<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR388210.7	1	CATATTTTAATCAGCCTCCTTTGCCCTCACCCAGGAAGTCAGAGGCACCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81650	CATATTTTAATCAGCCTCCTTTGCCCTCACCCAGGAAGTCAGAGGCACCA	81699

CR388210.7	51	GTGTGAGTATCCATCTGCTGTCCAGTACATTCATGGATTCCTCACTCTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81700	GTGTGAGTATCCATCTGCTGTCCAGTACATTCATGGATTCCTCACTCTCA	81749

CR388210.7	101	CTAGACAATGTTTGACCAGGAAGAACAGGGAATGAGAAGGAGCTGCTGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81750	CTAGACAATGTTTGACCAGGAAGAACAGGGAATGAGAAGGAGCTGCTGGA	81799

CR388210.7	151	TGGTGATGAGCCTTGGAAAGGGAGGCTGGGCGAGCAGAGACAGAAGAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81800	TGGTGATGAGCCTTGGAAAGGGAGGCTGGGCGAGCAGAGACAGAAGAGAA	81849

CR388210.7	201	ACACCTACCTGCTGTGACCTCACAAACACCCAGGCTGAGTTTTGATAAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81850	ACACCTACCTGCTGTGACCTCACAAACACCCAGGCTGAGTTTTGATAAGA	81899

CR388210.7	251	CAGGTTGAATCACACTGGGGTGACAGCCTCATCCCTCCAGGTACAAACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81900	CAGGTTGAATCACACTGGGGTGACAGCCTCATCCCTCCAGGTACAAACAA	81949

CR388210.7	301	GAACAGGCCATGGTTAACCAAAGCTCCACACCGGGCTTCCTCCTTCTGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	81950	GAACAGGCCATGGTTAACCAAAGCTCCACACCGGGCTTCCTCCTTCTGGG	81999

CR388210.7	351	CTTCTCTGAACACCCAGGGCTGGAAAGGACTCTCTTCGTGGTTGTCTTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82000	CTTCTCTGAACACCCAGGGCTGGAAAGGACTCTCTTCGTGGTTGTCTTCA	82049

CR388210.7	401	CTTCCTACCTCCTAACCCTAGTGGGCAACACACTCATCATCCTGCTGTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82050	CTTCCTACCTCCTAACCCTAGTGGGCAACACACTCATCATCCTGCTGTCT	82099

CR388210.7	451	GTGCTGGACCCCAAGCTCCACTCTCCAATGTACTTTTTCCTCTCCAACCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82100	GTGCTGGACCCCAAGCTCCACTCTCCAATGTACTTTTTCCTCTCCAACCT	82149

CR388210.7	501	CTCCTTCTTGGACCTCTGTTTCACCACGAGTTGTGTTCCCCAAATGCTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82150	CTCCTTCTTGGACCTCTGTTTCACCACGAGTTGTGTTCCCCAAATGCTGG	82199

CR388210.7	551	TCAACCTCTGGGGCCCAAAGAAGACCATCAGCTTCCTGGACTGCTCTGTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82200	TCAACCTCTGGGGCCCAAAGAAGACCATCAGCTTCCTGGACTGCTCTGTC	82249

CR388210.7	601	CAGATCTTCATCTTCCTGTCCCTGGGGACAACTGAGTGCATCCTCTTGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82250	CAGATCTTCATCTTCCTGTCCCTGGGGACAACTGAGTGCATCCTCTTGAC	82299

CR388210.7	651	AGTGATGGCTTTTGATCGCTACGTGGCTGTCTGCCAGCCCCTCCACTATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82300	AGTGATGGCTTTTGATCGCTACGTGGCTGTCTGCCAGCCCCTCCACTATG	82349

CR388210.7	701	CCACCATCATCCACCCCCGCCTGTGCTGGCAGCTGGCATCTGTGGCCTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82350	CCACCATCATCCACCCCCGCCTGTGCTGGCAGCTGGCATCTGTGGCCTGG	82399

CR388210.7	751	GTCATTGGGCTAGTGGAGTCAGTGGTCCAGACACCATCCACCCTGCACCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82400	GTCATTGGGCTAGTGGAGTCAGTGGTCCAGACACCATCCACCCTGCACCT	82449

CR388210.7	801	GCCCTTCTGCCCCGATCGGCAGGTGGATGATTTTGTCTGTGAGGTCCCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82450	GCCCTTCTGCCCCGATCGGCAGGTGGATGATTTTGTCTGTGAGGTCCCAG	82499

CR388210.7	851	CTCTAATTCGACTCTCCTGTGAAGACACCTCCTACAATGAGATCCAGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82500	CTCTAATTCGACTCTCCTGTGAAGACACCTCCTACAATGAGATCCAGGTG	82549

CR388210.7	901	GCTGTTGCCAGTGTCTTCATCTTGGTTGTGCCTCTCAGCCTCATCCTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82550	GCTGTTGCCAGTGTCTTCATCTTGGTTGTGCCTCTCAGCCTCATCCTTGT	82599

CR388210.7	951	CTCTTACGGAGCCATTACCTGGGCAGTGCTGAGGATTAACTCTGCAAAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82600	CTCTTACGGAGCCATTACCTGGGCAGTGCTGAGGATTAACTCTGCAAAAG	82649

CR388210.7	1001	GGCGGAGGAAAGCTTTTGGGACCTGCTCCTCCCATCTCACTGTGGTCACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82650	GGCGGAGGAAAGCTTTTGGGACCTGCTCCTCCCATCTCACTGTGGTCACC	82699

CR388210.7	1051	CTCTTCTACAGCTCAGTCATTGCTGTCTACCTCCAGCCCAAAAATCCCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82700	CTCTTCTACAGCTCAGTCATTGCTGTCTACCTCCAGCCCAAAAATCCCTA	82749

CR388210.7	1101	TGCCCAAGAGAGGGGCAAGTTCTTTGGTCTCTTCTATGCAGTGGGCACTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82750	TGCCCAAGAGAGGGGCAAGTTCTTTGGTCTCTTCTATGCAGTGGGCACTC	82799

CR388210.7	1151	CTTCACTTAACCCTCTCATATACACCCTGAGGAACAAGGAGGTAACCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82800	CTTCACTTAACCCTCTCATATACACCCTGAGGAACAAGGAGGTAACCAGG	82849

CR388210.7	1201	GCATTCAGGAGATTGCTGGGGAAGGAAATGGGGCTCACACAAAGCTGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82850	GCATTCAGGAGATTGCTGGGGAAGGAAATGGGGCTCACACAAAGCTGAGG	82899

CR388210.7	1251	GAGAGCTGCTTAATGTGCTTTAAAAGAGAGGAGATTCTATGTGCTTTTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82900	GAGAGCTGCTTAATGTGCTTTAAAAGAGAGGAGATTCTATGTGCTTTTAT	82949

CR388210.7	1301	CAGAAAGTTTGAGTTCCCTGCCCCTCTGCCTTCTTCACACCCATTACATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	82950	CAGAAAGTTTGAGTTCCCTGCCCCTCTGCCTTCTTCACACCCATTACATT	82999

CR388210.7	1351	GTGGGAATGGATGAAAGCCACATGTCTGTGTGTGTGCATGTATGTGTGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83000	GTGGGAATGGATGAAAGCCACATGTCTGTGTGTGTGCATGTATGTGTGCA	83049

CR388210.7	1401	AGAGACAGCGACTGAAATGTAGTAAAGGGAGGTATCTTTATGCGAAAAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83050	AGAGACAGCGACTGAAATGTAGTAAAGGGAGGTATCTTTATGCGAAAAAT	83099

CR388210.7	1451	TATAGGCATCAAGTATATTTTATATTTTTTTCTACTTTAAGTCTTCGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83100	TATAGGCATCAAGTATATTTTATATTTTTTTCTACTTTAAGTCTTCGCCT	83149

CR388210.7	1501	CCATAGTCATGTTCCTACCTTTATCACTTCCATTTTTAATTCCCCTCCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83150	CCATAGTCATGTTCCTACCTTTATCACTTCCATTTTTAATTCCCCTCCCT	83199

CR388210.7	1551	TGCCATATCCCCACTATTCCTTCACCTCCAATTCTAATTCCTACCATATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83200	TGCCATATCCCCACTATTCCTTCACCTCCAATTCTAATTCCTACCATATC	83249

CR388210.7	1601	TTCTTTGCTTCTCCCTCATGTTTTTCCCACTTCACTATATGTCTGTTTTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83250	TTCTTTGCTTCTCCCTCATGTTTTTCCCACTTCACTATATGTCTGTTTTG	83299

CR388210.7	1651	TATTCTCATTCTATTTTATTCCTCAAATAACAGCAAAAGAGAAGGGGAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83300	TATTCTCATTCTATTTTATTCCTCAAATAACAGCAAAAGAGAAGGGGAAG	83349

CR388210.7	1701	CTGAAGCCCAGCTAAGTTCGGAAACTCACCCAAGAACACACAGTGTCCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83350	CTGAAGCCCAGCTAAGTTCGGAAACTCACCCAAGAACACACAGTGTCCAC	83399

CR388210.7	1751	AGCATCAGAACTAAAATCCAGGCCCCATAATTTTCAGTCAGGCAACTCTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83400	AGCATCAGAACTAAAATCCAGGCCCCATAATTTTCAGTCAGGCAACTCTC	83449

CR388210.7	1801	AAATACACACTGTTGCTTTCACACCATAATCAAATATCCCAGTATTTCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83450	AAATACACACTGTTGCTTTCACACCATAATCAAATATCCCAGTATTTCAG	83499

CR388210.7	1851	GCTTGAGCCTTACAAAGGAAACTTAGCTTCTTCAGTCCTATTTCTTCTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83500	GCTTGAGCCTTACAAAGGAAACTTAGCTTCTTCAGTCCTATTTCTTCTCT	83549

CR388210.7	1901	TACAATGCCCACAAATCGCAGGTAAAGGAGCAGCCAAAAAGACACAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83550	TACAATGCCCACAAATCGCAGGTAAAGGAGCAGCCAAAAAGACACAAAAA	83599

CR388210.7	1951	TATCTTCATGTTTAGGCTGGCACATTGTGGACCTTGGTGTCATCTACCGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927223.9	83600	TATCTTCATGTTTAGGCTGGCACATTGTGGACCTTGGTGTCATCTACCGG	83649

Overview

Query
CR388210.7 - 64196 bps
Hit
BX927223.9 - 83649 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link