<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR925833.3	1	CTAGAGGATGTGGGATGGAGGCGTCATGGCAAGGCAAGGCCTGCCCCCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98410	CTAGAGGATGTGGGATGGAGGCGTCATGGCAAGGCAAGGCCTGCCCCCTG	98459

CR925833.3	51	GTGGTCAGAGAGCATGGGAGGCCCGAGCTACCAATGGTGGCTTTTCTCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98460	GTGGTCAGAGAGCATGGGAGGCCCGAGCTACCAATGGTGGCTTTTCTCAA	98509

CR925833.3	101	CTGGGCCTTGATTCCAGCTTCTGCCCGATCCCCTACCTTGCTTGCCTCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98510	CTGGGCCTTGATTCCAGCTTCTGCCCGATCCCCTACCTTGCTTGCCTCCT	98559

CR925833.3	151	TCTATCAACACCCCATTCACACCCCAAAGGATCAATATAGGAAAAATTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98560	TCTATCAACACCCCATTCACACCCCAAAGGATCAATATAGGAAAAATTGT	98609

CR925833.3	201	CTCTACTATCTCAGCTGTAAGAAGCCCACGGTTTGGGGAGGGAGAAGAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98610	CTCTACTATCTCAGCTGTAAGAAGCCCACGGTTTGGGGAGGGAGAAGAGG	98659

CR925833.3	251	TCACCACCAGTGGGGACGTGGAATAAGTAACTGGCTGGGGATAAAACTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98660	TCACCACCAGTGGGGACGTGGAATAAGTAACTGGCTGGGGATAAAACTCC	98709

CR925833.3	301	ACTCTTCCGGCCGGGAGCAGTGGCCCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98710	ACTCTTCCGGCCGGGAGCAGTGGCCCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG	98759

CR925833.3	351	GTGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGTCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98760	GTGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGTCTG	98809

CR925833.3	401	GCCAACATGGTGAATCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAACTTAGCCAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98810	GCCAACATGGTGAATCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAACTTAGCCAGA	98859

CR925833.3	451	CGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGTGGCTGAGGCACGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98860	CGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGTGGCTGAGGCACGA	98909

CR925833.3	501	GAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAACATTGTGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98910	GAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAACATTGTGCC	98959

CR925833.3	551	ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	98960	ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAA	99009

CR925833.3	601	AAAACAAACTCCACTCTTCCACAGTGTACACTCAATCACATGGTTCTACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99010	AAAACAAACTCCACTCTTCCACAGTGTACACTCAATCACATGGTTCTACT	99059

CR925833.3	651	CCACGTCCCAAGGCAATGTGGCTTAGAAGACAAATCAGCCTAGGTTGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99060	CCACGTCCCAAGGCAATGTGGCTTAGAAGACAAATCAGCCTAGGTTGGAG	99109

CR925833.3	701	TCCTGGTGCCACTACTGTAAACTGGGGGTACCACCTGTAAACTTCCAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99110	TCCTGGTGCCACTACTGTAAACTGGGGGTACCACCTGTAAACTTCCAGAC	99159

CR925833.3	751	CCCATTGCCCTAGGTGTTCAATGTGTGGTTCTTCTCCAGTGCTTCCCCCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99160	CCCATTGCCCTAGGTGTTCAATGTGTGGTTCTTCTCCAGTGCTTCCCCCG	99209

CR925833.3	801	TCCTGTGCAAGGGTGGCAGTGCCATTGCTACACCTGGACTCAAGGGCATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99210	TCCTGTGCAAGGGTGGCAGTGCCATTGCTACACCTGGACTCAAGGGCATC	99259

CR925833.3	851	CTGCTCTCCCAGCTCTTTTCTATATCTAAGACTTCTAAACATTTGTCATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99260	CTGCTCTCCCAGCTCTTTTCTATATCTAAGACTTCTAAACATTTGTCATA	99309

CR925833.3	901	GCTAAAAATGTTCCAGATTCCAAAGACAGTATGTGGGGTTTTTTTTTCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99310	GCTAAAAATGTTCCAGATTCCAAAGACAGTATGTGGGGTTTTTTTTTCAG	99359

CR925833.3	951	TCCATCTAGAATAAATCCTGATATGTGTGTACATTCAAGGGACCCCTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99360	TCCATCTAGAATAAATCCTGATATGTGTGTACATTCAAGGGACCCCTTTT	99409

CR925833.3	1001	AATAACTCTGAGAACCTCTAGGGAAGGCTAACCTGCAAGACAGGAACTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99410	AATAACTCTGAGAACCTCTAGGGAAGGCTAACCTGCAAGACAGGAACTGC	99459

CR925833.3	1051	TGCGCTAATCAGCACAGTGGGCACAAGAATGGAACTTTTTTTTTCTTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99460	TGCGCTAATCAGCACAGTGGGCACAAGAATGGAACTTTTTTTTTCTTTTT	99509

CR925833.3	1101	TTTTTCTTGAGACAGAGTCTTGTTCTGTTACCCAGGCTAGAGTGCAGTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99510	TTTTTCTTGAGACAGAGTCTTGTTCTGTTACCCAGGCTAGAGTGCAGTGG	99559

CR925833.3	1151	TGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGAGATTCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99560	TGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGAGATTCTC	99609

CR925833.3	1201	CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAGGATTACAGGCACCCACTACCATGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99610	CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCAGGATTACAGGCACCCACTACCATGCC	99659

CR925833.3	1251	CAGCTAATTTTCATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATCTTGGCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99660	CAGCTAATTTTCATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATCTTGGCCA	99709

CR925833.3	1301	GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCACGTCGGCCTCCCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99710	GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCACGTCGGCCTCCCAA	99759

CR925833.3	1351	AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCATCCATCCTGGCCAAGGATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99760	AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCATCCATCCTGGCCAAGGATG	99809

CR925833.3	1401	GAACTTTTCTAAAGAAATTATTCCCAGGCACTCAAGAGGAAAGGCAACAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99810	GAACTTTTCTAAAGAAATTATTCCCAGGCACTCAAGAGGAAAGGCAACAA	99859

CR925833.3	1451	ATAAAACAGTGTTGAAGTGGATGTGCACTGGTCTCTGTTTTTGTGTGTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99860	ATAAAACAGTGTTGAAGTGGATGTGCACTGGTCTCTGTTTTTGTGTGTGT	99909

CR925833.3	1501	TTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99910	TTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC	99959

CR925833.3	1551	TGGAGTGCAGTGGTGTGATTTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	99960	TGGAGTGCAGTGGTGTGATTTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGT	100009

CR925833.3	1601	TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGCGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100010	TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGCGCC	100059

CR925833.3	1651	TGTCACCATGCCTGGCTAACTTTTTTGTATTTTTACTAGAGACAGGGTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100060	TGTCACCATGCCTGGCTAACTTTTTTGTATTTTTACTAGAGACAGGGTTT	100109

CR925833.3	1701	CACCATGTTGGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100110	CACCATGTTGGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACC	100159

CR925833.3	1751	TGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCGCCGCACCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100160	TGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCGCCGCACCC	100209

CR925833.3	1801	AGTCTCTGGTCTGACTTCTTTAACAACAAGCTGTGGGCTGGCTGGATGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100210	AGTCTCTGGTCTGACTTCTTTAACAACAAGCTGTGGGCTGGCTGGATGTA	100259

CR925833.3	1851	GTTGAGGCCAATAAACTCCCAACTCAGACCATGAAAACAGGTGAAAACAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100260	GTTGAGGCCAATAAACTCCCAACTCAGACCATGAAAACAGGTGAAAACAC	100309

CR925833.3	1901	AAAAGTCCACAATCCAGCACAGGTGATCTCATCTTTCCCCCACCCCCACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100310	AAAAGTCCACAATCCAGCACAGGTGATCTCATCTTTCCCCCACCCCCACC	100359

CR925833.3	1951	AGGGTTCCTCTACGTGCTGGCAGGGGTGAGATTGGGTGACTTCTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927320.5	100360	AGGGTTCCTCTACGTGCTGGCAGGGGTGAGATTGGGTGACTTCTCTGGCC	100409

Overview

Query
CR925833.3 - 11734 bps
Hit
BX927320.5 - 100409 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link