<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX324171.9	1	AAGCTTGGTTGCCAAACTTTCAAAAGATGTTTTGAAATCCTCTGCGATCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	4836	AAGCTTGGTTGCCAAACTTTCAAAAGATGTTTTGAAATCCTCTGCGATCG	4885

BX324171.9	51	AGGCTCTAAGGTCGTCATGTAACGTACGAATCTCGGCCAACGTGATGTTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	4886	AGGCTCTAAGGTCGTCATGTAACGTACGAATCTCGGCCAACGTGATGTTA	4935

BX324171.9	101	GCATTTGGCAAAAGAGAGCCTTCTCTTTCTTTATCGACCTGTCTGCCCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	4936	GCATTTGGCAAAAGAGAGCCTTCTCTTTCTTTATCGACCTGTCTGCCCTT	4985

BX324171.9	151	TCCTTTTGACATTTCATAGGTGAAATATGTCATAGAACAGTAGATAAACG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	4986	TCCTTTTGACATTTCATAGGTGAAATATGTCATAGAACAGTAGATAAACG	5035

BX324171.9	201	AATACTGTCAGAAACTTACAAAAGTACTGATGTTAAAAGATAAAACTGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5036	AATACTGTCAGAAACTTACAAAAGTACTGATGTTAAAAGATAAAACTGAA	5085

BX324171.9	251	AAGTTTTTTGGGAGCTGACCACGCGCACGTCTACTCCTCAGACGCCATAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5086	AAGTTTTTTGGGAGCTGACCACGCGCACGTCTACTCCTCAGACGCCATAA	5135

BX324171.9	301	CCGGAACTCCCGGACCATTTGTCTTTTGAAGTAGAAATGAAATCCAAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5136	CCGGAACTCCCGGACCATTTGTCTTTTGAAGTAGAAATGAAATCCAAACT	5185

BX324171.9	351	AAGCATATGATTTTGTTAGCTCACATTGGAAGATTTGTAGTGAACACTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5186	AAGCATATGATTTTGTTAGCTCACATTGGAAGATTTGTAGTGAACACTTA	5235

BX324171.9	401	ATTTGTTTATGTCTTTAAGAAAAAAATTGTTAGCCCTTGCAATCTATAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5236	ATTTGTTTATGTCTTTAAGAAAAAAATTGTTAGCCCTTGCAATCTATAAT	5285

BX324171.9	451	TGAAATCTGAAAATGCACTTAGTTTTTTTTCATATAAATTCTCAGATTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5286	TGAAATCTGAAAATGCACTTAGTTTTTTTTCATATAAATTCTCAGATTTA	5335

BX324171.9	501	GATCATTTAGGTATTGGGCGTGGAAACTATATTTAACCACGCCCCTTCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5336	GATCATTTAGGTATTGGGCGTGGAAACTATATTTAACCACGCCCCTTCAA	5385

BX324171.9	551	CTGTCAGTTTTGACAACAAATAGAAATGGTGAGGAGGACTTGTCTGTTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5386	CTGTCAGTTTTGACAACAAATAGAAATGGTGAGGAGGACTTGTCTGTTAG	5435

BX324171.9	601	GTTGTAATAACTCTTCTAAAACTCATTTGCTGATATTTGTTTATGAAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5436	GTTGTAATAACTCTTCTAAAACTCATTTGCTGATATTTGTTTATGAAAAG	5485

BX324171.9	651	CCTACTTTACTACATCCAATCAGCTTGCAGTAGAAAAAAAAGTCACACCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5486	CCTACTTTACTACATCCAATCAGCTTGCAGTAGAAAAAAAAGTCACACCC	5535

BX324171.9	701	ACTGTTTTGTCATTTAATAATCTGGTTACTCCATCACAATGCAAAAAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5536	ACTGTTTTGTCATTTAATAATCTGGTTACTCCATCACAATGCAAAAAAGG	5585

BX324171.9	751	TTGCAGCTTCCGGTTCATGTGGGCTTTAATGATTGTTTGGTACCTGTCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5586	TTGCAGCTTCCGGTTCATGTGGGCTTTAATGATTGTTTGGTACCTGTCTC	5635

BX324171.9	801	GACACTTTGCATGTTTCCTGGATTTAGTTTTGTTGAATTACACTTACCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5636	GACACTTTGCATGTTTCCTGGATTTAGTTTTGTTGAATTACACTTACCAT	5685

BX324171.9	851	TGATGTTTGCTCCTGACTTGACCCCTGCCTGCCTGGCCATCCTGCATAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5686	TGATGTTTGCTCCTGACTTGACCCCTGCCTGCCTGGCCATCCTGCATAAA	5735

BX324171.9	901	GTTGTGTTTGTAAGTCAGCTTTCATTGAATGACCTCATACATGTTGGGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5736	GTTGTGTTTGTAAGTCAGCTTTCATTGAATGACCTCATACATGTTGGGAT	5785

BX324171.9	951	CATCAGTGTTGTTGATTTTGCTGAAGATCACTACCACCACAATTCTGGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5786	CATCAGTGTTGTTGATTTTGCTGAAGATCACTACCACCACAATTCTGGCT	5835

BX324171.9	1001	TACCTGTATTCCCTCTGTTCAGCCGATGTACCTCTCAATGTTCTAATCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5836	TACCTGTATTCCCTCTGTTCAGCCGATGTACCTCTCAATGTTCTAATCTC	5885

BX324171.9	1051	TAATGTGCATCTCTAATGCTCACGCTGATCTAACAGTCCTAAAGCCCGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5886	TAATGTGCATCTCTAATGCTCACGCTGATCTAACAGTCCTAAAGCCCGCA	5935

BX324171.9	1101	GAGTTCTCAGGTCACACTCAGTCTGCCACCAGCTCCCAAGATGTCTTCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5936	GAGTTCTCAGGTCACACTCAGTCTGCCACCAGCTCCCAAGATGTCTTCCT	5985

BX324171.9	1151	GTCCTGGTTCTCTTCTTGTCATTGTGTCTGTTCCTGAGTTTTACAAATTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	5986	GTCCTGGTTCTCTTCTTGTCATTGTGTCTGTTCCTGAGTTTTACAAATTA	6035

BX324171.9	1201	CCATTTCTGAAGCTGCTAGAGCCCCTGTCACTGCCAAAGCCTTTGATGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6036	CCATTTCTGAAGCTGCTAGAGCCCCTGTCACTGCCAAAGCCTTTGATGTA	6085

BX324171.9	1251	GCCACTTGATCTCTAAGTGTGGTTGCCTCTATCGCCAGAGCTACAGCTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6086	GCCACTTGATCTCTAAGTGTGGTTGCCTCTATCGCCAGAGCTACAGCTGC	6135

BX324171.9	1301	AAGAGCTGTAAATGCAGCTGCCTTATCCGCTGATGCCTCTTGATCTTAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6136	AAGAGCTGTAAATGCAGCTGCCTTATCCGCTGATGCCTCTTGATCTTAGC	6185

BX324171.9	1351	CTATCCAGAGCTCCACAGTCCAGACTCTCCACCCTCCAGACTCTCCACAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6186	CTATCCAGAGCTCCACAGTCCAGACTCTCCACCCTCCAGACTCTCCACAG	6235

BX324171.9	1401	CTCCAGACTCCATGCTCTAGACCAGGTTTGGGCAAACTTGATTCATGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6236	CTCCAGACTCCATGCTCTAGACCAGGTTTGGGCAAACTTGATTCATGAAG	6285

BX324171.9	1451	GCCAATGTCTCTGAATAGTTTTGCACCAACACTAATCAGAGACACCCGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6286	GCCAATGTCTCTGAATAGTTTTGCACCAACACTAATCAGAGACACCCGAA	6335

BX324171.9	1501	CACAGAACACACTACTTAGTGTCTTAAATGTCACTAGAAATACTTTAATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6336	CACAGAACACACTACTTAGTGTCTTAAATGTCACTAGAAATACTTTAATA	6385

BX324171.9	1551	TTACTGTGTTTGATTATGGTTGGAGAAAAACTAAGCAGGACACCGCCACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6386	TTACTGTGTTTGATTATGGTTGGAGAAAAACTAAGCAGGACACCGCCACT	6435

BX324171.9	1601	ACAGGATAAAGTTTGCCAATCCCTGCTCTAGATTCTTCAGAGCACCAGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6436	ACAGGATAAAGTTTGCCAATCCCTGCTCTAGATTCTTCAGAGCACCAGAC	6485

BX324171.9	1651	TCTCCACAGCTCTCTGCTCCACGCCTTTCTCAATTCCAAGCTCTAGACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6486	TCTCCACAGCTCTCTGCTCCACGCCTTTCTCAATTCCAAGCTCTAGACTC	6535

BX324171.9	1701	TCCACAGCTCCACACTCCAGATCCTTCTCAGTTCCATGCTCCAGACTCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6536	TCCACAGCTCCACACTCCAGATCCTTCTCAGTTCCATGCTCCAGACTCTT	6585

BX324171.9	1751	CATAGATCCACGCTCCAGGCCCTTCTAAGTTCCAAGCTCAAGACTCTTCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6586	CATAGATCCACGCTCCAGGCCCTTCTAAGTTCCAAGCTCAAGACTCTTCA	6635

BX324171.9	1801	AAACTCTACATTCCAAACTCTCCACAGCTCTATACTCGAAACTCCATAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6636	AAACTCTACATTCCAAACTCTCCACAGCTCTATACTCGAAACTCCATAGG	6685

BX324171.9	1851	TCCAGACTGAATCCAGACTGAATCCTCCACAATTCCATGCTCCACACCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6686	TCCAGACTGAATCCAGACTGAATCCTCCACAATTCCATGCTCCACACCCT	6735

BX324171.9	1901	CCACAGCTCTATGCTCCAGATTCTCTACAGCTCCACGCTCCAGGCCATTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6736	CCACAGCTCTATGCTCCAGATTCTCTACAGCTCCACGCTCCAGGCCATTC	6785

BX324171.9	1951	TCAGTTCCAAACTCCAGACTTTCCACAGCTCCACACTCCAGACCCTCCAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX957354.8	6786	TCAGTTCCAAACTCCAGACTTTCCACAGCTCCACACTCCAGACCCTCCAC	6835

Overview

Query
BX324171.9 - 151068 bps
Hit
BX957354.8 - 6835 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link