<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

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C  BX649552.3	1900	TCATTGTTATCACTATATTTATTAATCGCATAAAGAATTGCAATCTTTTA	1851
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C  BX649552.3	1800	TCACTATTTTGTAAAATATAATGCATAAAATTCAGCAAATAATGTATTAT	1751
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C  BX649552.3	1250	TTAAATTAAATGTGATTTTATTTTTTTCACTCGAATAACATCATCTTGTA	1201
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C  BX649552.3	1000	GTGTAAATAGTCTTTTAAATAAACATAAATGAATGATGTGTTTTGTTTTC	951
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C  BX649552.3	900	ATCATTTAAAGCCGACGTGAAAATTAATATTGTGCATAGAGTACATTTCA	851
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C  BX649552.3	800	ACTTTTGTAAGGGTTTTTCAGGGCCGATGGACTCGCTACAACAGATTCCC	751
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C  BX649552.3	700	ACATCATTTTTAACATGTGCCAAGATGCTTATTTTGGGACATTTAAAACT	651
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C  BX649552.3	650	TTTTTGTCACTTTTTTTGTCTATTTTTTTATATACTTTTTTTTAATTAAA	601
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C  BX649552.3	600	TTTTTATTTATATATATATATTTTTTTTTTTATTTATATTTACTATTTGT	551
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C  BX649552.3	550	GTCTATTTTTTTACAGAAACATAGACACTGTCACTTATTTATAATTTGAA	501
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C  BX649552.3	500	AATAGATGTCTTTTCAGTTGTTTCAGCATCACTTGCGTAATCAAATGCAG	451
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C  BX649552.3	450	AACAATACTGTTAAATATACTACAAAACAATAGTCAGTGTAAAGCCAATG	401
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  CR735122.6	1551	AACAATACTGTTAAATATACTACAAAACAATAGTCAGTGTAAAGCCAATG	1600

C  BX649552.3	400	TTGTAATAAAAAAATAAACATTTTGATTTATTAATTACAGCGGGGCAGTG	351
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C  BX649552.3	250	CGGTTTCCAGTCCAAAGACATACGTGTATGTGAATGCAAGAATGAATGAA	201
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C  BX649552.3	200	AGTTTCCCAGTGTTAGTTTGCAGCTGGAAGGGCATCCGCTGTGTAAAACA	151
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C  BX649552.3	150	TATGCTGGATATGTTGGCGGTTCATTCTGCTGTGGCGAACCCTGATTAAT	101
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C  BX649552.3	100	AAAGGGACTAAGCTGTAAAGAAAATGAATGAATGAATTTATTAATTACAT	51
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  CR735122.6	1901	AAAGGGACTAAGCTGTAAAGAAAATGAATGAATGAATTTATTAATTACAT	1950

C  BX649552.3	50	AAAGCAACATAATTTGATTAAACATAAATATTTTGTAGGCATGGGAATTC	1
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  CR735122.6	1951	AAAGCAACATAATTTGATTAAACATAAATATTTTGTAGGCATGGGAATTC	2000

Overview

Query
BX649552.3 - 163544 bps
Hit
CR735122.6 - 12563 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001838200012000-1120001
289.4862948622486317-1181819121
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