<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753818.5	1	TGTGGGGTCTATTTTCCGGTGGCTTTCCCTGTTGGTTGCCCCTGTGACTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77326	TGTGGGGTCTATTTTCCGGTGGCTTTCCCTGTTGGTTGCCCCTGTGACTG	77375

CR753818.5	51	CTGACATCCTGCCTTCTGGTGGAAACCACACTCTTCCTTGCCCAGTGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77376	CTGACATCCTGCCTTCTGGTGGAAACCACACTCTTCCTTGCCCAGTGAGG	77425

CR753818.5	101	GTTGGAAAATTGGATGACTAAACTCGACGAAGATAGCAAATAACATTTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77426	GTTGGAAAATTGGATGACTAAACTCGACGAAGATAGCAAATAACATTTGT	77475

CR753818.5	151	TCTGCGTGGGTGCCATCATCACCTGCACTTGAAAGCAAGGCTGAGGTGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77476	TCTGCGTGGGTGCCATCATCACCTGCACTTGAAAGCAAGGCTGAGGTGCA	77525

CR753818.5	201	GAAGACACAAAATGTGGCCATGTCCCTTGGCTGGCAAGTGGCCTAGGGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77526	GAAGACACAAAATGTGGCCATGTCCCTTGGCTGGCAAGTGGCCTAGGGGC	77575

CR753818.5	251	AATGTGAGCCTGAGTGTATGACACTGTGACACAGGACAGGGTGCGTCACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77576	AATGTGAGCCTGAGTGTATGACACTGTGACACAGGACAGGGTGCGTCACA	77625

CR753818.5	301	GTGTTGCCCATTGTGACTGCAGGGCCAAAAGGAACCAGGGCTGAGAGGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77626	GTGTTGCCCATTGTGACTGCAGGGCCAAAAGGAACCAGGGCTGAGAGGAA	77675

CR753818.5	351	CCTGGAGACATGCTAGGGTGGGGCCAAACGAGGGCTTGGAGAGAGCCTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77676	CCTGGAGACATGCTAGGGTGGGGCCAAACGAGGGCTTGGAGAGAGCCTCC	77725

CR753818.5	401	ACCCACCCTCACAGGGCCTGGTGGAGACAGACCGAGGAGGGGCACCTGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77726	ACCCACCCTCACAGGGCCTGGTGGAGACAGACCGAGGAGGGGCACCTGCC	77775

CR753818.5	451	CCTCTCCCCTTGCAGAGTGGAATGATAGCTGATGACATCATTTTGAAAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77776	CCTCTCCCCTTGCAGAGTGGAATGATAGCTGATGACATCATTTTGAAAGT	77825

CR753818.5	501	CACAGTACTACAGAGATGTTTGGACACTCATCAGAGGCAGACCTGCTGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77826	CACAGTACTACAGAGATGTTTGGACACTCATCAGAGGCAGACCTGCTGTG	77875

CR753818.5	551	GGAAAGTCAAGGCCTTGGTGCGGAAACCTAAGATTCTGCAAACTGGAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77876	GGAAAGTCAAGGCCTTGGTGCGGAAACCTAAGATTCTGCAAACTGGAACA	77925

CR753818.5	601	GGGTTATCCTATGGGTGCCCTTTAGAACTCTCTGGGCATGCAGAGGAGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77926	GGGTTATCCTATGGGTGCCCTTTAGAACTCTCTGGGCATGCAGAGGAGGC	77975

CR753818.5	651	TCGCCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTCCTACACTGGAAGTTGCTGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	77976	TCGCCCTTCTCTAGTAATGGTTCCCACTTCCTACACTGGAAGTTGCTGCA	78025

CR753818.5	701	GAAACCTCACCCCTATGATGCAGTGGGAATTCCACTCAGGAGCTTTGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78026	GAAACCTCACCCCTATGATGCAGTGGGAATTCCACTCAGGAGCTTTGCAG	78075

CR753818.5	751	TAACAGCCGTTATGTCCCCGTAGGAGCCTGAGGAGCAGTTCTGGGATTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78076	TAACAGCCGTTATGTCCCCGTAGGAGCCTGAGGAGCAGTTCTGGGATTGG	78125

CR753818.5	801	AATTTAAGGGTGTTTGATCAAAGGGCCAGAATCAAGCTGGATAAATTAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78126	AATTTAAGGGTGTTTGATCAAAGGGCCAGAATCAAGCTGGATAAATTAAA	78175

CR753818.5	851	AAAAACACCTTTGGCTTGGGAGCACTTTCTCAGGGTATGGGTTTATCAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78176	AAAAACACCTTTGGCTTGGGAGCACTTTCTCAGGGTATGGGTTTATCAAG	78225

CR753818.5	901	GACCTCAGGGCATGGGGCAAACCCACTGCTGGGGTGGACCCATGTAGACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78226	GACCTCAGGGCATGGGGCAAACCCACTGCTGGGGTGGACCCATGTAGACT	78275

CR753818.5	951	GGAAAAAATGATGTCCAACTCTCAGTAAGTTAGACATGAGTTAGTTGTCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78276	GGAAAAAATGATGTCCAACTCTCAGTAAGTTAGACATGAGTTAGTTGTCC	78325

CR753818.5	1001	TGGAACATGTAGAGGATGGATAATGAGGCTGAGGGAAGTGGGTGTGTGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78326	TGGAACATGTAGAGGATGGATAATGAGGCTGAGGGAAGTGGGTGTGTGGG	78375

CR753818.5	1051	ATGGAGACATCATGTGAACCAGAATGCCCACTAGGGCCATGCTCCACAGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78376	ATGGAGACATCATGTGAACCAGAATGCCCACTAGGGCCATGCTCCACAGA	78425

CR753818.5	1101	GGACCCATAGGGCACACCTTCCACCAGAGCCTCAGGAATGTGCTGGTGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78426	GGACCCATAGGGCACACCTTCCACCAGAGCCTCAGGAATGTGCTGGTGAG	78475

CR753818.5	1151	AGGGACTTGCATTGCTAAGAAGCGTCGGGGTGGTGTCCTCTGCAGGCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78476	AGGGACTTGCATTGCTAAGAAGCGTCGGGGTGGTGTCCTCTGCAGGCTGG	78525

CR753818.5	1201	GTGTGATGGCAGGAAGGAGGTCCTATAGTTGGGCTCATTGATATTCCTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78526	GTGTGATGGCAGGAAGGAGGTCCTATAGTTGGGCTCATTGATATTCCTGA	78575

CR753818.5	1251	GGAAAGTGTGGCCTTGAAAAGGCAGAGAACTAAATGGTGACAGTGGCCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78576	GGAAAGTGTGGCCTTGAAAAGGCAGAGAACTAAATGGTGACAGTGGCCTG	78625

CR753818.5	1301	CAAAAGCCAGAGGGCACGGTTAACTTGACAATCTCAGAGGAGCAGCTGAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78626	CAAAAGCCAGAGGGCACGGTTAACTTGACAATCTCAGAGGAGCAGCTGAG	78675

CR753818.5	1351	GCAGCTTGATCTGCAGGGAGTTGTGGGGAAGGTTAATAGAGGGTGGTGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78676	GCAGCTTGATCTGCAGGGAGTTGTGGGGAAGGTTAATAGAGGGTGGTGTC	78725

CR753818.5	1401	AGAAAAGACAGCAGCCAACAAGGGCACTGCTTGACATCTATGATAAGAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78726	AGAAAAGACAGCAGCCAACAAGGGCACTGCTTGACATCTATGATAAGAAA	78775

CR753818.5	1451	GCAAGAATTGATGAGCAGGGGGCTGAGGGTGTTTAACTCAATACAAAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78776	GCAAGAATTGATGAGCAGGGGGCTGAGGGTGTTTAACTCAATACAAAGTC	78825

CR753818.5	1501	ATGATCCCATTCTCAATTCCTAAATGTCAACCAAGTTTCAGATTCAGATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78826	ATGATCCCATTCTCAATTCCTAAATGTCAACCAAGTTTCAGATTCAGATC	78875

CR753818.5	1551	CCAGTTACAGAGAAGGAGTCCCTATCCCAGGAGGAAGGACCCTGGAACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78876	CCAGTTACAGAGAAGGAGTCCCTATCCCAGGAGGAAGGACCCTGGAACCT	78925

CR753818.5	1601	CATGGCAAGTATATGCTGGAACAATTCCCTCTGTCTTTCTGCAAAGGAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78926	CATGGCAAGTATATGCTGGAACAATTCCCTCTGTCTTTCTGCAAAGGAGC	78975

CR753818.5	1651	CTACAGTCATTTACTCAGGGGACTGTACACTAGGAAAGGGAAACAGGCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	78976	CTACAGTCATTTACTCAGGGGACTGTACACTAGGAAAGGGAAACAGGCAG	79025

CR753818.5	1701	AATTTGGGGGAGTGTTGACATTGGGTGTGAGCTAATATTGATGCCTACAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79026	AATTTGGGGGAGTGTTGACATTGGGTGTGAGCTAATATTGATGCCTACAG	79075

CR753818.5	1751	GCCTACAGCACCATTATGTCCCCAGCACAGTGGGGCTTACAGAAGCTGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79076	GCCTACAGCACCATTATGTCCCCAGCACAGTGGGGCTTACAGAAGCTGGG	79125

CR753818.5	1801	AATAAATCTGGACACATCACAAAGAGACTACTGGGTCCACAGACCCAGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79126	AATAAATCTGGACACATCACAAAGAGACTACTGGGTCCACAGACCCAGCC	79175

CR753818.5	1851	CTGTTTATCTCCCCATTCTCCAAGTGTGTAATTGGCATTGATGCCCTGGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79176	CTGTTTATCTCCCCATTCTCCAAGTGTGTAATTGGCATTGATGCCCTGGC	79225

CR753818.5	1901	AGCTGGAGTAACCCCCACATTGGGTCCCAAGTCTCTGGAATAAGGGCTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79226	AGCTGGAGTAACCCCCACATTGGGTCCCAAGTCTCTGGAATAAGGGCTGT	79275

CR753818.5	1951	CATTTTCTGAAAGCCAAAGGGAAACCTCTGCAACTGACTTCATCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388408.5	79276	CATTTTCTGAAAGCCAAAGGGAAACCTCTGCAACTGACTTCATCTTGGCC	79325

Overview

Query
CR753818.5 - 37833 bps
Hit
CR388408.5 - 79325 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link