<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649278.8	1	GTCAAACTCAGGCCCACTACAATTATATTTGGCCCGCAAGATGATTTTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191559	GTCAAACTCAGGCCCACTACAATTATATTTGGCCCGCAAGATGATTTTAA	191608

BX649278.8	51	ATATGTATTACATTTGGCCCGCTGGCCCGTTATACAGCGCATGTACCCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191609	ATATGTATTACATTTGGCCCGCTGGCCCGTTATACAGCGCATGTACCCCT	191658

BX649278.8	101	AAGGTGCCTACACATTGAATGCGTCAAGCGCTGAGCCATTCATTGTGTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191659	AAGGTGCCTACACATTGAATGCGTCAAGCGCTGAGCCATTCATTGTGTAT	191708

BX649278.8	151	GTGCGACGTCAGTGACAGAGCGCAAGTTCGTGCTGAGGCGCAGAGCATCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191709	GTGCGACGTCAGTGACAGAGCGCAAGTTCGTGCTGAGGCGCAGAGCATCG	191758

BX649278.8	201	CGCAAGGGTGGCGTTTGACTCCCGATTTAAAACATTTTTAATTCGAGCGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191759	CGCAAGGGTGGCGTTTGACTCCCGATTTAAAACATTTTTAATTCGAGCGT	191808

BX649278.8	251	CAAAACGCTGTGACGACATCTATGCGCGGCCAATAGGAGAGCAGCCAGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191809	CAAAACGCTGTGACGACATCTATGCGCGGCCAATAGGAGAGCAGCCAGTG	191858

BX649278.8	301	CCGGGAATTCCCGATGTGGAGCAAGAAGCTAAGCTTAGCCGCTGCTAAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191859	CCGGGAATTCCCGATGTGGAGCAAGAAGCTAAGCTTAGCCGCTGCTAAGC	191908

BX649278.8	351	GATAGAAGGGGCACTGCTGTCCGCGACACTACGTATTAAACTTTATTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191909	GATAGAAGGGGCACTGCTGTCCGCGACACTACGTATTAAACTTTATTAAA	191958

BX649278.8	401	GGGACACCACGGAGAAAACTCTCCTCTATCGCTTAGTTTAGCTTAGCAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	191959	GGGACACCACGGAGAAAACTCTCCTCTATCGCTTAGTTTAGCTTAGCAGA	192008

BX649278.8	451	GGGCTTACTGCTCCGCATCGGGAACTCCGTCCGACCTAAAAAAACAGCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192009	GGGCTTACTGCTCCGCATCGGGAACTCCGTCCGACCTAAAAAAACAGCTT	192058

BX649278.8	501	TTCTCCTGTTGGCCGCGCCCAGATGTCGTCACGGCGTTGGCACCAGACTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192059	TTCTCCTGTTGGCCGCGCCCAGATGTCGTCACGGCGTTGGCACCAGACTC	192108

BX649278.8	551	CGGAGCGCGAAAACACTCACCTCTTGTGTTGACGCTCATTAGCAAAGCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192109	CGGAGCGCGAAAACACTCACCTCTTGTGTTGACGCTCATTAGCAAAGCTG	192158

BX649278.8	601	CTACGAAGCACACGCTCAAATCCACCCTCCCGAAAAATTGCCAAACGAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192159	CTACGAAGCACACGCTCAAATCCACCCTCCCGAAAAATTGCCAAACGAAA	192208

BX649278.8	651	AATAGAAAACAGAAGCTTTCAAGATACATGGGTGACAGAGCCTGACTCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192209	AATAGAAAACAGAAGCTTTCAAGATACATGGGTGACAGAGCCTGACTCCA	192258

BX649278.8	701	GAAATTAATGCACTTGCATGTAAAAAGCGATGCCAAGTATCTGGCTTGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192259	GAAATTAATGCACTTGCATGTAAAAAGCGATGCCAAGTATCTGGCTTGGA	192308

BX649278.8	751	CCCATGTGCATCATCAGAGTAAATGAACAGTGAAAAAAACAAACAAGATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192309	CCCATGTGCATCATCAGAGTAAATGAACAGTGAAAAAAACAAACAAGATG	192358

BX649278.8	801	ATAAATGAATAACAGACACTTGGGGTATGAATGTTTTATTGAACATATAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192359	ATAAATGAATAACAGACACTTGGGGTATGAATGTTTTATTGAACATATAT	192408

BX649278.8	851	TGAACACATTCTGAATGATGATCATCCTTAGGATTATTAGGCAGCTCACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192409	TGAACACATTCTGAATGATGATCATCCTTAGGATTATTAGGCAGCTCACA	192458

BX649278.8	901	ATTTTATAAACTGAACAGTATAATAACCCAGCAGGCATCTTGATGTTAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192459	ATTTTATAAACTGAACAGTATAATAACCCAGCAGGCATCTTGATGTTAAA	192508

BX649278.8	951	ATGACATCGTAAACATGTCTAAAAATTAAATTTGATTTGATGTCAAAATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192509	ATGACATCGTAAACATGTCTAAAAATTAAATTTGATTTGATGTCAAAATC	192558

BX649278.8	1001	TTGATTTCACGCAGCTGCCATTTTAAAAGCGAAATCGTGGCTGCGGTGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192559	TTGATTTCACGCAGCTGCCATTTTAAAAGCGAAATCGTGGCTGCGGTGGG	192608

BX649278.8	1051	ACGAAACCCAGAAGTATCGCCTGAGTCACATAGGAACGTTTTGTACCTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192609	ACGAAACCCAGAAGTATCGCCTGAGTCACATAGGAACGTTTTGTACCTGG	192658

BX649278.8	1101	CTATATCTTATTAGCGAAGAAAAAACGACACAAATTTATCATTTCACCAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192659	CTATATCTTATTAGCGAAGAAAAAACGACACAAATTTATCATTTCACCAT	192708

BX649278.8	1151	CTTCCTGGTGACTAGAAGGTCAGTTCTGAATGAAAAGTGGAAATAAAAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192709	CTTCCTGGTGACTAGAAGGTCAGTTCTGAATGAAAAGTGGAAATAAAAAG	192758

BX649278.8	1201	GGATGTCAGACCTCATTTTTAGCTAAGTTAAACGAAATGGCACTAGTTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192759	GGATGTCAGACCTCATTTTTAGCTAAGTTAAACGAAATGGCACTAGTTAG	192808

BX649278.8	1251	CTAACGCTATCTTTACCAAACACACGGTTCAGATGCCAATTATCAAACTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192809	CTAACGCTATCTTTACCAAACACACGGTTCAGATGCCAATTATCAAACTC	192858

BX649278.8	1301	AAGTTAATGAACTGATTTTTTCACTATATTAGACCTGTTAGACATGATAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192859	AAGTTAATGAACTGATTTTTTCACTATATTAGACCTGTTAGACATGATAC	192908

BX649278.8	1351	TGAATTTTGTTACTTAAAAATATAAAAAACCCATAAATTTCCCGCTAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192909	TGAATTTTGTTACTTAAAAATATAAAAAACCCATAAATTTCCCGCTAACA	192958

BX649278.8	1401	TTTAAGCACTGTTGAACGCAACACCGCAGATTTGCCATAGTATTCACCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	192959	TTTAAGCACTGTTGAACGCAACACCGCAGATTTGCCATAGTATTCACCAG	193008

BX649278.8	1451	TGCTCAACAGAAATGACTTGTGATTGGCCGTGAAGGTCATTTTCCATCAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193009	TGCTCAACAGAAATGACTTGTGATTGGCCGTGAAGGTCATTTTCCATCAG	193058

BX649278.8	1501	GTGCCACAAGGAACAACCATTTTTCCATTGTCTGGCCAGTGCGAGTGAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193059	GTGCCACAAGGAACAACCATTTTTCCATTGTCTGGCCAGTGCGAGTGAAC	193108

BX649278.8	1551	TCCCCCCATAATCAAACAACCTGCCCAGGGGTGCATTTCTGAAACCCATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193109	TCCCCCCATAATCAAACAACCTGCCCAGGGGTGCATTTCTGAAACCCATC	193158

BX649278.8	1601	AATAGCCAACTAAGGTCACGAGTTCCATCGTTATAATAAATAAACAAACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193159	AATAGCCAACTAAGGTCACGAGTTCCATCGTTATAATAAATAAACAAACA	193208

BX649278.8	1651	TAAAGAAAAGAAAAAACATAGCTACTGGTCAGTTTAAGATATTCCATTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193209	TAAAGAAAAGAAAAAACATAGCTACTGGTCAGTTTAAGATATTCCATTAA	193258

BX649278.8	1701	ACACCTTATGATTAGCGGTCTTTTTTTTTTGCTTAAGATCGCCATTATGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193259	ACACCTTATGATTAGCGGTCTTTTTTTTTTGCTTAAGATCGCCATTATGT	193308

BX649278.8	1751	TTCCCTTTAAAATTTAAAGGTGTTGCATAAAATAATGAAGTAGTTTTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193309	TTCCCTTTAAAATTTAAAGGTGTTGCATAAAATAATGAAGTAGTTTTAAT	193358

BX649278.8	1801	TTATTAAGTGATGTTTTTTTGCTGCGACTAGTTTGTGCTGTACTGCGCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193359	TTATTAAGTGATGTTTTTTTGCTGCGACTAGTTTGTGCTGTACTGCGCAA	193408

BX649278.8	1851	CACTGCAGCATTGCATGTGGTCACGTTCATTTACACTGCACATTCTCAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193409	CACTGCAGCATTGCATGTGGTCACGTTCATTTACACTGCACATTCTCAGT	193458

BX649278.8	1901	GGCCATATCTGTATATCTGTTAGACGTCTCCTATTGGATGTTAAAAAGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193459	GGCCATATCTGTATATCTGTTAGACGTCTCCTATTGGATGTTAAAAAGAT	193508

BX649278.8	1951	GTTTAGAATGTTTCTGTTATATGTGGACAAAGTATGTAAACAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950862.7	193509	GTTTAGAATGTTTCTGTTATATGTGGACAAAGTATGTAAACAGAGAATTC	193558

Overview

Query
BX649278.8 - 41950 bps
Hit
BX950862.7 - 193558 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link