<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753865.8	132372	GAATTCAGAGAACATGAGAATGCTTATTAATGCACATATTTGTTTATCTG	132421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1	GAATTCAGAGAACATGAGAATGCTTATTAATGCACATATTTGTTTATCTG	50

CR753865.8	132422	ATAAGGCCCAGCTCCAACAGGTTATGACCCTGCTTATCTTTTAAAAGTGC	132471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	51	ATAAGGCCCAGCTCCAACAGGTTATGACCCTGCTTATCTTTTAAAAGTGC	100

CR753865.8	132472	AGAGTCCAATATAAACCCTTGTGAACACCTGCTGTATCTGACAGCACTGT	132521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	101	AGAGTCCAATATAAACCCTTGTGAACACCTGCTGTATCTGACAGCACTGT	150

CR753865.8	132522	ACAGTTGGAACTCCTACTGTTTTCATGTTCACGCACGTAGGCACTATCAA	132571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	151	ACAGTTGGAACTCCTACTGTTTTCATGTTCACGCACGTAGGCACTATCAA	200

CR753865.8	132572	AATATAGAATGTTGTTTTTAGTTACCTGCTAAATATTGCAGAGCAGCTAC	132621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	201	AATATAGAATGTTGTTTTTAGTTACCTGCTAAATATTGCAGAGCAGCTAC	250

CR753865.8	132622	CTACACCTCTGTTACATGTAAACAGATAGAGATAAACTGATACCTGGTAC	132671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	251	CTACACCTCTGTTACATGTAAACAGATAGAGATAAACTGATACCTGGTAC	300

CR753865.8	132672	AGCATTAAACTAACAATGACCGTGTAAAAGCTAGTTCATTTTGTGCTTGT	132721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	301	AGCATTAAACTAACAATGACCGTGTAAAAGCTAGTTCATTTTGTGCTTGT	350

CR753865.8	132722	TTATGTGGTACCTAACAATTAAAAATCAAACTTATTGGGGTATTTAGTAG	132771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	351	TTATGTGGTACCTAACAATTAAAAATCAAACTTATTGGGGTATTTAGTAG	400

CR753865.8	132772	AAGTGGTGGGGTAAGGCCATATAATAAGTTTTTTTTTTTTGCAATATCAA	132821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	401	AAGTGGTGGGGTAAGGCCATATAATAAGTTTTTTTTTTTTGCAATATCAA	450

CR753865.8	132822	ATATATTAAGCCTATAGATATGTGTGTATCTTGTATTCCGTATGTTGTGG	132871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	451	ATATATTAAGCCTATAGATATGTGTGTATCTTGTATTCCGTATGTTGTGG	500

CR753865.8	132872	GGACCAAATTGTGCTACGAGTATAGCAATACCAGTAATTTGTTTCCTTGT	132921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	501	GGACCAAATTGTGCTACGAGTATAGCAATACCAGTAATTTGTTTCCTTGT	550

CR753865.8	132922	GGAAACTTTTTTTTTGTTGTTCCCCATGAGTAAAAAGGCTCATAAATCAC	132971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	551	GGAAACTTTTTTTTTGTTGTTCCCCATGAGTAAAAAGGCTCATAAATCAC	600

CR753865.8	132972	ACCAAATAAGATGTTTTTTAAAAACTACACAGACTGTTTACACTGATGGT	133021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	601	ACCAAATAAGATGTTTTTTAAAAACTACACAGACTGTTTACACTGATGGT	650

CR753865.8	133022	TAGTTATAGGTATAGGGTATAAGGGAATAGAATATACTGTTTGTATAGTA	133071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	651	TAGTTATAGGTATAGGGTATAAGGGAATAGAATATACTGTTTGTATAGTA	700

CR753865.8	133072	GACCAATCATTACATTAATGGGAAGTCCCCATAAAGATACAGTCAGAACT	133121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	701	GACCAATCATTACATTAATGGGAAGTCCCCATAAAGATACAGTCAGAACT	750

CR753865.8	133122	CCTACATTTTTCCTGCACACACACTATTAAAGTATAGTGTATATTATTTT	133171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	751	CCTACATTTTTCCTGCACACACACTATTAAAGTATAGTGTATATTATTTT	800

CR753865.8	133172	AGTCACCTGCTTAACATTTAACTGCCTGCTTAGAGGGAAACAGATCAACT	133221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	801	AGTCACCTGCTTAACATTTAACTGCCTGCTTAGAGGGAAACAGATCAACT	850

CR753865.8	133222	GAGATAAAGACCACCAACTCACCAATCAAGCAAGATGACATTATCTCATT	133271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	851	GAGATAAAGACCACCAACTCACCAATCAAGCAAGATGACATTATCTCATT	900

CR753865.8	133272	ATGACTCATCATATGAGATGACACCTGGGCGGTGCTCAGGTTGTTATTAT	133321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	901	ATGACTCATCATATGAGATGACACCTGGGCGGTGCTCAGGTTGTTATTAT	950

CR753865.8	133322	TCTGTCAGCGCCATGTTTCCTACCACAGGATCTCCATAAATGGACAGTGA	133371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	951	TCTGTCAGCGCCATGTTTCCTACCACAGGATCTCCATAAATGGACAGTGA	1000

CR753865.8	133372	TGAATGTGTTTTGCTTTTAATTTTCAGCTTTGGCTACCAGTCTTGTTTGT	133421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1001	TGAATGTGTTTTGCTTTTAATTTTCAGCTTTGGCTACCAGTCTTGTTTGT	1050

CR753865.8	133422	GTGCCTTGGCTCAATAATGGAGCCTCACCTGCGGTGGCGTGACTTGACTC	133471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1051	GTGCCTTGGCTCAATAATGGAGCCTCACCTGCGGTGGCGTGACTTGACTC	1100

CR753865.8	133472	GACTATCCTTGTTTTTAAAGCAGACAGAGCAAGACCGGAGTTAGTGTTGG	133521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1101	GACTATCCTTGTTTTTAAAGCAGACAGAGCAAGACCGGAGTTAGTGTTGG	1150

CR753865.8	133522	CACTCATATTCACCAAATTATAAGAGGACCAGGCTAGATGCAAGAAAACA	133571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1151	CACTCATATTCACCAAATTATAAGAGGACCAGGCTAGATGCAAGAAAACA	1200

CR753865.8	133572	GATTTTCAAAACCTCTGATTGCTAATCTCAGGCATTTTGTACGCTGTGCG	133621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1201	GATTTTCAAAACCTCTGATTGCTAATCTCAGGCATTTTGTACGCTGTGCG	1250

CR753865.8	133622	ATCAAAATGAGTAAACGCTGCTTTCTATGACGATTCATGTTTGTAAGCAC	133671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1251	ATCAAAATGAGTAAACGCTGCTTTCTATGACGATTCATGTTTGTAAGCAC	1300

CR753865.8	133672	TTTCGGGATGGTGTAATGGAAAATGTCCTGGCCGTGGAGAAAACATGTTG	133721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1301	TTTCGGGATGGTGTAATGGAAAATGTCCTGGCCGTGGAGAAAACATGTTG	1350

CR753865.8	133722	TTGATGTGTTACTAGTTCTTGTACAACTGACGAATCTCTTCTATGTCTTA	133771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1351	TTGATGTGTTACTAGTTCTTGTACAACTGACGAATCTCTTCTATGTCTTA	1400

CR753865.8	133772	CTGAAACTGATTTTTTGTTTTGCACGTCATCCGCGATGTATCATGCCAGT	133821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1401	CTGAAACTGATTTTTTGTTTTGCACGTCATCCGCGATGTATCATGCCAGT	1450

CR753865.8	133822	TAGATTAATTTGATTCTGAGCTGGCAGCGTCAGACGTCGATAATGAGATG	133871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1451	TAGATTAATTTGATTCTGAGCTGGCAGCGTCAGACGTCGATAATGAGATG	1500

CR753865.8	133872	CTTCAGGCACTCATTAGCTGATTTGCTTGACAATATAATACCAGCCAGCA	133921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1501	CTTCAGGCACTCATTAGCTGATTTGCTTGACAATATAATACCAGCCAGCA	1550

CR753865.8	133922	GCTGTCTTGAGTTCTGCCTTCCCAGACGCTGTACACGATCCAGTCTAAAC	133971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1551	GCTGTCTTGAGTTCTGCCTTCCCAGACGCTGTACACGATCCAGTCTAAAC	1600

CR753865.8	133972	ATCAGGATCGGACGGCAAACACCTAAATCATCCTCCTCTTGTTGGTTTAA	134021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1601	ATCAGGATCGGACGGCAAACACCTAAATCATCCTCCTCTTGTTGGTTTAA	1650

CR753865.8	134022	AGGGACAGTTGTAGCTTATTTACTCATCCTCGTGTTGTTTCTGCCATATT	134071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1651	AGGGACAGTTGTAGCTTATTTACTCATCCTCGTGTTGTTTCTGCCATATT	1700

CR753865.8	134072	GTTTTGATATTTTTGTATGAGCAGCACAATATAAGTTCACATTAAATGCT	134121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1701	GTTTTGATATTTTTGTATGAGCAGCACAATATAAGTTCACATTAAATGCT	1750

CR753865.8	134122	GCTTTACTTAAACTAATAAATCAGTATTTAAAAAAAAATGCATCACTTGC	134171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1751	GCTTTACTTAAACTAATAAATCAGTATTTAAAAAAAAATGCATCACTTGC	1800

CR753865.8	134172	TAAACTTCTTAAGTTATTGTTGAGACTGGAATATGAATATGCTGTCAAGA	134221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1801	TAAACTTCTTAAGTTATTGTTGAGACTGGAATATGAATATGCTGTCAAGA	1850

CR753865.8	134222	ATTTTTAAAGATTTGTTTGGTTGTTTGTTTACACATTAGTTAAATTTTTT	134271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1851	ATTTTTAAAGATTTGTTTGGTTGTTTGTTTACACATTAGTTAAATTTTTT	1900

CR753865.8	134272	TTAACCAAAATAACATGTAATTACAAACTATTACAAATTATTGTATGTAA	134321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1901	TTAACCAAAATAACATGTAATTACAAACTATTACAAATTATTGTATGTAA	1950

CR753865.8	134322	TAGTTTTGTAATAGAATGTAATACAATAACAATGTCAACAACAACATCAA	134371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR381633.6	1951	TAGTTTTGTAATAGAATGTAATACAATAACAATGTCAACAACAACATCAA	2000

Overview

Query
CR753865.8 - 134371 bps
Hit
CR381633.6 - 163910 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194420001323721343711120001
286.397169309432621508452511
386.861001749608496257-114073142471
491.331271889607096257-114883150781
587.362233732466025032142680430511
686.71983599605996417142680430401
789.65951442094121084142682428261
885.6193362102708103069-145343457101
983.751743599605996417182646830021
1088.64218835629217395734-185823893441
1186.174398239130492126-189342901511
1284.232284749069691169-190267907291
1386.465319548970190654-190730916751
1485.32176363960559641711051141054741
1599.7359906132896669579711089671150961
1697.691611739558395755-11089811091531
1797.691601738968089852-11148821150541
1891.19614012523512537411405941407391
1991.1612918012538312556211409371411171
2081.3510833786118947-11519691523111
2188.66951512465524805-11567091568581
Short-link