<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX321890.5	145232	TCTCCAGAAGAAAAAAAAGTATAGGAAATACTGTGAAAAATTCCTTGCTC	145281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1	TCTCCAGAAGAAAAAAAAGTATAGGAAATACTGTGAAAAATTCCTTGCTC	50

BX321890.5	145282	TGTTAAACAGATTTTGGGAAATATTTGACGAAGAGACAAAAAAAAATAAA	145331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	51	TGTTAAACAGATTTTGGGAAATATTTGACGAAGAGACAAAAAAAAATAAA	100

BX321890.5	145332	TTACAGGAGGGCTGATAATTTTGATTTTGATTGTACATGGAGTGTTTTGC	145381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	101	TTACAGGAGGGCTGATAATTTTGATTTTGATTGTACATGGAGTGTTTTGC	150

BX321890.5	145382	ATTATATTGTGAAGATGTGTCTTGTAGCACGTGCAATAGTCACCAGTGTT	145431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	151	ATTATATTGTGAAGATGTGTCTTGTAGCACGTGCAATAGTCACCAGTGTT	200

BX321890.5	145432	GCTAGTTGTTTAAGCATGTGATAATGCTGCTTTCAGTCATCGTTGCTAAA	145481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	201	GCTAGTTGTTTAAGCATGTGATAATGCTGCTTTCAGTCATCGTTGCTAAA	250

BX321890.5	145482	TTACTGCAGAGGAACATGTTTGTAATAAGTTACAGGAGGATGTTGTTTTT	145531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	251	TTACTGCAGAGGAACATGTTTGTAATAAGTTACAGGAGGATGTTGTTTTT	300

BX321890.5	145532	GGGAGTGTGTATCCGTGTCCTTTTCTGCTCATTTACTGATCTCTTACGTC	145581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	301	GGGAGTGTGTATCCGTGTCCTTTTCTGCTCATTTACTGATCTCTTACGTC	350

BX321890.5	145582	CTGAACAAGAGTGGCGTGTCAAAGCAGAGCACTGACACAGCAGAAAAAGC	145631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	351	CTGAACAAGAGTGGCGTGTCAAAGCAGAGCACTGACACAGCAGAAAAAGC	400

BX321890.5	145632	TAATTTGTGAGGTCAAATCTATGGACTGTAACCGGGAACGATGGAGAAAC	145681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	401	TAATTTGTGAGGTCAAATCTATGGACTGTAACCGGGAACGATGGAGAAAC	450

BX321890.5	145682	ACAGGAAGGAGGGGTGGATTTGACCTTTAAGATGAAATAGAGATATTTAC	145731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	451	ACAGGAAGGAGGGGTGGATTTGACCTTTAAGATGAAATAGAGATATTTAC	500

BX321890.5	145732	TGTAGCAGATAATTGAACGCTATGGAACATTGACACATTTATTAATCAAT	145781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	501	TGTAGCAGATAATTGAACGCTATGGAACATTGACACATTTATTAATCAAT	550

BX321890.5	145782	GTGAATCCTGGAATCACTTGGGTATTGGCAGTCTCAGAGCCTGGAATTGT	145831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	551	GTGAATCCTGGAATCACTTGGGTATTGGCAGTCTCAGAGCCTGGAATTGT	600

BX321890.5	145832	GGAAGTCTGGAGCAAACCACATAAAAGTTTTAAGGACAGGAATGGTTTTC	145881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	601	GGAAGTCTGGAGCAAACCACATAAAAGTTTTAAGGACAGGAATGGTTTTC	650

BX321890.5	145882	AGAAAGGGGATGTGTGCCAGTCATGGGGGAAGTGGTTTGTGCTAAAGGCA	145931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	651	AGAAAGGGGATGTGTGCCAGTCATGGGGGAAGTGGTTTGTGCTAAAGGCA	700

BX321890.5	145932	GCAGTGGAACATCCAATATAGATAAAGCAGGGTACAAACACAGACAGACA	145981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	701	GCAGTGGAACATCCAATATAGATAAAGCAGGGTACAAACACAGACAGACA	750

BX321890.5	145982	CACATACTAAAATCTGAGATGAAGACAAAATATGTACTGTCTCAATCTTT	146031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	751	CACATACTAAAATCTGAGATGAAGACAAAATATGTACTGTCTCAATCTTT	800

BX321890.5	146032	TCTGATTATTAATGTCCCTTTTTTGACCACTTTTCATTTTTTTAAACCTT	146081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	801	TCTGATTATTAATGTCCCTTTTTTGACCACTTTTCATTTTTTTAAACCTT	850

BX321890.5	146082	TTTAGCACAAAAAGAGGGTAAAATAAAATAGGGAATAAATAAAAAGGAAT	146131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	851	TTTAGCACAAAAAGAGGGTAAAATAAAATAGGGAATAAATAAAAAGGAAT	900

BX321890.5	146132	GGAATTAAAAGGTCACCAGAGACATCATATACAGCTCGTGCATCATTCAT	146181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	901	GGAATTAAAAGGTCACCAGAGACATCATATACAGCTCGTGCATCATTCAT	950

BX321890.5	146182	ATGCAGTTTTGGCTTTTTATGACAGTTATATATTTTTGTTTGGACATACA	146231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	951	ATGCAGTTTTGGCTTTTTATGACAGTTATATATTTTTGTTTGGACATACA	1000

BX321890.5	146232	GTCCCATTGGGCTCCTCTCCATCAGAAATAAAAACTGGATAGAGGCATAG	146281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1001	GTCCCATTGGGCTCCTCTCCATCAGAAATAAAAACTGGATAGAGGCATAG	1050

BX321890.5	146282	TAAATAAAATACCTTTAATAAATACCTTTTAAGAAACATGACGCACTCCA	146331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1051	TAAATAAAATACCTTTAATAAATACCTTTTAAGAAACATGACGCACTCCA	1100

BX321890.5	146332	TAATCATGTAATGTCCCACTTTTTAAGCACATGTACAGGATGACGATTTA	146381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1101	TAATCATGTAATGTCCCACTTTTTAAGCACATGTACAGGATGACGATTTA	1150

BX321890.5	146382	AGTGTATATAGAAAGTTTTTTGCTGTATCATTTATATTATGACATATATA	146431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1151	AGTGTATATAGAAAGTTTTTTGCTGTATCATTTATATTATGACATATATA	1200

BX321890.5	146432	TCTGCAAGCATGCATGAATGAGACACTATTTTGGGCTGATGGACATAACT	146481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1201	TCTGCAAGCATGCATGAATGAGACACTATTTTGGGCTGATGGACATAACT	1250

BX321890.5	146482	GAAGCACTCACACAGAAAGTATTGCTCTCAGACTGCTTGTAATCCCAAAT	146531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1251	GAAGCACTCACACAGAAAGTATTGCTCTCAGACTGCTTGTAATCCCAAAT	1300

BX321890.5	146532	TCATTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTTATTGCACTTGAATGGCCAGATGTGA	146581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1301	TCATTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTTATTGCACTTGAATGGCCAGATGTGA	1350

BX321890.5	146582	CACTGTCAGAATTGTCTTAAGTGAATAGCAGAACTTTGTGGTTTATTAGG	146631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1351	CACTGTCAGAATTGTCTTAAGTGAATAGCAGAACTTTGTGGTTTATTAGG	1400

BX321890.5	146632	TCTTAATATATTAATAAAACAAAGAACAAAAGACAGAGAAAACAGCTTAC	146681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1401	TCTTAATATATTAATAAAACAAAGAACAAAAGACAGAGAAAACAGCTTAC	1450

BX321890.5	146682	AGCTTTTGTTTTGACTTTAAAAATCAATACGTTTTCATGGAGTGTTCATG	146731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1451	AGCTTTTGTTTTGACTTTAAAAATCAATACGTTTTCATGGAGTGTTCATG	1500

BX321890.5	146732	ATACACTTTCTTCCACTTACTGCTGAACGTGTGATAAATTATATTCGGTG	146781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1501	ATACACTTTCTTCCACTTACTGCTGAACGTGTGATAAATTATATTCGGTG	1550

BX321890.5	146782	TGTGTGTGTGCCTGCATTTGTCCTTTTATCCCTTGCTGTAATATCACACA	146831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1551	TGTGTGTGTGCCTGCATTTGTCCTTTTATCCCTTGCTGTAATATCACACA	1600

BX321890.5	146832	TCAATGATTTTTAAAGGCCAGCTGGTCACGTGCTGCAGTGCTGACTGTAT	146881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1601	TCAATGATTTTTAAAGGCCAGCTGGTCACGTGCTGCAGTGCTGACTGTAT	1650

BX321890.5	146882	AGGGTATTCAACCAATAAAGCAAATGAAAAGATTTATATCAGATACTCTT	146931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1651	AGGGTATTCAACCAATAAAGCAAATGAAAAGATTTATATCAGATACTCTT	1700

BX321890.5	146932	CTATCATTGGCCAAGGTTAATAGAATTGTTTGACCGAGAACATTGTTGTT	146981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1701	CTATCATTGGCCAAGGTTAATAGAATTGTTTGACCGAGAACATTGTTGTT	1750

BX321890.5	146982	GTTGAGAAAGAAAAGCGAGAGAGGGAGATTTCAGAGAAATGTAGGAAGAA	147031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1751	GTTGAGAAAGAAAAGCGAGAGAGGGAGATTTCAGAGAAATGTAGGAAGAA	1800

BX321890.5	147032	TGCTTGCCAGTAGTATTGGAGAAACCTTTATTAAGTGATAAACAGAGGGA	147081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1801	TGCTTGCCAGTAGTATTGGAGAAACCTTTATTAAGTGATAAACAGAGGGA	1850

BX321890.5	147082	TTTCGTGCATGACTGACTGCCAGCTTCACATGCCTGTTGTTATGTAAGAG	147131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1851	TTTCGTGCATGACTGACTGCCAGCTTCACATGCCTGTTGTTATGTAAGAG	1900

BX321890.5	147132	CACTCCTAAGAGTTAACCAGTTCCTTTCCTTCTTCAGCAAGCTAGCTTGT	147181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1901	CACTCCTAAGAGTTAACCAGTTCCTTTCCTTCTTCAGCAAGCTAGCTTGT	1950

BX321890.5	147182	GTGCTTTTTACAGCGTGACAACATGCACTTTTTGTCTTTTGCCTGAATTC	147231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR450689.6	1951	GTGCTTTTTACAGCGTGACAACATGCACTTTTTGTCTTTTGCCTGAATTC	2000

Overview

Query
BX321890.5 - 147231 bps
Hit
CR450689.6 - 120558 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194120001452321472311120001
294.1611213751195255116460165961
396.27118134126813126946116463165961
493.331171513759037740-116467166161
582.411283273741337739119514198541
692.8697126126818126943-119729198541
792.689312351275249-119732198541
881.4275182144432144613-134176343581
987.317913351235255-154261543941
1088.9786135126812126946-154261543961
1190.581371917622976419-169481696711
1291.4185127101146101272-172393725201
1387.76115196102859103054188624888111
1494.481151443759737740188823889671
1582.7497220117254117473197724979431
1685.151072022289623097197733979341
1780.5115453100949101401199095995761
1887.79801305126525511066381067681
1988.558313012681712694611066381067681
2092109151375903774011132311133801
2190.349814810304410319111132361133801
2293.0810113051265255-11132511133801
2393.85104130126817126946-11132511133801
Short-link