<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927250.5	1	GGCCACCTGGGCCTTTCTTCTCCTGAGCAACAGCCAAGCAACATTATAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62197	GGCCACCTGGGCCTTTCTTCTCCTGAGCAACAGCCAAGCAACATTATAGG	62246

BX927250.5	51	CTTCAGGCCTACCTAGCCCAGGTTGGGTTAAAGCAGATAAACGAAGCGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62247	CTTCAGGCCTACCTAGCCCAGGTTGGGTTAAAGCAGATAAACGAAGCGGA	62296

BX927250.5	101	CAGCGGAGGAAAAGCACGTAACCAAGTGCAGTGGGTCTGAAGCGAAAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62297	CAGCGGAGGAAAAGCACGTAACCAAGTGCAGTGGGTCTGAAGCGAAAGGC	62346

BX927250.5	151	AAGAAAAGCTCTGCCCTTAGGAACGGGGTGTCACTGCGCGGCTCGCAGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62347	AAGAAAAGCTCTGCCCTTAGGAACGGGGTGTCACTGCGCGGCTCGCAGGC	62396

BX927250.5	201	ACCTCTCTTTGACCTATTTATAATCTGCGCCTTATTCTCCGCCCCCAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62397	ACCTCTCTTTGACCTATTTATAATCTGCGCCTTATTCTCCGCCCCCAAAG	62446

BX927250.5	251	GCTGCTGGCAACCAATTCTCGGTGGCGAAGTCGTGACGTCAGCTGTTGCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62447	GCTGCTGGCAACCAATTCTCGGTGGCGAAGTCGTGACGTCAGCTGTTGCG	62496

BX927250.5	301	GGTCAGATTGGGAGAGCTTCCTGGTCCTTACCTAGCAAGATTCTGCCGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62497	GGTCAGATTGGGAGAGCTTCCTGGTCCTTACCTAGCAAGATTCTGCCGCT	62546

BX927250.5	351	AGGTGGCGAAAAGCGAAGGGGCCAAAGAAATGGAAAGAAGGCGAGGAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62547	AGGTGGCGAAAAGCGAAGGGGCCAAAGAAATGGAAAGAAGGCGAGGAAAA	62596

BX927250.5	401	GCGGGAGAAGATGGGGAAGGAAAATGTATATTCTTGTATCATCCTACAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62597	GCGGGAGAAGATGGGGAAGGAAAATGTATATTCTTGTATCATCCTACAGC	62646

BX927250.5	451	TAGGCAAAAATATTAGGATAATGTGGCCTAACCTCCAGTTCTATGTTGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62647	TAGGCAAAAATATTAGGATAATGTGGCCTAACCTCCAGTTCTATGTTGGC	62696

BX927250.5	501	TGGAAAATCCAGGAATGGGAAGCTCACTCCCGTAGTTCCCACTCATTCCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62697	TGGAAAATCCAGGAATGGGAAGCTCACTCCCGTAGTTCCCACTCATTCCC	62746

BX927250.5	551	ACCACGGTTGGACAGCTCTGAAGGAGGGAAAATTCTTTCTTTTGAGCTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62747	ACCACGGTTGGACAGCTCTGAAGGAGGGAAAATTCTTTCTTTTGAGCTGA	62796

BX927250.5	601	AATCTGCCTTCAGAGTCTTGCACCCAACTGTTCTACCCCACGGGGACCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62797	AATCTGCCTTCAGAGTCTTGCACCCAACTGTTCTACCCCACGGGGACCTA	62846

BX927250.5	651	CAGAACAGCCCAAAGCCTCTTACGCAGGACAACCCATAGCAGTTTGATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62847	CAGAACAGCCCAAAGCCTCTTACGCAGGACAACCCATAGCAGTTTGATTA	62896

BX927250.5	701	AAATCAGCGCAAACCCATTCCCATTTGGGGAGGGGGGAGGGGGAGGGGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62897	AAATCAGCGCAAACCCATTCCCATTTGGGGAGGGGGGAGGGGGAGGGGCA	62946

BX927250.5	751	AGCCTCAGTGCCTGACTCACTTGACTCACAAGAAGCTGAATGTTTTTCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62947	AGCCTCAGTGCCTGACTCACTTGACTCACAAGAAGCTGAATGTTTTTCCT	62996

BX927250.5	801	TTTGAAAGATAAAAATATTGGTGAATCTCAGACTAACAATAGGGAATACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	62997	TTTGAAAGATAAAAATATTGGTGAATCTCAGACTAACAATAGGGAATACA	63046

BX927250.5	851	TAAAAATGGAAAAAATGTTGATAGATAAAATTTAAACCTTTGGTAGAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63047	TAAAAATGGAAAAAATGTTGATAGATAAAATTTAAACCTTTGGTAGAACA	63096

BX927250.5	901	TAATTAGTTTTTTGTTCTCTACATTTTTCCATATCGTTTCTAATTTTTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63097	TAATTAGTTTTTTGTTCTCTACATTTTTCCATATCGTTTCTAATTTTTCT	63146

BX927250.5	951	ACACTGTATGTGTTACTTAAAGAAATAAACCAGTAGGCCAGGCGCGGTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63147	ACACTGTATGTGTTACTTAAAGAAATAAACCAGTAGGCCAGGCGCGGTGG	63196

BX927250.5	1001	CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63197	CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACG	63246

BX927250.5	1051	AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAATACGGTGAAACCCCGTCTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63247	AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAATACGGTGAAACCCCGTCTCT	63296

BX927250.5	1101	ACTAAAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACGCACCCCTGTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63297	ACTAAAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACGCACCCCTGTAAT	63346

BX927250.5	1151	CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63347	CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC	63396

BX927250.5	1201	GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGTCACTGCACTCCAGACTGGGCGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63397	GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGTCACTGCACTCCAGACTGGGCGAC	63446

BX927250.5	1251	AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAATAAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63447	AGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAATAAAC	63496

BX927250.5	1301	CAGTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGCAATCCCAGCACTTTGGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63497	CAGTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGCAATCCCAGCACTTTGGGA	63546

BX927250.5	1351	GGACGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGCCCATCCTGACCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63547	GGACGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGCCCATCCTGACCA	63596

BX927250.5	1401	ATATGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63597	ATATGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTG	63646

BX927250.5	1451	GTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACAAAGGAGGGTGAGGCAGGAGAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63647	GTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACAAAGGAGGGTGAGGCAGGAGAAT	63696

BX927250.5	1501	CCCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCATTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63697	CCCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCATTG	63746

BX927250.5	1551	CACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63747	CACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAA	63796

BX927250.5	1601	GAAAGAAAAGAAAAAGAAATAAAGCAGTATGAAAGAGCAGCCCCTGGCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63797	GAAAGAAAAGAAAAAGAAATAAAGCAGTATGAAAGAGCAGCCCCTGGCTG	63846

BX927250.5	1651	CATTCACCACAGCACCCATGCTCACACATGCTACAGGCGCTCACTTGCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63847	CATTCACCACAGCACCCATGCTCACACATGCTACAGGCGCTCACTTGCTG	63896

BX927250.5	1701	GGAGCTGCCTCACATTGATTCGGATCAGTGTTCTCATTTCTCCGACCTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63897	GGAGCTGCCTCACATTGATTCGGATCAGTGTTCTCATTTCTCCGACCTAC	63946

BX927250.5	1751	CTAGGAAGCATCTGGCTAAATTGATGTAAATTAGACATTTTATAGTCTAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63947	CTAGGAAGCATCTGGCTAAATTGATGTAAATTAGACATTTTATAGTCTAT	63996

BX927250.5	1801	CGGTCATTGAGCCTCAGTGGAATATCTAGACCAATTTAAACACACAAATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	63997	CGGTCATTGAGCCTCAGTGGAATATCTAGACCAATTTAAACACACAAATA	64046

BX927250.5	1851	TTATGGGAAATAGGGCCACAAAAGTAGAAAAGAAAACGTGAATTCCTCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	64047	TTATGGGAAATAGGGCCACAAAAGTAGAAAAGAAAACGTGAATTCCTCTT	64096

BX927250.5	1901	TATATTTATGCCACTAGAGGGAGTTCCAGAAGAAAATCACTGCATGTAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	64097	TATATTTATGCCACTAGAGGGAGTTCCAGAAGAAAATCACTGCATGTAAG	64146

BX927250.5	1951	GGCTAATGACTGTATTTACTGAGTGGTTACTGTGTACCATTCACAGTTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388210.7	64147	GGCTAATGACTGTATTTACTGAGTGGTTACTGTGTACCATTCACAGTTCA	64196

Overview

Query
BX927250.5 - 92630 bps
Hit
CR388210.7 - 64196 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link