<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX901978.14	1	AAGCTTATGTGCAGTTTCGCAGTTCGTTGTGTTGCAAAGTTCAAGCTTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112295	AAGCTTATGTGCAGTTTCGCAGTTCGTTGTGTTGCAAAGTTCAAGCTTGG	112344

BX901978.14	51	TGAATTCTGACCTGCAAAATTGCATCACTCGACTGTATGAGACCAATCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112345	TGAATTCTGACCTGCAAAATTGCATCACTCGACTGTATGAGACCAATCAA	112394

BX901978.14	101	AAAATCAAAACATGACCTCTCTGGGGGGCGACGCAGTGGCACAGTGGGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112395	AAAATCAAAACATGACCTCTCTGGGGGGCGACGCAGTGGCACAGTGGGTA	112444

BX901978.14	151	GCACGTGGGTAGCCTCACAGCAAGAAGGTAGCTGGGTCTGTGTGGAGTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112445	GCACGTGGGTAGCCTCACAGCAAGAAGGTAGCTGGGTCTGTGTGGAGTTT	112494

BX901978.14	201	GCATGTTCTCCCTGCATTCGCGTGGGTTTCCTCATGGGTACTCCGGTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112495	GCATGTTCTCCCTGCATTCGCGTGGGTTTCCTCATGGGTACTCCGGTTTC	112544

BX901978.14	251	CCCCATAGTCCAAAGACATGCGGTGCAGGTGAATTAGGTAGGCTAAATTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112545	CCCCATAGTCCAAAGACATGCGGTGCAGGTGAATTAGGTAGGCTAAATTG	112594

BX901978.14	301	TCCGTAGTGTATGAGTGTGTGTGTGTATGTGTGGATGTTTCCCAGAGATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112595	TCCGTAGTGTATGAGTGTGTGTGTGTATGTGTGGATGTTTCCCAGAGATG	112644

BX901978.14	351	GGTTGCGGCTGGAAGGGCATCTGCTGTGTAAAAACTTGCTGGATAAGTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112645	GGTTGCGGCTGGAAGGGCATCTGCTGTGTAAAAACTTGCTGGATAAGTTG	112694

BX901978.14	401	GCGGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCAGATTAATAAAGGGACTAAGCCGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112695	GCGGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCAGATTAATAAAGGGACTAAGCCGA	112744

BX901978.14	451	CAACAAAATGAATGAATGAATGACCTGTCTGGACAGAAAGGACCAATCGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112745	CAACAAAATGAATGAATGAATGACCTGTCTGGACAGAAAGGACCAATCGC	112794

BX901978.14	501	TCGCTTTTTCTAAATGTCTAATCATCTTGTTTAATTCCGCCCCTTTTCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112795	TCGCTTTTTCTAAATGTCTAATCATCTTGTTTAATTCCGCCCCTTTTCAC	112844

BX901978.14	551	AGCGCCATGCTACAGAATTTCGCAAACTAAAACTCTAGTGTGACCGCAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112845	AGCGCCATGCTACAGAATTTCGCAAACTAAAACTCTAGTGTGACCGCAGC	112894

BX901978.14	601	TTTCCTATGTTAAAGTTCTATATCATTACATACAGCCTTTATTAACAGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112895	TTTCCTATGTTAAAGTTCTATATCATTACATACAGCCTTTATTAACAGAC	112944

BX901978.14	651	AATTAGTACTGATGACTGATCGGTTTAGATAGGCTTGTGTATACACACAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112945	AATTAGTACTGATGACTGATCGGTTTAGATAGGCTTGTGTATACACACAC	112994

BX901978.14	701	CTGTCTGCAATCTAGCTTTACACCAAAACCTGGCATGGAAACGCATGAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	112995	CTGTCTGCAATCTAGCTTTACACCAAAACCTGGCATGGAAACGCATGAGC	113044

BX901978.14	751	AATATAAACAGTCTCACTTTTGCTGTGGATTGATCAGCTCTAATTAGCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113045	AATATAAACAGTCTCACTTTTGCTGTGGATTGATCAGCTCTAATTAGCAG	113094

BX901978.14	801	GGCTGGAAAAATGTATTGCATAAACGAAACGCACACTCTGCATAATGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113095	GGCTGGAAAAATGTATTGCATAAACGAAACGCACACTCTGCATAATGAGA	113144

BX901978.14	851	CAATTGTCTGCGCCGGTGCAGGGAGGATTCCAGTCATACCGGAATACCGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113145	CAATTGTCTGCGCCGGTGCAGGGAGGATTCCAGTCATACCGGAATACCGA	113194

BX901978.14	901	GCGCTCTGTAATTGAGAACACCTTTCTAGCTGTAGACTAGCACTTGAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113195	GCGCTCTGTAATTGAGAACACCTTTCTAGCTGTAGACTAGCACTTGAGCT	113244

BX901978.14	951	GAGCCAAAGAGTCTGCCAGAGTCTCACATTTTCTCCACAGAGGAGTCTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113245	GAGCCAAAGAGTCTGCCAGAGTCTCACATTTTCTCCACAGAGGAGTCTTT	113294

BX901978.14	1001	GTTCTCTCGGCTGATGGCTTCTGTGACATTTTAGGCATCTCTTAAGTTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113295	GTTCTCTCGGCTGATGGCTTCTGTGACATTTTAGGCATCTCTTAAGTTGA	113344

BX901978.14	1051	CTATGTGACTTTGTTTACATGGACGACAGTAATCTAATTATTTACAATTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113345	CTATGTGACTTTGTTTACATGGACGACAGTAATCTAATTATTTACAATTA	113394

BX901978.14	1101	TCTAAATAAGCCAATGAGTACGTTTACACAAAGACCAATACTCCAATTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113395	TCTAAATAAGCCAATGAGTACGTTTACACAAAGACCAATACTCCAATTTA	113444

BX901978.14	1151	AATACAATTAAGACAATACTCTGATTAAATGTCTACTATGTAAACACTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113445	AATACAATTAAGACAATACTCTGATTAAATGTCTACTATGTAAACACTGA	113494

BX901978.14	1201	CTACGTTTACATGGACATCAGTAATCAAATTATTTGCCTTAATCTGAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113495	CTACGTTTACATGGACATCAGTAATCAAATTATTTGCCTTAATCTGAATA	113544

BX901978.14	1251	AGACAATAATATGATTAAGGTGTTTACATGAGTTGCTTTTTTAATGCTCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113545	AGACAATAATATGATTAAGGTGTTTACATGAGTTGCTTTTTTAATGCTCC	113594

BX901978.14	1301	TTTCAGGATCTCGTTTCACATGTTACAGCATATAATACACGTTTCCTCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113595	TTTCAGGATCTCGTTTCACATGTTACAGCATATAATACACGTTTCCTCTG	113644

BX901978.14	1351	GAGCATGCTATATGGGAAAAAAAAAAACTCCGCATTTCGTGATGCAGGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113645	GAGCATGCTATATGGGAAAAAAAAAAACTCCGCATTTCGTGATGCAGGTC	113694

BX901978.14	1401	TCTGTGGTCCTTTACTGACTCAGTAGGTACAGATAATAGTGTCAAACAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113695	TCTGTGGTCCTTTACTGACTCAGTAGGTACAGATAATAGTGTCAAACAGC	113744

BX901978.14	1451	CGTGTGTGTTTAGACTATCCTGTCGCAAAACGCTACACATTGATAATAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113745	CGTGTGTGTTTAGACTATCCTGTCGCAAAACGCTACACATTGATAATAGT	113794

BX901978.14	1501	TTGATAACGGTGTTTACATGTCTGTACTGCACTTCAGTAATGCCACTAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113795	TTGATAACGGTGTTTACATGTCTGTACTGCACTTCAGTAATGCCACTAAA	113844

BX901978.14	1551	ATTGAATTACTCCACATGTCTTGTGTATTTCTCCACATTTAATTCAATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113845	ATTGAATTACTCCACATGTCTTGTGTATTTCTCCACATTTAATTCAATTT	113894

BX901978.14	1601	ATGTTTAATTCGATTATGACCTTAATTGGATTGAATTAATCAAAAATTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113895	ATGTTTAATTCGATTATGACCTTAATTGGATTGAATTAATCAAAAATTGC	113944

BX901978.14	1651	TGTTAACATGCAATTTAACAGACTTTTAATCAGAGTATTGTCTTAATTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113945	TGTTAACATGCAATTTAACAGACTTTTAATCAGAGTATTGTCTTAATTGT	113994

BX901978.14	1701	ATTAAAATCGGATGAAACAATGATCCCTATTTGCCCATCTCATTTGCCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	113995	ATTAAAATCGGATGAAACAATGATCCCTATTTGCCCATCTCATTTGCCAT	114044

BX901978.14	1751	ATTTGTGAAATAGTATATATTATTGTTTATACAGTATTTAGCAACACTAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	114045	ATTTGTGAAATAGTATATATTATTGTTTATACAGTATTTAGCAACACTAT	114094

BX901978.14	1801	ATATAAAAAATATATTGATGATGATGTCCGAGAAGACGTTACAGTTTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	114095	ATATAAAAAATATATTGATGATGATGTCCGAGAAGACGTTACAGTTTTTT	114144

BX901978.14	1851	TTTCAGTTGTTTACACACATTTTTGAAAACCTGGCTCTTTTTTTCAAAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	114145	TTTCAGTTGTTTACACACATTTTTGAAAACCTGGCTCTTTTTTTCAAAAT	114194

BX901978.14	1901	GTAATCACAATTATTTAAAGACCACACTCAAATTGCAGAATTCCTAGATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	114195	GTAATCACAATTATTTAAAGACCACACTCAAATTGCAGAATTCCTAGATT	114244

BX901978.14	1951	GTTTACAAAACATACAAACTTATAGACATATTTGTGAAAATGCTAGTAGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX942820.8	114245	GTTTACAAAACATACAAACTTATAGACATATTTGTGAAAATGCTAGTAGT	114294

Overview

Query
BX901978.14 - 168101 bps
Hit
BX942820.8 - 114294 bps
Total alignments
25
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196120001200011122951142941
296.11051266790868033-192110481
398.41116126155586155711192110461
491.51409586155136155721-1497355491
586.6111423267908681391498052031
689.1411417945775459531640365771
782.75105261103100103360-114132143861
897.54107120155592155711133454335751
988.272313693706937437-154392547661
1092.81041376891769053154624547621
1191.451091524580245953-178822789731
1285.552345231433314855-190772912901
1388.8730455356786230190775913221
1484.952024776262063096190820912911
1586.2722446145254985-190867913251
1690.291231754577545949194934951081
1798.661041493479234940-11064831066321
1898.661041493479234940-11066351067841
1984.691954685761622811088391093081
2080.5118158812706512765211107871113761
2192.692182903707437363-11124811127671
2287.06156274121458121731-11124811127661
2382.16116279153740154018-11124811127661
2486.76144264687896905211124811127671
2587.4517428911300411329211124811127671
Short-link