<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927229.6	1	GGCCATTCCGTTCACCCTGTCATTCCATGAAACAGCTAAAAATACACATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	50774	GGCCATTCCGTTCACCCTGTCATTCCATGAAACAGCTAAAAATACACATG	50823

BX927229.6	51	GTCATAGAGATCAGAGTAATTTAGCAATTTATTTTAACCCATATATAATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	50824	GTCATAGAGATCAGAGTAATTTAGCAATTTATTTTAACCCATATATAATG	50873

BX927229.6	101	TGTGTGTGTATATATATATATATACACACACACACACAAACATATACATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	50874	TGTGTGTGTATATATATATATATACACACACACACACAAACATATACATA	50923

BX927229.6	151	TACATATATATACACACACATATATATACACACACACACACATATATATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	50924	TACATATATATACACACACATATATATACACACACACACACATATATATA	50973

BX927229.6	201	TACACACACACATACACACAAGGCTTCTGGAACAGTGGATGAAAGCTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	50974	TACACACACACATACACACAAGGCTTCTGGAACAGTGGATGAAAGCTTTG	51023

BX927229.6	251	TATATCTATCTATCCATCTATCTATCTATTTATCTATCTAAACTCCATAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51024	TATATCTATCTATCCATCTATCTATCTATTTATCTATCTAAACTCCATAG	51073

BX927229.6	301	GAGTACCTAGAGGAGTGCCTAATAAATTTAAAGCACGAAACCAAATACCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51074	GAGTACCTAGAGGAGTGCCTAATAAATTTAAAGCACGAAACCAAATACCT	51123

BX927229.6	351	GCTAGATTTGAGTCAGCACTTTTCTGGTGGTCAACTATTAACAAGAATGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51124	GCTAGATTTGAGTCAGCACTTTTCTGGTGGTCAACTATTAACAAGAATGT	51173

BX927229.6	401	AAATTAGATTAATTACATGTCTTATAATCAGCAAAGATTCATCAATTACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51174	AAATTAGATTAATTACATGTCTTATAATCAGCAAAGATTCATCAATTACA	51223

BX927229.6	451	CGCAAAATGCCCTTAAGGGAGTAGCCAGACAACTAAATGCCACTAGCTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51224	CGCAAAATGCCCTTAAGGGAGTAGCCAGACAACTAAATGCCACTAGCTAA	51273

BX927229.6	501	ATGGCTTGGGAAAACAGAATTACACTGGACATAATATTAGCAGAGAAAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51274	ATGGCTTGGGAAAACAGAATTACACTGGACATAATATTAGCAGAGAAAGG	51323

BX927229.6	551	TGATATATGTGATATGCTGGGTGGAAAATGTGACACTTCCATTCACAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51324	TGATATATGTGATATGCTGGGTGGAAAATGTGACACTTCCATTCACAACA	51373

BX927229.6	601	ATGCTGCCCCAAATGGAACCATCATAAAGGGATGGCAGGGACTAACAACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51374	ATGCTGCCCCAAATGGAACCATCATAAAGGGATGGCAGGGACTAACAACT	51423

BX927229.6	651	CTAGTCAACGAGCTGGCAGAAAACACAGGAGTAAATGACCTTTTTACTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51424	CTAGTCAACGAGCTGGCAGAAAACACAGGAGTAAATGACCTTTTTACTAA	51473

BX927229.6	701	CTGGTTAGAAGGTTGGTTTGAAAAATAGAAAGGAATGGTACCTTCAATTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51474	CTGGTTAGAAGGTTGGTTTGAAAAATAGAAAGGAATGGTACCTTCAATTC	51523

BX927229.6	751	TTACATCTCTCGTGATTATGGCTGGGGTCTTAACAGCCATAGGATGTTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51524	TTACATCTCTCGTGATTATGGCTGGGGTCTTAACAGCCATAGGATGTTGT	51573

BX927229.6	801	ATCATACCTTGTGTGAAGGGTTTATTTAACACAAAGGTTAATTAAAGCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51574	ATCATACCTTGTGTGAAGGGTTTATTTAACACAAAGGTTAATTAAAGCAG	51623

BX927229.6	851	CTATTAGTAAACAAATGCCCCTAATGTCCCAACAGAATGACTTACTATTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51624	CTATTAGTAAACAAATGCCCCTAATGTCCCAACAGAATGACTTACTATTA	51673

BX927229.6	901	TTAAAAGCCAAACTAAACTTCTCCTCCTATAATGAAGAAAGTAAAAAACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51674	TTAAAAGCCAAACTAAACTTCTCCTCCTATAATGAAGAAAGTAAAAAACT	51723

BX927229.6	951	TCCAGAACAGTTAATAAACAAAGATATGTAAGTGAAAATAAGACCAAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51724	TCCAGAACAGTTAATAAACAAAGATATGTAAGTGAAAATAAGACCAAAAA	51773

BX927229.6	1001	GGGTAAAAAGAAAAAGAGGAGGTAAGTGTAAAAAATAACCTACATGTGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51774	GGGTAAAAAGAAAAAGAGGAGGTAAGTGTAAAAAATAACCTACATGTGAA	51823

BX927229.6	1051	GAAGGTTCATTTTCATAAGTGCCTTAGAATATGTTTAAGCAGGCCACATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51824	GAAGGTTCATTTTCATAAGTGCCTTAGAATATGTTTAAGCAGGCCACATG	51873

BX927229.6	1101	GAAACAAAGAGATAAAGAAGCAAAATATACTAAGCCACAATCCCCTCCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51874	GAAACAAAGAGATAAAGAAGCAAAATATACTAAGCCACAATCCCCTCCTT	51923

BX927229.6	1151	CCTGCTTTCCCTTTGACCCAGTGTCCAGGAGCCTACTGGTCAGGGCCCCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51924	CCTGCTTTCCCTTTGACCCAGTGTCCAGGAGCCTACTGGTCAGGGCCCCC	51973

BX927229.6	1201	TCAATGACCCCCCTCCCCACCTCACCAAAGAATTTAGTTTGGGCTAGCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	51974	TCAATGACCCCCCTCCCCACCTCACCAAAGAATTTAGTTTGGGCTAGCTT	52023

BX927229.6	1251	GCCATCACCTAAGTGCAGCCACTAGGGCCATAAGTCAAATGCTCAGAGTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52024	GCCATCACCTAAGTGCAGCCACTAGGGCCATAAGTCAAATGCTCAGAGTC	52073

BX927229.6	1301	TTGAGACAGTCGCCATGCATTATGGGTGGCTGCAACAAAATGCAGCAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52074	TTGAGACAGTCGCCATGCATTATGGGTGGCTGCAACAAAATGCAGCAAAA	52123

BX927229.6	1351	AATGCAGCAAAAAGACCCTAAAGAACATACTTGAAGTCTTAATACAACTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52124	AATGCAGCAAAAAGACCCTAAAGAACATACTTGAAGTCTTAATACAACTA	52173

BX927229.6	1401	CCAATAGGCGATGCCCAGGAAGACTATAACCCCGTAGTACTCAGCTAATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52174	CCAATAGGCGATGCCCAGGAAGACTATAACCCCGTAGTACTCAGCTAATG	52223

BX927229.6	1451	AGGAATTGGGGAAGGGACTTGCACACTAGGGAAGAAATAGTTTGTTGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52224	AGGAATTGGGGAAGGGACTTGCACACTAGGGAAGAAATAGTTTGTTGAAA	52273

BX927229.6	1501	CTGTCCCAGGTGTACCTGCACTCCAGACACCTGATCTTGCAAGACTGTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52274	CTGTCCCAGGTGTACCTGCACTCCAGACACCTGATCTTGCAAGACTGTCA	52323

BX927229.6	1551	TTAAAAGTCTCTCTTTCGCTGTTCTCTGGGTCTCTGAGTCTATTCTTTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52324	TTAAAAGTCTCTCTTTCGCTGTTCTCTGGGTCTCTGAGTCTATTCTTTGG	52373

BX927229.6	1601	GTTTGAATGGGTGAGTTTCTTTCTCACAGGGATGTAGATGGCAACGTGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52374	GTTTGAATGGGTGAGTTTCTTTCTCACAGGGATGTAGATGGCAACGTGGC	52423

BX927229.6	1651	TCTCATTCCCCTCCCAAATACCCCAACTTTCATCGCCTGTTCCAGAAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52424	TCTCATTCCCCTCCCAAATACCCCAACTTTCATCGCCTGTTCCAGAAGCC	52473

BX927229.6	1701	TTGTCACCTACAAGCCTATCTGCACAGAAGGTATGAGGGGACCCTACAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52474	TTGTCACCTACAAGCCTATCTGCACAGAAGGTATGAGGGGACCCTACAGC	52523

BX927229.6	1751	CCAGACAGGGACCCTCCCATCTCTAGCAACTGTCCCCTTTTCTCACCTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52524	CCAGACAGGGACCCTCCCATCTCTAGCAACTGTCCCCTTTTCTCACCTGG	52573

BX927229.6	1801	ACCCTCTGCACCTGATGTTGTCTTCTTCTTGCATCAAAGGACACAGAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52574	ACCCTCTGCACCTGATGTTGTCTTCTTCTTGCATCAAAGGACACAGAGAA	52623

BX927229.6	1851	TAATAATACTACTAATAATACTAATGATGATGAAAGCAGCAACAGCAGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52624	TAATAATACTACTAATAATACTAATGATGATGAAAGCAGCAACAGCAGCA	52673

BX927229.6	1901	ACATATGGAATGGCTGGTCATCAACTCTGAAGCACCAGGGCCATCCCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52674	ACATATGGAATGGCTGGTCATCAACTCTGAAGCACCAGGGCCATCCCTGA	52723

BX927229.6	1951	AAAAAAGGGCCTGTTACACACTGGGCACCCACAGCCACAGCCGTTCCTGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382333.7	52724	AAAAAAGGGCCTGTTACACACTGGGCACCCACAGCCACAGCCGTTCCTGC	52773

Overview

Query
BX927229.6 - 112627 bps
Hit
CR382333.7 - 52773 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link