<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936878.10	1	AAGAGACAAGCTGGAATTCCAACTCAGGCCTGTCGACCCACCCTGTGATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103136	AAGAGACAAGCTGGAATTCCAACTCAGGCCTGTCGACCCACCCTGTGATT	103185

CR936878.10	51	TTGACCAGATTACAGCACTCAGGAAGAGTTCTCGTTTTGAAACCTGAAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103186	TTGACCAGATTACAGCACTCAGGAAGAGTTCTCGTTTTGAAACCTGAAGA	103235

CR936878.10	101	CTCAATGTGTACTTCACTGCCGGGGACCTCAGTTTGCCCATCTGTTAAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103236	CTCAATGTGTACTTCACTGCCGGGGACCTCAGTTTGCCCATCTGTTAAAG	103285

CR936878.10	151	GAGCATGTTGAACCAGAGGACCCGCCAAGCCCCTTCCGAGTGCCTACATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103286	GAGCATGTTGAACCAGAGGACCCGCCAAGCCCCTTCCGAGTGCCTACATG	103335

CR936878.10	201	TAATCCTCCCTCCTCTCTCCTGGACCACAGCGCCCGCTCTGACAGCAGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103336	TAATCCTCCCTCCTCTCTCCTGGACCACAGCGCCCGCTCTGACAGCAGGG	103385

CR936878.10	251	GGCGCCCTCGGGCCGGCGGAGCCTCCGCTTACCCACAATCAGGGCCTTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103386	GGCGCCCTCGGGCCGGCGGAGCCTCCGCTTACCCACAATCAGGGCCTTGG	103435

CR936878.10	301	TGCGCAGCCCGCCCTGGAGCTCTGGCTGCAGGAGCAGCAGCTCTTCCTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103436	TGCGCAGCCCGCCCTGGAGCTCTGGCTGCAGGAGCAGCAGCTCTTCCTCA	103485

CR936878.10	351	TCCTCTTCGTCGTCGGGTTGGGCTGCTGGAGGGTTGGGGGCACTGGGGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103486	TCCTCTTCGTCGTCGGGTTGGGCTGCTGGAGGGTTGGGGGCACTGGGGAC	103535

CR936878.10	401	CTCAGGCTCCGGGCCCAGCTCCTCCAGTACCGAACTCTCGGAGGGGTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103536	CTCAGGCTCCGGGCCCAGCTCCTCCAGTACCGAACTCTCGGAGGGGTATT	103585

CR936878.10	451	GGTACGTGGTCTCCAGGGCTGTCTCGCTGAAGGAGATCTTAAGCTGAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103586	GGTACGTGGTCTCCAGGGCTGTCTCGCTGAAGGAGATCTTAAGCTGAAGG	103635

CR936878.10	501	AGGGAGAAAAAGGGGGCAGGAGGCAAGGTCAGCAGGGGAGAAGCCCGCGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103636	AGGGAGAAAAAGGGGGCAGGAGGCAAGGTCAGCAGGGGAGAAGCCCGCGG	103685

CR936878.10	551	GGGTTGAGGGAGAGAAAGCGGGGGCGGGGGGGGCGGAGTCTGCAAGGGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103686	GGGTTGAGGGAGAGAAAGCGGGGGCGGGGGGGGCGGAGTCTGCAAGGGAG	103735

CR936878.10	601	CAGGTGGGACTGGCGGAACGTGGGGGTGGGGGCTGGACTCAGGTGCCCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103736	CAGGTGGGACTGGCGGAACGTGGGGGTGGGGGCTGGACTCAGGTGCCCCA	103785

CR936878.10	651	CTCACTCTCCCCATCCACTCTGGGATCCAGTTTTCCTTTCCATACTGGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103786	CTCACTCTCCCCATCCACTCTGGGATCCAGTTTTCCTTTCCATACTGGCT	103835

CR936878.10	701	CTCCAATTCTAGAGTTTCCCTCTTCGATCATATCATTTCAAAACATCAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103836	CTCCAATTCTAGAGTTTCCCTCTTCGATCATATCATTTCAAAACATCAGA	103885

CR936878.10	751	CTTTGCCCTGTACGTTGGCAGGGGCTTGGGAGGCAGAAGTGAATAATATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103886	CTTTGCCCTGTACGTTGGCAGGGGCTTGGGAGGCAGAAGTGAATAATATA	103935

CR936878.10	801	AGACCAAGGTCCCTGCTATTTCGAGTGTGGGAGGCAGAGGGGTAAAAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103936	AGACCAAGGTCCCTGCTATTTCGAGTGTGGGAGGCAGAGGGGTAAAAAGA	103985

CR936878.10	851	AATTAAAATACATGGCGATAAGTCTTGTGATCAGAACCGAGTCTTTGGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	103986	AATTAAAATACATGGCGATAAGTCTTGTGATCAGAACCGAGTCTTTGGGC	104035

CR936878.10	901	ACCTTGGGGGCAATCGAGTGAACTTCCCAGAGGAGCCCAGCAGACTGGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104036	ACCTTGGGGGCAATCGAGTGAACTTCCCAGAGGAGCCCAGCAGACTGGCC	104085

CR936878.10	951	AGTGGGGAAAGAACTGGCTGGGGAGCGAGTCTCAGACAAAAGCAAGGTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104086	AGTGGGGAAAGAACTGGCTGGGGAGCGAGTCTCAGACAAAAGCAAGGTTT	104135

CR936878.10	1001	TCATACCCACAGCCCCTTGCTGTCCTATGCAAAACCCAGGACCCTGGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104136	TCATACCCACAGCCCCTTGCTGTCCTATGCAAAACCCAGGACCCTGGGCA	104185

CR936878.10	1051	CCTGTTCCCTCCTACTCTCCTCATTCCTCTCCTATCCATAGCAAAGGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104186	CCTGTTCCCTCCTACTCTCCTCATTCCTCTCCTATCCATAGCAAAGGGAG	104235

CR936878.10	1101	TCTAGGGCCTAGGAAGAGATGGGAGATGAACAGAAAGGCCGAGAGGAACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104236	TCTAGGGCCTAGGAAGAGATGGGAGATGAACAGAAAGGCCGAGAGGAACC	104285

CR936878.10	1151	AAGAGACTCCAGCAACACACAGGGGAAAGATGAGCCGCTGACACCCTGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104286	AAGAGACTCCAGCAACACACAGGGGAAAGATGAGCCGCTGACACCCTGAA	104335

CR936878.10	1201	GGCTGGGGGAGATGACAAGGGCAGAAAGGAAAGTCCACACAAACCTGGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104336	GGCTGGGGGAGATGACAAGGGCAGAAAGGAAAGTCCACACAAACCTGGGG	104385

CR936878.10	1251	TGGGGGTCCACAGTGTGCCCAAAGGGACAGGCACAGAGACAAAATACCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104386	TGGGGGTCCACAGTGTGCCCAAAGGGACAGGCACAGAGACAAAATACCAG	104435

CR936878.10	1301	ACAGGGCACAGAAAACCCTTGGTAATCACACTGTCCCAAGAGCAGGCGAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104436	ACAGGGCACAGAAAACCCTTGGTAATCACACTGTCCCAAGAGCAGGCGAG	104485

CR936878.10	1351	TCCCAGCTGTTCTCACTGCCTTTCTACCCTTCCCCTTTGCCCTATTAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104486	TCCCAGCTGTTCTCACTGCCTTTCTACCCTTCCCCTTTGCCCTATTAAGA	104535

CR936878.10	1401	AGCTCAGGGGGAAGGGGCAGGGTGGGATTAAGTCTAGGAGCCAAAGGGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104536	AGCTCAGGGGGAAGGGGCAGGGTGGGATTAAGTCTAGGAGCCAAAGGGAT	104585

CR936878.10	1451	TAGGGAGACAGCAGGAGGATTCCATATGAACTACTTGGAAAGGTCCAAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104586	TAGGGAGACAGCAGGAGGATTCCATATGAACTACTTGGAAAGGTCCAAAT	104635

CR936878.10	1501	GATCTACTCAGGCCTTCCCTGGCATCTGTTTGGGAAGACTTGGGGTCAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104636	GATCTACTCAGGCCTTCCCTGGCATCTGTTTGGGAAGACTTGGGGTCAGC	104685

CR936878.10	1551	CGTACATCCCTGAGTCCCCTAATGAACTGAGGTATGAAAAGAGAGAAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104686	CGTACATCCCTGAGTCCCCTAATGAACTGAGGTATGAAAAGAGAGAAGCC	104735

CR936878.10	1601	AGAAGGGTGGCTGGGCAGGTGGTTGTTAAGAGCTGCATCAATATGACACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104736	AGAAGGGTGGCTGGGCAGGTGGTTGTTAAGAGCTGCATCAATATGACACC	104785

CR936878.10	1651	AGTCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAGCCCCAGCACTTTGGGAGGTTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104786	AGTCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAGCCCCAGCACTTTGGGAGGTTGA	104835

CR936878.10	1701	GGCGGGAGGATTTCTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAATAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104836	GGCGGGAGGATTTCTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAATAG	104885

CR936878.10	1751	AGTGACACTGTCTCTAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAACCAGATATGACACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104886	AGTGACACTGTCTCTAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAACCAGATATGACACC	104935

CR936878.10	1801	TGGGTCCCCATGGGAAGGTAGAACTCAGGAACTGTATATGTTACTCCTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104936	TGGGTCCCCATGGGAAGGTAGAACTCAGGAACTGTATATGTTACTCCTTG	104985

CR936878.10	1851	TTGGCTCTGAACCCTGCAGTGTCTCCCCATCTCACTTGGAGCAAAAAGTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	104986	TTGGCTCTGAACCCTGCAGTGTCTCCCCATCTCACTTGGAGCAAAAAGTC	105035

CR936878.10	1901	TACTCCAGGCTGGGCGCGGTGGTTCATGCCTATAATCCCAGAACTTTGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	105036	TACTCCAGGCTGGGCGCGGTGGTTCATGCCTATAATCCCAGAACTTTGGG	105085

CR936878.10	1951	AGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753328.11	105086	AGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCC	105135

Overview

Query
CR936878.10 - 66216 bps
Hit
CR753328.11 - 105135 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link