<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753845.11	1	AGTCGATCACTAGAAGACACAAAGCTGGGGAGATGCAGACTGAAGATCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69591	AGTCGATCACTAGAAGACACAAAGCTGGGGAGATGCAGACTGAAGATCAA	69640

CR753845.11	51	AGGGGGGTTTTACCTTCTCCCCTCAGACCCTGTGGAGACTCAATATTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69641	AGGGGGGTTTTACCTTCTCCCCTCAGACCCTGTGGAGACTCAATATTCCC	69690

CR753845.11	101	TCTATAGCCCAGCTCCTACAGCCCAAACCTCCCAAGGACTCAGGCAATCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69691	TCTATAGCCCAGCTCCTACAGCCCAAACCTCCCAAGGACTCAGGCAATCA	69740

CR753845.11	151	ACTCCACCAAATGGGCCCAGCCTTATCTCTACTCTCTAACCTCTCATACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69741	ACTCCACCAAATGGGCCCAGCCTTATCTCTACTCTCTAACCTCTCATACA	69790

CR753845.11	201	GAGATTTCCTCTGGGGACGTCTGGATGACTGTAAAAGAGACCAAGAACAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69791	GAGATTTCCTCTGGGGACGTCTGGATGACTGTAAAAGAGACCAAGAACAG	69840

CR753845.11	251	TTAAGATGATTTCCAGTTGCTGACATGTGGTCCAAAATATATTTGTCTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69841	TTAAGATGATTTCCAGTTGCTGACATGTGGTCCAAAATATATTTGTCTCT	69890

CR753845.11	301	CATATTCCTCCATCCCCAACCCCTCAGGGACAGAAATTAGGAGCCTTTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69891	CATATTCCTCCATCCCCAACCCCTCAGGGACAGAAATTAGGAGCCTTTAC	69940

CR753845.11	351	CTCTTGCAGGTCATCATCAGCAGATATGCTCCTCTGGAACGGCTGGAAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69941	CTCTTGCAGGTCATCATCAGCAGATATGCTCCTCTGGAACGGCTGGAAAG	69990

CR753845.11	401	TGGGGACTGGTCCCTTCTCGGGGTCCTGGAGTGGTGAGAGACCTACCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	69991	TGGGGACTGGTCCCTTCTCGGGGTCCTGGAGTGGTGAGAGACCTACCTCA	70040

CR753845.11	451	GTGTGGAGCAGGAGGTTGCCCAACCATGGACCAGAGGTGTTCCTCTTCCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70041	GTGTGGAGCAGGAGGTTGCCCAACCATGGACCAGAGGTGTTCCTCTTCCC	70090

CR753845.11	501	TCACCCTCTTCTAGGTTTCCTCTGATCTTTTCTTCCCTTTTAATTCTACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70091	TCACCCTCTTCTAGGTTTCCTCTGATCTTTTCTTCCCTTTTAATTCTACA	70140

CR753845.11	551	TACATTTCTTATTTGACGTGGTTTTACTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70141	TACATTTCTTATTTGACGTGGTTTTACTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGA	70190

CR753845.11	601	GACACGGTCCTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAATAGAGCAATCGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70191	GACACGGTCCTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAATAGAGCAATCGTA	70240

CR753845.11	651	GCTTGCTGCAGCCTTGACCTCCCATGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70241	GCTTGCTGCAGCCTTGACCTCCCATGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGC	70290

CR753845.11	701	CTCCCTAGTAGCTGGGACTAGAGATGTGCTCTACCATGCTTGGCTAATTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70291	CTCCCTAGTAGCTGGGACTAGAGATGTGCTCTACCATGCTTGGCTAATTT	70340

CR753845.11	751	CTGTATTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATAGGGTTTCACTATGTTGCCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70341	CTGTATTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATAGGGTTTCACTATGTTGCCAGG	70390

CR753845.11	801	GCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCGGCCTCCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70391	GCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCGGCCTCCTA	70440

CR753845.11	851	AAGTGCTGAAATTAACCAGGAATGAGCCATTGCCGCACCTGCCATTGTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70441	AAGTGCTGAAATTAACCAGGAATGAGCCATTGCCGCACCTGCCATTGTGG	70490

CR753845.11	901	CTTGTTTTGTTTTTGAGACAGAATCTTGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70491	CTTGTTTTGTTTTTGAGACAGAATCTTGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTG	70540

CR753845.11	951	CAGTGGTGTGATCTCCACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70541	CAGTGGTGTGATCTCCACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTG	70590

CR753845.11	1001	ATTCTCTGGCCTCAGCCTCCTCAGTAACTGGGACTATAAGTGTGCACCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70591	ATTCTCTGGCCTCAGCCTCCTCAGTAACTGGGACTATAAGTGTGCACCAC	70640

CR753845.11	1051	CACATTCTGCTAATTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTGTCACCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70641	CACATTCTGCTAATTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTGTCACCC	70690

CR753845.11	1101	AGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGACTCACTGCAAGCTCCGCCTCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70691	AGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGACTCACTGCAAGCTCCGCCTCCT	70740

CR753845.11	1151	GGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70741	GGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAG	70790

CR753845.11	1201	GCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70791	GCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG	70840

CR753845.11	1251	TTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70841	TTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGC	70890

CR753845.11	1301	CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70891	CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCC	70940

CR753845.11	1351	CGGCCTCACACCCTGCTGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70941	CGGCCTCACACCCTGCTGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTA	70990

CR753845.11	1401	CCATGTTGGCCAGGTTGGTCTTAAACTCCTAATCTCAAGTGATCTGCCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	70991	CCATGTTGGCCAGGTTGGTCTTAAACTCCTAATCTCAAGTGATCTGCCCA	71040

CR753845.11	1451	CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71041	CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAG	71090

CR753845.11	1501	CTGGTATTTTTTATAAGTGACTCGATATATTATGTATTCAGTTTATTTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71091	CTGGTATTTTTTATAAGTGACTCGATATATTATGTATTCAGTTTATTTGA	71140

CR753845.11	1551	ACCTCTCTTGAACCTGATAACATTTTCAGCCCTTTCCATCCCTTAGGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71141	ACCTCTCTTGAACCTGATAACATTTTCAGCCCTTTCCATCCCTTAGGGCA	71190

CR753845.11	1601	ACATATTCCAAGAGCTCCAATCCAAGGTGGATTAGAACCACAGAATTTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71191	ACATATTCCAAGAGCTCCAATCCAAGGTGGATTAGAACCACAGAATTTGT	71240

CR753845.11	1651	AAAATGGAGAATTCAGGAGTCGTCTAGTTTTTTCATTTTATACATGAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71241	AAAATGGAGAATTCAGGAGTCGTCTAGTTTTTTCATTTTATACATGAGAG	71290

CR753845.11	1701	GTGAAACTCAGAATGGTACAGCAATTTGCCAGTGCTTGAGTATGCATATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71291	GTGAAACTCAGAATGGTACAGCAATTTGCCAGTGCTTGAGTATGCATATT	71340

CR753845.11	1751	TTTCCCCAAACCCATCTACATTCCAACTTGGAGGGATGCCCTTTAAACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71341	TTTCCCCAAACCCATCTACATTCCAACTTGGAGGGATGCCCTTTAAACAA	71390

CR753845.11	1801	TCTTTCTGCTTGTGCTCACCTTTAACTTCCCCTCAAGGGTTCGAGAACGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71391	TCTTTCTGCTTGTGCTCACCTTTAACTTCCCCTCAAGGGTTCGAGAACGC	71440

CR753845.11	1851	TTGAAGCCTGAGTTCTTGGTCTCAGCCTTGATGGCACTGATGGCTCCTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71441	TTGAAGCCTGAGTTCTTGGTCTCAGCCTTGATGGCACTGATGGCTCCTGA	71490

CR753845.11	1901	CTTCACCAGCTGCTTTGCCTGCTCTGTTGCTGTGGCTGTGTCCATGACAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71491	CTTCACCAGCTGCTTTGCCTGCTCTGTTGCTGTGGCTGTGTCCATGACAG	71540

CR753845.11	1951	GCTGCTCTGATAGTGCTGGAGAGACAAGGGGAAGAGGCATTATGTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388219.12	71541	GCTGCTCTGATAGTGCTGGAGAGACAAGGGGAAGAGGCATTATGTTGGCC	71590

Overview

Query
CR753845.11 - 96090 bps
Hit
CR388219.12 - 71590 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link