCTGGCCAATCGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79669	GGGCGCTGTCCAATGGCGCGGAAGAGAACAAATGAGCTGGCCAATCGGGA	79718

CR388229.14	301	ACGGCACGGGGGCGGGCTCGCTCGGCGCGAAGTTCGGGCCCGGGAATTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79719	ACGGCACGGGGGCGGGCTCGCTCGGCGCGAAGTTCGGGCCCGGGAATTCC	79768

CR388229.14	351	GAAGGAGGGGTAGGCGCTGCCCGCGCGCAGAGGCCGCGCCCCTCCTGGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79769	GAAGGAGGGGTAGGCGCTGCCCGCGCGCAGAGGCCGCGCCCCTCCTGGCC	79818

CR388229.14	401	CCGGCTTCTTGGCTGTCAAACAGATGCAGCAACGTCGGCTCCTGCCGAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79819	CCGGCTTCTTGGCTGTCAAACAGATGCAGCAACGTCGGCTCCTGCCGAGG	79868

CR388229.14	451	AGCCCAAGGGGTCCCGGGATCCGCCGCACAGGCTGGCACTGCTTGAAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79869	AGCCCAAGGGGTCCCGGGATCCGCCGCACAGGCTGGCACTGCTTGAAGAG	79918

CR388229.14	501	GAGGCTACTCGGAGACTGCGCCGCGCGGGTAGATCCGAAACGGGGCTGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79919	GAGGCTACTCGGAGACTGCGCCGCGCGGGTAGATCCGAAACGGGGCTGGG	79968

CR388229.14	551	GCGGAGTGGGAAAAGGCCGGGTATGCCTTGCATGATCGCGGGGAGCTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	79969	GCGGAGTGGGAAAAGGCCGGGTATGCCTTGCATGATCGCGGGGAGCTCCT	80018

CR388229.14	601	TCCTGTTTTTATCCCACCTAGAGAAGCCGGGAAGTAGGGGTTTAGGTCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80019	TCCTGTTTTTATCCCACCTAGAGAAGCCGGGAAGTAGGGGTTTAGGTCCA	80068

CR388229.14	651	ATTTGTTGGAGTACTTAAGGACTCGTTTGCACTTTCTTTTGGGGGATGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80069	ATTTGTTGGAGTACTTAAGGACTCGTTTGCACTTTCTTTTGGGGGATGAC	80118

CR388229.14	701	AGTGGATTCATTGCCCTCGGAGGTTCAACCAGTTATGAGTGAGGGATTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80119	AGTGGATTCATTGCCCTCGGAGGTTCAACCAGTTATGAGTGAGGGATTGG	80168

CR388229.14	751	CCAGAAGATCGGGGCGCAGGCAAGCAGGAGTGCTCTATTAGGATAAGCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80169	CCAGAAGATCGGGGCGCAGGCAAGCAGGAGTGCTCTATTAGGATAAGCAA	80218

CR388229.14	801	GTTTGACAGGAAGAAGCTGCTCTTCTCCGAATTACACAGAGGTGATGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80219	GTTTGACAGGAAGAAGCTGCTCTTCTCCGAATTACACAGAGGTGATGTGT	80268

CR388229.14	851	TCGTATTGCACGTAGACGTGTGTATAACAGGACCTCCTTCCCCGCGCCCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80269	TCGTATTGCACGTAGACGTGTGTATAACAGGACCTCCTTCCCCGCGCCCC	80318

CR388229.14	901	GCCACCCCGACACACACAGGAGCTGCCTAAAGTATCCTTGCCTTGCAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80319	GCCACCCCGACACACACAGGAGCTGCCTAAAGTATCCTTGCCTTGCAGAT	80368

CR388229.14	951	TGGAGGCTCCCCAAATATTTTGTGATCTGAGGATCCAGCTCAAGTGAGGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80369	TGGAGGCTCCCCAAATATTTTGTGATCTGAGGATCCAGCTCAAGTGAGGT	80418

CR388229.14	1001	GCCATAGGACGTGTTCCTGAGTTTGCATTGCACGGAGACCTTCCTGGAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80419	GCCATAGGACGTGTTCCTGAGTTTGCATTGCACGGAGACCTTCCTGGAAT	80468

CR388229.14	1051	TTTTCATTTGCAAGTCGGCTTAACCAATTTTGCATTGAGTCCTAGGCTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80469	TTTTCATTTGCAAGTCGGCTTAACCAATTTTGCATTGAGTCCTAGGCTGC	80518

CR388229.14	1101	TTGCACTCTGAATTTGGGCTATTCAGGTAGTGTGCTCAAAGTTGAAACCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80519	TTGCACTCTGAATTTGGGCTATTCAGGTAGTGTGCTCAAAGTTGAAACCG	80568

CR388229.14	1151	CATACAGCACAACTCAAGTTTGCATCAGACTGGGAAGCGAACTTAAGCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80569	CATACAGCACAACTCAAGTTTGCATCAGACTGGGAAGCGAACTTAAGCCA	80618

CR388229.14	1201	GCGGTGCGTGGCCCAGGAGTGGGAAAGGAAATGGATGCCTGAAGTGGAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80619	GCGGTGCGTGGCCCAGGAGTGGGAAAGGAAATGGATGCCTGAAGTGGAAG	80668

CR388229.14	1251	AGGTGGTGCAGAGGGGGCACCGCCCATGCTGCCCTGCTTCCAACTGCTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80669	AGGTGGTGCAGAGGGGGCACCGCCCATGCTGCCCTGCTTCCAACTGCTGC	80718

CR388229.14	1301	GCATAGGGGGCGGCAGGGGCGGTGATCTCTACACCTTCCACCCCCCCGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80719	GCATAGGGGGCGGCAGGGGCGGTGATCTCTACACCTTCCACCCCCCCGCC	80768

CR388229.14	1351	GGGGCTGGCTGCACCTATCGCTTGGGCCACAGGGCCGACCTGTGTGATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80769	GGGGCTGGCTGCACCTATCGCTTGGGCCACAGGGCCGACCTGTGTGATGT	80818

CR388229.14	1401	GGCCCTGCGGCCCCAGCAGGAGCCTGGCCTCATCTCTGGGATCCACGCCG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80819	GGCCCTGCGGCCCCAGCAGGAGCCTGGCCTCATCTCTGGGATCCACGCCG	80868

CR388229.14	1451	AACTGCATGCCGAGCCCCGGGGTGATGACTGGAGGGTCAGCCTGGAAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80869	AACTGCATGCCGAGCCCCGGGGTGATGACTGGAGGGTCAGCCTGGAAGAC	80918

CR388229.14	1501	CACAGCAGCCAAGGTGAGCATTAAGCAGGGCAGCTTTGCCCCTGGGTGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80919	CACAGCAGCCAAGGTGAGCATTAAGCAGGGCAGCTTTGCCCCTGGGTGGT	80968

CR388229.14	1551	TGAAGCGCCAGGCTGGAATGAGTAAGGTCTCCACAAGACCTTGCTGCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	80969	TGAAGCGCCAGGCTGGAATGAGTAAGGTCTCCACAAGACCTTGCTGCCTG	81018

CR388229.14	1601	CCTCCCATACTCCCATCAGATTGGATGGATAGTCGTGGTCCAGACCTTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81019	CCTCCCATACTCCCATCAGATTGGATGGATAGTCGTGGTCCAGACCTTCA	81068

CR388229.14	1651	TCTTCCCACCAGAAGTGTGCACAGTCAGAAGCTCTCTGCCAGACTGACCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81069	TCTTCCCACCAGAAGTGTGCACAGTCAGAAGCTCTCTGCCAGACTGACCC	81118

CR388229.14	1701	TTTTTGGTCCCGTTTAGCTCATACAGGACCTGGGATATCATCAGAAAGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81119	TTTTTGGTCCCGTTTAGCTCATACAGGACCTGGGATATCATCAGAAAGAT	81168

CR388229.14	1751	ATCACAGTGGGGATGTTCTGAGGCCACTAGAGGCCAAGTTTAGACTTGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81169	ATCACAGTGGGGATGTTCTGAGGCCACTAGAGGCCAAGTTTAGACTTGAT	81218

CR388229.14	1801	TCAGTTTCCAGCTTTGCTGAGGCACTCTGTTCCTGGGTTAGGGCAGTTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81219	TCAGTTTCCAGCTTTGCTGAGGCACTCTGTTCCTGGGTTAGGGCAGTTCT	81268

CR388229.14	1851	ATGTTGAATAATGTTTTTAATAATCTGGGCATGTCTTTCTCCGTGACTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81269	ATGTTGAATAATGTTTTTAATAATCTGGGCATGTCTTTCTCCGTGACTTG	81318

CR388229.14	1901	AGGCAGTTAGCCTCAGAAAGCCTAGATTCACATTTGAGTTTTGCCACTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81319	AGGCAGTTAGCCTCAGAAAGCCTAGATTCACATTTGAGTTTTGCCACTGC	81368

CR388229.14	1951	CTCTTGGTAAAGTCAGCTGTAGGAGTGTTATGGTTATTAGACTATAGTAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753819.5	81369	CTCTTGGTAAAGTCAGCTGTAGGAGTGTTATGGTTATTAGACTATAGTAG	81418

Overview

Query
CR388229.14 - 121659 bps
Hit
CR753819.5 - 81418 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link