<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927217.5	8465	AAGCTTTTCATTTAAAGCTACTTACGCCAAATTTATTCATACTGTGAGGG	8514
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1	AAGCTTTTCATTTAAAGCTACTTACGCCAAATTTATTCATACTGTGAGGG	50

BX927217.5	8515	TAAAAGATTTTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTGGCAACGTGATGATGTAAAA	8564
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	51	TAAAAGATTTTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTGGCAACGTGATGATGTAAAA	100

BX927217.5	8565	ACATTTCAGCACATTCATCTCTCAGGAATCATCCCTGAATCAGATGCACC	8614
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	101	ACATTTCAGCACATTCATCTCTCAGGAATCATCCCTGAATCAGATGCACC	150

BX927217.5	8615	TCAGTCTGCTGGTGAACAAAAGCGCTTGCATCATAGCGGTGGGTAAAAAT	8664
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	151	TCAGTCTGCTGGTGAACAAAAGCGCTTGCATCATAGCGGTGGGTAAAAAT	200

BX927217.5	8665	ACCAATTCCCTGCTGTATTATTGTGTCATACTGTGCTTACACAATATCAT	8714
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	201	ACCAATTCCCTGCTGTATTATTGTGTCATACTGTGCTTACACAATATCAT	250

BX927217.5	8715	ACCCAACTGACGTATGCATTATGAATGAGTGTCAACTGTGTGTGTGCCAC	8764
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	251	ACCCAACTGACGTATGCATTATGAATGAGTGTCAACTGTGTGTGTGCCAC	300

BX927217.5	8765	TGAATCTGCTGACGGATGAATTTGAGACCGATAAGAAAAATCACCAGCTA	8814
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	301	TGAATCTGCTGACGGATGAATTTGAGACCGATAAGAAAAATCACCAGCTA	350

BX927217.5	8815	CCTGGACAGCTGCAATAATAACAGTTTAAAGGAGGCATCTTGTTTTGCCC	8864
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	351	CCTGGACAGCTGCAATAATAACAGTTTAAAGGAGGCATCTTGTTTTGCCC	400

BX927217.5	8865	AAAAATTAATCTGGTCTAGATGTTGAATAAGAAATAAACATAACATTTGA	8914
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	401	AAAAATTAATCTGGTCTAGATGTTGAATAAGAAATAAACATAACATTTGA	450

BX927217.5	8915	ACACGCATGAATGATTACCTCTACACTATTATCTATAAGCTGTTTCATAC	8964
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	451	ACACGCATGAATGATTACCTCTACACTATTATCTATAAGCTGTTTCATAC	500

BX927217.5	8965	ACCTCACCTTTAAATGGTGATCTAGAAATTGCTTTACTAGAGATAGTTTC	9014
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	501	ACCTCACCTTTAAATGGTGATCTAGAAATTGCTTTACTAGAGATAGTTTC	550

BX927217.5	9015	CTCAAGAGCCATGAGTATTATTTTTGTTTTGCCTGTGTGTTTTTATGGCT	9064
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	551	CTCAAGAGCCATGAGTATTATTTTTGTTTTGCCTGTGTGTTTTTATGGCT	600

BX927217.5	9065	CTCAAAGTGCTGGTAATTATTCCTTTGGATTTGTTGAATCACCAAGGACC	9114
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	601	CTCAAAGTGCTGGTAATTATTCCTTTGGATTTGTTGAATCACCAAGGACC	650

BX927217.5	9115	ATCGTTTAAGCAAAAACTCTCATTATTGCACTTAAAATTGGTCTAACTAT	9164
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	651	ATCGTTTAAGCAAAAACTCTCATTATTGCACTTAAAATTGGTCTAACTAT	700

BX927217.5	9165	TCCTATATATGGCATTTGAAATAAGTGGCTACTGTATACAGGAAAGGAAA	9214
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	701	TCCTATATATGGCATTTGAAATAAGTGGCTACTGTATACAGGAAAGGAAA	750

BX927217.5	9215	ACATACCAAATCTCGGTTTCCCAACATTTGAGCAAAAGTTAATATTTGGT	9264
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	751	ACATACCAAATCTCGGTTTCCCAACATTTGAGCAAAAGTTAATATTTGGT	800

BX927217.5	9265	TTACTCTCTTAGATCTGGATATGTTTATTGCAGTTTCTTAATAAACATAT	9314
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	801	TTACTCTCTTAGATCTGGATATGTTTATTGCAGTTTCTTAATAAACATAT	850

BX927217.5	9315	CGTGATTTAGAGCATTTTCCACCAGATGACAACTGTTTTGAATCGGACTG	9364
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	851	CGTGATTTAGAGCATTTTCCACCAGATGACAACTGTTTTGAATCGGACTG	900

BX927217.5	9365	GCTGATAGGCATGCGATATAACAGCACTTGTACAGCCTTCTCACCCTTCT	9414
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	901	GCTGATAGGCATGCGATATAACAGCACTTGTACAGCCTTCTCACCCTTCT	950

BX927217.5	9415	GTATTACACTGCCCTCATAGTGACAGCAGATCAATAAACTCACCACAGTT	9464
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	951	GTATTACACTGCCCTCATAGTGACAGCAGATCAATAAACTCACCACAGTT	1000

BX927217.5	9465	TGACAAATACTGCAGCTGTTGGACAACATAATGTACTTTTAAGGCTTTTT	9514
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1001	TGACAAATACTGCAGCTGTTGGACAACATAATGTACTTTTAAGGCTTTTT	1050

BX927217.5	9515	AGGCAAAAAACATCGTTGTTTAGATTGCAACTATGCAGTTTATTTATAAG	9564
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1051	AGGCAAAAAACATCGTTGTTTAGATTGCAACTATGCAGTTTATTTATAAG	1100

BX927217.5	9565	GATAGTGCCTACTTTAAATGTTTAGAATTTCTGAGATACAGTATGTCAAC	9614
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1101	GATAGTGCCTACTTTAAATGTTTAGAATTTCTGAGATACAGTATGTCAAC	1150

BX927217.5	9615	ATCCGCCTGTCATACTGAGCAGAGCAAAGACGGCTGACCTTCTGCCACAA	9664
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1151	ATCCGCCTGTCATACTGAGCAGAGCAAAGACGGCTGACCTTCTGCCACAA	1200

BX927217.5	9665	GATGGCGACAGAGTCCACATAATAGGCCCTTACAGAAGAAAAACTTGGCG	9714
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1201	GATGGCGACAGAGTCCACATAATAGGCCCTTACAGAAGAAAAACTTGGCG	1250

BX927217.5	9715	TAATATAAGTACAGCTGATCAAATCATTATGAAAACAGGTACGTGACTTC	9764
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1251	TAATATAAGTACAGCTGATCAAATCATTATGAAAACAGGTACGTGACTTC	1300

BX927217.5	9765	TAAGTTGATCTCTCTCTTTTGTTTTTTGCAGTGCTGGATTTATACCACAG	9814
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1301	TAAGTTGATCTCTCTCTTTTGTTTTTTGCAGTGCTGGATTTATACCACAG	1350

BX927217.5	9815	TAATTTGGTAGTGTTTGCTTTGACGTTTTTGGGGTTATTATTTCATAATT	9864
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1351	TAATTTGGTAGTGTTTGCTTTGACGTTTTTGGGGTTATTATTTCATAATT	1400

BX927217.5	9865	ATTGTGATATCCCGATTGCAGCATAGAAATATTAGAAAATGTCTCTAGAC	9914
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1401	ATTGTGATATCCCGATTGCAGCATAGAAATATTAGAAAATGTCTCTAGAC	1450

BX927217.5	9915	TGAAGGCATTTCATGGCATTTAGCCTTATAATCTTAAAATGTGAGCAAAA	9964
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1451	TGAAGGCATTTCATGGCATTTAGCCTTATAATCTTAAAATGTGAGCAAAA	1500

BX927217.5	9965	TCACATGTTTTGTCATCACTTTAGATATTATGCTAGAGAATCATTCAAAT	10014
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1501	TCACATGTTTTGTCATCACTTTAGATATTATGCTAGAGAATCATTCAAAT	1550

BX927217.5	10015	ACTAGCTCTAAAGTGACGTTTGTGAATTAGCAACGGTTTCTGCTGTTCTG	10064
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1551	ACTAGCTCTAAAGTGACGTTTGTGAATTAGCAACGGTTTCTGCTGTTCTG	1600

BX927217.5	10065	ACGTCAACTGTAGATGTGGATAAATGGTGGAAGAAAGTAGTTCCTCATAA	10114
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1601	ACGTCAACTGTAGATGTGGATAAATGGTGGAAGAAAGTAGTTCCTCATAA	1650

BX927217.5	10115	AAAAGGATTTTTAGCCTCTCTGTGTTTGATTTTAGTGGAAGAAAGTAGTT	10164
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1651	AAAAGGATTTTTAGCCTCTCTGTGTTTGATTTTAGTGGAAGAAAGTAGTT	1700

BX927217.5	10165	CCTCATAAAAAAAGGATTTTTAGCCTCTCTGTGTTTGATTTTCTCTTTTA	10214
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1701	CCTCATAAAAAAAGGATTTTTAGCCTCTCTGTGTTTGATTTTCTCTTTTA	1750

BX927217.5	10215	TATACAAGATTATACCATCGAACTGTTGTATAAACGCAATATCACATGAG	10264
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1751	TATACAAGATTATACCATCGAACTGTTGTATAAACGCAATATCACATGAG	1800

BX927217.5	10265	TAGCAGTGCGAAATGGCTTTATTTCTTCACCGGTGGGACACTAAGGCACT	10314
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1801	TAGCAGTGCGAAATGGCTTTATTTCTTCACCGGTGGGACACTAAGGCACT	1850

BX927217.5	10315	AAGCCTGTGGCCTCGAGCCAACGCACGTCATCAGTATTATGACAACACAA	10364
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1851	AAGCCTGTGGCCTCGAGCCAACGCACGTCATCAGTATTATGACAACACAA	1900

BX927217.5	10365	CCATAAATTCAGAGAAACAATTACATTTTTAAGTGTTCTCTCTAATTTTT	10414
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1901	CCATAAATTCAGAGAAACAATTACATTTTTAAGTGTTCTCTCTAATTTTT	1950

BX927217.5	10415	CTATTATTAAATACAATTTTAACAAAGAGGAAAAAACAAGAGAACCATAA	10464
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR631123.6	1951	CTATTATTAAATACAATTTTAACAAAGAGGAAAAAACAAGAGAACCATAA	2000

Overview

Query
BX927217.5 - 10464 bps
Hit
CR631123.6 - 138519 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194020008465104641120001
298.25505810149102061162716831
398.28505710091101471168517421
Short-link