<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759837.3	1	ACTGAGCCCATTTTAATCCTTCTGCTCTGTCCCAATTTTCCATATCAAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76473	ACTGAGCCCATTTTAATCCTTCTGCTCTGTCCCAATTTTCCATATCAAGA	76522

CR759837.3	51	GTGCCTGTCTGTGGGAACCATGGGTTATACATAATAACCTCCTGCAGCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76523	GTGCCTGTCTGTGGGAACCATGGGTTATACATAATAACCTCCTGCAGCAT	76572

CR759837.3	101	TGTAGTTAATGTCTGAGATCTAACCTGAGCACCAGATTATTTCAACAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76573	TGTAGTTAATGTCTGAGATCTAACCTGAGCACCAGATTATTTCAACAAAA	76622

CR759837.3	151	CTTTAAGCAACTGCTCATAATGTTTTTCTTCAATAGACAAATTCTGCCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76623	CTTTAAGCAACTGCTCATAATGTTTTTCTTCAATAGACAAATTCTGCCTC	76672

CR759837.3	201	ACGTTACCCTGATTTAGAAAACTTCCCGTTCCCAATACTTCTTTAGAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76673	ACGTTACCCTGATTTAGAAAACTTCCCGTTCCCAATACTTCTTTAGAGCA	76722

CR759837.3	251	CTGACCTTATATTGCTCCCAGTACCTCTTTAGGGCACTGACCTTATATCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76723	CTGACCTTATATTGCTCCCAGTACCTCTTTAGGGCACTGACCTTATATCA	76772

CR759837.3	301	GCTGCCAGCAGACTCATCTCGGGGTCCCCATTCGTCTTGTCAATTTCAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76773	GCTGCCAGCAGACTCATCTCGGGGTCCCCATTCGTCTTGTCAATTTCAGT	76822

CR759837.3	351	TCCTCTGCTCCACCAGATCTTCTTTGTTCACATTCTCATGTCCCTGTGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76823	TCCTCTGCTCCACCAGATCTTCTTTGTTCACATTCTCATGTCCCTGTGTT	76872

CR759837.3	401	TAGAAACCACTACGGTGTCGCCCTGTCGCTGTTTGAACATCACTATGCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76873	TAGAAACCACTACGGTGTCGCCCTGTCGCTGTTTGAACATCACTATGCCA	76922

CR759837.3	451	TGGACCCTGTTGGACTGAACAAAGGAGGATGAACATGGAAATAAAGACAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76923	TGGACCCTGTTGGACTGAACAAAGGAGGATGAACATGGAAATAAAGACAA	76972

CR759837.3	501	AAGAATATATTTGGAAGAAGGGGTCAGGGGCACCTTGCTCTTTGTGAACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	76973	AAGAATATATTTGGAAGAAGGGGTCAGGGGCACCTTGCTCTTTGTGAACA	77022

CR759837.3	551	AAGGCCCTGAGCCTGGAGCTTCCTTCGTATTTACTGAGAAGAGATAGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77023	AAGGCCCTGAGCCTGGAGCTTCCTTCGTATTTACTGAGAAGAGATAGCAA	77072

CR759837.3	601	GGAGGGGGTCGTTGTCGGTCTGCTGCTTGCTCCAGAGCAGCCTTGCAAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77073	GGAGGGGGTCGTTGTCGGTCTGCTGCTTGCTCCAGAGCAGCCTTGCAAGA	77122

CR759837.3	651	CTACATTCCTTGAACAATAGATTCTAGATGTCCCAGTAGATAACCTGAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77123	CTACATTCCTTGAACAATAGATTCTAGATGTCCCAGTAGATAACCTGAAG	77172

CR759837.3	701	GAGCTCTGCACCAGGGAGTGATTGCCCTCAGCAAACCTTCTGGTGGCCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77173	GAGCTCTGCACCAGGGAGTGATTGCCCTCAGCAAACCTTCTGGTGGCCAG	77222

CR759837.3	751	CACAGAGGAGAGTTTGCCCCTGCTCTGTATTCATGATAAACAGTTTGCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77223	CACAGAGGAGAGTTTGCCCCTGCTCTGTATTCATGATAAACAGTTTGCTG	77272

CR759837.3	801	TTTGATCATATTGCCTCAGTGGAAATTCTGAATTGGTCATGATTCTCCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77273	TTTGATCATATTGCCTCAGTGGAAATTCTGAATTGGTCATGATTCTCCAG	77322

CR759837.3	851	CCTCCGGCTCTCTACACTGAATGGATTCAACAAGAAAGTGGTTGAATTTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77323	CCTCCGGCTCTCTACACTGAATGGATTCAACAAGAAAGTGGTTGAATTTA	77372

CR759837.3	901	TGCAACTGTCTAGTTATTTATAATGAAACAAGCAAAAATTAACCATAAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77373	TGCAACTGTCTAGTTATTTATAATGAAACAAGCAAAAATTAACCATAAAG	77422

CR759837.3	951	AAGTGAATTGGGTGGTGATTGTATAAAAGATGTGAGTCTAGGCCAGGCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77423	AAGTGAATTGGGTGGTGATTGTATAAAAGATGTGAGTCTAGGCCAGGCAT	77472

CR759837.3	1001	GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77473	GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGA	77522

CR759837.3	1051	TCACGAGGTCAGAAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAAACCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77523	TCACGAGGTCAGAAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAAACCAG	77572

CR759837.3	1101	TCTCTACTAAAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGTCGGGCACCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77573	TCTCTACTAAAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGCAGTGTCGGGCACCT	77622

CR759837.3	1151	GTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77623	GTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAG	77672

CR759837.3	1201	AGGCGGAGCTGGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77673	AGGCGGAGCTGGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	77722

CR759837.3	1251	TGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77723	TGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC	77772

CR759837.3	1301	AAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAGATGTGAGTCTAGACTTTTCAGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77773	AAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAGATGTGAGTCTAGACTTTTCAGAAA	77822

CR759837.3	1351	GAGCACAGTGTGAACCAGTGCTCTCAACCTCAGCACTGTTGACATTTTGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77823	GAGCACAGTGTGAACCAGTGCTCTCAACCTCAGCACTGTTGACATTTTGG	77872

CR759837.3	1401	ACCAGGTAATTCTTCGTTGGTGATGGAGGCTGTTGTGTACATTGCAGGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77873	ACCAGGTAATTCTTCGTTGGTGATGGAGGCTGTTGTGTACATTGCAGGTT	77922

CR759837.3	1451	CTCTAGAAGTGTCCCTGGCTTCTACTCATTAAATATCAGAAGAAATCCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77923	CTCTAGAAGTGTCCCTGGCTTCTACTCATTAAATATCAGAAGAAATCCCT	77972

CR759837.3	1501	GTTGTGACAACCAAAAATTCCTCCAAACATTGCCACATGTTCCCCAAGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	77973	GTTGTGACAACCAAAAATTCCTCCAAACATTGCCACATGTTCCCCAAGGG	78022

CR759837.3	1551	TGATGGGAGGGAAGTGAGGGGTGGTGAACTATCCCTGGGTAAGAACCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78023	TGATGGGAGGGAAGTGAGGGGTGGTGAACTATCCCTGGGTAAGAACCATG	78072

CR759837.3	1601	GGTGTGAACCATCTGAAAAAATCTGTGTTGAACAAGCCACTATCAGTTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78073	GGTGTGAACCATCTGAAAAAATCTGTGTTGAACAAGCCACTATCAGTTAT	78122

CR759837.3	1651	GGAGCAGCTGAGAATTACTTTGAAAAACATCTGTTGAAAATCTTGGTCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78123	GGAGCAGCTGAGAATTACTTTGAAAAACATCTGTTGAAAATCTTGGTCCT	78172

CR759837.3	1701	ACATAAAATGAAAATGTTGTAGAATTCTGGTCCCAATACAGTGCTATGTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78173	ACATAAAATGAAAATGTTGTAGAATTCTGGTCCCAATACAGTGCTATGTT	78222

CR759837.3	1751	TCCAGAAAATGAACTTGTGGAGAACCAAGATTTACTGATTTCCTTGCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78223	TCCAGAAAATGAACTTGTGGAGAACCAAGATTTACTGATTTCCTTGCCTT	78272

CR759837.3	1801	TATAATCAGTCATCAAATCATATCATTTATCTTTCATAGCATCTTCTTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78273	TATAATCAGTCATCAAATCATATCATTTATCTTTCATAGCATCTTCTTTC	78322

CR759837.3	1851	TTAATTTCTGTGCCACTGGTCCACTAATTATCTGTAGTAATGAATCACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78323	TTAATTTCTGTGCCACTGGTCCACTAATTATCTGTAGTAATGAATCACAA	78372

CR759837.3	1901	CCAGAGCCATTTGATTCCCATTTAATGCCCCAACTAACTCATTTCTCTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78373	CCAGAGCCATTTGATTCCCATTTAATGCCCCAACTAACTCATTTCTCTCA	78422

CR759837.3	1951	GTCTCCCACTCCCAACAATACTAACAGGCATCAAATTTCCAGCCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753634.3	78423	GTCTCCCACTCCCAACAATACTAACAGGCATCAAATTTCCAGCCTTGGCC	78472

Overview

Query
CR759837.3 - 11802 bps
Hit
CR753634.3 - 78472 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link