<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927132.7	1	GGCCATTTACTTTAACAAAATAATTGTTTTTAACAAATAAGGGGGATTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58037	GGCCATTTACTTTAACAAAATAATTGTTTTTAACAAATAAGGGGGATTTA	58086

BX927132.7	51	TTGCTTATAAAACCAAAAAGTTCAGCAGTAGTGTGGGCTTCAGGTATAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58087	TTGCTTATAAAACCAAAAAGTTCAGCAGTAGTGTGGGCTTCAGGTATAGC	58136

BX927132.7	101	TTGATCAGTGCTCTGGATCAATATCTCTGCAGTTTCCTCAGCTATGTCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58137	TTGATCAGTGCTCTGGATCAATATCTCTGCAGTTTCCTCAGCTATGTCCT	58186

BX927132.7	151	CTTCCATGTATTGGATTTGTCATCAAGTTGATTCCCCTCACAATCACGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58187	CTTCCATGTATTGGATTTGTCATCAAGTTGATTCCCCTCACAATCACGAA	58236

BX927132.7	201	ACATTGTCAGCAATAATCAGGCCTATATGCTTCCTTGTTCACATTCAAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58237	ACATTGTCAGCAATAATCAGGCCTATATGCTTCCTTGTTCACATTCAAGA	58286

BX927132.7	251	GGTTGAATATCATCCTATAATCAATGAACAAAAATGGCTCTTTATACAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58287	GGTTGAATATCATCCTATAATCAATGAACAAAAATGGCTCTTTATACAGA	58336

BX927132.7	301	GCTTCATACTGACGCATAAGTTGTCTGCACATTCCTGGCAACATGTTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58337	GCTTCATACTGACGCATAAGTTGTCTGCACATTCCTGGCAACATGTTTGG	58386

BX927132.7	351	GACAAGGGGCGAAAATGCAATGATTGGCTGAGATTAATTGGGGGCCACTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58387	GACAAGGGGCGAAAATGCAATGATTGGCTGAGATTAATTGGGGGCCACTT	58436

BX927132.7	401	CTGAAGCCAGGTTTTCAGTGAAAGGGCCATATATGCAAAGCCATCTCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58437	CTGAAGCCAGGTTTTCAGTGAAAGGGCCATATATGCAAAGCCATCTCTCA	58486

BX927132.7	451	AATGCACAAAGAGCAGATAAATCAAAGAAGGAGGCAGACAAATCTAGCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58487	AATGCACAAAGAGCAGATAAATCAAAGAAGGAGGCAGACAAATCTAGCTT	58536

BX927132.7	501	GTTGGTTTGGGGTGATTTACTAAAGGAATTTACAGACATATATGTTGTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58537	GTTGGTTTGGGGTGATTTACTAAAGGAATTTACAGACATATATGTTGTCT	58586

BX927132.7	551	TGGGTGGCCACAACATAGTTAGATTTTGCACTGCAGTCCTCCAGATCTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58587	TGGGTGGCCACAACATAGTTAGATTTTGCACTGCAGTCCTCCAGATCTAG	58636

BX927132.7	601	GGCTTATCTTTTGAGGAAAGTATACTTGCTCTGAAAGAAACATGTAGGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58637	GGCTTATCTTTTGAGGAAAGTATACTTGCTCTGAAAGAAACATGTAGGTA	58686

BX927132.7	651	GCTACAGGTGCCATGGACTATGCTTCCTACAACAGCGTCAAGGGTTGTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58687	GCTACAGGTGCCATGGACTATGCTTCCTACAACAGCGTCAAGGGTTGTTT	58736

BX927132.7	701	TGGAGGAAACTTACAGTGAATACATGTTCCTACATAAAGAGTAATATATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58737	TGGAGGAAACTTACAGTGAATACATGTTCCTACATAAAGAGTAATATATC	58786

BX927132.7	751	AACTTAACATCTTATAGGGACTCAGGGTTATTCAGAAGTTACACGGCAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58787	AACTTAACATCTTATAGGGACTCAGGGTTATTCAGAAGTTACACGGCAGA	58836

BX927132.7	801	TTAGCATTTAAAATAAAGTCACTCTTGCTCCTGCACTGGGGGTGGGGTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58837	TTAGCATTTAAAATAAAGTCACTCTTGCTCCTGCACTGGGGGTGGGGTTA	58886

BX927132.7	851	ATTTCATCCAAAGCACATGCTACACAGTGTAGGTGAGATGGGATAACTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58887	ATTTCATCCAAAGCACATGCTACACAGTGTAGGTGAGATGGGATAACTAT	58936

BX927132.7	901	TGGGAGGCAACAGTAATATCATAGTCTCTATTGTCTGCATGAGAAAACTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58937	TGGGAGGCAACAGTAATATCATAGTCTCTATTGTCTGCATGAGAAAACTG	58986

BX927132.7	951	ACCACAACAGAGCTAGTAAGTGATGAAGCTTGGATTCAAATGTGGGCTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	58987	ACCACAACAGAGCTAGTAAGTGATGAAGCTTGGATTCAAATGTGGGCTTT	59036

BX927132.7	1001	CTAACTTCACAGTTTGTTCTTAATCACTAGGCAATTGTTCCTCCCTATAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59037	CTAACTTCACAGTTTGTTCTTAATCACTAGGCAATTGTTCCTCCCTATAG	59086

BX927132.7	1051	ACATCTGAACTCTTTAAAACAAGAAGGTGAGGATTCAGTATGTACATTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59087	ACATCTGAACTCTTTAAAACAAGAAGGTGAGGATTCAGTATGTACATTTC	59136

BX927132.7	1101	TTGGCTCTTTGCAACTTGTCATGGGAAGGTCTTCATTTTCTCCTATTCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59137	TTGGCTCTTTGCAACTTGTCATGGGAAGGTCTTCATTTTCTCCTATTCTT	59186

BX927132.7	1151	TGTTTTAACACCTAATATTTGAACCACACTGAATTTATCTTACTCTCTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59187	TGTTTTAACACCTAATATTTGAACCACACTGAATTTATCTTACTCTCTTA	59236

BX927132.7	1201	CTGTCCTGAGGATGTTCACAAGAACTTTTCCTTCAAGGTTAAAATGTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59237	CTGTCCTGAGGATGTTCACAAGAACTTTTCCTTCAAGGTTAAAATGTGTC	59286

BX927132.7	1251	ACTTATACCTCAACCAAACATTTCATATTTGCAGCAATTATGCTTATTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59287	ACTTATACCTCAACCAAACATTTCATATTTGCAGCAATTATGCTTATTCA	59336

BX927132.7	1301	CATAAGGTTGTAAATTCCTCAAGGCTCAACCAATGGCTGAGAAGTGTTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59337	CATAAGGTTGTAAATTCCTCAAGGCTCAACCAATGGCTGAGAAGTGTTTT	59386

BX927132.7	1351	GGGCCACTGTACCTTTAACAGGCCATTGGTGCATGAAGAACATCAGCGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59387	GGGCCACTGTACCTTTAACAGGCCATTGGTGCATGAAGAACATCAGCGAC	59436

BX927132.7	1401	AATGTCATTCTCCTAGACCACTGGGCAGTATCTGCCATATGTAGGCCAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59437	AATGTCATTCTCCTAGACCACTGGGCAGTATCTGCCATATGTAGGCCAGT	59486

BX927132.7	1451	CGTTATTTTTTATTACCATTATTACTAATTTTTACTATTATTACTATAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59487	CGTTATTTTTTATTACCATTATTACTAATTTTTACTATTATTACTATAGT	59536

BX927132.7	1501	GGTTTCCAAATAATGATTCTTAAAGTTCCATCATTCCTTCTAAACTTATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59537	GGTTTCCAAATAATGATTCTTAAAGTTCCATCATTCCTTCTAAACTTATT	59586

BX927132.7	1551	AGTTTGTGTGGTAGGCTAAATACTTCCTCTCCTTGTCGCAAATGATCACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59587	AGTTTGTGTGGTAGGCTAAATACTTCCTCTCCTTGTCGCAAATGATCACA	59636

BX927132.7	1601	CCCTAACCTCTGGGACTTGTTATTATATGTTACTTTACATGGCAAAAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59637	CCCTAACCTCTGGGACTTGTTATTATATGTTACTTTACATGGCAAAAGGA	59686

BX927132.7	1651	TTTTTATAGATGTGATTAAATTCAGAACCTTGAGTTGGGATTATTATCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59687	TTTTTATAGATGTGATTAAATTCAGAACCTTGAGTTGGGATTATTATCCT	59736

BX927132.7	1701	GAATTAGCCAGGTGGGCTGACATAGTCATATGTGTTCATATAAGAGGGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59737	GAATTAGCCAGGTGGGCTGACATAGTCATATGTGTTCATATAAGAGGGAG	59786

BX927132.7	1751	GCCAGAGGTCAGAGAGAAGATAGTCTGCTGCTGACTTTAAAGAAACAGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59787	GCCAGAGGTCAGAGAGAAGATAGTCTGCTGCTGACTTTAAAGAAACAGGA	59836

BX927132.7	1801	ATGGGCCATGAGCCAAGGAAAACAGGTTGCTTCTAGAAGCTGGAGTAGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59837	ATGGGCCATGAGCCAAGGAAAACAGGTTGCTTCTAGAAGCTGGAGTAGTT	59886

BX927132.7	1851	GAGAAAACAGATTCTCTCTGAAAGCCTACAGAAGAAATGCAGCCCTGTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59887	GAGAAAACAGATTCTCTCTGAAAGCCTACAGAAGAAATGCAGCCCTGTAG	59936

BX927132.7	1901	ACCCAATTTAGTATTCCTATCTCCAGATACATGATATTTTTGTTATTTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59937	ACCCAATTTAGTATTCCTATCTCCAGATACATGATATTTTTGTTATTTTA	59986

BX927132.7	1951	AACACCAAATTTGTAGTAATTTGTTATAGCAACAATGGAAAACTAATAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR547123.3	59987	AACACCAAATTTGTAGTAATTTGTTATAGCAACAATGGAAAACTAATAGA	60036

Overview

Query
BX927132.7 - 93511 bps
Hit
CR547123.3 - 60036 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link