<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR927215.14	179826	GAATTCTTCCACCTCGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGCTGG	179875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1	GAATTCTTCCACCTCGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGCTGG	50

CR927215.14	179876	AATCTGACATTTCTGTATGTATTTGCTGCTATTTTCGGTAAAGATGACGT	179925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	51	AATCTGACATTTCTGTATGTATTTGCTGCTATTTTCGGTAAAGATGACGT	100

CR927215.14	179926	TAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTAAAAGAGTGAGAGTAAAAG	179975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	101	TAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTAAAAGAGTGAGAGTAAAAG	150

CR927215.14	179976	TACTTCTACAGAAACACCATGATCTCTCGAATGCCAGAACATATGAGCGA	180025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	151	TACTTCTACAGAAACACCATGATCTCTCGAATGCCAGAACATATGAGCGA	200

CR927215.14	180026	CGAAGAAGGGATTTGAACCCACGCATGCAGAGCACAATGGATTAGCAGTC	180075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	201	CGAAGAAGGGATTTGAACCCACGCATGCAGAGCACAATGGATTAGCAGTC	250

CR927215.14	180076	CATCACCTTTACCACTCGGTCAACTCGTCACGTACGTTCCATCTTCTCTG	180125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	251	CATCACCTTTACCACTCGGTCAACTCGTCACGTACGTTCCATCTTCTCTG	300

CR927215.14	180126	GTAAAGGCCGGACTGTGGAACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTA	180175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	301	GTAAAGGCCGGACTGTGGAACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTA	350

CR927215.14	180176	TTTTCGGTCAGATGACTTTCAGTTTTGCCGTATGAACTACAGAGCAAATG	180225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	351	TTTTCGGTCAGATGACTTTCAGTTTTGCCGTATGAACTACAGAGCAAATG	400

CR927215.14	180226	AACGACAAAAATGGGATTCGATGGACTCGGCCACCCCGTCATGTATGTAC	180275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	401	AACGACAAAAATGGGATTCGATGGACTCGGCCACCCCGTCATGTATGTAC	450

CR927215.14	180276	TCACTTTCCTGTTGGGGGCTGGACTACGGCATTTCTGTATGTATTTGCTG	180325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	451	TCACTTTCCTGTTGGGGGCTGGACTACGGCATTTCTGTATGTATTTGCTG	500

CR927215.14	180326	CTATTTTCGGTAAAGATGACGTTAAATTTTGCAAAAACATCCTTCAAAAC	180375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	501	CTATTTTCGGTAAAGATGACGTTAAATTTTGCAAAAACATCCTTCAAAAC	550

CR927215.14	180376	GATAAGAGTGTGCGATTAAAACACCTTCCATGGAAGCACCGGCCTCTTTC	180425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	551	GATAAGAGTGTGCGATTAAAACACCTTCCATGGAAGCACCGGCCTCTTTC	600

CR927215.14	180426	AAACGCCAGAGCATTCGAACGACAAGGATGGGATTCGATAGACCCTTCCA	180475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	601	AAACGCCAGAGCATTCGAACGACAAGGATGGGATTCGATAGACCCTTCCA	650

CR927215.14	180476	CCTCGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGCTGGACTATGGCATA	180525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	651	CCTCGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGCTGGACTATGGCATA	700

CR927215.14	180526	TGTTTGTATTTGCAGCTATTTTCGATAAAGTTGACATAAAATTTTGCAAC	180575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	701	TGTTTGTATTTGCAGCTATTTTCGATAAAGTTGACATAAAATTTTGCAAC	750

CR927215.14	180576	AACATCCCTCAAAACGCTAATTGAGTGAGAGAACTTATACAGAAACACCA	180625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	751	AACATCCCTCAAAACGCTAATTGAGTGAGAGAACTTATACAGAAACACCA	800

CR927215.14	180626	TGATCTCTCAAATACCAGAACATATGAGCGACGAGGTTGGGATTCGAACC	180675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	801	TGATCTCTCAAATACCAGAACATATGAGCGACGAGGTTGGGATTCGAACC	850

CR927215.14	180676	CTCGCGTGCAGAGCACAATGGATTAGCAGTGCATCACCTTAACCACTCGG	180725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	851	CTCGCGTGCAGAGCACAATGGATTAGCAGTGCATCACCTTAACCACTCGG	900

CR927215.14	180726	CCACCTCGTCGCGTTCTCTCCTTCTTCTCGGGTGGAGGCCGGACTGTGGC	180775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	901	CCACCTCGTCGCGTTCTCTCCTTCTTCTCGGGTGGAGGCCGGACTGTGGC	950

CR927215.14	180776	ACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTATTTCGGGCAGATGACTTTC	180825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	951	ACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTATTTCGGGCAGATGACTTTC	1000

CR927215.14	180826	AGTTTTGCCGTATGAACGACAAAAATGGGATTCAATGGACTCGGCCACCC	180875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1001	AGTTTTGCCGTATGAACGACAAAAATGGGATTCAATGGACTCGGCCACCC	1050

CR927215.14	180876	CGTCATGTATGTACTCACTTTCCTGTTGGGGGCTGGACTACGGCATTTCT	180925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1051	CGTCATGTATGTACTCACTTTCCTGTTGGGGGCTGGACTACGGCATTTCT	1100

CR927215.14	180926	GTATATATTGGCTGCTGTTTTCGGTAAAGATGACGTTAAATTTTGCAACA	180975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1101	GTATATATTGGCTGCTGTTTTCGGTAAAGATGACGTTAAATTTTGCAACA	1150

CR927215.14	180976	ACATCCTTCAAAACGATAAGAGTGTGCGAGTAAAACACCTTCCACGGAAG	181025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1151	ACATCCTTCAAAACGATAAGAGTGTGCGAGTAAAACACCTTCCACGGAAG	1200

CR927215.14	181026	CACCGGCCTCATTTAAGCGCCAGAGCATTCGAACGACAAGGATGGGATTT	181075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1201	CACCGGCCTCATTTAAGCGCCAGAGCATTCGAACGACAAGGATGGGATTT	1250

CR927215.14	181076	GATAGACCATTCCACCTTGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGC	181125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1251	GATAGACCATTCCACCTTGTCATGTATGTACTCACTTTCATGATGGGGGC	1300

CR927215.14	181126	TGGACTATGGCATATGTTTGTATTTTCAGCTATTTTCGATAAAGTTGACA	181175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1301	TGGACTATGGCATATGTTTGTATTTTCAGCTATTTTCGATAAAGTTGACA	1350

CR927215.14	181176	TAAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTTAAAGAGTGAGAGTACTT	181225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1351	TAAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTTAAAGAGTGAGAGTACTT	1400

CR927215.14	181226	CTACAGAAATACCATGATCTCTCGAATGACAGAAAACATATGAGCGACGA	181275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1401	CTACAGAAATACCATGATCTCTCGAATGACAGAAAACATATGAGCGACGA	1450

CR927215.14	181276	GGATGGGATTCGAACCCACGCATGTAGAGCACAATGGATTAGCAGTCCAT	181325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1451	GGATGGGATTCGAACCCACGCATGTAGAGCACAATGGATTAGCAGTCCAT	1500

CR927215.14	181326	CACCTTAACCACTCGGCCACCTCGTCACGTACTTTTCATCTTCTCTGGTG	181375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1501	CACCTTAACCACTCGGCCACCTCGTCACGTACTTTTCATCTTCTCTGGTG	1550

CR927215.14	181376	GAGGCCGGACTGTGGCACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTATTT	181425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1551	GAGGCCGGACTGTGGCACATAATTGTAAATGTATGTTTCTGCAACTATTT	1600

CR927215.14	181426	TCGGTCAGATGACTTTCAGTTTTGCCGTATGAACGACAAAAATGGGATTC	181475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1601	TCGGTCAGATGACTTTCAGTTTTGCCGTATGAACGACAAAAATGGGATTC	1650

CR927215.14	181476	GATGGACTCGGCCACCCCGTCATGTATGTACTCACTTTCCTGTTGGGGGC	181525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1651	GATGGACTCGGCCACCCCGTCATGTATGTACTCACTTTCCTGTTGGGGGC	1700

CR927215.14	181526	TGGACTACGGCATTTCTGTATATATTGGCTGCTGTTTTCGGTAAAGATGA	181575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1701	TGGACTACGGCATTTCTGTATATATTGGCTGCTGTTTTCGGTAAAGATGA	1750

CR927215.14	181576	CGTTAAATTTTGCAATAACATCCGTCAAAACGATAAGAGCGTGCGAGTAA	181625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1751	CGTTAAATTTTGCAATAACATCCGTCAAAACGATAAGAGCGTGCGAGTAA	1800

CR927215.14	181626	AACACCTTCCACGGAAGCACCGGCCTCTTTCAAACGCCAAAGCATTCGAA	181675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1801	AACACCTTCCACGGAAGCACCGGCCTCTTTCAAACGCCAAAGCATTCGAA	1850

CR927215.14	181676	CGACAAGGATGGGATTCGATAGACCCTTCCACCTTGTCATGTATGTACTC	181725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1851	CGACAAGGATGGGATTCGATAGACCCTTCCACCTTGTCATGTATGTACTC	1900

CR927215.14	181726	ACTTTCATGATGGGGGCTGGACTATGGCATATGTTTGTATTTTCAGCTAT	181775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1901	ACTTTCATGATGGGGGCTGGACTATGGCATATGTTTGTATTTTCAGCTAT	1950

CR927215.14	181776	TTTCGATAAAGTTGACATAAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTT	181825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927374.34	1951	TTTCGATAAAGTTGACATAAAATTTTGCAACAACATCCTTCAAAACGCTT	2000

Overview

Query
CR927215.14 - 181825 bps
Hit
BX927374.34 - 163193 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link