<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957323.7	1	TTCCCCATTCAGAGAGAATGCCTAAACATACTGCCCAAGTAGCATTTCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66629	TTCCCCATTCAGAGAGAATGCCTAAACATACTGCCCAAGTAGCATTTCAA	66678

BX957323.7	51	AGATGGCTGTCGAGTGTAATGACTTGCCTTGCTCACCGAAACATATCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66679	AGATGGCTGTCGAGTGTAATGACTTGCCTTGCTCACCGAAACATATCATT	66728

BX957323.7	101	CTTTTTTTGGTCTGGACCACACGAACCATGAGAACCATACTACACACCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66729	CTTTTTTTGGTCTGGACCACACGAACCATGAGAACCATACTACACACCCT	66778

BX957323.7	151	AAGTTGCGAAATGTAATATTTCACCATCTACTCCAGCTCAAAAACACAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66779	AAGTTGCGAAATGTAATATTTCACCATCTACTCCAGCTCAAAAACACAAG	66828

BX957323.7	201	TCAAACAACATAGGCTCAAAAAACAGTAAGGAAAACAAGAATATCAGAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66829	TCAAACAACATAGGCTCAAAAAACAGTAAGGAAAACAAGAATATCAGAGC	66878

BX957323.7	251	ATTTCATGAAAAGGATCAATGTTGCGTGAGATAAACAACCCTCCAGTGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66879	ATTTCATGAAAAGGATCAATGTTGCGTGAGATAAACAACCCTCCAGTGTG	66928

BX957323.7	301	TTTACATCTGCTGGCAGGCACGAAAAATGCCAGAGGCCAAAACCCCAGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66929	TTTACATCTGCTGGCAGGCACGAAAAATGCCAGAGGCCAAAACCCCAGGC	66978

BX957323.7	351	ACTGTTATTATATTCCCCCATTGATCTATTGCACTTTTTTAGTAGTTGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	66979	ACTGTTATTATATTCCCCCATTGATCTATTGCACTTTTTTAGTAGTTGGG	67028

BX957323.7	401	GCATCATGGAAGGTCTCAATCCATCATGCAGGGCCTCAAAAATTAGTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67029	GCATCATGGAAGGTCTCAATCCATCATGCAGGGCCTCAAAAATTAGTATT	67078

BX957323.7	451	TTCAAACAGTTCCTCAAGTTAGCCAGCACTTATAAATAACACAGTCTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67079	TTCAAACAGTTCCTCAAGTTAGCCAGCACTTATAAATAACACAGTCTCTA	67128

BX957323.7	501	AGCTGCAAACATCAATGGCAGACAGCTGAGCCTATTGTTGATGCTTCACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67129	AGCTGCAAACATCAATGGCAGACAGCTGAGCCTATTGTTGATGCTTCACT	67178

BX957323.7	551	GCGTTCACCCGCCTCTCTGCAATGGGATGTGGTGGAAGATTGATGTGAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67179	GCGTTCACCCGCCTCTCTGCAATGGGATGTGGTGGAAGATTGATGTGAGA	67228

BX957323.7	601	TGTCACTGGAGGGAAGTAGGAGTGGCCAAGCATCAGTGTAGCGCATGTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67229	TGTCACTGGAGGGAAGTAGGAGTGGCCAAGCATCAGTGTAGCGCATGTTC	67278

BX957323.7	651	CTGCTCTCCAGCGCAGCGGGCAGCTGCACAGTCTGGCGGCCAGCGGTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67279	CTGCTCTCCAGCGCAGCGGGCAGCTGCACAGTCTGGCGGCCAGCGGTCCT	67328

BX957323.7	701	GCGTGCAGTCATGGAGGGATCTTGGGGAACGCAGCAGAAACCGGCCCAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67329	GCGTGCAGTCATGGAGGGATCTTGGGGAACGCAGCAGAAACCGGCCCAAC	67378

BX957323.7	751	AAATGTGGTATGCTGAGGCCTGCAGATCTACATTACACAGTCGGAGTTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67379	AAATGTGGTATGCTGAGGCCTGCAGATCTACATTACACAGTCGGAGTTGC	67428

BX957323.7	801	TGGGCAGAGGCCACGTCAAACAATGCGGAGGTCAAAAGAAGTGGCTTTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67429	TGGGCAGAGGCCACGTCAAACAATGCGGAGGTCAAAAGAAGTGGCTTTTA	67478

BX957323.7	851	TCAGGAATTACACTGCATCGAAGTATCTCCAATCAACTCTGCAGGCCAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67479	TCAGGAATTACACTGCATCGAAGTATCTCCAATCAACTCTGCAGGCCAAA	67528

BX957323.7	901	AAAGGGGAAATGGTGGAGTACTGAAGCATGTAAAGAAAGTAGTCCCTGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67529	AAAGGGGAAATGGTGGAGTACTGAAGCATGTAAAGAAAGTAGTCCCTGTG	67578

BX957323.7	951	TAGTCACCAGCGGTGTGAAATGAGGCATTGATTTGCAATCTGCTGAGTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67579	TAGTCACCAGCGGTGTGAAATGAGGCATTGATTTGCAATCTGCTGAGTAA	67628

BX957323.7	1001	CAGGACGCCCTGTCAGTCAGGTTATCAATGGGGTGTAAAGGCTTTTGGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67629	CAGGACGCCCTGTCAGTCAGGTTATCAATGGGGTGTAAAGGCTTTTGGTA	67678

BX957323.7	1051	TTTGGCACACGAGACTCCTCACGCTGGGTGCCAACTTAAACAGCAGTTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67679	TTTGGCACACGAGACTCCTCACGCTGGGTGCCAACTTAAACAGCAGTTTA	67728

BX957323.7	1101	AACCCCACGACGCAGGACAAACCATTCTCTGTCATCGCAATACTTCACGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67729	AACCCCACGACGCAGGACAAACCATTCTCTGTCATCGCAATACTTCACGC	67778

BX957323.7	1151	TGTCTCCACTACTCCACTGCCAAAACTTCAAAATGAGCATTTTCTGTGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67779	TGTCTCCACTACTCCACTGCCAAAACTTCAAAATGAGCATTTTCTGTGGA	67828

BX957323.7	1201	AATCTAAATGGTCGGAGTGCACTTTAAAACAGTGTTTTGGATCACAATGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67829	AATCTAAATGGTCGGAGTGCACTTTAAAACAGTGTTTTGGATCACAATGT	67878

BX957323.7	1251	AGCATAGAGAGATTTGTTGTATTAATACGCAACAGACCATTGAAAATGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67879	AGCATAGAGAGATTTGTTGTATTAATACGCAACAGACCATTGAAAATGAT	67928

BX957323.7	1301	CATATCTTGAAGAAGTAACGAACGAACGAACGAATAGGATAATTCAGCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67929	CATATCTTGAAGAAGTAACGAACGAACGAACGAATAGGATAATTCAGCAA	67978

BX957323.7	1351	CTGACTCCAGAACTTGTTATTGTCAGTTAAACTAAAACCATGTGCTAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	67979	CTGACTCCAGAACTTGTTATTGTCAGTTAAACTAAAACCATGTGCTAATT	68028

BX957323.7	1401	AAAAATATTTGTTTGTTTATTTTGTAAGATTCTATTCTATCAACCCAACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68029	AAAAATATTTGTTTGTTTATTTTGTAAGATTCTATTCTATCAACCCAACA	68078

BX957323.7	1451	ATGGAATCCGATGAATGGTTGAAACTTAAAAGCCTTTTTAGCACTTCTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68079	ATGGAATCCGATGAATGGTTGAAACTTAAAAGCCTTTTTAGCACTTCTAA	68128

BX957323.7	1501	GCACTTTCTAGCACTTCTGTTATTTATTACAATTTATTTATATTTGTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68129	GCACTTTCTAGCACTTCTGTTATTTATTACAATTTATTTATATTTGTTTT	68178

BX957323.7	1551	CAGCTCCAAGTTCAATCTGACTCCAGTTTTAATTTAACCATTAATGTTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68179	CAGCTCCAAGTTCAATCTGACTCCAGTTTTAATTTAACCATTAATGTTTT	68228

BX957323.7	1601	TAACTGATCATATTATTAATTGTAGTACAATTTAAATTTTAATATATTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68229	TAACTGATCATATTATTAATTGTAGTACAATTTAAATTTTAATATATTCT	68278

BX957323.7	1651	TGGGTCCCATAGTCTTAATTGTACGTTTATTAGAGACCAAACACTGCTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68279	TGGGTCCCATAGTCTTAATTGTACGTTTATTAGAGACCAAACACTGCTTA	68328

BX957323.7	1701	GAGTTCCATGCCCCAAGATTGCATTTCTTCTCACGGACATTATCTCAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68329	GAGTTCCATGCCCCAAGATTGCATTTCTTCTCACGGACATTATCTCAACA	68378

BX957323.7	1751	CTCTGGAGTTAGTCCGAGGATGTAGGCTTAAGTAATATTCAAGTAGTCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68379	CTCTGGAGTTAGTCCGAGGATGTAGGCTTAAGTAATATTCAAGTAGTCTG	68428

BX957323.7	1801	GTTGCTTCCCCCTCACTCATACCAAAAGAGTAGCGAGTTTATTCATTTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68429	GTTGCTTCCCCCTCACTCATACCAAAAGAGTAGCGAGTTTATTCATTTCC	68478

BX957323.7	1851	AGACAACTTACTAATATCAGTGACTAAATGATTACGAGGTCTTCATGCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68479	AGACAACTTACTAATATCAGTGACTAAATGATTACGAGGTCTTCATGCTG	68528

BX957323.7	1901	CCATGCCTCCTGCTTCGTACAGTCAAATGCGACTTGAAAATGGATAAAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68529	CCATGCCTCCTGCTTCGTACAGTCAAATGCGACTTGAAAATGGATAAAAT	68578

BX957323.7	1951	CATGTCACTTCCTAATGGTAGGGCAGACTCAACTTAATCTACTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX950173.7	68579	CATGTCACTTCCTAATGGTAGGGCAGACTCAACTTAATCTACTGGAATTC	68628

Overview

Query
BX957323.7 - 107162 bps
Hit
BX950173.7 - 68628 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001979200012000166629686281
285.061332549195392206-1343336931
384.62571179175991875-1375738731
482.181162939145591747-1403043321
582.74962558091581169-111057113051
689.23671268687486999111169112981
798.947911807818168-111559116491
898.8242852095821042111559116431
981.591433612890629266118554189171
1089.1654832891528997-143661437431
1188.24531361457914714-147083472181
1289.63551331472614858-147083472171
1386.351933613841338773-149468498261
1410032592095621014-153341533991
1510032588915489211153341533981
1610039801808018159-157661577401
1710043812096321043157661577411
1886.952014248687487297-162367627951
1993.33811207807878197-162712628311
2087.69481331472514857164703648321
2191.96561121457914690164707648181
Short-link