<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR847852.10	1	CAAGGCTGCAGTGAGCTATAATCATGCCACTGCATTCCAACTGAGTGACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36217	CAAGGCTGCAGTGAGCTATAATCATGCCACTGCATTCCAACTGAGTGACA	36266

CR847852.10	51	CAGCAAGACTCCTCTCTTAAAAAAAAAAAAAATTCATGGCAGGGCACAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36267	CAGCAAGACTCCTCTCTTAAAAAAAAAAAAAATTCATGGCAGGGCACAAT	36316

CR847852.10	101	GAGTACTATCAGGAAGGTTCAAACCACGGGCTAAATCAGTAGTTCTAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36317	GAGTACTATCAGGAAGGTTCAAACCACGGGCTAAATCAGTAGTTCTAAAA	36366

CR847852.10	151	CTTGACTACACATCGGAATCACCTAGGGAACTTTAAAAGATACTAAGATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36367	CTTGACTACACATCGGAATCACCTAGGGAACTTTAAAAGATACTAAGATT	36416

CR847852.10	201	TAGGTCCAACCTGGGTTTACTGATTTAACAACCTAGGTTGTGGCTGTGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36417	TAGGTCCAACCTGGGTTTACTGATTTAACAACCTAGGTTGTGGCTGTGGC	36466

CR847852.10	251	CTGGGAACATGGATATTAAAAACTCTCCAGGTGGTTCTACGCAGTGGCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36467	CTGGGAACATGGATATTAAAAACTCTCCAGGTGGTTCTACGCAGTGGCTA	36516

CR847852.10	301	GGTTTGATGACCTCTGCCTAGATGTCCCAACGACTAAGAGATGTGCGTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36517	GGTTTGATGACCTCTGCCTAGATGTCCCAACGACTAAGAGATGTGCGTTG	36566

CR847852.10	351	GGGACAAGGCAATTCTCTTAGTAGAAAGAGGCTTTCGGGACAGCATTCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36567	GGGACAAGGCAATTCTCTTAGTAGAAAGAGGCTTTCGGGACAGCATTCTT	36616

CR847852.10	401	ATTATTGAGAATTGAGAATTCATATGCCACACAATTTATCCTTTTAAAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36617	ATTATTGAGAATTGAGAATTCATATGCCACACAATTTATCCTTTTAAAGT	36666

CR847852.10	451	GTGCAGCTCAGTGGCTTCTAGCGTAATCACAAGGTTGTGCCACCGTCACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36667	GTGCAGCTCAGTGGCTTCTAGCGTAATCACAAGGTTGTGCCACCGTCACC	36716

CR847852.10	501	ACTGTCTACCCTGGAAGATTTTTTTTCCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36717	ACTGTCTACCCTGGAAGATTTTTTTTCCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTCTT	36766

CR847852.10	551	TTTATTTTAAAGGCTAGTCAAGTGAAACAGTGGGAGTGAAGAAGAAACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36767	TTTATTTTAAAGGCTAGTCAAGTGAAACAGTGGGAGTGAAGAAGAAACAA	36816

CR847852.10	601	AGACATCTATAACTGGTTGTGATCAATTAGTTGTACACACTGCACTCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36817	AGACATCTATAACTGGTTGTGATCAATTAGTTGTACACACTGCACTCAGA	36866

CR847852.10	651	CCAGCCTGGGAAGATTTTAAGGATATGGTGTGGTCTGATGGGTTCCAAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36867	CCAGCCTGGGAAGATTTTAAGGATATGGTGTGGTCTGATGGGTTCCAAGG	36916

CR847852.10	701	CAGAGGTTACAATAGCCTGGAAGAGGGAGACTGCTTAGGCAGTGGCATCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36917	CAGAGGTTACAATAGCCTGGAAGAGGGAGACTGCTTAGGCAGTGGCATCC	36966

CR847852.10	751	TGGTGGGATAGGGTGAGGAGATCCCAGAGCCCACGTTTACTGCAACCCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	36967	TGGTGGGATAGGGTGAGGAGATCCCAGAGCCCACGTTTACTGCAACCCTG	37016

CR847852.10	801	GGGAGATGTCACCAGAGAAATGGGGGTGGTGCCAGACAGCAGATTGTGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37017	GGGAGATGTCACCAGAGAAATGGGGGTGGTGCCAGACAGCAGATTGTGGC	37066

CR847852.10	851	AGCTGAGGTTTTCCACGGTAGAGTAGAAGCATCCATCATGTGTGACATTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37067	AGCTGAGGTTTTCCACGGTAGAGTAGAAGCATCCATCATGTGTGACATTC	37116

CR847852.10	901	AGCAGATGGGGCGCTGTGGGTGGCTTGGAGCACTCTGGTTGTAACTGAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37117	AGCAGATGGGGCGCTGTGGGTGGCTTGGAGCACTCTGGTTGTAACTGAGG	37166

CR847852.10	951	CAGGCACCGTGTTTAGGAAGGCTGTGCAGTAATCTAGGCTGAAGGGAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37167	CAGGCACCGTGTTTAGGAAGGCTGTGCAGTAATCTAGGCTGAAGGGAGGG	37216

CR847852.10	1001	GAAAGCCTAGACTAAGATTGTGGCTGTGGGATTGAAATAGCGTTGAAGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37217	GAAAGCCTAGACTAAGATTGTGGCTGTGGGATTGAAATAGCGTTGAAGGA	37266

CR847852.10	1051	GCTGACTTTGACTCCCGGAGATGATGGGGAAAGAGGAAATCAGAAGGGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37267	GCTGACTTTGACTCCCGGAGATGATGGGGAAAGAGGAAATCAGAAGGGAC	37316

CR847852.10	1101	CAAGGATGGTGATGTTCTTAAGAGAAACTGAGGAGGAAGAGAGGATGATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37317	CAAGGATGGTGATGTTCTTAAGAGAAACTGAGGAGGAAGAGAGGATGATA	37366

CR847852.10	1151	TGGTGGCAGACGTATAGAGAGTCTTTGTAGATCTCTCACATTGGAGGGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37367	TGGTGGCAGACGTATAGAGAGTCTTTGTAGATCTCTCACATTGGAGGGGA	37416

CR847852.10	1201	CTATGGTCGGAGGTACAGATGTCCTAAGGCAGGCTGGAAAAGGGAGTCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37417	CTATGGTCGGAGGTACAGATGTCCTAAGGCAGGCTGGAAAAGGGAGTCTG	37466

CR847852.10	1251	GAGAGAGCTTGGTGTTGTAGTGAACCACAGGGAGCCGCCTCCTTGGCCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37467	GAGAGAGCTTGGTGTTGTAGTGAACCACAGGGAGCCGCCTCCTTGGCCCT	37516

CR847852.10	1301	GTGATCACCCAGGGACTGAATAGAGAGGCGGCCCTGGGAGACTTCAGACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37517	GTGATCACCCAGGGACTGAATAGAGAGGCGGCCCTGGGAGACTTCAGACA	37566

CR847852.10	1351	CTTAGAGGATATAAGGGGGTGAAAGGGGGGCCTGGCTTTGAGTCAAAGGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37567	CTTAGAGGATATAAGGGGGTGAAAGGGGGGCCTGGCTTTGAGTCAAAGGG	37616

CR847852.10	1401	AGGAGAAGGAGATTATAAAGCTGAAACGTCTAAGAGAGTTTGTGGTCTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37617	AGGAGAAGGAGATTATAAAGCTGAAACGTCTAAGAGAGTTTGTGGTCTGA	37666

CR847852.10	1451	GCGGTTCTACTGCGGCAGGTGCTTCTGAGAGGCAGAGGTGGCTGAGATCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37667	GCGGTTCTACTGCGGCAGGTGCTTCTGAGAGGCAGAGGTGGCTGAGATCT	37716

CR847852.10	1501	GGAAACAGGTCTGCAAATCTGGTCACTGGTCTCATTGCCAGTAACGCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37717	GGAAACAGGTCTGCAAATCTGGTCACTGGTCTCATTGCCAGTAACGCTGT	37766

CR847852.10	1551	GCGCGGTTGAGGGAGTGTGTTGGGAGAATAGCCACGCGTTGTCTGTCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37767	GCGCGGTTGAGGGAGTGTGTTGGGAGAATAGCCACGCGTTGTCTGTCCTG	37816

CR847852.10	1601	GAAGGAACAAGCCAGTGAGAGCCGGTTTAATGGGGCGGCCGGCGAAAGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37817	GAAGGAACAAGCCAGTGAGAGCCGGTTTAATGGGGCGGCCGGCGAAAGGG	37866

CR847852.10	1651	GCTTGGTGAGGCCCGCGCTCCTCGGGGTGGGGGCGCGGGGATGGGTGGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37867	GCTTGGTGAGGCCCGCGCTCCTCGGGGTGGGGGCGCGGGGATGGGTGGTC	37916

CR847852.10	1701	GCGATGCCGGGAGGGCAGGCAGGGCCCTGGCCGTGCTTATGAAGTTGGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37917	GCGATGCCGGGAGGGCAGGCAGGGCCCTGGCCGTGCTTATGAAGTTGGAG	37966

CR847852.10	1751	CTGTACTCTCAGCTACTCGAAGCTGGTCCCTGCTTTAGGCTGCGCTCCCG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	37967	CTGTACTCTCAGCTACTCGAAGCTGGTCCCTGCTTTAGGCTGCGCTCCCG	38016

CR847852.10	1801	CGTGCTCCCCATTTTCTGGGCCCCAGGTCCCGCCTTCTAAATCTCCCCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	38017	CGTGCTCCCCATTTTCTGGGCCCCAGGTCCCGCCTTCTAAATCTCCCCAG	38066

CR847852.10	1851	GTCTCCAGCCCACTGGAATTTTCTCTTCCAAGCGTGGCCCCGCCCTCTCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	38067	GTCTCCAGCCCACTGGAATTTTCTCTTCCAAGCGTGGCCCCGCCCTCTCC	38116

CR847852.10	1901	GCTCGTGATTGGCCCTAAGTTCCGGGCCCCAGTTTCATTGGATGAGCGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	38117	GCTCGTGATTGGCCCTAAGTTCCGGGCCCCAGTTTCATTGGATGAGCGGT	38166

CR847852.10	1951	CGGGGGACCGGGCCAGGTGACTAAGTTTCCGCGGCGCCTTCTCCCCGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR318637.4	38167	CGGGGGACCGGGCCAGGTGACTAAGTTTCCGCGGCGCCTTCTCCCCGGCC	38216

Overview

Query
CR847852.10 - 56201 bps
Hit
CR318637.4 - 38216 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link