<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759769.4	1	GGCCGCGCTGGAAGGGCCCTCGAATGCCATTCACAGGAGCAGCCCAGGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	35834	GGCCGCGCTGGAAGGGCCCTCGAATGCCATTCACAGGAGCAGCCCAGGAA	35883

CR759769.4	51	CCCAGGGGCCTCAGAAAGACGGGTTTGTCCGAAAAGTGAGAGGAGACGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	35884	CCCAGGGGCCTCAGAAAGACGGGTTTGTCCGAAAAGTGAGAGGAGACGGA	35933

CR759769.4	101	GGAGAGGAGAGGAGAGAAAGTGCAGGACAAGACCAGAAAATGCAGGGGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	35934	GGAGAGGAGAGGAGAGAAAGTGCAGGACAAGACCAGAAAATGCAGGGGGC	35983

CR759769.4	151	GGGTGATGAGCGATCCCGAGGAGGACTGAAAAGAGACGTGGAAGCAGGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	35984	GGGTGATGAGCGATCCCGAGGAGGACTGAAAAGAGACGTGGAAGCAGGGT	36033

CR759769.4	201	TGAGGTGTGGCGGGAACGGGCCGCGTCCACTCCCCGCACCCCCGACAGCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36034	TGAGGTGTGGCGGGAACGGGCCGCGTCCACTCCCCGCACCCCCGACAGCG	36083

CR759769.4	251	CACCTGAGCCCCGCCTCGGTCGCACAGCGCTCGCCGCTACCCACCCGGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36084	CACCTGAGCCCCGCCTCGGTCGCACAGCGCTCGCCGCTACCCACCCGGAC	36133

CR759769.4	301	CCCCAGAAACGCCCCGCCGCTGCCGCTCCGCCGAGGACCGCCAGGAACCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36134	CCCCAGAAACGCCCCGCCGCTGCCGCTCCGCCGAGGACCGCCAGGAACCC	36183

CR759769.4	351	CACTTACCAGCAGCAGCTCCCTGGGGTGCAAAAAGGGCAGTGCGGATCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36184	CACTTACCAGCAGCAGCTCCCTGGGGTGCAAAAAGGGCAGTGCGGATCAG	36233

CR759769.4	401	GAACAGCAGGACTAGGCTCATCTCCATGGCCCAGACTTTGCTTTCCTCGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36234	GAACAGCAGGACTAGGCTCATCTCCATGGCCCAGACTTTGCTTTCCTCGC	36283

CR759769.4	451	AGTGGCTCAAGCGGCTGCCAACCCAGCGGAGCCGCGAAGGCCCACCAGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36284	AGTGGCTCAAGCGGCTGCCAACCCAGCGGAGCCGCGAAGGCCCACCAGAA	36333

CR759769.4	501	ATTTCCTGTCACCTGGCCCCACCCCAGTGACCGCTCACCCAATGAAAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36334	ATTTCCTGTCACCTGGCCCCACCCCAGTGACCGCTCACCCAATGAAAACT	36383

CR759769.4	551	GGCGCCCGCAGCTTAGGGCCAATCACGAGCTTGGAGGGCGGGGCCACACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36384	GGCGCCCGCAGCTTAGGGCCAATCACGAGCTTGGAGGGCGGGGCCACACT	36433

CR759769.4	601	CAGAAGGGAACGTTCCAGCGGTCAGGAGACCTGGAGAACTTTGGCTGGCG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36434	CAGAAGGGAACGTTCCAGCGGTCAGGAGACCTGGAGAACTTTGGCTGGCG	36483

CR759769.4	651	GGACCTGGAGCCCAGAAAAGGGGGAGCGCGCGGAAGCGCCGCCAAATGCG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36484	GGACCTGGAGCCCAGAAAAGGGGGAGCGCGCGGAAGCGCCGCCAAATGCG	36533

CR759769.4	701	GGGACTGGCTCCGAGCAGCTGAGAGTACAGCCCCAACCGCATGAGCACGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36534	GGGACTGGCTCCGAGCAGCTGAGAGTACAGCCCCAACCGCATGAGCACGA	36583

CR759769.4	751	CCTGGGCCCTGCCGCCCTCCCTGTATTGCGACCACCCCATCCCCGCACCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36584	CCTGGGCCCTGCCGCCCTCCCTGTATTGCGACCACCCCATCCCCGCACCC	36633

CR759769.4	801	CCACCCCTAGGATAGCGTGCCTCACCAAGACCGTTTCGCCAGCCACCCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36634	CCACCCCTAGGATAGCGTGCCTCACCAAGACCGTTTCGCCAGCCACCCCA	36683

CR759769.4	851	TCAAGCTGACTGTCATTCGCTTGTTCTTTCCAGGACACACTTACAGAAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36684	TCAAGCTGACTGTCATTCGCTTGTTCTTTCCAGGACACACTTACAGAAGA	36733

CR759769.4	901	GACGAGGCCTGGTTATTCTTCCAACACACTCCCCTCAGCCGCGCACAGCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36734	GACGAGGCCTGGTTATTCTTCCAACACACTCCCCTCAGCCGCGCACAGCG	36783

CR759769.4	951	TTACTGGCTATGTGGCCAGTGACCAGATTTGCAGACCTGTTTCCAGACCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36784	TTACTGGCTATGTGGCCAGTGACCAGATTTGCAGACCTGTTTCCAGACCT	36833

CR759769.4	1001	CAGCTACCTCTGTTTCTGAAGCACCTGCCCCAGCTGATCCGCTAAGACGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36834	CAGCTACCTCTGTTTCTGAAGCACCTGCCCCAGCTGATCCGCTAAGACGA	36883

CR759769.4	1051	CAAATCTCTTAGACGTTTCAGCTTTACAATCTCCTTCTCCTCCCTTTTAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36884	CAAATCTCTTAGACGTTTCAGCTTTACAATCTCCTTCTCCTCCCTTTTAC	36933

CR759769.4	1101	TCAAAGCTAGGTCCCCTTTCTTATGGTCACTTCCTGTAAGTGTGTGAGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36934	TCAAAGCTAGGTCCCCTTTCTTATGGTCACTTCCTGTAAGTGTGTGAGGT	36983

CR759769.4	1151	CTCCCGGGGCTGCCTCTCTATTCAGCCCCTGGGTGATCAAAAGGCCAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	36984	CTCCCGGGGCTGCCTCTCTATTCAGCCCCTGGGTGATCAAAAGGCCAAGG	37033

CR759769.4	1201	AGGCAGCTTGCCAGTGTCCACTCCAACACCAAGCTCTCCCCAGACTCCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37034	AGGCAGCTTGCCAGTGTCCACTCCAACACCAAGCTCTCCCCAGACTCCCT	37083

CR759769.4	1251	TTTCCAGCCTGCTTTAGGACATCTGTACCTCTGAGACCATAGTAGCTTCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37084	TTTCCAGCCTGCTTTAGGACATCTGTACCTCTGAGACCATAGTAGCTTCC	37133

CR759769.4	1301	AATGTGACAGGTCTACAAGGACACTCTACACGTCTCGCATGACATCATCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37134	AATGTGACAGGTCTACAAGGACACTCTACACGTCTCGCATGACATCATCC	37183

CR759769.4	1351	TCTCTTCCTCCCCTGTTTCTCTTTCCGTGGTGCCTTCTGATTTCCCCCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37184	TCTCTTCCTCCCCTGTTTCTCTTTCCGTGGTGCCTTCTGATTTCCCCCTT	37233

CR759769.4	1401	TTCCTTCTCAAGTACTCAAAGCTCCTCCAACCCTATTTTGATCCCACAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37234	TTCCTTCTCAAGTACTCAAAGCTCCTCCAACCCTATTTTGATCCCACAGC	37283

CR759769.4	1451	CACTACTTTAGTCTCGGCTTTCAGCCTAGATCACTGCACAGGATTCAGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37284	CACTACTTTAGTCTCGGCTTTCAGCCTAGATCACTGCACAGGATTCAGCC	37333

CR759769.4	1501	TAGATTACTGTACAGGCTTCCTAAACACTGTGACTGTCCCAGCTATAGTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37334	TAGATTACTGTACAGGCTTCCTAAACACTGTGACTGTCCCAGCTATAGTC	37383

CR759769.4	1551	AGAGTGCTCTAAGACCCCCACAGCACCCCATGTGCTGAATGTCACACGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37384	AGAGTGCTCTAAGACCCCCACAGCACCCCATGTGCTGAATGTCACACGTG	37433

CR759769.4	1601	AGGTCTCTACCATGGAAGCCACAGCTGCCACAACCTCCTGTCTGTCACCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37434	AGGTCTCTACCATGGAAGCCACAGCTGCCACAACCTCCTGTCTGTCACCA	37483

CR759769.4	1651	CCCCCATTTCTCTGGTGACATCCCTCTTTCCAGTGTTGCAGTAAAAGTGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37484	CCCCCATTTCTCTGGTGACATCCCTCTTTCCAGTGTTGCAGTAAAAGTGG	37533

CR759769.4	1701	GCTCCCCAATCTCCTTGCCCTGTCCCACCGGGATGCCACTGCCTAAGCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37534	GCTCCCCAATCTCCTTGCCCTGTCCCACCGGGATGCCACTGCCTAAGCAG	37583

CR759769.4	1751	TCTCCTGCTTCCAGATTACTGTCACTTCTGCCTCTGAGCCCATTAGACCG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37584	TCTCCTGCTTCCAGATTACTGTCACTTCTGCCTCTGAGCCCATTAGACCG	37633

CR759769.4	1801	TGTCACATCCTTAAATCTTCCCAATTAGGCTGGTCAGAGTGTAGCGGTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37634	TGTCACATCCTTAAATCTTCCCAATTAGGCTGGTCAGAGTGTAGCGGTGT	37683

CR759769.4	1851	TTACAACTAATTGATCACAACCAATTACAGATTTCTTTTTTCCTTCTCCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37684	TTACAACTAATTGATCACAACCAATTACAGATTTCTTTTTTCCTTCTCCG	37733

CR759769.4	1901	CTCGCACTGCTTTACTTGACTAGCCTTTAAAAAAAGAAAATCTTCCCAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37734	CTCGCACTGCTTTACTTGACTAGCCTTTAAAAAAAGAAAATCTTCCCAAT	37783

CR759769.4	1951	TAGATAATAGCGACTGTGGCACGATGTTGTGATTATGCTAAAAGCCACTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753818.5	37784	TAGATAATAGCGACTGTGGCACGATGTTGTGATTATGCTAAAAGCCACTG	37833

Overview

Query
CR759769.4 - 88412 bps
Hit
CR753818.5 - 37833 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link