<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927180.9	1	GGCCACCCAGTTTTGTGCTTGAAACCCAGGGCCCTGGTGGGGTAGTCACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16281	GGCCACCCAGTTTTGTGCTTGAAACCCAGGGCCCTGGTGGGGTAGTCACT	16330

BX927180.9	51	GGAGGGAATCTCCTGGTTTGTGGGTTTCGAAGACTGTGGGACAAGTGCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16331	GGAGGGAATCTCCTGGTTTGTGGGTTTCGAAGACTGTGGGACAAGTGCAG	16380

BX927180.9	101	TATCTGTGCTGGAGTTCCTCAGGCTCAGACCCTCATGGCTTCCCTTGGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16381	TATCTGTGCTGGAGTTCCTCAGGCTCAGACCCTCATGGCTTCCCTTGGGT	16430

BX927180.9	151	AGAGGGGAAAATTCCCCGACCCCTTGCACTTCCCAGGTGAGGTGATGCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16431	AGAGGGGAAAATTCCCCGACCCCTTGCACTTCCCAGGTGAGGTGATGCCC	16480

BX927180.9	201	CACCCTGCTTCGGCTTGCCCTCCGTGGGCTGCACCCACTGTCCAACCAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16481	CACCCTGCTTCGGCTTGCCCTCCGTGGGCTGCACCCACTGTCCAACCAGT	16530

BX927180.9	251	CCCAGTGAGATGAACCGTGTGCCTCAGTTGGAAATGCAGAAATCACCCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16531	CCCAGTGAGATGAACCGTGTGCCTCAGTTGGAAATGCAGAAATCACCCAC	16580

BX927180.9	301	CTTCTGCCTCGATCTCGCTGGGAGCTGCAGACTGGTGCTGTTCCTATTCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16581	CTTCTGCCTCGATCTCGCTGGGAGCTGCAGACTGGTGCTGTTCCTATTCG	16630

BX927180.9	351	GCCATCTTGAATCTTGCCTGTTCATTTTTAATTTTTTCTTTCAGTGTATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16631	GCCATCTTGAATCTTGCCTGTTCATTTTTAATTTTTTCTTTCAGTGTATT	16680

BX927180.9	401	TTCCTCTCAGTTCAGGCTGGAAAATTTCAATTGCTCTATCTTTGAGTTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16681	TTCCTCTCAGTTCAGGCTGGAAAATTTCAATTGCTCTATCTTTGAGTTCA	16730

BX927180.9	451	CTGATTGTTTCTTTTGTCATATTCATTCTGTTATTGAATCCATCCAGTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16731	CTGATTGTTTCTTTTGTCATATTCATTCTGTTATTGAATCCATCCAGTGA	16780

BX927180.9	501	GTTTTCATTTTGGTTATTTTATTTTCCAGCTATAAAATTTCCATTTGCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16781	GTTTTCATTTTGGTTATTTTATTTTCCAGCTATAAAATTTCCATTTGCTT	16830

BX927180.9	551	CTTTCTTTCTTTTTTTTTTTAGAAATGTTCATCTTTTTATTTTAAGTTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16831	CTTTCTTTCTTTTTTTTTTTAGAAATGTTCATCTTTTTATTTTAAGTTCC	16880

BX927180.9	601	GGGGTACATATACAGGATGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACATGTGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16881	GGGGTACATATACAGGATGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACATGTGCC	16930

BX927180.9	651	ATGGGTAGTGTTCATCTATAGCTCTATCAATGCTTCTTGTCTTTAAGTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16931	ATGGGTAGTGTTCATCTATAGCTCTATCAATGCTTCTTGTCTTTAAGTCT	16980

BX927180.9	701	ACCTTGTTTGAGAGCTATGTCAGCATTCTTTTTTTTTTTTAATTATACTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	16981	ACCTTGTTTGAGAGCTATGTCAGCATTCTTTTTTTTTTTTAATTATACTT	17030

BX927180.9	751	TAAGTTCTAGGATATATATGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATGTCTATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17031	TAAGTTCTAGGATATATATGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATGTCTATA	17080

BX927180.9	801	CATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAACATTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17081	CATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAACATTAG	17130

BX927180.9	851	GTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCGCCAACCCCACAACAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17131	GTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCGCCAACCCCACAACAGGC	17180

BX927180.9	901	CCTGGTGTGTGATGTTCCCTTTCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17181	CCTGGTGTGTGATGTTCCCTTTCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAA	17230

BX927180.9	951	TTCCCATCTATGAGTGAGAACATGTGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17231	TTCCCATCTATGAGTGAGAACATGTGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCGA	17280

BX927180.9	1001	TAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTACAAAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17281	TAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTACAAAGG	17330

BX927180.9	1051	ACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17331	ACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATG	17380

BX927180.9	1101	TGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17381	TGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTT	17430

BX927180.9	1151	CCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAACATACGTGTGCATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17431	CCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAACATACGTGTGCATG	17480

BX927180.9	1201	TGTCTTTATAGCAGCACGTTTTATAATCCTTTGGGTATATACCCAGTAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17481	TGTCTTTATAGCAGCACGTTTTATAATCCTTTGGGTATATACCCAGTAAT	17530

BX927180.9	1251	GGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17531	GGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCG	17580

BX927180.9	1301	CCACACTGACTTCCACAATGGTTGAGCTAGTTTACAGTCCCACCAACAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17581	CCACACTGACTTCCACAATGGTTGAGCTAGTTTACAGTCCCACCAACAGT	17630

BX927180.9	1351	GTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17631	GTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT	17680

BX927180.9	1401	GACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTAGTGTGAGATGGAATCTCATTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17681	GACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTAGTGTGAGATGGAATCTCATTGT	17730

BX927180.9	1451	GGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17731	GGTTTTGATTTGCATTTCTCCGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCA	17780

BX927180.9	1501	TGTGTCTTTTGGCTGTGTAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17781	TGTGTCTTTTGGCTGTGTAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATA	17830

BX927180.9	1551	TCCTTCGCCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17831	TCCTTCGCCCACTTGTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTG	17880

BX927180.9	1601	TTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17881	TTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGA	17930

BX927180.9	1651	TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17931	TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAG	17980

BX927180.9	1701	TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	17981	TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCA	18030

BX927180.9	1751	ATTTTGGCATTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	18031	ATTTTGGCATTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTT	18080

BX927180.9	1801	GCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTGTTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	18081	GCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTGTTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTT	18130

BX927180.9	1851	TTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	18131	TTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGAGGATACAAACAAATGGAAGAACA	18180

BX927180.9	1901	TTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATATCGTGAAAATGGCCATACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	18181	TTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATATCGTGAAAATGGCCATACTG	18230

BX927180.9	1951	CCCAAGGTAATTTATAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGCTACCAATGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753609.4	18231	CCCAAGGTAATTTATAGATTCAATGCCATCCCCATCAAGCTACCAATGAC	18280

Overview

Query
BX927180.9 - 69474 bps
Hit
CR753609.4 - 18280 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link