<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  BX470134.5	91865	GAATTCTTCATCACATTTTGGTATCTACATGAATTTAAATCTACAAAAGT	91816
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34415	GAATTCTTCATCACATTTTGGTATCTACATGAATTTAAATCTACAAAAGT	34464

C  BX470134.5	91815	TTTTAATTATAATATATTATAATTATATAATATAATATTCTACAAACTTT	91766
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34465	TTTTAATTATAATATATTATAATTATATAATATAATATTCTACAAACTTT	34514

C  BX470134.5	91765	TATAATTATAGTATATTATAATTATATACTGTAATAATATATTATTATAT	91716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34515	TATAATTATAGTATATTATAATTATATACTGTAATAATATATTATTATAT	34564

C  BX470134.5	91715	TTTAATATATACATAAAAATGCAATTGTTAACTTTTAAGTTTCAAATAAC	91666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34565	TTTAATATATACATAAAAATGCAATTGTTAACTTTTAAGTTTCAAATAAC	34614

C  BX470134.5	91665	TTTCCTGAAAATTAAGCATCAAAATATGAATGAAATAGTGTTTGATCATC	91616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34615	TTTCCTGAAAATTAAGCATCAAAATATGAATGAAATAGTGTTTGATCATC	34664

C  BX470134.5	91615	ATTTAAATACAACTCAATTTATGTAAAAAATTAAATAACATAATTTTTCT	91566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34665	ATTTAAATACAACTCAATTTATGTAAAAAATTAAATAACATAATTTTTCT	34714

C  BX470134.5	91565	AACCTGTACACATTAAAGTGTATAAAACTATATTTCAAAATATTTGAAAT	91516
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34715	AACCTGTACACATTAAAGTGTATAAAACTATATTTCAAAATATTTGAAAT	34764

C  BX470134.5	91515	GTCTTCTTGACAAATAATGTAGTTACAGTAAAACCTAGTTGTCTATAGGA	91466
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34765	GTCTTCTTGACAAATAATGTAGTTACAGTAAAACCTAGTTGTCTATAGGA	34814

C  BX470134.5	91465	TAGAGACAAAAAAAATCTTAATATGAAAGATTTTAAATGACCTTTAATTT	91416
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34815	TAGAGACAAAAAAAATCTTAATATGAAAGATTTTAAATGACCTTTAATTT	34864

C  BX470134.5	91415	GGGTGTTTTCAGTAAGCCACTGTCAAAATGTACTAAAGCAAAAACTATAG	91366
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34865	GGGTGTTTTCAGTAAGCCACTGTCAAAATGTACTAAAGCAAAAACTATAG	34914

C  BX470134.5	91365	AATACACAAGACATGTCACTCATAGTTTTGAATAGGGAAAATTGTAACAG	91316
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34915	AATACACAAGACATGTCACTCATAGTTTTGAATAGGGAAAATTGTAACAG	34964

C  BX470134.5	91315	TCAATATGGTAAATGAATCCACGCCTAATAGTACAGTATTTTATTTATAT	91266
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	34965	TCAATATGGTAAATGAATCCACGCCTAATAGTACAGTATTTTATTTATAT	35014

C  BX470134.5	91265	TTTTTTAATACCCAAGGTCTGCTAGTTGCAATTTCCAAATTTTTATTGCC	91216
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35015	TTTTTTAATACCCAAGGTCTGCTAGTTGCAATTTCCAAATTTTTATTGCC	35064

C  BX470134.5	91215	AATCTTAAGACAATTGTAATTGTTTGTTTTGGTTCAACTTTTAATTTCCA	91166
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35065	AATCTTAAGACAATTGTAATTGTTTGTTTTGGTTCAACTTTTAATTTCCA	35114

C  BX470134.5	91165	CAACCATAGCAGAGCCGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGG	91116
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35115	CAACCATAGCAGAGCCGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGG	35164

C  BX470134.5	91115	ATCAGAGTTAGCACTCTAGCTTGGCCTCACCCTACTAGAACAGAAGCCAA	91066
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35165	ATCAGAGTTAGCACTCTAGCTTGGCCTCACCCTACTAGAACAGAAGCCAA	35214

C  BX470134.5	91065	TCATCAATCGCTATAGACTGACAGACAGGTTTTATCTATACACTAGACAG	91016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35215	TCATCAATCGCTATAGACTGACAGACAGGTTTTATCTATACACTAGACAG	35264

C  BX470134.5	91015	GTTTGTGATCAACAAACACACCAAAATCTCAGCGAATAGTTGATTCACAG	90966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35265	GTTTGTGATCAACAAACACACCAAAATCTCAGCGAATAGTTGATTCACAG	35314

C  BX470134.5	90965	ATGTAAGTAATAAATCTAAATAAAGCTTAAAATCTCTACTTTTACATTTT	90916
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35315	ATGTAAGTAATAAATCTAAATAAAGCTTAAAATCTCTACTTTTACATTTT	35364

C  BX470134.5	90915	TTACTTTCTCAAATTTTTTTGTTTTGTAATCTGTATGAATCAAACTCGAG	90866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35365	TTACTTTCTCAAATTTTTTTGTTTTGTAATCTGTATGAATCAAACTCGAG	35414

C  BX470134.5	90865	GTACAGTCCATCCTGTCATACATACATCACATGACAGCAACTACTCAAAC	90816
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35415	GTACAGTCCATCCTGTCATACATACATCACATGACAGCAACTACTCAAAC	35464

C  BX470134.5	90815	GCCCACAAACTTGTAAACAAAGAGTCGCTGTCAATTCTGGAGGAGATTCA	90766
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35465	GCCCACAAACTTGTAAACAAAGAGTCGCTGTCAATTCTGGAGGAGATTCA	35514

C  BX470134.5	90765	CCATTAAGAGCAAGTTGTGAATTACTTCAGAAGACCAGCACGATCAGACC	90716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35515	CCATTAAGAGCAAGTTGTGAATTACTTCAGAAGACCAGCACGATCAGACC	35564

C  BX470134.5	90715	ATCATTATTTAGAGGTGATAATGTGTAGAACAGCAGTAAATGAGGTTGGT	90666
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35565	ATCATTATTTAGAGGTGATAATGTGTAGAACAGCAGTAAATGAGGTTGGT	35614

C  BX470134.5	90665	GTTTTGGTCTCATTCCTTTCGAGTGCGCATTAGCTTGGGCACCGTAAAAA	90616
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35615	GTTTTGGTCTCATTCCTTTCGAGTGCGCATTAGCTTGGGCACCGTAAAAA	35664

C  BX470134.5	90615	TGATGATTTTGTTTGATTCAAATTTTAGAAATTAAACTTATGAGACCGAT	90566
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35665	TGATGATTTTGTTTGATTCAAATTTTAGAAATTAAACTTATGAGACCGAT	35714

C  BX470134.5	90565	GTTTAATTTTATTGGTAATTCCAAATATGTAATGTAATCATAAGCTTGGC	90516
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35715	GTTTAATTTTATTGGTAATTCCAAATATGTAATGTAATCATAAGCTTGGC	35764

C  BX470134.5	90515	AAACAGTTTTGGAGAATTTGATATTTCCCCATTCAGACAGAATGAGCACA	90466
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35765	AAACAGTTTTGGAGAATTTGATATTTCCCCATTCAGACAGAATGAGCACA	35814

C  BX470134.5	90465	CTGCCCGAGAGGCGTTTTAAAGATGGCCGCTGAGTGAAATTACTTGCCTT	90416
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35815	CTGCCCGAGAGGCGTTTTAAAGATGGCCGCTGAGTGAAATTACTTGCCTT	35864

C  BX470134.5	90415	AATGAGACTTTGATTAAAGTCATTTAATTCTGACATATTCATCAAATTAA	90366
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35865	AATGAGACTTTGATTAAAGTCATTTAATTCTGACATATTCATCAAATTAA	35914

C  BX470134.5	90365	ACAGAATGTGAAAAATGTTCTAATGAAACAATTATTCATCTGTTTTGAGC	90316
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35915	ACAGAATGTGAAAAATGTTCTAATGAAACAATTATTCATCTGTTTTGAGC	35964

C  BX470134.5	90315	ACTAATAATTTACTCAAAAATCTATTTTTGTTAGTATTTGTGTGTATAAG	90266
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	35965	ACTAATAATTTACTCAAAAATCTATTTTTGTTAGTATTTGTGTGTATAAG	36014

C  BX470134.5	90265	AGCATGGAGATAAATACACAAATATACAGTACAATCTACTAACAGATTCT	90216
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36015	AGCATGGAGATAAATACACAAATATACAGTACAATCTACTAACAGATTCT	36064

C  BX470134.5	90215	AAGATGATATACATGTAAACCAGTATGGCTGTTTTAAATAGTATCTAATT	90166
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36065	AAGATGATATACATGTAAACCAGTATGGCTGTTTTAAATAGTATCTAATT	36114

C  BX470134.5	90165	AAATCAAGATTCAAACATAAAGAACAGAATCACTGATTCTCCAGGTCTGT	90116
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36115	AAATCAAGATTCAAACATAAAGAACAGAATCACTGATTCTCCAGGTCTGT	36164

C  BX470134.5	90115	GAGTTGCACGCTGGATATCATTCTCTGCATCTGTCTGCTTTCATGAATTG	90066
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36165	GAGTTGCACGCTGGATATCATTCTCTGCATCTGTCTGCTTTCATGAATTG	36214

C  BX470134.5	90065	TCAGTCATTAATCCTGCTATCCATTGATATGACTGGATAAGGGTATTATC	90016
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36215	TCAGTCATTAATCCTGCTATCCATTGATATGACTGGATAAGGGTATTATC	36264

C  BX470134.5	90015	TTATTATTATTTTGTAAATATGAGTAGTGGAAGTTCTCAGAAATATGAAT	89966
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36265	TTATTATTATTTTGTAAATATGAGTAGTGGAAGTTCTCAGAAATATGAAT	36314

C  BX470134.5	89965	GGGTTGCAATTTCACCCTTGACAAGACTATACCAAGAAGTAAGAATCAAA	89916
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36315	GGGTTGCAATTTCACCCTTGACAAGACTATACCAAGAAGTAAGAATCAAA	36364

C  BX470134.5	89915	CAGAAGCAAAACACTGCCTGTATCCAGAGTATATCTGCAATTAAAAATTA	89866
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX927354.14	36365	CAGAAGCAAAACACTGCCTGTATCCAGAGTATATCTGCAATTAAAAATTA	36414

Overview

Query
BX470134.5 - 91865 bps
Hit
BX927354.14 - 36414 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100188920008986691865-134415364141
298.86438882147822341240624931
310042878125681342-1240624921
4100428681244813291240724921
510040838214882230-1241024921
690.436711370220703321248826021
783.155918129023292031249126741
898.48386638941390061663867031
910030612870628766-1663866981
1083.59901926541365604111049112371
1110030627648476545115024150851
1296.8335637648676548115086151481
1395.644918124081330116132162221
1496.4742858214882232-116135162191
1596.5139868124381328-116137162221
1696.3937838214882230116138162201
1791.2557813690136981-122151222301
1810031638214682208132435324971
1910030618124481304132437324971
2010031638124181303-132437324991
2110030618214982209-132437324971
Short-link