<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759814.6	1	TCAATATCACTGCTCATTAGAGAAATGTAAATCAAAGCCACAATGAGATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119660	TCAATATCACTGCTCATTAGAGAAATGTAAATCAAAGCCACAATGAGATA	119709

CR759814.6	51	CCATCTCCCACCAGTCAGAATGGTAATTATTAAAAAGTCAAGAAACAATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119710	CCATCTCCCACCAGTCAGAATGGTAATTATTAAAAAGTCAAGAAACAATA	119759

CR759814.6	101	GATGCTGGCGAGGCTGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGTTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119760	GATGCTGGCGAGGCTGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGTTGG	119809

CR759814.6	151	GAATGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCCATTCCTCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119810	GAATGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCCATTCCTCAG	119859

CR759814.6	201	AGACCTAGAACCAGAAATATTATTTGACCCCTTGGGTATCTACCCAAAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119860	AGACCTAGAACCAGAAATATTATTTGACCCCTTGGGTATCTACCCAAAGG	119909

CR759814.6	251	AATATAAATCATTCTACTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTACTGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119910	AATATAAATCATTCTACTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTACTGCA	119959

CR759814.6	301	GCACTATTTACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	119960	GCACTATTTACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAGT	120009

CR759814.6	351	GATAGATGGATAAAGAAAATGTGGTGCATACCACCATGGAATAGTACACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120010	GATAGATGGATAAAGAAAATGTGGTGCATACCACCATGGAATAGTACACA	120059

CR759814.6	401	GCCAGAAAAAGGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120060	GCCAGAAAAAGGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCT	120109

CR759814.6	451	GGAAGTCATCATCCTCAGCAAACTAACACGGGAACAGAAAACAAAGCACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120110	GGAAGTCATCATCCTCAGCAAACTAACACGGGAACAGAAAACAAAGCACC	120159

CR759814.6	501	TCATGTTCTCATTCCTAAGTGAGAGTTGAACAATGACAACACATGGACAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120160	TCATGTTCTCATTCCTAAGTGAGAGTTGAACAATGACAACACATGGACAC	120209

CR759814.6	551	AGGGAGGGGAACAACACATATCAGGGCCTTTTGGGGAGTGTGGGGGGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120210	AGGGAGGGGAACAACACATATCAGGGCCTTTTGGGGAGTGTGGGGGGCAA	120259

CR759814.6	601	GGGACGGGAACTTAGAGGATGGGTCAATAGGTGCAGCAAACCACCATGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120260	GGGACGGGAACTTAGAGGATGGGTCAATAGGTGCAGCAAACCACCATGGC	120309

CR759814.6	651	AGACTATACGTATGTAACAAACCTGCAGGTTCTGCACATGTATCCTGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120310	AGACTATACGTATGTAACAAACCTGCAGGTTCTGCACATGTATCCTGGAA	120359

CR759814.6	701	CCTAAAGTAAAATAAAACAAAGCAAATTAAAAAAAGAAAGCCCATGTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120360	CCTAAAGTAAAATAAAACAAAGCAAATTAAAAAAAGAAAGCCCATGTCTT	120409

CR759814.6	751	ACATGTATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120410	ACATGTATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATG	120459

CR759814.6	801	GAATCAACCTAAATGTCCATCAATGGTAGACTGGATAAAGAAAATGTGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120460	GAATCAACCTAAATGTCCATCAATGGTAGACTGGATAAAGAAAATGTGGC	120509

CR759814.6	851	AAATATGCTCTACCGGCAGGATTTGATGGCGTGATGTCTCACAGAAAGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120510	AAATATGCTCTACCGGCAGGATTTGATGGCGTGATGTCTCACAGAAAGTT	120559

CR759814.6	901	CTCCACTCCCAGACATGGGTCCCTCGGCTTCCTGCCTTGGAAGCGCAGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120560	CTCCACTCCCAGACATGGGTCCCTCGGCTTCCTGCCTTGGAAGCGCAGCA	120609

CR759814.6	951	GCAGGCATCGTGGGAAGGTGAAGAGCTTCCCTAAGGATGACCCGTCCAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120610	GCAGGCATCGTGGGAAGGTGAAGAGCTTCCCTAAGGATGACCCGTCCAAG	120659

CR759814.6	1001	CCGGTCCACCTCACAGCCTTCCTGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120660	CCGGTCCACCTCACAGCCTTCCTGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACAT	120709

CR759814.6	1051	CGTGCGGGAAGTCGACAGGCCAGGATCCAAGGTGAACAAGAAGGAGGTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120710	CGTGCGGGAAGTCGACAGGCCAGGATCCAAGGTGAACAAGAAGGAGGTGG	120759

CR759814.6	1101	TGGAGGCTGTGACCATTGTGGAGAGGCCACCAGTGGGCATTGTGGGCTGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120760	TGGAGGCTGTGACCATTGTGGAGAGGCCACCAGTGGGCATTGTGGGCTGC	120809

CR759814.6	1151	GTGGAAACCCCTCAAGGCTTCCGGACTTGCAAGACTGTCTTCGCTGAGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120810	GTGGAAACCCCTCAAGGCTTCCGGACTTGCAAGACTGTCTTCGCTGAGCA	120859

CR759814.6	1201	CATCAGTGATGAATGCAAGAGACGTTTCTATAAGAACTGGCATAAATCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120860	CATCAGTGATGAATGCAAGAGACGTTTCTATAAGAACTGGCATAAATCTA	120909

CR759814.6	1251	AGAAGAAGGCCTTTACCAAGTACTGCAAGAAATGGCAGGATGAGGATGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120910	AGAAGAAGGCCTTTACCAAGTACTGCAAGAAATGGCAGGATGAGGATGGC	120959

CR759814.6	1301	AAGAAGCAGCTGGAGAAGGACTTCAGCAGCATGAAGAAGTACTGCCAAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	120960	AAGAAGCAGCTGGAGAAGGACTTCAGCAGCATGAAGAAGTACTGCCAAGT	121009

CR759814.6	1351	CATCTGCGTCATTGCCCACACCCAGATGCAACTGCTTCCTCTGTGCCAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121010	CATCTGCGTCATTGCCCACACCCAGATGCAACTGCTTCCTCTGTGCCAGA	121059

CR759814.6	1401	AGAAGGCCCACCTGATGGAGATCCAGGTGAATGGAGGCACTGTGGCTGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121060	AGAAGGCCCACCTGATGGAGATCCAGGTGAATGGAGGCACTGTGGCTGAG	121109

CR759814.6	1451	AAGCTGGACTGGGCTGGCGAGAGGCTCAAGCACCAGGTACCTGTGAACCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121110	AAGCTGGACTGGGCTGGCGAGAGGCTCAAGCACCAGGTACCTGTGAACCA	121159

CR759814.6	1501	AGTGTTTGGGCAGGATGAGATGATCGACGTCATCAGGGTGACCAAGGGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121160	AGTGTTTGGGCAGGATGAGATGATCGACGTCATCAGGGTGACCAAGGGCA	121209

CR759814.6	1551	AAGGCTACAAAAGGGTCACCAGTCGTTGGCACACCAAGAAGCTGCCCCGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121210	AAGGCTACAAAAGGGTCACCAGTCGTTGGCACACCAAGAAGCTGCCCCGC	121259

CR759814.6	1601	AAGACCCATCAAGGCCTGTGCAAGGTGGCCTGTATTGGGGCATGGCATCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121260	AAGACCCATCAAGGCCTGTGCAAGGTGGCCTGTATTGGGGCATGGCATCC	121309

CR759814.6	1651	TGCTCGTGTGGGCTTCTCTGTGGTACGTGGTGGGCAGAAAGGCTACCATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121310	TGCTCGTGTGGGCTTCTCTGTGGTACGTGGTGGGCAGAAAGGCTACCATC	121359

CR759814.6	1701	ACCGCACTGAGATCAACAAGAAGATCTATAGGATTGGCTAGGGCTACCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121360	ACCGCACTGAGATCAACAAGAAGATCTATAGGATTGGCTAGGGCTACCTT	121409

CR759814.6	1751	ATCAAGGATGGCAAGCTGATCAAGAACAATGCCTCCACTGACTATGACCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121410	ATCAAGGATGGCAAGCTGATCAAGAACAATGCCTCCACTGACTATGACCT	121459

CR759814.6	1801	GTCTGACAAGAGCATCAACCCTTTGGGTGGCTTCGTCCACTATGGTGAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121460	GTCTGACAAGAGCATCAACCCTTTGGGTGGCTTCGTCCACTATGGTGAAG	121509

CR759814.6	1851	TGACCAATGACTTTGTCATGCTGAAAGGCTGTGTGGTGGGAACCAAGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121510	TGACCAATGACTTTGTCATGCTGAAAGGCTGTGTGGTGGGAACCAAGAAG	121559

CR759814.6	1901	TGGGTGCTCACCCTCCACAAGTCCTTGCTGGTGCAGACAAAGCAGCGGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121560	TGGGTGCTCACCCTCCACAAGTCCTTGCTGGTGCAGACAAAGCAGCGGGC	121609

CR759814.6	1951	TCTGGAGAAGATTGACCTTAAGTTCATTGACACCCCCTCCAAGTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388229.14	121610	TCTGGAGAAGATTGACCTTAAGTTCATTGACACCCCCTCCAAGTTTGGCC	121659

Overview

Query
CR759814.6 - 63499 bps
Hit
CR388229.14 - 121659 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link