<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753846.4	1	CTCTGGGCTTTAATGTCCTCCTCGGAAAATGAGAACGATATTAAAATATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	105899	CTCTGGGCTTTAATGTCCTCCTCGGAAAATGAGAACGATATTAAAATATG	105948

CR753846.4	51	ACAAGTATATGTAAAGAGTCCAGGAATTTTTCATTCCAAGTGCAGTGTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	105949	ACAAGTATATGTAAAGAGTCCAGGAATTTTTCATTCCAAGTGCAGTGTAT	105998

CR753846.4	101	GTACATTTCTCACAACTGCCTAATGAGGTACCTCAATGCCTCCAGCCAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	105999	GTACATTTCTCACAACTGCCTAATGAGGTACCTCAATGCCTCCAGCCAAA	106048

CR753846.4	151	GACCAGCAGGAGCATACAAGCAATGAACAAGTCAGCTTTATTGTTTATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106049	GACCAGCAGGAGCATACAAGCAATGAACAAGTCAGCTTTATTGTTTATTG	106098

CR753846.4	201	CAATGATGGATAAAACTCACCATGAGAATCATGCAGCCCCTCAGTAAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106099	CAATGATGGATAAAACTCACCATGAGAATCATGCAGCCCCTCAGTAAGAG	106148

CR753846.4	251	ATTGTTGGAACCAAAGAAGTAGAACCAGGAGAATACATATATTAAGATAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106149	ATTGTTGGAACCAAAGAAGTAGAACCAGGAGAATACATATATTAAGATAA	106198

CR753846.4	301	TGATGCAAGGAATTAATTTTTGCATCTGTGGGGGTGGGCTAGGCAAGTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106199	TGATGCAAGGAATTAATTTTTGCATCTGTGGGGGTGGGCTAGGCAAGTCA	106248

CR753846.4	351	GAGATCCTCTGGGAGGTAGTTATCAGGAAGGGCAGGCTGGAACTCTCAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106249	GAGATCCTCTGGGAGGTAGTTATCAGGAAGGGCAGGCTGGAACTCTCAGC	106298

CR753846.4	401	ACAGGCTGACACACTGTCCAGAGTGGAATTTCTGTTTCCTCAGAGAAACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106299	ACAGGCTGACACACTGTCCAGAGTGGAATTTCTGTTTCCTCAGAGAAACC	106348

CR753846.4	451	TCAGCTCTGCTCTTAAGGCTTTTCAACAGCTTAGATTAAGCTCACCCAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106349	TCAGCTCTGCTCTTAAGGCTTTTCAACAGCTTAGATTAAGCTCACCCAGT	106398

CR753846.4	501	TTTCCTAGGATAAATTCTTAAAGTCAACTGATTATGAACTTCAATGACAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106399	TTTCCTAGGATAAATTCTTAAAGTCAACTGATTATGAACTTCAATGACAT	106448

CR753846.4	551	CTACAAAATATCTTCACAGCAACATCTAGATTGTTAGTGTTTGACTGAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106449	CTACAAAATATCTTCACAGCAACATCTAGATTGTTAGTGTTTGACTGAAT	106498

CR753846.4	601	AACTGGGGATCACAGTCTAGCTGACACATAAAATTGACCATTAATCAGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106499	AACTGGGGATCACAGTCTAGCTGACACATAAAATTGACCATTAATCAGTT	106548

CR753846.4	651	GTAAGGTTTGTGCTTGTTTTAGGTGATTTTGGGGAGGATTTAAGAAAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106549	GTAAGGTTTGTGCTTGTTTTAGGTGATTTTGGGGAGGATTTAAGAAAGAG	106598

CR753846.4	701	GGATTTTGCTTTTAATTGGATTCTGACAGAAAGTGGAGGGTTGGGGTGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106599	GGATTTTGCTTTTAATTGGATTCTGACAGAAAGTGGAGGGTTGGGGTGGC	106648

CR753846.4	751	AATGTTATGATTGGGTAGCTTCATAAATCCTACCTAGAGGGACAGAAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106649	AATGTTATGATTGGGTAGCTTCATAAATCCTACCTAGAGGGACAGAAGAC	106698

CR753846.4	801	TATCCTGAGGCTACAGACGTGGTTGGTAAAGAAGCAGTAATCACTCCCGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106699	TATCCTGAGGCTACAGACGTGGTTGGTAAAGAAGCAGTAATCACTCCCGA	106748

CR753846.4	851	GAGAGATGTGCCTGGTCATTTTTGTGGTTTGGACAATATTCATGTTTTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106749	GAGAGATGTGCCTGGTCATTTTTGTGGTTTGGACAATATTCATGTTTTGT	106798

CR753846.4	901	CTGGGTTCAGACATGATGACTGAGCATTCAGGTGTTCTGTCTCAATCCAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106799	CTGGGTTCAGACATGATGACTGAGCATTCAGGTGTTCTGTCTCAATCCAC	106848

CR753846.4	951	TGTGCTCACAGAGTACCTGTCTGATTCTGATGTTCTATGAAATCCTTTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106849	TGTGCTCACAGAGTACCTGTCTGATTCTGATGTTCTATGAAATCCTTTAT	106898

CR753846.4	1001	CTCCAACAGGAGAACCAAAACCACCTGGGAGTGCCAGGCTAGCTGCTAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106899	CTCCAACAGGAGAACCAAAACCACCTGGGAGTGCCAGGCTAGCTGCTAGC	106948

CR753846.4	1051	AACCCCAAGCCTTTGTTAATTACATCCAGACAGTCTCAGGTGTCAGGACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106949	AACCCCAAGCCTTTGTTAATTACATCCAGACAGTCTCAGGTGTCAGGACA	106998

CR753846.4	1101	TTTTTTTTTTGTTTCACTTTTTTTTTTACGGTGTCTGCCAGTGGGAGGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	106999	TTTTTTTTTTGTTTCACTTTTTTTTTTACGGTGTCTGCCAGTGGGAGGTA	107048

CR753846.4	1151	AAACATAGTGCTGAGAATCTCAGAAGGCCATTTATCAAGGACAGAGTGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107049	AAACATAGTGCTGAGAATCTCAGAAGGCCATTTATCAAGGACAGAGTGAT	107098

CR753846.4	1201	TCTAAATAGAAGCTCCATTAACTTATGGTTTCTATCACATACAGAAAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107099	TCTAAATAGAAGCTCCATTAACTTATGGTTTCTATCACATACAGAAAATA	107148

CR753846.4	1251	GATGCATCTGAAAAAATATAATAAGTTTCCCTCTAAGGACTAACTTTGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107149	GATGCATCTGAAAAAATATAATAAGTTTCCCTCTAAGGACTAACTTTGGC	107198

CR753846.4	1301	TCAATCTCTAGTCCCTTGCAAATATTTGGAATTTTAGTGTGGTAGGATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107199	TCAATCTCTAGTCCCTTGCAAATATTTGGAATTTTAGTGTGGTAGGATAA	107248

CR753846.4	1351	CAAGTTTTAAAAGATCTGGTAGTTTAAGAAAAGAAAACCATTTTTCTAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107249	CAAGTTTTAAAAGATCTGGTAGTTTAAGAAAAGAAAACCATTTTTCTAAG	107298

CR753846.4	1401	TCAGTGCAATTCTTCTTATTCTACCCTCAACTTTTGACTTCATATTCTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107299	TCAGTGCAATTCTTCTTATTCTACCCTCAACTTTTGACTTCATATTCTTA	107348

CR753846.4	1451	ATTTTTTTAAAAAAAGTTCTTAGAGTAATTGAGCCAGCCAAATTTTAAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107349	ATTTTTTTAAAAAAAGTTCTTAGAGTAATTGAGCCAGCCAAATTTTAAAT	107398

CR753846.4	1501	GTAATCAATGTCCCCAAATTTCCTTTAAACATACTCAAGAAGCACCAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107399	GTAATCAATGTCCCCAAATTTCCTTTAAACATACTCAAGAAGCACCAAAA	107448

CR753846.4	1551	CACAGAATATAAGGATTACTCAATGCAAAGAAAAACTGTATAAAGTCTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107449	CACAGAATATAAGGATTACTCAATGCAAAGAAAAACTGTATAAAGTCTCA	107498

CR753846.4	1601	TACAGTTACTATAGACAGCACCATCTGACATTATAACCCCTTTTTATTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107499	TACAGTTACTATAGACAGCACCATCTGACATTATAACCCCTTTTTATTGC	107548

CR753846.4	1651	CCTGGCCAAAACCACTTGGATCTTTTGAGTGCTTGAGAAGAACTTACCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107549	CCTGGCCAAAACCACTTGGATCTTTTGAGTGCTTGAGAAGAACTTACCCA	107598

CR753846.4	1701	GCTGGATTTATACAAGTAGAAAAGGCAAAGGTATTGCTTGGCTACCACCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107599	GCTGGATTTATACAAGTAGAAAAGGCAAAGGTATTGCTTGGCTACCACCA	107648

CR753846.4	1751	GCAGAGATCCCTAGGTAGGTGGGGTCAACTTAACATTTGGAGAATTCCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107649	GCAGAGATCCCTAGGTAGGTGGGGTCAACTTAACATTTGGAGAATTCCAC	107698

CR753846.4	1801	GCGCACTATGGAAGCAAAAAGAAAAACAGCTAACCCTCATACAGAAGCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107699	GCGCACTATGGAAGCAAAAAGAAAAACAGCTAACCCTCATACAGAAGCCA	107748

CR753846.4	1851	GAGAAAGGGCAGGGGATGGGGACTGCCAGGGAGGGAAATCAACTCAGGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107749	GAGAAAGGGCAGGGGATGGGGACTGCCAGGGAGGGAAATCAACTCAGGGA	107798

CR753846.4	1901	AAAATTCCTGGAGGTTGTAACCCAGAAAATCCTGAAGGATGCCATATAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107799	AAAATTCCTGGAGGTTGTAACCCAGAAAATCCTGAAGGATGCCATATAAT	107848

CR753846.4	1951	TGATGACCTCATCTATCCATGAGGCTGCTCAGAAATGCCCACCCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR753309.2	107849	TGATGACCTCATCTATCCATGAGGCTGCTCAGAAATGCCCACCCCTGGCC	107898

Overview

Query
CR753846.4 - 128049 bps
Hit
CR753309.2 - 107898 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link