<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927182.6	1	GGCCAATGCCCCAGTGACCTACAAGGAAACCTTTACTGCCCACAGGGAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90631	GGCCAATGCCCCAGTGACCTACAAGGAAACCTTTACTGCCCACAGGGAAC	90680

BX927182.6	51	CAGAACTGACAATTCCTCTACGGCAGATGCTGCAGGTGAGAGCAGGAGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90681	CAGAACTGACAATTCCTCTACGGCAGATGCTGCAGGTGAGAGCAGGAGCA	90730

BX927182.6	101	ACCAGACCTGCACTGCCCCTGCTGTGGGTGCCCCAAAAAACATGGTCCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90731	ACCAGACCTGCACTGCCCCTGCTGTGGGTGCCCCAAAAAACATGGTCCTG	90780

BX927182.6	151	GGGACTGTGTTCCTGGGGGCTAGACAAGGTAACACTTGGACATATGATGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90781	GGGACTGTGTTCCTGGGGGCTAGACAAGGTAACACTTGGACATATGATGA	90830

BX927182.6	201	AAACAGGGACCACAGCTGCCCTGACAAGGAGCTGGTTCCTGCTTCCCAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90831	AAACAGGGACCACAGCTGCCCTGACAAGGAGCTGGTTCCTGCTTCCCAAA	90880

BX927182.6	251	TGGCCCAGGGATGTCTGCTTATATACTCCTCCATAACATCTGCACAGAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90881	TGGCCCAGGGATGTCTGCTTATATACTCCTCCATAACATCTGCACAGAAA	90930

BX927182.6	301	CTCAGGGAGGCAGGGCCATGTGGTGGGAACCTCCAGTGATGCAGAGGACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90931	CTCAGGGAGGCAGGGCCATGTGGTGGGAACCTCCAGTGATGCAGAGGACA	90980

BX927182.6	351	TGATACCCCCAAGATAGCTCCTGGAGGAGGCCCATGGGGAGCTGCAAAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	90981	TGATACCCCCAAGATAGCTCCTGGAGGAGGCCCATGGGGAGCTGCAAAGT	91030

BX927182.6	401	GGACAGAGATGGCTGTGTGCACTCAGGACCCCCCCTGTTACAAGGGGACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91031	GGACAGAGATGGCTGTGTGCACTCAGGACCCCCCCTGTTACAAGGGGACC	91080

BX927182.6	451	TCAAAGGGGCTGCACAGGCAGGCCTCCCAGTCTGGGCTTCGTGGGTCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91081	TCAAAGGGGCTGCACAGGCAGGCCTCCCAGTCTGGGCTTCGTGGGTCTTT	91130

BX927182.6	501	TTCTTGGTGTCCTCCTGATGGCTGGAGAAACAGGAGAGAGGGATGCAGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91131	TTCTTGGTGTCCTCCTGATGGCTGGAGAAACAGGAGAGAGGGATGCAGAG	91180

BX927182.6	551	AGGAAGAGACTAGGGGCACCGCCTCTCCTCGGATTCCTCTCCAGTTTCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91181	AGGAAGAGACTAGGGGCACCGCCTCTCCTCGGATTCCTCTCCAGTTTCTA	91230

BX927182.6	601	GCTCCTCCCCAGATCACAGCCGCCTTTACTATTTACTCCCACTGAAGCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91231	GCTCCTCCCCAGATCACAGCCGCCTTTACTATTTACTCCCACTGAAGCCA	91280

BX927182.6	651	TGATCATCCAGGCCCTCAGCAATCAGCACGTGATTCTCAACTCACCCCAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91281	TGATCATCCAGGCCCTCAGCAATCAGCACGTGATTCTCAACTCACCCCAC	91330

BX927182.6	701	CTGGACGCACCGTGGTGAGCCCAAGAAACAAGAGAGACCAGGATGGGGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91331	CTGGACGCACCGTGGTGAGCCCAAGAAACAAGAGAGACCAGGATGGGGAC	91380

BX927182.6	751	AGAGCAGGTGCCACAGCCCTCCCTGCTGCCCACTCCTCACCTGCAGCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91381	AGAGCAGGTGCCACAGCCCTCCCTGCTGCCCACTCCTCACCTGCAGCAGG	91430

BX927182.6	801	AGGAGGCCACCGCTGGACATTTGAGGGCCGTGGCCCAGCCCTGGCTTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91431	AGGAGGCCACCGCTGGACATTTGAGGGCCGTGGCCCAGCCCTGGCTTGGG	91480

BX927182.6	851	CAGGACTTAGGGGTGTAGATGGAGATGTGGCTCCCATTCCCCTCCCAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91481	CAGGACTTAGGGGTGTAGATGGAGATGTGGCTCCCATTCCCCTCCCAAAT	91530

BX927182.6	901	ACCCCAATGTCCATCCCCTGTTCCAGGACCTTGTTACCTACATGTCTATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91531	ACCCCAATGTCCATCCCCTGTTCCAGGACCTTGTTACCTACATGTCTATC	91580

BX927182.6	951	TGTGCAGGAGCTATGAGGGGACCCTGCTGCCCAGAGAAGAGTCCTTCCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91581	TGTGCAGGAGCTATGAGGGGACCCTGCTGCCCAGAGAAGAGTCCTTCCAT	91630

BX927182.6	1001	CTCCAGCCACTGCCCCGTTTTCTCACCTGGACTCTGCAGCTGATGTTGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91631	CTCCAGCCACTGCCCCGTTTTCTCACCTGGACTCTGCAGCTGATGTTGTC	91680

BX927182.6	1051	TTCTTCTTGCACCAAAGGACACAGAGAATACTACTACTACTACTGCTAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91681	TTCTTCTTGCACCAAAGGACACAGAGAATACTACTACTACTACTGCTAAT	91730

BX927182.6	1101	AATAATAATGACAGTAGCAATAGCAGCATACAGAATGGCTGCCATTGACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91731	AATAATAATGACAGTAGCAATAGCAGCATACAGAATGGCTGCCATTGACT	91780

BX927182.6	1151	CTGAAGCACCAGGGCCTTCTCTAAAAAAAGGGCCTTGTGACACACTGAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91781	CTGAAGCACCAGGGCCTTCTCTAAAAAAAGGGCCTTGTGACACACTGAGC	91830

BX927182.6	1201	ACGCAAAGCCACAGCCGTCCCTGCTATCCCCACCCTGGCCTGACCTCCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91831	ACGCAAAGCCACAGCCGTCCCTGCTATCCCCACCCTGGCCTGACCTCCCT	91880

BX927182.6	1251	AGGTCGAAACCCTTGAGAGTTGCCCCTGGCTCACCAGAGGGCACAGGGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91881	AGGTCGAAACCCTTGAGAGTTGCCCCTGGCTCACCAGAGGGCACAGGGTG	91930

BX927182.6	1301	AGTGCTGTGATTCCCTCTGTGTCCCATGTAGCAGGTGAACCTCTGCTCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91931	AGTGCTGTGATTCCCTCTGTGTCCCATGTAGCAGGTGAACCTCTGCTCCT	91980

BX927182.6	1351	CTCCTCGGGGAATCCTGGTGGCCATGCAGGTCTGGTAGGTCCCATTCCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	91981	CTCCTCGGGGAATCCTGGTGGCCATGCAGGTCTGGTAGGTCCCATTCCCA	92030

BX927182.6	1401	TTGGGCAGGACACCCCTAGACTGCTGGGCATCCTGGCTCAAAGATGCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92031	TTGGGCAGGACACCCCTAGACTGCTGGGCATCCTGGCTCAAAGATGCCTC	92080

BX927182.6	1451	ATCCTGATGCCAGGTCAGAGAGATATTCCAGGGATAGAAGATGGAGGCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92081	ATCCTGATGCCAGGTCAGAGAGATATTCCAGGGATAGAAGATGGAGGCCA	92130

BX927182.6	1501	GCACATCATGGTGACATTGCCTTCTAAGGCCCCACTGTGCATCTCATTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92131	GCACATCATGGTGACATTGCCTTCTAAGGCCCCACTGTGCATCTCATTCA	92180

BX927182.6	1551	CTGTGGGGGTCATTGGAGACAAAAGGGCAGAGCCAGTGAGGCATGTGGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92181	CTGTGGGGGTCATTGGAGACAAAAGGGCAGAGCCAGTGAGGCATGTGGCC	92230

BX927182.6	1601	AAGCCTTTCTCCCCTCTAAGGGAGATGCAGGGAACAGGACTGGTCCTCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92231	AAGCCTTTCTCCCCTCTAAGGGAGATGCAGGGAACAGGACTGGTCCTCTC	92280

BX927182.6	1651	TATTGTTCTGACTCTCGCTGAAACCCACACTGACCCCAGACCTTCTGCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92281	TATTGTTCTGACTCTCGCTGAAACCCACACTGACCCCAGACCTTCTGCAA	92330

BX927182.6	1701	ATCGGTCCTTACCTGGGGTCCAATTCCCCTAGGCTTGCTGGAAGATGGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92331	ATCGGTCCTTACCTGGGGTCCAATTCCCCTAGGCTTGCTGGAAGATGGGC	92380

BX927182.6	1751	CTCAGGACTGTGGCCTCACACTCTGGGACTCCGGCTTTGATGCTGAGGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92381	CTCAGGACTGTGGCCTCACACTCTGGGACTCCGGCTTTGATGCTGAGGAG	92430

BX927182.6	1801	AGGGTTGTCAGGGGTGGGCTCCTGGGTCGTGGGGCTAGGAGGTAGCTCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92431	AGGGTTGTCAGGGGTGGGCTCCTGGGTCGTGGGGCTAGGAGGTAGCTCTC	92480

BX927182.6	1851	CAGGATGGGCAGGCTGGGAGGCAGATGAGGCAGCCCTGGCCTTGAGGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92481	CAGGATGGGCAGGCTGGGAGGCAGATGAGGCAGCCCTGGCCTTGAGGCCT	92530

BX927182.6	1901	TCCTTTCCTGCCTAATGCCCACCCCAGGTTCAGGCTTCTATAGGAGGACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92531	TCCTTTCCTGCCTAATGCCCACCCCAGGTTCAGGCTTCTATAGGAGGACC	92580

BX927182.6	1951	CACTACTTTCACAGTACCTGTTTTTCTGATACCTCCAGAATTTCAGATAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927250.5	92581	CACTACTTTCACAGTACCTGTTTTTCTGATACCTCCAGAATTTCAGATAA	92630

Overview

Query
BX927182.6 - 51649 bps
Hit
BX927250.5 - 92630 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link