<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX936428.10	186619	GTTAAAAACAAGTTATGTACTATCAATTGTTACAGACTTTTGACTTTTGA	186668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1	GTTAAAAACAAGTTATGTACTATCAATTGTTACAGACTTTTGACTTTTGA	50

BX936428.10	186669	AAAATTCAGATTTGGACCTTTTAATGTAGACATTAAGGACTCCAGCATTG	186718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	51	AAAATTCAGATTTGGACCTTTTAATGTAGACATTAAGGACTCCAGCATTG	100

BX936428.10	186719	CACGATTGAGTTACTCCCCCCAAAGAAGTAACTAGCTGGGATACTTAATT	186768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	101	CACGATTGAGTTACTCCCCCCAAAGAAGTAACTAGCTGGGATACTTAATT	150

BX936428.10	186769	ACTTATTATGGTAAGTGATGTGTACGTTACTTTTGAGTTACTTTTGCGTT	186818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	151	ACTTATTATGGTAAGTGATGTGTACGTTACTTTTGAGTTACTTTTGCGTT	200

BX936428.10	186819	AATTTTTCTGACCTGGATGTCATAAAAAAATTACAATATAGGATAATCTT	186868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	201	AATTTTTCTGACCTGGATGTCATAAAAAAATTACAATATAGGATAATCTT	250

BX936428.10	186869	ATTTTCTGTGCACTTCTGACCATTAAGCTGTATGCCATATATACAGTACT	186918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	251	ATTTTCTGTGCACTTCTGACCATTAAGCTGTATGCCATATATACAGTACT	300

BX936428.10	186919	TTTGCACTGTTTGTCTTATTAATAAAGTAAAATCAATGTCCATTGAGACT	186968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	301	TTTGCACTGTTTGTCTTATTAATAAAGTAAAATCAATGTCCATTGAGACT	350

BX936428.10	186969	ATTATTGCCTTTTCCCTGTCTTTGGTTTCTTTCTGTTTCTGCATTGTCAC	187018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	351	ATTATTGCCTTTTCCCTGTCTTTGGTTTCTTTCTGTTTCTGCATTGTCAC	400

BX936428.10	187019	TGAGTGCGGGATTCAACGTGACTATGTTTATTTTAATTCAGCTAATTATT	187068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	401	TGAGTGCGGGATTCAACGTGACTATGTTTATTTTAATTCAGCTAATTATT	450

BX936428.10	187069	GAAACTAAAAAGTAACTCACATTACATTTTTTAAAAAAGTAACTCAAATA	187118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	451	GAAACTAAAAAGTAACTCACATTACATTTTTTAAAAAAGTAACTCAAATA	500

BX936428.10	187119	TTATTATTTTTTTATTAGAATATACAAAAGGTACACAATTTGAGATGATG	187168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	501	TTATTATTTTTTTATTAGAATATACAAAAGGTACACAATTTGAGATGATG	550

BX936428.10	187169	CAAATACAAAGAAAATGAAACGAAAACAAAATTACCAAAAACAACAATAA	187218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	551	CAAATACAAAGAAAATGAAACGAAAACAAAATTACCAAAAACAACAATAA	600

BX936428.10	187219	TACAAATTAAATACTGGCAGGTGCGTGTGTTTGTGTATGTGTGATAAGGA	187268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	601	TACAAATTAAATACTGGCAGGTGCGTGTGTTTGTGTATGTGTGATAAGGA	650

BX936428.10	187269	GTAACAACAATGCTAGTGATATAATGACAGTAATAATGACAGTAAACAAG	187318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	651	GTAACAACAATGCTAGTGATATAATGACAGTAATAATGACAGTAAACAAG	700

BX936428.10	187319	CAAGGAGGGACAACCAACTACTACTACTACTACTACAAAGAGTTCCTAAT	187368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	701	CAAGGAGGGACAACCAACTACTACTACTACTACTACAAAGAGTTCCTAAT	750

BX936428.10	187369	TTTACAACTATTACTACTTCTACTACAGCAACAACCACTACTACTACTAC	187418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	751	TTTACAACTATTACTACTTCTACTACAGCAACAACCACTACTACTACTAC	800

BX936428.10	187419	TACTACTACTACTACAATGTCTACTCCTACTAATATTATTACAACAACTA	187468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	801	TACTACTACTACTACAATGTCTACTCCTACTAATATTATTACAACAACTA	850

BX936428.10	187469	CTACCACTACATCTACTACTACTACTGATACTACTACAACAACAATGACT	187518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	851	CTACCACTACATCTACTACTACTACTGATACTACTACAACAACAATGACT	900

BX936428.10	187519	GATACTACAACATCTACATCAACAACGTTTACTACTTCTGATACCACTAT	187568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	901	GATACTACAACATCTACATCAACAACGTTTACTACTTCTGATACCACTAT	950

BX936428.10	187569	GCCAACAACATCAATTACTACAGATACTACTTCAACTACTACTTCAAAAA	187618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	951	GCCAACAACATCAATTACTACAGATACTACTTCAACTACTACTTCAAAAA	1000

BX936428.10	187619	CCCCAACTACAACTACAACTACAACCGCTACTACTACTATGACTGCTACT	187668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1001	CCCCAACTACAACTACAACTACAACCGCTACTACTACTATGACTGCTACT	1050

BX936428.10	187669	ATAACTACTACAACAACTAAAGCAACCTGAATGACAATGGTAGAAATACT	187718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1051	ATAACTACTACAACAACTAAAGCAACCTGAATGACAATGGTAGAAATACT	1100

BX936428.10	187719	TAAAAACAATAATGAGGAGATAACAGGACAAGTCAGGACAGTAATAATAA	187768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1101	TAAAAACAATAATGAGGAGATAACAGGACAAGTCAGGACAGTAATAATAA	1150

BX936428.10	187769	TAATGATAACAAAAAAATCTTATTGATAATAGTAAGGAGGTGAGGGTGGG	187818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1151	TAATGATAACAAAAAAATCTTATTGATAATAGTAAGGAGGTGAGGGTGGG	1200

BX936428.10	187819	GGGGATTCAGGAAGAGGACAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT	187868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1201	GGGGATTCAGGAAGAGGACAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT	1250

BX936428.10	187869	AATAATAACAATAATAATAATAATTATTATAATAATATGTAAAAAACGGA	187918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1251	AATAATAACAATAATAATAATAATTATTATAATAATATGTAAAAAACGGA	1300

BX936428.10	187919	AAGAGAACAAATAGAAGTTTAGAGAAAAAATAGAAAAGGAAGGGAAAGAA	187968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1301	AAGAGAACAAATAGAAGTTTAGAGAAAAAATAGAAAAGGAAGGGAAAGAA	1350

BX936428.10	187969	AGAGTAGAAGAAGTAAAGGAAAATAAAAAAAAATATAGGAAGTGGAAACA	188018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1351	AGAGTAGAAGAAGTAAAGGAAAATAAAAAAAAATATAGGAAGTGGAAACA	1400

BX936428.10	188019	AATAGCAGCAGACAAAACAATGAGAATATTAGGGGAAGAAAAAAAAAACT	188068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1401	AATAGCAGCAGACAAAACAATGAGAATATTAGGGGAAGAAAAAAAAAACT	1450

BX936428.10	188069	ACTATAATAATGGTAATATACTCAAAGTAAAGACGAATTTAGGTAATAAT	188118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1451	ACTATAATAATGGTAATATACTCAAAGTAAAGACGAATTTAGGTAATAAT	1500

BX936428.10	188119	ATGATGAATTATTATTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	188168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1501	ATGATGAATTATTATTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	1550

BX936428.10	188169	ATGAGAAGAAGAAGAATGAAAGATCAAGAGGAGGAATGATAAATGCATGA	188218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1551	ATGAGAAGAAGAAGAATGAAAGATCAAGAGGAGGAATGATAAATGCATGA	1600

BX936428.10	188219	TAAAAATATTATTAATTTTTAGAAGCAATGTGTTACATTTTACTTGGAAA	188268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1601	TAAAAATATTATTAATTTTTAGAAGCAATGTGTTACATTTTACTTGGAAA	1650

BX936428.10	188269	ATAATATTGTTATGTATTATTATTATTATTAATTTATGTTTTTTGTAATT	188318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1651	ATAATATTGTTATGTATTATTATTATTATTAATTTATGTTTTTTGTAATT	1700

BX936428.10	188319	TGCTTCCCCCAACACTGACTGTAGCATAATTTAGCTTTTTTTTTGGTTTG	188368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1701	TGCTTCCCCCAACACTGACTGTAGCATAATTTAGCTTTTTTTTTGGTTTG	1750

BX936428.10	188369	TGTTTTGTTCTGTTCAGGAATTAAAAGAACTTGGCAGATTTGCCAAAATT	188418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1751	TGTTTTGTTCTGTTCAGGAATTAAAAGAACTTGGCAGATTTGCCAAAATT	1800

BX936428.10	188419	GGTGCATTTGCCAAAACTTCTGTGTTCTCACAATACATGTGTTTTTAATT	188468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1801	GGTGCATTTGCCAAAACTTCTGTGTTCTCACAATACATGTGTTTTTAATT	1850

BX936428.10	188469	AAGTTTTTTTTTTGAAAGCTAGTTTATCTTAGCTATCACTTGAGTATAAT	188518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1851	AAGTTTTTTTTTTGAAAGCTAGTTTATCTTAGCTATCACTTGAGTATAAT	1900

BX936428.10	188519	AATAGACATTTGTGTAGAACCACTCTAAGAGTCCTCTGGCTTACCTTATA	188568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1901	AATAGACATTTGTGTAGAACCACTCTAAGAGTCCTCTGGCTTACCTTATA	1950

BX936428.10	188569	CCTACAGCTGGAGATTTGATCGCAAATTGCTTTGTCAAAACAATGAATTC	188618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950193.6	1951	CCTACAGCTGGAGATTTGATCGCAAATTGCTTTGTCAAAACAATGAATTC	2000

Overview

Query
BX936428.10 - 188618 bps
Hit
BX950193.6 - 15876 bps
Total alignments
7
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100186020001866191886181120001
289.2992140595460931318333221
384.171703627346973830-112692130641
485.481973693106731435112698130621
583.95116246120285120530-112700129421
685.081312508175182000112768130151
790.83841202123521354-114928150471
Short-link