<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759281.4	1	AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGCTGGGAGTTTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107068	AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGCTGGGAGTTTGA	107117

CR759281.4	51	GACCAGCCTGACCAACATAGAAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107118	GACCAGCCTGACCAACATAGAAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAA	107167

CR759281.4	101	TTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCCGCTACATGGGAGGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107168	TTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCCGCTACATGGGAGGCT	107217

CR759281.4	151	GAGGCAGGTGAATCACTTGAAACTGGGAAGTGGGCATTGTGGTAAGCCGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107218	GAGGCAGGTGAATCACTTGAAACTGGGAAGTGGGCATTGTGGTAAGCCGA	107267

CR759281.4	201	GATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATCAAAACTCTGTATC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107268	GATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATCAAAACTCTGTATC	107317

CR759281.4	251	AAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGACAAGCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107318	AAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGACAAGCTT	107367

CR759281.4	301	GAAAATGCCTACAGAATGTATTAACCTAAAAATGACCTGTTTTTCAAAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107368	GAAAATGCCTACAGAATGTATTAACCTAAAAATGACCTGTTTTTCAAAAG	107417

CR759281.4	351	AACTAAAGTTAGTTTTTAGGAAGTAAAATTAACTTTGATTTTAAAATTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107418	AACTAAAGTTAGTTTTTAGGAAGTAAAATTAACTTTGATTTTAAAATTTT	107467

CR759281.4	401	TAACTTAGTTGAATTAAAAATTGAAAAGTCATGATCTATTGACTTTTGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107468	TAACTTAGTTGAATTAAAAATTGAAAAGTCATGATCTATTGACTTTTGCT	107517

CR759281.4	451	TTGGATTATGATGGAATAACAAGGACCAGATTTACTCTCATGCCTTAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107518	TTGGATTATGATGGAATAACAAGGACCAGATTTACTCTCATGCCTTAAGC	107567

CR759281.4	501	ACAACAAACTCAAAATAATATATGAAAAAATAGCTATGTACTCAGATACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107568	ACAACAAACTCAAAATAATATATGAAAAAATAGCTATGTACTCAGATACT	107617

CR759281.4	551	AGACAGCAGGTATCCCAGAGACTGTGATCTCTGGGAGAAGGGGAATGGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107618	AGACAGCAGGTATCCCAGAGACTGTGATCTCTGGGAGAAGGGGAATGGAA	107667

CR759281.4	601	AAGGTAAGGTCTACAGTTGTCCAGCTTCCTTCCTGGACAGAGTTTCCAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107668	AAGGTAAGGTCTACAGTTGTCCAGCTTCCTTCCTGGACAGAGTTTCCAAG	107717

CR759281.4	651	GCAGAGTGCAGAGAGGCAGAGCCCTAACCAGGAGGTTCACTGAGGTGAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107718	GCAGAGTGCAGAGAGGCAGAGCCCTAACCAGGAGGTTCACTGAGGTGAGG	107767

CR759281.4	701	GGACAGAGTTGTGAACTTGGAGATTCCAGGACATCCAGAATATGCAAAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107768	GGACAGAGTTGTGAACTTGGAGATTCCAGGACATCCAGAATATGCAAAGA	107817

CR759281.4	751	TGAAGGCACATAGAAAAGACAGCTGATGATAAAAAGCACTGTAAGTCTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107818	TGAAGGCACATAGAAAAGACAGCTGATGATAAAAAGCACTGTAAGTCTGC	107867

CR759281.4	801	AGGAGGTACCCCTCAAATTTTCAGTTAATCAGCATATTATATAAGGGAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107868	AGGAGGTACCCCTCAAATTTTCAGTTAATCAGCATATTATATAAGGGAAC	107917

CR759281.4	851	TACCCAAAGACAGGGAAAGAATTATCCGAAAGGACTTCAGAGAATAGTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107918	TACCCAAAGACAGGGAAAGAATTATCCGAAAGGACTTCAGAGAATAGTAC	107967

CR759281.4	901	CCAGTGATATACAGGGCTGGAAATAATGCCTGTTCCCACTAGCCAGACTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	107968	CCAGTGATATACAGGGCTGGAAATAATGCCTGTTCCCACTAGCCAGACTG	108017

CR759281.4	951	GAAAACCTCATAATTTGCTGAGCATTGGATAGAGTATTCTGAAGGGTCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108018	GAAAACCTCATAATTTGCTGAGCATTGGATAGAGTATTCTGAAGGGTCTT	108067

CR759281.4	1001	ATGTCAGCAGTGGTAAATAATTAGCCCTGGACTAAACACTTTTTGTTTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108068	ATGTCAGCAGTGGTAAATAATTAGCCCTGGACTAAACACTTTTTGTTTTT	108117

CR759281.4	1051	TTGCTAAAAGATATTAAAAGACTTAAAATGATCAAACAGCTCCTGAATAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108118	TTGCTAAAAGATATTAAAAGACTTAAAATGATCAAACAGCTCCTGAATAA	108167

CR759281.4	1101	CTTAATTTGTCCCAGTAAAAATAAAAAGCTCAGCCGGGCACGGTGGCTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108168	CTTAATTTGTCCCAGTAAAAATAAAAAGCTCAGCCGGGCACGGTGGCTCA	108217

CR759281.4	1151	TGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108218	TGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAG	108267

CR759281.4	1201	GTTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAATCCCGTCTCTAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108268	GTTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAATCCCGTCTCTAC	108317

CR759281.4	1251	TAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108318	TAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTATAATCCCAGC	108367

CR759281.4	1301	TACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108368	TACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGT	108417

CR759281.4	1351	TGCAGTGAGCCAAGTTCTCACCATTGCACTCCAGGCAACAAGAGGGAAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108418	TGCAGTGAGCCAAGTTCTCACCATTGCACTCCAGGCAACAAGAGGGAAAC	108467

CR759281.4	1401	TCTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAATAAAGCTCATGAATACTTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108468	TCTGTCTCAAAATAATAATAATAATAATAATAAAGCTCATGAATACTTAT	108517

CR759281.4	1451	AGAATGCAAAAATATCTGGCACCTAACCTGGTAAAGTCATGTCTGGCATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108518	AGAATGCAAAAATATCTGGCACCTAACCTGGTAAAGTCATGTCTGGCATT	108567

CR759281.4	1501	AAATAAAAACAATCACCAGGCATATAATAAAAACAAGAAAATACAACTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108568	AAATAAAAACAATCACCAGGCATATAATAAAAACAAGAAAATACAACTCA	108617

CR759281.4	1551	GAAGGCAGAGAAAACCATCAGTCTAAAGTTACCTAGAACTGACATAGATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108618	GAAGGCAGAGAAAACCATCAGTCTAAAGTTACCTAGAACTGACATAGATG	108667

CR759281.4	1601	TCAGAATTAGCAGGCAATAACATAAAACGGTTATTGTAAATGTATTCCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108668	TCAGAATTAGCAGGCAATAACATAAAACGGTTATTGTAAATGTATTCCAT	108717

CR759281.4	1651	ATGTTCAAAAAGTTACACAGAGACATGAAAGATACATAAAACATCAAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108718	ATGTTCAAAAAGTTACACAGAGACATGAAAGATACATAAAACATCAAAAT	108767

CR759281.4	1701	CAAACTTCCAAAGATGAAAATGTCAGACATAAAATACACTGGATGTGAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108768	CAAACTTCCAAAGATGAAAATGTCAGACATAAAATACACTGGATGTGAGG	108817

CR759281.4	1751	TGAGATTAATGGTAAACTTTATGCTGTAGATTAAACAGTGACTTTGAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108818	TGAGATTAATGGTAAACTTTATGCTGTAGATTAAACAGTGACTTTGAAGA	108867

CR759281.4	1801	CATAGAAATAGAAACTTTCTGGGCCAGGTGCGGTGGCTCAAGCCTATAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108868	CATAGAAATAGAAACTTTCTGGGCCAGGTGCGGTGGCTCAAGCCTATAAT	108917

CR759281.4	1851	CCTAGCACTTTGGGAGGCTTAGATATAGAAGGAATGTATCTTACCAGGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108918	CCTAGCACTTTGGGAGGCTTAGATATAGAAGGAATGTATCTTACCAGGAT	108967

CR759281.4	1901	AAAGGCTATGACAAACTCACAACTAACATCATACTCAATGGCGAAAGTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	108968	AAAGGCTATGACAAACTCACAACTAACATCATACTCAATGGCGAAAGTTG	109017

CR759281.4	1951	CATACTTTTCCTGTAAGATCAGGAACAAGACAATGATGCCCACTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388382.5	109018	CATACTTTTCCTGTAAGATCAGGAACAAGACAATGATGCCCACTCTGGCC	109067

Overview

Query
CR759281.4 - 107020 bps
Hit
CR388382.5 - 109067 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link