<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR847841.4	1	CCTCATTCCTCATGCTCTTGGTAAGTAACCTCTGACTTCTACCTCAAATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	59883	CCTCATTCCTCATGCTCTTGGTAAGTAACCTCTGACTTCTACCTCAAATC	59932

CR847841.4	51	TAACCTATTTCGTTCTTTGGAGGAAAAGGGTTCTTTCTCCTTTATGATCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	59933	TAACCTATTTCGTTCTTTGGAGGAAAAGGGTTCTTTCTCCTTTATGATCC	59982

CR847841.4	101	CTGACCTTTCGATATTCCCCCAAATACACACTCATTGTGTCAGATATTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	59983	CTGACCTTTCGATATTCCCCCAAATACACACTCATTGTGTCAGATATTCC	60032

CR847841.4	151	CTCATCTGGTTTTCCCCCCTTCTTCCAGAACCTCATTCTCACCACACTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60033	CTCATCTGGTTTTCCCCCCTTCTTCCAGAACCTCATTCTCACCACACTCT	60082

CR847841.4	201	GGAGCAACCCGGACATGGACACTCCCACAGTGGTGAGGAAGAGACAGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60083	GGAGCAACCCGGACATGGACACTCCCACAGTGGTGAGGAAGAGACAGATG	60132

CR847841.4	251	GGGATGGGAGTTGGGGTGCTGGGGAAGGTCCGTCTCTCCCTATTCCTCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60133	GGGATGGGAGTTGGGGTGCTGGGGAAGGTCCGTCTCTCCCTATTCCTCAC	60182

CR847841.4	301	CTCCCGCACTTGAGGAGGAGGAGTCTGGAATGCACATCTCCCTTAATGTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60183	CTCCCGCACTTGAGGAGGAGGAGTCTGGAATGCACATCTCCCTTAATGTC	60232

CR847841.4	351	TCAATGCCTCCATTCCCAGGCCAGGGCCCCATTCTGTCTGTGGGACTGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60233	TCAATGCCTCCATTCCCAGGCCAGGGCCCCATTCTGTCTGTGGGACTGTG	60282

CR847841.4	401	GGTTCTCAGTGGAATTGTTGCCTTTCTTGTCGTGGAGAAATTTGTGAGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60283	GGTTCTCAGTGGAATTGTTGCCTTTCTTGTCGTGGAGAAATTTGTGAGAC	60332

CR847841.4	451	ATGTGAAAGGAGGACATGGTCACAGTCATGGACATGGACACGCTCACAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60333	ATGTGAAAGGAGGACATGGTCACAGTCATGGACATGGACACGCTCACAGT	60382

CR847841.4	501	CATACACGTGGAAGTCATGGACATGGAAGACAAGGTGAGCCCAGGAACAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60383	CATACACGTGGAAGTCATGGACATGGAAGACAAGGTGAGCCCAGGAACAA	60432

CR847841.4	551	CTTTCCTGAAAGCTGACTTGCCTGCCTCAGAATCTCCTCATCTTATGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60433	CTTTCCTGAAAGCTGACTTGCCTGCCTCAGAATCTCCTCATCTTATGGCC	60482

CR847841.4	601	CTCAGGAGGGAGAGGACATGTTGGAAGATCTGTTCTCCACTCTGACCAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60483	CTCAGGAGGGAGAGGACATGTTGGAAGATCTGTTCTCCACTCTGACCAAC	60532

CR847841.4	651	TCTTTTCTTCCCTCAGAGCGTTCTACCAAGGAGAAGCAGAGCTCAGAGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60533	TCTTTTCTTCCCTCAGAGCGTTCTACCAAGGAGAAGCAGAGCTCAGAGGA	60582

CR847841.4	701	AGAAGAAAAGGAAACAAGAGGGGTTCAGAAGAGGCGAGGAGGGAGCACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60583	AGAAGAAAAGGAAACAAGAGGGGTTCAGAAGAGGCGAGGAGGGAGCACAG	60632

CR847841.4	751	TACCCAAAGATGGGCCAGTGAGACCTCAGAACGCTGAAGAAGAAAAAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60633	TACCCAAAGATGGGCCAGTGAGACCTCAGAACGCTGAAGAAGAAAAAAGA	60682

CR847841.4	801	GGCTTAGGTAAGGGCCAGAGTTGGTGATAAATTTGGGCAAGGGACATCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60683	GGCTTAGGTAAGGGCCAGAGTTGGTGATAAATTTGGGCAAGGGACATCAT	60732

CR847841.4	851	CACAAATCACATGGAATATGTGCTGTGGGTAATGGCAGGTATCTGAGAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60733	CACAAATCACATGGAATATGTGCTGTGGGTAATGGCAGGTATCTGAGAAA	60782

CR847841.4	901	CACTAAAGGACTGGGTGTAAAGTGGTCTCTGAGGGGAGGTGTGAGAATAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60783	CACTAAAGGACTGGGTGTAAAGTGGTCTCTGAGGGGAGGTGTGAGAATAG	60832

CR847841.4	951	CTGACCAAGACTGGAACAAGTGGTGATGGAAGCCTCTGATCATTTTCTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60833	CTGACCAAGACTGGAACAAGTGGTGATGGAAGCCTCTGATCATTTTCTCT	60882

CR847841.4	1001	TCTTGTCCTGTACAAGACCTGCGTGTGTCGGGGTACCTGAATCTGGCTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60883	TCTTGTCCTGTACAAGACCTGCGTGTGTCGGGGTACCTGAATCTGGCTGC	60932

CR847841.4	1051	TGACTTGGCACACAACTTCACTGATGGTCTGGCCATTGGGGCTTCCTTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60933	TGACTTGGCACACAACTTCACTGATGGTCTGGCCATTGGGGCTTCCTTTC	60982

CR847841.4	1101	GAGGGGGCCGGGGACTAGGGATCCTGACCACAATGACTGTCCTGCTACAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	60983	GAGGGGGCCGGGGACTAGGGATCCTGACCACAATGACTGTCCTGCTACAT	61032

CR847841.4	1151	GAAGTGCCCCACGAGGTCGGAGACTTTGCCATCTTGGTCCAGTCTGGCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61033	GAAGTGCCCCACGAGGTCGGAGACTTTGCCATCTTGGTCCAGTCTGGCTG	61082

CR847841.4	1201	CAGCAAAAAGCAGGTTGGTGATGTCTGCCAAACACAGCTGCCTCAAACCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61083	CAGCAAAAAGCAGGTTGGTGATGTCTGCCAAACACAGCTGCCTCAAACCC	61132

CR847841.4	1251	TTTATCTCTCCTCACTCACCCTAAACCCAAACAGCCTCTTATTAGTTCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61133	TTTATCTCTCCTCACTCACCCTAAACCCAAACAGCCTCTTATTAGTTCCA	61182

CR847841.4	1301	AACAATTCATACTGTCATTGACAAGTCCTCTAGAAATGAGGGGGAAGAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61183	AACAATTCATACTGTCATTGACAAGTCCTCTAGAAATGAGGGGGAAGAAG	61232

CR847841.4	1351	TTCTGGTTACTTTGTCCTTTAGCTCAGTATTTCTTAAACTGGTCTATAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61233	TTCTGGTTACTTTGTCCTTTAGCTCAGTATTTCTTAAACTGGTCTATAAA	61282

CR847841.4	1401	CCATCTGAATGGTTTAGTGGAGTCTTACACACACACGCCTACTCAATCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61283	CCATCTGAATGGTTTAGTGGAGTCTTACACACACACGCCTACTCAATCAG	61332

CR847841.4	1451	AAAGTCTGTGGAAAGGACCTCTGATCTCTTAAGATTTTTCAGAAATTGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61333	AAAGTCTGTGGAAAGGACCTCTGATCTCTTAAGATTTTTCAGAAATTGTC	61382

CR847841.4	1501	TATTCTAGACTGCTCCCTCTTCTCTTTTTATTTTGATGTTTAGTTTCCAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61383	TATTCTAGACTGCTCCCTCTTCTCTTTTTATTTTGATGTTTAGTTTCCAA	61432

CR847841.4	1551	ATCCATGTCCCCTATACCTATACCCCACCAGCCACTTCTAAACCACTGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61433	ATCCATGTCCCCTATACCTATACCCCACCAGCCACTTCTAAACCACTGAT	61482

CR847841.4	1601	AATCTTTAGCTATTGGTGAGTGCCTTTTTCTCTTTTCTGCCCATCAGGCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61483	AATCTTTAGCTATTGGTGAGTGCCTTTTTCTCTTTTCTGCCCATCAGGCG	61532

CR847841.4	1651	ATGCGTCTGCAACTACTGACAGCAGTAGGGGCACTGGCAGGCACAGCCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61533	ATGCGTCTGCAACTACTGACAGCAGTAGGGGCACTGGCAGGCACAGCCTG	61582

CR847841.4	1701	TGCCCTTCTCACTGAAGGAGGAGCAGTGGGCAGTGAAATTGCAGGTGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61583	TGCCCTTCTCACTGAAGGAGGAGCAGTGGGCAGTGAAATTGCAGGTGGTG	61632

CR847841.4	1751	CAGGTCCTGGCTGGGTCCTGCCATTTACTGCAGGTGGCTTTATCTACGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61633	CAGGTCCTGGCTGGGTCCTGCCATTTACTGCAGGTGGCTTTATCTACGTA	61682

CR847841.4	1801	GCAACAGTGTCTGTGTTGCCCGAGCTGCTGAGGGAGGCATCACCATTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61683	GCAACAGTGTCTGTGTTGCCCGAGCTGCTGAGGGAGGCATCACCATTGCA	61732

CR847841.4	1851	ATCACTTCTGGAGGTGCTGGGGCTGCTGGGGGGAGTTATCATGATGGTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61733	ATCACTTCTGGAGGTGCTGGGGCTGCTGGGGGGAGTTATCATGATGGTGC	61782

CR847841.4	1901	TGATTGCCCACCTTGAGTGAGGGGTGGATAAACTACCCCTGCCCCAAACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61783	TGATTGCCCACCTTGAGTGAGGGGTGGATAAACTACCCCTGCCCCAAACC	61832

CR847841.4	1951	TCTACCCCTAACTCCAGGTCAGGGGTGCGTAGAGGTTGGGGGCCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR354565.6	61833	TCTACCCCTAACTCCAGGTCAGGGGTGCGTAGAGGTTGGGGGCCCTGGCC	61882

Overview

Query
CR847841.4 - 8399 bps
Hit
CR354565.6 - 61882 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link