<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR388219.12	1	GGCCAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATAGAAAAAATTAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78365	GGCCAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATAGAAAAAATTAGCT	78414

CR388219.12	51	GGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78415	GGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCA	78464

CR388219.12	101	GAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78465	GAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCC	78514

CR388219.12	151	ACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78515	ACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAACAAA	78564

CR388219.12	201	CAAACAAAAATGGGACTAGTAGCGTCTACCATCTGATGCCAGAGAGAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78565	CAAACAAAAATGGGACTAGTAGCGTCTACCATCTGATGCCAGAGAGAAAA	78614

CR388219.12	251	TAAAGTAATTGTTCTCTTTCCAAAAAATACAGCCAGGAGCTGGTCATGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78615	TAAAGTAATTGTTCTCTTTCCAAAAAATACAGCCAGGAGCTGGTCATGGA	78664

CR388219.12	301	GGTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCATGTGACTGAGATGGGAGGGTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78665	GGTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCATGTGACTGAGATGGGAGGGTTG	78714

CR388219.12	351	CTTGAGCCCAGGATTTCGAGGCTGCAGAGAGCTATGACTGTCTGTGAACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78715	CTTGAGCCCAGGATTTCGAGGCTGCAGAGAGCTATGACTGTCTGTGAACT	78764

CR388219.12	401	GCTACTGTACTTCAGCCTGGGTGACATAGCAAGACCCTGTCTCTTAAAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78765	GCTACTGTACTTCAGCCTGGGTGACATAGCAAGACCCTGTCTCTTAAAAG	78814

CR388219.12	451	AAAAAACGAACAAAAATTTCCTAAGTCTGCCCACTCAAAAGTCCTAGAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78815	AAAAAACGAACAAAAATTTCCTAAGTCTGCCCACTCAAAAGTCCTAGAAG	78864

CR388219.12	501	CAGCGACAACCCAATAACAATAAACACTCCTAGGAACATAGATTGTATTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78865	CAGCGACAACCCAATAACAATAAACACTCCTAGGAACATAGATTGTATTC	78914

CR388219.12	551	TCTAAAAAATGCTTCTGGCCGGGCGCTGTGGCTCACGAGGTCAGGAGTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78915	TCTAAAAAATGCTTCTGGCCGGGCGCTGTGGCTCACGAGGTCAGGAGTTC	78964

CR388219.12	601	AAGATCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	78965	AAGATCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA	79014

CR388219.12	651	AAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79015	AAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG	79064

CR388219.12	701	GCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTAAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79065	GCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTAAGC	79114

CR388219.12	751	TGTGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79115	TGTGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCGTC	79164

CR388219.12	801	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCCCATAAAGGAAGCAGAGTTTCTTAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79165	TCAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCCCATAAAGGAAGCAGAGTTTCTTAGAG	79214

CR388219.12	851	AAATGGTGGATTCTGAGTTGGGGGCAGGAAATGTGCTGAAAGGTCAGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79215	AAATGGTGGATTCTGAGTTGGGGGCAGGAAATGTGCTGAAAGGTCAGGAG	79264

CR388219.12	901	GCTCTCAAAGGCCACTGGGCCACTGGGTCATGTCACAGCCACAGAGGCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79265	GCTCTCAAAGGCCACTGGGCCACTGGGTCATGTCACAGCCACAGAGGCCT	79314

CR388219.12	951	CTTAAAGGGGCTTCTTCTGGACAATGATGGAATAATTCAAAGACTGAGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79315	CTTAAAGGGGCTTCTTCTGGACAATGATGGAATAATTCAAAGACTGAGAA	79364

CR388219.12	1001	GAATGCCAATAAATGACTAAAACACATCCAATGTATGACAACCCAAGAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79365	GAATGCCAATAAATGACTAAAACACATCCAATGTATGACAACCCAAGAGT	79414

CR388219.12	1051	TAATAAAAAGCCTCACTGGACACTTTCAGAGATTAAGACAGGAACTGATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79415	TAATAAAAAGCCTCACTGGACACTTTCAGAGATTAAGACAGGAACTGATT	79464

CR388219.12	1101	ATTCTGAAACTTGATAAAGAGAAAGAAACGAGAAAGAAAAGAATGAAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79465	ATTCTGAAACTTGATAAAGAGAAAGAAACGAGAAAGAAAAGAATGAAGAG	79514

CR388219.12	1151	AAATACAAATGAGGAAGAAGAAAGCAATGAGGACAGACACGAGCAGTGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79515	AAATACAAATGAGGAAGAAGAAAGCAATGAGGACAGACACGAGCAGTGTG	79564

CR388219.12	1201	AGGTCAGATGTAGGAAAGGCGGCCCAAAGCCTGAGGCCAAGCCAAGGAAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79565	AGGTCAGATGTAGGAAAGGCGGCCCAAAGCCTGAGGCCAAGCCAAGGAAC	79614

CR388219.12	1251	CCAGGCACCAGGGACCCAGAGGGGCTGGGCTGGGTGGGCCGCTGACCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79615	CCAGGCACCAGGGACCCAGAGGGGCTGGGCTGGGTGGGCCGCTGACCTGG	79664

CR388219.12	1301	GCGTTGACGTCCACCTGTCCTGTGCTCAGCAGCAGGCTGACCATCTCCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79665	GCGTTGACGTCCACCTGTCCTGTGCTCAGCAGCAGGCTGACCATCTCCAA	79714

CR388219.12	1351	GTTCCCGATTTTGGCTGCGTGGTGGAGGCAGGTGGAACCGTCCTCCTCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79715	GTTCCCGATTTTGGCTGCGTGGTGGAGGCAGGTGGAACCGTCCTCCTCCT	79764

CR388219.12	1401	GAGGGAGACACGGGCAAATGAGCCTTTGGGCTGGCACCCCAAACCTGGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79765	GAGGGAGACACGGGCAAATGAGCCTTTGGGCTGGCACCCCAAACCTGGTC	79814

CR388219.12	1451	CCTGACTCCGGGGGCCACGCCCTGCTGCCTGCGCGCACACCTTGCTATAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79815	CCTGACTCCGGGGGCCACGCCCTGCTGCCTGCGCGCACACCTTGCTATAG	79864

CR388219.12	1501	ACACAGCCACCACGCTGCACCATGTAACGGGCTACCTCCAGGTGGTTGTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79865	ACACAGCCACCACGCTGCACCATGTAACGGGCTACCTCCAGGTGGTTGTT	79914

CR388219.12	1551	CACCACGGCCTCCATCAGTGGCGTCCGCTGCTGTTTGTCCACTGCATTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79915	CACCACGGCCTCCATCAGTGGCGTCCGCTGCTGTTTGTCCACTGCATTTA	79964

CR388219.12	1601	TGTTGGCTCCAGCCTGTGAGGGGGCAGGAGGGCTGGCACCAGGGAGGCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	79965	TGTTGGCTCCAGCCTGTGAGGGGGCAGGAGGGCTGGCACCAGGGAGGCAT	80014

CR388219.12	1651	GGGGCAGGGGAGGGGCCTAAGGGCCTGGTGAATGAGGCATGGGGCCGGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80015	GGGGCAGGGGAGGGGCCTAAGGGCCTGGTGAATGAGGCATGGGGCCGGGC	80064

CR388219.12	1701	CCGTGCTGACCTGCAGCAGCACATGGCAGATCTCCACGGAGCCCTTCTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80065	CCGTGCTGACCTGCAGCAGCACATGGCAGATCTCCACGGAGCCCTTCTGG	80114

CR388219.12	1751	GCGGCTGCATGCAGGGGCGTGCGCTTGCTCTGCTGGTCGCTCTGGAAGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80115	GCGGCTGCATGCAGGGGCGTGCGCTTGCTCTGCTGGTCGCTCTGGAAGTT	80164

CR388219.12	1801	GGGGTCCAGGTTGTCCACTGCGGGGAGAGCCCGCCACACCGGGAGAGGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80165	GGGGTCCAGGTTGTCCACTGCGGGGAGAGCCCGCCACACCGGGAGAGGGA	80214

CR388219.12	1851	GGGACAAGTGGTAAGCAAGCTAGGGGGCAGGTGGCACTTCTTTCAGGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80215	GGGACAAGTGGTAAGCAAGCTAGGGGGCAGGTGGCACTTCTTTCAGGAAG	80264

CR388219.12	1901	GCTTCTCAGGGCCCCAAGCTGGATCAGGGCCCCTCCTGGCATTCTCCGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80265	GCTTCTCAGGGCCCCAAGCTGGATCAGGGCCCCTCCTGGCATTCTCCGAG	80314

CR388219.12	1951	CTTGCCTCCACCACAGCATTTATCAGAATAAGGAGTCAAAGGCATCAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR388202.9	80315	CTTGCCTCCACCACAGCATTTATCAGAATAAGGAGTCAAAGGCATCAGCT	80364

Overview

Query
CR388219.12 - 71590 bps
Hit
CR388202.9 - 80364 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link