<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX897745.14	1	AAGCTTATGACCATGATGTAATGTAATACAAGTGTTAGAATATCATTGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110503	AAGCTTATGACCATGATGTAATGTAATACAAGTGTTAGAATATCATTGAG	110552

BX897745.14	51	TGCATGTAAAATTTTGCTGTTTGATATGTTTATAAATCTACTAATAAACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110553	TGCATGTAAAATTTTGCTGTTTGATATGTTTATAAATCTACTAATAAACC	110602

BX897745.14	101	GAAAACAGTTTAGACGTGTGGTTGTGGTTCTTAATATTGTTTAACAAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110603	GAAAACAGTTTAGACGTGTGGTTGTGGTTCTTAATATTGTTTAACAAAAT	110652

BX897745.14	151	GTTCTAATTTTTATTGATTTGAGGAACAACCCCTCTTCAATTCTTACTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110653	GTTCTAATTTTTATTGATTTGAGGAACAACCCCTCTTCAATTCTTACTAT	110702

BX897745.14	201	CCCAAAACTCTCTTCTGTGTTTACAGTACATGCAAATATCTTTTTTTTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110703	CCCAAAACTCTCTTCTGTGTTTACAGTACATGCAAATATCTTTTTTTTAC	110752

BX897745.14	251	TCTGCCCTTTATACATCTCTAAATCTGTTTAATCTGTTCCCTCACTAAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110753	TCTGCCCTTTATACATCTCTAAATCTGTTTAATCTGTTCCCTCACTAAGG	110802

BX897745.14	301	TGTCTAACTGACTGTCTACATGAATATATCTGCACTTACTTTGAGTTTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110803	TGTCTAACTGACTGTCTACATGAATATATCTGCACTTACTTTGAGTTTCT	110852

BX897745.14	351	CGGCAACAGAAGCAGCATTGTTAAACCAGGATGAAACTCCACGATAATTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110853	CGGCAACAGAAGCAGCATTGTTAAACCAGGATGAAACTCCACGATAATTG	110902

BX897745.14	401	GGTGTTAGATCCAGCACTATGGAGATTCCTGAGAGGGAAAGAGGAGAGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110903	GGTGTTAGATCCAGCACTATGGAGATTCCTGAGAGGGAAAGAGGAGAGGA	110952

BX897745.14	451	GGGAAAAAGTCAACAAACCAGAAGGCTGTTAAATGCTATTTCTGGAGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	110953	GGGAAAAAGTCAACAAACCAGAAGGCTGTTAAATGCTATTTCTGGAGTTT	111002

BX897745.14	501	AACAGCCTAATGTTTGCTTTGTATGAAGCCTTTTTTAAAGGCATATTGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111003	AACAGCCTAATGTTTGCTTTGTATGAAGCCTTTTTTAAAGGCATATTGCT	111052

BX897745.14	551	TTATTTGCTCGAAACTAAGCAGGTGTTCTAGCTAAATAAACGTGGTGAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111053	TTATTTGCTCGAAACTAAGCAGGTGTTCTAGCTAAATAAACGTGGTGAAT	111102

BX897745.14	601	CAATTCCAAGAAAGACTTTAAAGTTTTATTTTAAATCGCATAATGTATAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111103	CAATTCCAAGAAAGACTTTAAAGTTTTATTTTAAATCGCATAATGTATAT	111152

BX897745.14	651	TTGTAGAATATGTAAGGAAATACTTGATGGTAAATGACTCATGAAAAATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111153	TTGTAGAATATGTAAGGAAATACTTGATGGTAAATGACTCATGAAAAATC	111202

BX897745.14	701	CTTTTAAAATTATTGCAGCGTAGTGAGAAACAAGAGAGGAGGTCAGAGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111203	CTTTTAAAATTATTGCAGCGTAGTGAGAAACAAGAGAGGAGGTCAGAGGT	111252

BX897745.14	751	TAAACTGACAGCTGATTGTTATTTCAGACAGCCTTCCTCTAGAACAGAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111253	TAAACTGACAGCTGATTGTTATTTCAGACAGCCTTCCTCTAGAACAGAAC	111302

BX897745.14	801	AACAGGAGCCTATGATGATTAGATCTATCCAGTGACCTATTATGTGTCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111303	AACAGGAGCCTATGATGATTAGATCTATCCAGTGACCTATTATGTGTCTG	111352

BX897745.14	851	GAAAAGTGACCTTGGCTGATATTTCAATTTGAAAACCTTCAAAACAAACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111353	GAAAAGTGACCTTGGCTGATATTTCAATTTGAAAACCTTCAAAACAAACT	111402

BX897745.14	901	AGTGAGTTCACCTTTTCTATGTGCTCGGTCCAGCAGAGAAGTCAGCTCGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111403	AGTGAGTTCACCTTTTCTATGTGCTCGGTCCAGCAGAGAAGTCAGCTCGC	111452

BX897745.14	951	TCTCAGAGCCAAAATCAGGGTTAATGGAAGTTAGTTCAAGTGCACTTGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111453	TCTCAGAGCCAAAATCAGGGTTAATGGAAGTTAGTTCAAGTGCACTTGAC	111502

BX897745.14	1001	TGGTCTGCTTGCACAGAATGTACTGGACCCAAAACAAGCCCCTTCACCTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111503	TGGTCTGCTTGCACAGAATGTACTGGACCCAAAACAAGCCCCTTCACCTT	111552

BX897745.14	1051	CATCTGACTCAGATAGTCCAACTTCTCCTCCACTCCTACAGATGAAAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111553	CATCTGACTCAGATAGTCCAACTTCTCCTCCACTCCTACAGATGAAAAAG	111602

BX897745.14	1101	GGGTTAAGAAAAAAAGAGGAAATGAATGAGCAACCGTCATCAGTTACTGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111603	GGGTTAAGAAAAAAAGAGGAAATGAATGAGCAACCGTCATCAGTTACTGC	111652

BX897745.14	1151	CTCCTTTAGCTATCTCTATAGCCACAGAATTCAGGGCACCTTTTAATCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111653	CTCCTTTAGCTATCTCTATAGCCACAGAATTCAGGGCACCTTTTAATCAT	111702

BX897745.14	1201	TAATCTGCTTTGATGATATAGCTTGTGCACACCTAAAGATATCAGGGTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111703	TAATCTGCTTTGATGATATAGCTTGTGCACACCTAAAGATATCAGGGTTT	111752

BX897745.14	1251	AAGGTCACTGTACTTGATCATCTAAATCTATGATATAGCCGTGTGGGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111753	AAGGTCACTGTACTTGATCATCTAAATCTATGATATAGCCGTGTGGGAAA	111802

BX897745.14	1301	GCAAACTTATCACAACTGTGTGATTGGGAACAGAATCTTGCATAGGTCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111803	GCAAACTTATCACAACTGTGTGATTGGGAACAGAATCTTGCATAGGTCAG	111852

BX897745.14	1351	CACATGCTTTCTCACATAAGGGAGTCACAAGACAGTCAGTCTCTTCTGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111853	CACATGCTTTCTCACATAAGGGAGTCACAAGACAGTCAGTCTCTTCTGGC	111902

BX897745.14	1401	TTATCTACAGCATCAGCAAATCTGCTTCCCCCCACAGTGTTTTCATAATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111903	TTATCTACAGCATCAGCAAATCTGCTTCCCCCCACAGTGTTTTCATAATG	111952

BX897745.14	1451	TTACCCAAGCAAGGCGTCTAAATTACTGCATATTCGGCAGTTGATACCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	111953	TTACCCAAGCAAGGCGTCTAAATTACTGCATATTCGGCAGTTGATACCTG	112002

BX897745.14	1501	TTAAGGGGTATTGAAAATATAGACATTCATTCATACCTTTCAGTCCATTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112003	TTAAGGGGTATTGAAAATATAGACATTCATTCATACCTTTCAGTCCATTC	112052

BX897745.14	1551	TTAGAGAAGGCATCCAAGTTAGATATCTGGTACAGAGGACCTTCATTCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112053	TTAGAGAAGGCATCCAAGTTAGATATCTGGTACAGAGGACCTTCATTCCA	112102

BX897745.14	1601	CCAGTGCATCTCAGGAATGGGTTTACAGCGTGGAGCTTGTACTATGATTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112103	CCAGTGCATCTCAGGAATGGGTTTACAGCGTGGAGCTTGTACTATGATTA	112152

BX897745.14	1651	CTATTGCTCCAGCTAACATGCCAACCCAACCAAGCCAGAATAGAACCAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112153	CTATTGCTCCAGCTAACATGCCAACCCAACCAAGCCAGAATAGAACCAGT	112202

BX897745.14	1701	AAAGCCCAACGAGTCCGAACCCAACTGCAGATGACAGGCAATAGTTACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112203	AAAGCCCAACGAGTCCGAACCCAACTGCAGATGACAGGCAATAGTTACAT	112252

BX897745.14	1751	CAAACAAACAGCTTATATATAAAGCAATGTATAAGATAGTTAAATAGCGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112253	CAAACAAACAGCTTATATATAAAGCAATGTATAAGATAGTTAAATAGCGT	112302

BX897745.14	1801	ACCCAGCTGTACCGGCGACTTTCATCAACTCTTCTTTAGAGAGGCCCGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112303	ACCCAGCTGTACCGGCGACTTTCATCAACTCTTCTTTAGAGAGGCCCGTA	112352

BX897745.14	1851	AATTTGACTTCTGCGTCCTCCGGCACTTTGACCTTTACGCTGCCGTTTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112353	AATTTGACTTCTGCGTCCTCCGGCACTTTGACCTTTACGCTGCCGTTTTT	112402

BX897745.14	1901	TTCGGTGCCTGTCGGAGTTTGGCCGGTCATCGGCTGTTTTTCCTGATCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112403	TTCGGTGCCTGTCGGAGTTTGGCCGGTCATCGGCTGTTTTTCCTGATCCA	112452

BX897745.14	1951	TCTCGTTCAGTTCTACTTCCTTCATCTCGTCTTCTTTGTTCATTGTTTGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR293510.8	112453	TCTCGTTCAGTTCTACTTCCTTCATCTCGTCTTCTTTGTTCATTGTTTGT	112502

BX897745.14	2001	T	2001
			|
CR293510.8	112503	T	112503

Overview

Query
BX897745.14 - 137821 bps
Hit
CR293510.8 - 112503 bps
Total alignments
27
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196720011200111105031125031
289.55741356927169405-1554656791
39059896708767175150986510751
497.931811931443314625-154661548531
596.9235655807158135-168560686241
696.9235657389973963-168560686241
798.3632615807558135168561686211
898.3632617390373963168561686211
997.4739791551715595168646687241
1098.7341791552015598-168648687261
1198.738775804958125168648687241
1292.2340103100254100356-168649687511
1398.6336737389073962168649687211
1495.564090100265100354168649687381
1598.6539747388973962-168652687251
1695.438875804658132-168656687421
1798.413163118920118982-168663687251
181003048118917118964-183823838701
1984.531736888568957-184330844001
2083.391272801503615315-188056883321
2189.6957986916169258-190492905881
2284.615512997369864190597907261
2390.8214620715351741199576997821
2488.8936907058714711002421003311
2586.96651156480464918-11014201015341
2694.7393115609556106911014201015331
2792.754969101153101221-11016491017171
Short-link