<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927220.8	1	GGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCTGCACTTTGGGAGGCTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26277	GGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCTGCACTTTGGGAGGCTGA	26326

BX927220.8	51	GGTGTGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26327	GGTGTGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAT	26376

BX927220.8	101	GGTGAAATCTGTCTCAATAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26377	GGTGAAATCTGTCTCAATAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGATG	26426

BX927220.8	151	CACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26427	CACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG	26476

BX927220.8	201	AACCACGGAGTCAGAGGTTGCAATGAGCTAATATCATGCCACTATACTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26477	AACCACGGAGTCAGAGGTTGCAATGAGCTAATATCATGCCACTATACTCC	26526

BX927220.8	251	AGCCCTGGAAATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAATTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26527	AGCCCTGGAAATGGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAATTG	26576

BX927220.8	301	ATTCACACCTAAACATTAATATATTATACTGAAACTATTACCAGCCAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26577	ATTCACACCTAAACATTAATATATTATACTGAAACTATTACCAGCCAAAA	26626

BX927220.8	351	ATAGAAATGACATCTTAAAAGCAATGAGAAAAAACTCATCTCATACAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26627	ATAGAAATGACATCTTAAAAGCAATGAGAAAAAACTCATCTCATACAAAT	26676

BX927220.8	401	ACACTCATACACACAGACACAATAATCTTAATAGCTAACCTCATCAGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26677	ACACTCATACACACAGACACAATAATCTTAATAGCTAACCTCATCAGTAA	26726

BX927220.8	451	CAATGGAGGTTAGAAGGCTGTAACATGGGCTGGGTGCCGTGGCTCATGTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26727	CAATGGAGGTTAGAAGGCTGTAACATGGGCTGGGTGCCGTGGCTCATGTC	26776

BX927220.8	501	TATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26777	TATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG	26826

BX927220.8	551	AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26827	AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAA	26876

BX927220.8	601	TATAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTACATGCCTGTAATCCCAGCTACTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26877	TATAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTACATGCCTGTAATCCCAGCTACTC	26926

BX927220.8	651	GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGCGCAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26927	GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGCGCAGT	26976

BX927220.8	701	GAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	26977	GAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC	27026

BX927220.8	751	TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGAAGACAGTAACATATGCAAATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27027	TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGAAGACAGTAACATATGCAAATTT	27076

BX927220.8	801	GGGGGTTAGTGGGGAGAAGCTAGCAATCAAGAATTTTACATCAAGAAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27077	GGGGGTTAGTGGGGAGAAGCTAGCAATCAAGAATTTTACATCAAGAAAAA	27126

BX927220.8	851	TTATCCTTCAAAACTGAAGACCGGTACAGGGACAGTGGTTTGCACCCATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27127	TTATCCTTCAAAACTGAAGACCGGTACAGGGACAGTGGTTTGCACCCATA	27176

BX927220.8	901	ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27177	ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAG	27226

BX927220.8	951	TTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAAGTAAGACCCTGTCTCTGCAAAAAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27227	TTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAAGTAAGACCCTGTCTCTGCAAAAAAAA	27276

BX927220.8	1001	AAAAAAAAAAAAAATTTAGCCATGTGTGGTAGTGCACACCTGTAGTCCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27277	AAAAAAAAAAAAAATTTAGCCATGTGTGGTAGTGCACACCTGTAGTCCTA	27326

BX927220.8	1051	GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGCTCTCTTAGGCCCGAGAGATTGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27327	GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGCTCTCTTAGGCCCGAGAGATTGAG	27376

BX927220.8	1101	GTTGCAATGAGACATGATCATGCCACTACACTCCGGCCTGGGCAACAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27377	GTTGCAATGAGACATGATCATGCCACTACACTCCGGCCTGGGCAACAGAG	27426

BX927220.8	1151	CGAGACCCTGTCTCCAAAACCAAAATTTATTCTAAAGAAAACAAAAAGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27427	CGAGACCCTGTCTCCAAAACCAAAATTTATTCTAAAGAAAACAAAAAGAG	27476

BX927220.8	1201	AAGCCAACATGAACATATTCTTACATAAACAAAGACTAGGGAGATTTATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27477	AAGCCAACATGAACATATTCTTACATAAACAAAGACTAGGGAGATTTATC	27526

BX927220.8	1251	TCTTGCAGATATGTCTTACAAGAAACACTAATGTAATACTAAAGTAAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27527	TCTTGCAGATATGTCTTACAAGAAACACTAATGTAATACTAAAGTAAGTT	27576

BX927220.8	1301	CTTCAGACTGAGAAGAAATGACACCAGATAATAATCCCAATCCAATGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27577	CTTCAGACTGAGAAGAAATGACACCAGATAATAATCCCAATCCAATGAAA	27626

BX927220.8	1351	AACAATTATTGTATGTCAATTAAAGATAAAACTTGTAGCTAGGCACAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27627	AACAATTATTGTATGTCAATTAAAGATAAAACTTGTAGCTAGGCACAGTG	27676

BX927220.8	1401	GCGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACAAGAATCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27677	GCGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACAAGAATCAC	27726

BX927220.8	1451	TTGAACCCAGCAGGTGGAGTCTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27727	TTGAACCCAGCAGGTGGAGTCTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTAG	27776

BX927220.8	1501	TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAATATTACATTAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27777	TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAATATTACATTAAA	27826

BX927220.8	1551	AAAAGTAAAATTTGTAAAAGAAACAAACAGCATCAGAAAAAATAATATGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27827	AAAAGTAAAATTTGTAAAAGAAACAAACAGCATCAGAAAAAATAATATGT	27876

BX927220.8	1601	TGGTAATTATTTTTTAAAAACTAAAAACTAAAAACTACAAATCTCTTCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27877	TGGTAATTATTTTTTAAAAACTAAAAACTAAAAACTACAAATCTCTTCTT	27926

BX927220.8	1651	TTTCTTTTTCTTTTTTGAGAGACAAGGTCTCACTCTCTCACCCAGGATGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27927	TTTCTTTTTCTTTTTTGAGAGACAAGGTCTCACTCTCTCACCCAGGATGG	27976

BX927220.8	1701	AGTGCAGTGGTTTGACCATCGCTCACTGCAGCCTCAAATCCTGGACTCAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	27977	AGTGCAGTGGTTTGACCATCGCTCACTGCAGCCTCAAATCCTGGACTCAA	28026

BX927220.8	1751	GTGATCCCCTCACCTCAGCCTCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	28027	GTGATCCCCTCACCTCAGCCTCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCA	28076

BX927220.8	1801	CACCGCCATGCCTGGCTCCTTTTCATTTCTTAACTGTTTTAAAAGAAATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	28077	CACCGCCATGCCTGGCTCCTTTTCATTTCTTAACTGTTTTAAAAGAAATT	28126

BX927220.8	1851	ACATAAAACAACAATTATAAAATTACAGTGTTGGGTTTGTAACATCTAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	28127	ACATAAAACAACAATTATAAAATTACAGTGTTGGGTTTGTAACATCTAAA	28176

BX927220.8	1901	GATAATGTGTGTGTATATATGCACTCACACACATATGACAATAATGGTAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	28177	GATAATGTGTGTGTATATATGCACTCACACACATATGACAATAATGGTAC	28226

BX927220.8	1951	AAAGGATAGGGAAAAGATGGAGTTACATTGAAACAAAGGAACCACATCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR382280.5	28227	AAAGGATAGGGAAAAGATGGAGTTACATTGAAACAAAGGAACCACATCAG	28276

Overview

Query
BX927220.8 - 82724 bps
Hit
CR382280.5 - 28276 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link