<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759770.3	1	CCAGAGGATTTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157367	CCAGAGGATTTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGG	157416

CR759770.3	51	CAAAACCCTGTCTCTATGAAAATTACAAAAATTAGCCCGGTGTGGTGGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157417	CAAAACCCTGTCTCTATGAAAATTACAAAAATTAGCCCGGTGTGGTGGCA	157466

CR759770.3	101	CAAGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATCACCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157467	CAAGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAGGATCACCTG	157516

CR759770.3	151	AGCCCGGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGCAGGGATCGTGCCACTGCACTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157517	AGCCCGGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGCAGGGATCGTGCCACTGCACTTC	157566

CR759770.3	201	AACCTGGGTGACAGAGTGAAACACTGTCTCAAAATTAAAACAGATAAAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157567	AACCTGGGTGACAGAGTGAAACACTGTCTCAAAATTAAAACAGATAAAAT	157616

CR759770.3	251	AAAAATATAGCTCATACTGGTACCATGCACAAGTAGATTTGTCAAAGGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157617	AAAAATATAGCTCATACTGGTACCATGCACAAGTAGATTTGTCAAAGGTC	157666

CR759770.3	301	AGGGCCACCTTCACTCAGAGTCTCTTCCGTTGGTTGCCAACTTGTAAACG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157667	AGGGCCACCTTCACTCAGAGTCTCTTCCGTTGGTTGCCAACTTGTAAACG	157716

CR759770.3	351	AAAAAGTATGTCAGATAGGTCTCAATCAGTTTAGAATTTTCATTTTGCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157717	AAAAAGTATGTCAGATAGGTCTCAATCAGTTTAGAATTTTCATTTTGCCA	157766

CR759770.3	401	AGGTTAAGGACGCACCCAGGAAACAGGTATATGTACCTTTCTCAAAGATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157767	AGGTTAAGGACGCACCCAGGAAACAGGTATATGTACCTTTCTCAAAGATG	157816

CR759770.3	451	ATTGTGAGGGCTTCAATATTTAAAGGTGAGAAGTGGGCTAGATGGGAAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157817	ATTGTGAGGGCTTCAATATTTAAAGGTGAGAAGTGGGCTAGATGGGAAAG	157866

CR759770.3	501	AGGGTGTGGTTATCCACATGTTGCAAGAGAAAAGGAGTAGGCAGGAAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157867	AGGGTGTGGTTATCCACATGTTGCAAGAGAAAAGGAGTAGGCAGGAAAAC	157916

CR759770.3	551	AGTCAATTATGGATTCATCTCACACTCAGTAATAGGCCCTTTACATAAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157917	AGTCAATTATGGATTCATCTCACACTCAGTAATAGGCCCTTTACATAAGG	157966

CR759770.3	601	TGAACATAAGACTAGCTACTTGAGGAGCTATTTAACCTTCTATCTGTAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	157967	TGAACATAAGACTAGCTACTTGAGGAGCTATTTAACCTTCTATCTGTAGC	158016

CR759770.3	651	TATCTGCTGAGGAACAAAAGGAAAGACAGTTTTTTGCATGACTCAGCTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158017	TATCTGCTGAGGAACAAAAGGAAAGACAGTTTTTTGCATGACTCAGCTTT	158066

CR759770.3	701	CAGCTTAATTTTTTCCATTTGGCATAGTGAATTGGAGTCCTGAGTTTTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158067	CAGCTTAATTTTTTCCATTTGGCATAGTGAATTGGAGTCCTGAGTTTTAT	158116

CR759770.3	751	TTTCCTTTCCCACCTCAAACCCCACAAGCTTTGCGTTGTTGCAGATTGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158117	TTTCCTTTCCCACCTCAAACCCCACAAGCTTTGCGTTGTTGCAGATTGTC	158166

CR759770.3	801	CCTCTCAGAATATTTTACAAGATGGTGAAGTGCCTAATGAACATTTCTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158167	CCTCTCAGAATATTTTACAAGATGGTGAAGTGCCTAATGAACATTTCTTT	158216

CR759770.3	851	TGTCATAAAGTGAGTTTGGATCCTGAAGAAGCCATCATCTTAATCAGGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158217	TGTCATAAAGTGAGTTTGGATCCTGAAGAAGCCATCATCTTAATCAGGCT	158266

CR759770.3	901	TTGGGATCAAAGTTCCCCTTCACCCGAACCCTGAACAGCACAGCAGACAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158267	TTGGGATCAAAGTTCCCCTTCACCCGAACCCTGAACAGCACAGCAGACAG	158316

CR759770.3	951	GGAAGGACTTACTGAGATGGCTGCTCCCACTCTCCAGCCCCCACTTTCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158317	GGAAGGACTTACTGAGATGGCTGCTCCCACTCTCCAGCCCCCACTTTCCT	158366

CR759770.3	1001	GACCATTCCTGGCAGGAAGAGCTGCTGAGCAGACTCCATGGGCTGCCCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158367	GACCATTCCTGGCAGGAAGAGCTGCTGAGCAGACTCCATGGGCTGCCCAC	158416

CR759770.3	1051	ACAGGGTCTGGACCTAGCTGTCTTCCTGTGCCCAGCAGCCTGTGAGCCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158417	ACAGGGTCTGGACCTAGCTGTCTTCCTGTGCCCAGCAGCCTGTGAGCCAT	158466

CR759770.3	1101	CCCAGTCCCCTATGTGCAGTGGTCAGCACCCACAAGCCAGCCTTCATAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158467	CCCAGTCCCCTATGTGCAGTGGTCAGCACCCACAAGCCAGCCTTCATAGG	158516

CR759770.3	1151	GATTCAGTTCATGGGTGTTGCCCTGAGCCTGGCACAGTGGCCTCCCCAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158517	GATTCAGTTCATGGGTGTTGCCCTGAGCCTGGCACAGTGGCCTCCCCAGC	158566

CR759770.3	1201	TTAGCATCTGCAGTTCGGGTCAGGGTGTTCTTAACGGCCCTCACCTATGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158567	TTAGCATCTGCAGTTCGGGTCAGGGTGTTCTTAACGGCCCTCACCTATGC	158616

CR759770.3	1251	CTTTTCTGGCCACACATGAGTTTGGATGAAGCAGGAGTCTCTTCCATAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158617	CTTTTCTGGCCACACATGAGTTTGGATGAAGCAGGAGTCTCTTCCATAGC	158666

CR759770.3	1301	TCCTTTTCATCTGAGATGTCCATGACTGGCTCAAGTGAACCACAGTGTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158667	TCCTTTTCATCTGAGATGTCCATGACTGGCTCAAGTGAACCACAGTGTCA	158716

CR759770.3	1351	GGAGAGGGGCACGGAAGCTGCACCCTAAATTCCCCGGGACCTGTGGCAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158717	GGAGAGGGGCACGGAAGCTGCACCCTAAATTCCCCGGGACCTGTGGCAGG	158766

CR759770.3	1401	CCTTCCTGGTGACCTCTGCCTTCTCAGGTGACTTCTGCCCTCCTGGGTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158767	CCTTCCTGGTGACCTCTGCCTTCTCAGGTGACTTCTGCCCTCCTGGGTGA	158816

CR759770.3	1451	CATTAGTTCTCCCCTCTCAAGTGATCTGTGCCCTCCTAGGTTACCTCAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158817	CATTAGTTCTCCCCTCTCAAGTGATCTGTGCCCTCCTAGGTTACCTCAGC	158866

CR759770.3	1501	TCTCCCAGGTGACCTCTGCCTTTCCAGATGACTTCAGTCTTTTCAGGTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158867	TCTCCCAGGTGACCTCTGCCTTTCCAGATGACTTCAGTCTTTTCAGGTGA	158916

CR759770.3	1551	CCTCAGCCCTCCTAAGTGACATTAGTCCTCCCTGGTTATCTCTGCCCTCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158917	CCTCAGCCCTCCTAAGTGACATTAGTCCTCCCTGGTTATCTCTGCCCTCC	158966

CR759770.3	1601	CTGGTGAACTCAGGTCTTCCAGGGGACCTCTGCTTTCCCAGATGATCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	158967	CTGGTGAACTCAGGTCTTCCAGGGGACCTCTGCTTTCCCAGATGATCTCT	159016

CR759770.3	1651	GCCTTCTCAGGTGACATTAGTCCTCCTAGGGGATATTAACTCTCCCAAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159017	GCCTTCTCAGGTGACATTAGTCCTCCTAGGGGATATTAACTCTCCCAAGT	159066

CR759770.3	1701	GACCTCTTCCCTTCCAAGTGACCTGTTTCCTCAGGTGACCTCAGCTCTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159067	GACCTCTTCCCTTCCAAGTGACCTGTTTCCTCAGGTGACCTCAGCTCTGC	159116

CR759770.3	1751	CAGGGGACTTCTGCCTTTCCAGGTAACCTCTGCCCTCTTGGTGACATAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159117	CAGGGGACTTCTGCCTTTCCAGGTAACCTCTGCCCTCTTGGTGACATAGT	159166

CR759770.3	1801	GTGCTCAGGTGACATTAGCCCTCTCAGGTGACCTCAACCCTCCAAGGTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159167	GTGCTCAGGTGACATTAGCCCTCTCAGGTGACCTCAACCCTCCAAGGTGA	159216

CR759770.3	1851	CGTCAGCCTTGGTGAAGTCTTTCCATGATGACTTTGGCTTTTGCCAGAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159217	CGTCAGCCTTGGTGAAGTCTTTCCATGATGACTTTGGCTTTTGCCAGAGG	159266

CR759770.3	1901	TAGGCTACTGCGGGGGCATAAGCCATATCATGCCATGAGCCACTATCCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159267	TAGGCTACTGCGGGGGCATAAGCCATATCATGCCATGAGCCACTATCCTG	159316

CR759770.3	1951	CTCATGTTCCAGAATGAGGAGACATCTGGGTGCTGGCCCAGCTGCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388393.8	159317	CTCATGTTCCAGAATGAGGAGACATCTGGGTGCTGGCCCAGCTGCTGGCC	159366

Overview

Query
CR759770.3 - 52550 bps
Hit
CR388393.8 - 159366 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link