<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571983.12	1	AAGCTTTATTAAGAGCACACATACAAACAAACACAAAGGGGCAATCCAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15544	AAGCTTTATTAAGAGCACACATACAAACAAACACAAAGGGGCAATCCAGG	15593

BX571983.12	51	AAACAGAACGTGGGATAGGCAAAAGTTCAAGGGCAGGCAGATATCTTACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15594	AAACAGAACGTGGGATAGGCAAAAGTTCAAGGGCAGGCAGATATCTTACT	15643

BX571983.12	101	GGTCAAAATAACAGGCTGGAGATCAGGGGCAGGCAGATGTCTTTCGTAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15644	GGTCAAAATAACAGGCTGGAGATCAGGGGCAGGCAGATGTCTTTCGTAAT	15693

BX571983.12	151	CGTAGAACAAGCACAGGGTCAGAAACACAGATCAGTCCGAAGCAGGGAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15694	CGTAGAACAAGCACAGGGTCAGAAACACAGATCAGTCCGAAGCAGGGAGT	15743

BX571983.12	201	ATGGAACGCTCAGAAATGACAGCCAGGCAAATCAAGACTTCGCAAAGAAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15744	ATGGAACGCTCAGAAATGACAGCCAGGCAAATCAAGACTTCGCAAAGAAC	15793

BX571983.12	251	CGGAGCGTGAGTGTGGTATATATACACGAGAGCTGATGAGTTGCACCTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15794	CGGAGCGTGAGTGTGGTATATATACACGAGAGCTGATGAGTTGCACCTGG	15843

BX571983.12	301	ACCGTAATCAGTGCCAGGTAGCAGGGCTTATGGGATTTTGAGTCCGTGAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15844	ACCGTAATCAGTGCCAGGTAGCAGGGCTTATGGGATTTTGAGTCCGTGAG	15893

BX571983.12	351	TCGAATCAGAATTCTGGCGATGGTTCCCTCTGGTGGTGCACAAGAGGGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15894	TCGAATCAGAATTCTGGCGATGGTTCCCTCTGGTGGTGCACAAGAGGGTT	15943

BX571983.12	401	GGCATCGCCCTCATTTACAACGGAACCCCCCTCCTGCGAGCGGCTCCTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15944	GGCATCGCCCTCATTTACAACGGAACCCCCCTCCTGCGAGCGGCTCCTGA	15993

BX571983.12	451	AGCGAGAAGGCACCTGACGCCGGGGTCTACCGCGCTGTCGGGGGGCTGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	15994	AGCGAGAAGGCACCTGACGCCGGGGTCTACCGCGCTGTCGGGGGGCTGGT	16043

BX571983.12	501	TTCTCTGGGAACCTTTGATGAAACTCTTCCGTGAGAGTTGGGTCTAGAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16044	TTCTCTGGGAACCTTTGATGAAACTCTTCCGTGAGAGTTGGGTCTAGAAT	16093

BX571983.12	551	ATCTCTAGCATTCACCCAGGACCGTTCCTCTGGACCGTACCCTTCCCAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16094	ATCTCTAGCATTCACCCAGGACCGTTCCTCTGGACCGTACCCTTCCCAGT	16143

BX571983.12	601	CCACCAGATATTGGAGGGCGCCACCCCGACGTCGAGAGTCCAGCACTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16144	CCACCAGATATTGGAGGGCGCCACCCCGACGTCGAGAGTCCAGCACTTCT	16193

BX571983.12	651	CGAACGAGGTAAGCTTCCTCGCCCTCGATCATGACAGGTGGAGGGGTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16194	CGAACGAGGTAAGCTTCCTCGCCCTCGATCATGACAGGTGGAGGGGTCCT	16243

BX571983.12	701	GGTTTCCGATTCCTCCTCAACCGCCTCCTCTCGTGGACCACCAGCGGGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16244	GGTTTCCGATTCCTCCTCAACCGCCTCCTCTCGTGGACCACCAGCGGGTT	16293

BX571983.12	751	TGAGTAATGACATGTGGAAAGTAGGAGAAATACGATAATGATTAGACAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16294	TGAGTAATGACATGTGGAAAGTAGGAGAAATACGATAATGATTAGACAAG	16343

BX571983.12	801	GCTAAGCGAAAAGACACTGGAGTAATCTGGCGTACAATTTTGAATGGCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16344	GCTAAGCGAAAAGACACTGGAGTAATCTGGCGTACAATTTTGAATGGCCC	16393

BX571983.12	851	TACATACCTGGGACTGAGTTTGCGGCAGGGCAATCTCAGACGAAGGTCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16394	TACATACCTGGGACTGAGTTTGCGGCAGGGCAATCTCAGACGAAGGTCTC	16443

BX571983.12	901	GTGTCGACAACCACACCCACTGCCCCGGTTGATACGTGGGTCCCTGGCGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16444	GTGTCGACAACCACACCCACTGCCCCGGTTGATACGTGGGTCCCTGGCGT	16493

BX571983.12	951	CGGTGACGGTTCGCCTGAATCTCTCTCCTCCTGACTGCCCTCATGAGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16494	CGGTGACGGTTCGCCTGAATCTCTCTCCTCCTGACTGCCCTCATGAGATG	16543

BX571983.12	1001	TCTGTGAGCCTGGTTCCAGACATCCTCACTCCGCTGCAGCCAATCCGTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16544	TCTGTGAGCCTGGTTCCAGACATCCTCACTCCGCTGCAGCCAATCCGTGA	16593

BX571983.12	1051	CAGCAGGTAACTCAGTGGGTTCTCCGGACCATGGAAACAGGGGTGGTTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16594	CAGCAGGTAACTCAGTGGGTTCTCCGGACCATGGAAACAGGGGTGGTTGG	16643

BX571983.12	1101	TAGCCAAGAATACATTTGAATGGCGTAATACCCGTGGCTGGCTTTATTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16644	TAGCCAAGAATACATTTGAATGGCGTAATACCCGTGGCTGGCTTTATTAA	16693

BX571983.12	1151	TGAATTTTGTGCATATTCTGCCCACATCAGATAGCGACTCCAGTCGTGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16694	TGAATTTTGTGCATATTCTGCCCACATCAGATAGCGACTCCAGTCGTGCT	16743

BX571983.12	1201	GTTGCTGATGACAGTAGGAACGTAGAAATCGAATGACTTCTTGATTCATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16744	GTTGCTGATGACAGTAGGAACGTAGAAATCGAATGACTTCTTGATTCATA	16793

BX571983.12	1251	CGTTCAGTTTGGCCGTTGGATTGAGGATGGTACCCTGAGGTGAGACTAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16794	CGTTCAGTTTGGCCGTTGGATTGAGGATGGTACCCTGAGGTGAGACTAAC	16843

BX571983.12	1301	ATTAATATTTAGATTTTTACAGAGAGCGGACCATACCCGGGAAGTGAATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16844	ATTAATATTTAGATTTTTACAGAGAGCGGACCATACCCGGGAAGTGAATT	16893

BX571983.12	1351	GGGATCCCCTGTCTGAGACGATATCATCAGGTAAGCCAAACATTCGAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16894	GGGATCCCCTGTCTGAGACGATATCATCAGGTAAGCCAAACATTCGAAAT	16943

BX571983.12	1401	ACATGATTGCACAGGGCTTCTGCGGTTTCAAAGGCAGAGGGCAATTTGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16944	ACATGATTGCACAGGGCTTCTGCGGTTTCAAAGGCAGAGGGCAATTTGGG	16993

BX571983.12	1451	CAACGGTATTAGGCGACAAGCCTTGGAGAAACGATCAACCACCGTGAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	16994	CAACGGTATTAGGCGACAAGCCTTGGAGAAACGATCAACCACCGTGAGAA	17043

BX571983.12	1501	TGACTGTGTTGTTCTGGGAAACAGGGAGATCCGTAATGAAGTCCACCGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17044	TGACTGTGTTGTTCTGGGAAACAGGGAGATCCGTAATGAAGTCCACCGCT	17093

BX571983.12	1551	ATATGGGACCAGGGCCGTTGCGGAACCGGTAGCGGTTGTAACAGGCCAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17094	ATATGGGACCAGGGCCGTTGCGGAACCGGTAGCGGTTGTAACAGGCCAGC	17143

BX571983.12	1601	AGGGGTTTGGTGAGATGCCTTCGTGCTTTGGCAAATTTTACATTTCTGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17144	AGGGGTTTGGTGAGATGCCTTCGTGCTTTGGCAAATTTTACATTTCTGAA	17193

BX571983.12	1651	CATAATTAATTACATCCTTCGTGAGGGACGGCCACCAGAAACGGGCTTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17194	CATAATTAATTACATCCTTCGTGAGGGACGGCCACCAGAAACGGGCTTTG	17243

BX571983.12	1701	ACTAACTCCAAAGTTGCAGTGATGCCTGGATGCCCCGAACTGGGAGTGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17244	ACTAACTCCAAAGTTGCAGTGATGCCTGGATGCCCCGAACTGGGAGTGTC	17293

BX571983.12	1751	ATGAATATGGGTCAGTAATCTGGTACGTATGTTATTGGGTACAAAAATCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17294	ATGAATATGGGTCAGTAATCTGGTACGTATGTTATTGGGTACAAAAATCA	17343

BX571983.12	1801	GGTGATTCGGACAGTCTACTGGAGGGTTGTTTTCTCGGTTGGCCTCTTGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17344	GGTGATTCGGACAGTCTACTGGAGGGTTGTTTTCTCGGTTGGCCTCTTGG	17393

BX571983.12	1851	ATCTCGGTAAGTATGTCCCACTGTACTGGAGCCACTAGTAAGTTCGTAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17394	ATCTCGGTAAGTATGTCCCACTGTACTGGAGCCACTAGTAAGTTCGTAGG	17443

BX571983.12	1901	AATAATGGTTTCATCACTAATTGGGGTTTTATCCTCTGATAGCCTGGATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17444	AATAATGGTTTCATCACTAATTGGGGTTTTATCCTCTGATAGCCTGGATA	17493

BX571983.12	1951	GTGCATCTGCCTTACTATTTTTACTCCCTGGTCTATAGGTGACAATGAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450731.8	17494	GTGCATCTGCCTTACTATTTTTACTCCCTGGTCTATAGGTGACAATGAAG	17543

Overview

Query
BX571983.12 - 248929 bps
Hit
CR450731.8 - 17543 bps
Total alignments
39
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001997200012000115544175431
282.36832093489435102-1206522681
385.42981911702091703991206522561
483.6689202110176110377-1206722681
59041622710627167-1207721361
690.9131442699027033-1222522681
797.73404499785998281222522681
897.26357342399424711699870701
998.61357282401824721699970701
1098.5935711112401113101700070701
1198.5734708243782506-1700170701
1298.5534691598816056-1700270701
1398.5534694240842476-1700270701
1410035657761077674-1700270661
1598.553469111243111311-1700270701
1698.553469122408122476-1700270701
1798.593771237584237654-1700270721
1898.59377116041161111700270721
19100316377613776751700270641
2098.5534691224071224751700270701
2197.2635732375952376671700270741
2298.53326760976610421700470711
2310048914246142551-1968997791
2497.841921112381113291968997791
251003776122407122482-1969497691
2697.784089237578237666-1969697851
2710040831598716069-1969797791
2897.8442948240182494-1969797891
291004586111239111324-1969797821
30100408315988160701969797791
31100408342408424901969797791
32100418482423825061969797801
3310039802375862376651969797761
3410036731224071224791969897701
3510032657761277676-1971497781
36100336777612776781971597811
3791.4629042553725796111939123361
3890225344159988160331-111946122851
3910045145747165172115508159641
Short-link