<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927133.5	1	GGCCAAAGAAATCGCAGGCCAACTGAGCTTCTGTAACCTTCAATGGAAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97723	GGCCAAAGAAATCGCAGGCCAACTGAGCTTCTGTAACCTTCAATGGAAAG	97772

BX927133.5	51	AGTGTCAAAAATTGTGTGGACATCCTTAATCTACCACAGTCCCATATCTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97773	AGTGTCAAAAATTGTGTGGACATCCTTAATCTACCACAGTCCCATATCTA	97822

BX927133.5	101	ACCACTAATAATTCATGTTGTTCCCATATGCAAGGTACACTTACTCCTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97823	ACCACTAATAATTCATGTTGTTCCCATATGCAAGGTACACTTACTCCTCT	97872

BX927133.5	151	TCCTAATAATCTTAAAATCTCATCCCTTTATAGCATCAGCTCAAAGTCTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97873	TCCTAATAATCTTAAAATCTCATCCCTTTATAGCATCAGCTCAAAGTCTA	97922

BX927133.5	201	GGTTTTTAAAATCCAAATCATGACAAAGTGCAAATGGGGCATATTTAGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97923	GGTTTTTAAAATCCAAATCATGACAAAGTGCAAATGGGGCATATTTAGTA	97972

BX927133.5	251	TGATTCCTCAAGAATGGTTCCTTTTGACCTGAAGACCTTTGAACTTGAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	97973	TGATTCCTCAAGAATGGTTCCTTTTGACCTGAAGACCTTTGAACTTGAAG	98022

BX927133.5	301	AAGTCAGGTTATCTTCCTGTCACACACTCAGCACATAATGATAAAGTAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98023	AAGTCAGGTTATCTTCCTGTCACACACTCAGCACATAATGATAAAGTAGA	98072

BX927133.5	351	TATAAGATGACAGTAATAGAAAATGTTACTCCAAAAGAGAAAAAATGGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98073	TATAAGATGACAGTAATAGAAAATGTTACTCCAAAAGAGAAAAAATGGGA	98122

BX927133.5	401	GGCACATAACAGTTACATAGCAATTGTGAAACCCATTTGGGGACATTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98123	GGCACATAACAGTTACATAGCAATTGTGAAACCCATTTGGGGACATTTTT	98172

BX927133.5	451	CTCACTCCGTCCTCTAGAGTCTAAGATGATGCAATTGAAACTGATGATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98173	CTCACTCCGTCCTCTAGAGTCTAAGATGATGCAATTGAAACTGATGATAC	98222

BX927133.5	501	CAATAAAATTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98223	CAATAAAATTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	98272

BX927133.5	551	TTTTTTACACGGATCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGTACAGTGGGACG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98273	TTTTTTACACGGATCTCACTCTGTCACCCAGACTGGAGTACAGTGGGACG	98322

BX927133.5	601	GTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98323	GTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT	98372

BX927133.5	651	CTCAACTGAGCCTCCTAAGTAGTTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98373	CTCAACTGAGCCTCCTAAGTAGTTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGC	98422

BX927133.5	701	CCGGCTAAATTTTGTACTTTTAATAGAGACAGGGTTTCCACCGTGTTGCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98423	CCGGCTAAATTTTGTACTTTTAATAGAGACAGGGTTTCCACCGTGTTGCG	98472

BX927133.5	751	CAGGCTGGCCTCAAACCCCTGATTTCATGTGATCCACCCACATGAGCCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98473	CAGGCTGGCCTCAAACCCCTGATTTCATGTGATCCACCCACATGAGCCTC	98522

BX927133.5	801	CCAAAGTGCTGGGATTACAGATCTGAGTCACTGTGCCTGGCCCACCAATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98523	CCAAAGTGCTGGGATTACAGATCTGAGTCACTGTGCCTGGCCCACCAATA	98572

BX927133.5	851	ATATTCCTTTTAAAATATTTTAGGTTCTTAGGATTCTTATTTGGGTTTAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98573	ATATTCCTTTTAAAATATTTTAGGTTCTTAGGATTCTTATTTGGGTTTAG	98622

BX927133.5	901	TCAATTAGATAAGTACCACACTCATACATCTCCTTAGGACAGGCCTTTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98623	TCAATTAGATAAGTACCACACTCATACATCTCCTTAGGACAGGCCTTTCT	98672

BX927133.5	951	CTGACTTGGGCTGACAATTAGTGTACTGTGAGACAACACCCTTGAGATTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98673	CTGACTTGGGCTGACAATTAGTGTACTGTGAGACAACACCCTTGAGATTT	98722

BX927133.5	1001	CTCTCTGTCTGTCTTCATGCCAGTAGAATACTGTTTTATTTACTGTACCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98723	CTCTCTGTCTGTCTTCATGCCAGTAGAATACTGTTTTATTTACTGTACCT	98772

BX927133.5	1051	TTGCAACATCTTGGGAAGTCAAGAAGAGTGATACCATCTGCTTTGCTATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98773	TTGCAACATCTTGGGAAGTCAAGAAGAGTGATACCATCTGCTTTGCTATT	98822

BX927133.5	1101	CTTTCTGAAGATCACTTGGGCTATTTGAGGTCTTTCTTGAATAGTTTTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98823	CTTTCTGAAGATCACTTGGGCTATTTGAGGTCTTTCTTGAATAGTTTTTT	98872

BX927133.5	1151	CCATTTCTGTAAAAAATGCTTTTGGGATTTTGATAGTGATTGCATTGAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98873	CCATTTCTGTAAAAAATGCTTTTGGGATTTTGATAGTGATTGCATTGAAT	98922

BX927133.5	1201	TCATAGACAAGTTATGGTAGTGTGGACATTTTACAATTTTAATTCTTCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98923	TCATAGACAAGTTATGGTAGTGTGGACATTTTACAATTTTAATTCTTCTA	98972

BX927133.5	1251	AGCCCTGAACATAGGTTATGTTTCTATTTATTTGAGTCTTCTTCAATTCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	98973	AGCCCTGAACATAGGTTATGTTTCTATTTATTTGAGTCTTCTTCAATTCC	99022

BX927133.5	1301	TTTCATCAATGTTTTTACAGTTGCCAGTGTACAAGTCATTCACTTCCTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99023	TTTCATCAATGTTTTTACAGTTGCCAGTGTACAAGTCATTCACTTCCTTG	99072

BX927133.5	1351	GTTAAGTTTATTGCTAAGCATTTTATTCTTTTTTATGCTATTTTAAATGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99073	GTTAAGTTTATTGCTAAGCATTTTATTCTTTTTTATGCTATTTTAAATGA	99122

BX927133.5	1401	AATTGTTTTGGTTCTTCCTTTTCTGATAGCTCAGAAAAGCTAGATTGTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99123	AATTGTTTTGGTTCTTCCTTTTCTGATAGCTCAGAAAAGCTAGATTGTTA	99172

BX927133.5	1451	ATGTATAGGAATGCAATTGATTTTGTATGTTAATTTTATATTCAATTTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99173	ATGTATAGGAATGCAATTGATTTTGTATGTTAATTTTATATTCAATTTGA	99222

BX927133.5	1501	ATGCCTTCCATTTAATTAAAATAGTATAGTACTGAGATAAAGACAGACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99223	ATGCCTTCCATTTAATTAAAATAGTATAGTACTGAGATAAAGACAGACAT	99272

BX927133.5	1551	ACAAGCCAATAGAACAGAATGGAGAGTCCAGAAATAAATGCACATATATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99273	ACAAGCCAATAGAACAGAATGGAGAGTCCAGAAATAAATGCACATATATA	99322

BX927133.5	1601	TAGTAAACTGATCTTGGACAAGATTGCTGAGAACACACAATGGAGAAAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99323	TAGTAAACTGATCTTGGACAAGATTGCTGAGAACACACAATGGAGAAAGA	99372

BX927133.5	1651	ATAGTCCCTTCAATAGATGGTGTAGAATAAACTACATAGAGAAGAATGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99373	ATAGTCCCTTCAATAGATGGTGTAGAATAAACTACATAGAGAAGAATGAA	99422

BX927133.5	1701	ATTGGACCCTATCTCATACTATATACAAAATCAACTCAAAATGGATTAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99423	ATTGGACCCTATCTCATACTATATACAAAATCAACTCAAAATGGATTAAA	99472

BX927133.5	1751	GATTTAAATGTAAAACTCCTAGAAGAAAAAGAATAAGGAGATAACTTCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99473	GATTTAAATGTAAAACTCCTAGAAGAAAAAGAATAAGGAGATAACTTCTT	99522

BX927133.5	1801	GATGTTGGTCTTGACAATGATTTTCTAGATTTGAAACAACAAAATAAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99523	GATGTTGGTCTTGACAATGATTTTCTAGATTTGAAACAACAAAATAAAAA	99572

BX927133.5	1851	ATAGACAAGCAGGACTATGTAAAGCTAAAAAGCTTCTTCACAACAAAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99573	ATAGACAAGCAGGACTATGTAAAGCTAAAAAGCTTCTTCACAACAAAGGA	99622

BX927133.5	1901	AATGATCAACAGAGTGAAAAGTCATCCTATGAAGCGGGAGAAAATATTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99623	AATGATCAACAGAGTGAAAAGTCATCCTATGAAGCGGGAGAAAATATTTC	99672

BX927133.5	1951	AAACCATCTATCTGATAGGGGTTAATATCTAAAATACATAATAATCTTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927232.4	99673	AAACCATCTATCTGATAGGGGTTAATATCTAAAATACATAATAATCTTCT	99722

Overview

Query
BX927133.5 - 107459 bps
Hit
BX927232.4 - 99722 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link