<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927189.6	1	GGCCATTTGGGGTTTTTTGTGACTCCATATGAATTTTAGTTTTTTTTCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71010	GGCCATTTGGGGTTTTTTGTGACTCCATATGAATTTTAGTTTTTTTTCTA	71059

BX927189.6	51	TTTTTCTGAAGAATGTCATTCGTATTTTGATAACAGGGATTGTATTAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71060	TTTTTCTGAAGAATGTCATTCGTATTTTGATAACAGGGATTGTATTAAAT	71109

BX927189.6	101	CTGTAGACTGCTTTGGGTAGGACAGTCATTTTAACAATATTAATTCTAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71110	CTGTAGACTGCTTTGGGTAGGACAGTCATTTTAACAATATTAATTCTAAT	71159

BX927189.6	151	CCACAAGCATGGAATATTTTTCCATTTGTTTGTGTCTTCTTCAATTTCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71160	CCACAAGCATGGAATATTTTTCCATTTGTTTGTGTCTTCTTCAATTTCTT	71209

BX927189.6	201	TCATCAGTGTTTTGTAGTTTTCATTAAAGAGGTCTTTCACCTCCTTGGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71210	TCATCAGTGTTTTGTAGTTTTCATTAAAGAGGTCTTTCACCTCCTTGGTT	71259

BX927189.6	251	AACTTCATTCCCAGGTATTTTATTTTACTTTTGTAGCTATTGTAAATGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71260	AACTTCATTCCCAGGTATTTTATTTTACTTTTGTAGCTATTGTAAATGGG	71309

BX927189.6	301	GTTGCTTTCTTGATGTCTTTTTTAGCTAGTTTGTTATTGGTGTATTAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71310	GTTGCTTTCTTGATGTCTTTTTTAGCTAGTTTGTTATTGGTGTATTAAAA	71359

BX927189.6	351	ATGCAGTAGACTTTTTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71360	ATGCAGTAGACTTTTTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATT	71409

BX927189.6	401	TGTTTATTAGTTCTAAGGGTTTTTTGGTGGGGCCTTTAGGTTTTTCTACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71410	TGTTTATTAGTTCTAAGGGTTTTTTGGTGGGGCCTTTAGGTTTTTCTACA	71459

BX927189.6	451	TATAAGTATAGCCGTTACGGAAAACAGTATGAGAGTTTCTCAAAAAACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71460	TATAAGTATAGCCGTTACGGAAAACAGTATGAGAGTTTCTCAAAAAACTA	71509

BX927189.6	501	AAAATAGAACTACCATATGATCCAGCAATCTCATTACTAGGTATTTATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71510	AAAATAGAACTACCATATGATCCAGCAATCTCATTACTAGGTATTTATCC	71559

BX927189.6	551	AAAGAAAAGAAAATCAGTATATCAAAGGGATACCTGCACACTCATGTTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71560	AAAGAAAAGAAAATCAGTATATCAAAGGGATACCTGCACACTCATGTTTA	71609

BX927189.6	601	TTGTGGCACTATTCACAATAGTTGAGATGTGGACTCAATCTAAGCATCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71610	TTGTGGCACTATTCACAATAGTTGAGATGTGGACTCAATCTAAGCATCCA	71659

BX927189.6	651	TCAACAGATAGATAAAGAAAATGTAGCATATATACACAATGGAGTACTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71660	TCAACAGATAGATAAAGAAAATGTAGCATATATACACAATGGAGTACTAT	71709

BX927189.6	701	TCATCCATAATAAATTTGAGTTCATGGAAGTAAGACAGTAGAATAGTAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71710	TCATCCATAATAAATTTGAGTTCATGGAAGTAAGACAGTAGAATAGTAAT	71759

BX927189.6	751	GATTAGAGGTTGGGAAGGGGGCTGGGGAGAGGAGGGTGGGGAGAAGTTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71760	GATTAGAGGTTGGGAAGGGGGCTGGGGAGAGGAGGGTGGGGAGAAGTTGG	71809

BX927189.6	801	TTAACAGATACAAAGTTATAGCTACATGGGAAGAATAAATTCTAGTGTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71810	TTAACAGATACAAAGTTATAGCTACATGGGAAGAATAAATTCTAGTGTTG	71859

BX927189.6	851	TGCAGCATTGCAGGGAGAATATAATTAACTATAATTTACTATACATTTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71860	TGCAGCATTGCAGGGAGAATATAATTAACTATAATTTACTATACATTTTC	71909

BX927189.6	901	AAAAAGCTAGAAGAGAGGATTTTGAATGTTCCAACACAAAGAAATGATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71910	AAAAAGCTAGAAGAGAGGATTTTGAATGTTCCAACACAAAGAAATGATAA	71959

BX927189.6	951	GTGTTTGAGGTGACAGATATACTAATTACTCTGAGTTGATTATTATATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	71960	GTGTTTGAGGTGACAGATATACTAATTACTCTGAGTTGATTATTATATAT	72009

BX927189.6	1001	TATATACTTGTATCAAAGTATCACTCTAGGCCAGGCACAGTGGCTCACGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72010	TATATACTTGTATCAAAGTATCACTCTAGGCCAGGCACAGTGGCTCACGC	72059

BX927189.6	1051	CTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGCAGGCGATCACCTGAGGTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72060	CTGTAATCCCAGCACTGTGGGAGGCTGAGGCAGGCGATCACCTGAGGTCA	72109

BX927189.6	1101	GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGACTCTACCAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72110	GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGACTCTACCAAA	72159

BX927189.6	1151	AATACAGAAAATAGCCAGGTGTGGTGATGTGCGCCTGTAATCCCAGCTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72160	AATACAGAAAATAGCCAGGTGTGGTGATGTGCGCCTGTAATCCCAGCTAT	72209

BX927189.6	1201	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGACAGAGGTTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72210	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGACAGAGGTTGC	72259

BX927189.6	1251	AGAGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCAGGAGGCGGAGATTACAGTGAGCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72260	AGAGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCAGGAGGCGGAGATTACAGTGAGCTG	72309

BX927189.6	1301	AGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72310	AGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTCTGTCTC	72359

BX927189.6	1351	AAAAATAAACAAACAAAAACCTCTACATCCCATAAATATATACATTATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72360	AAAAATAAACAAACAAAAACCTCTACATCCCATAAATATATACATTATAT	72409

BX927189.6	1401	AGCACTAAAATTAAAAGAGAAAACACAAAACAAAAAAAGAAACCTACCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72410	AGCACTAAAATTAAAAGAGAAAACACAAAACAAAAAAAGAAACCTACCAG	72459

BX927189.6	1451	TACCAATAACATTTCCTATACTAGTTTCAAGCTGACACCATTTTCTCTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72460	TACCAATAACATTTCCTATACTAGTTTCAAGCTGACACCATTTTCTCTCC	72509

BX927189.6	1501	CTTCCCTTGACCTTATCCCACCCCAGGGAGAGCTGCAATCTGAGTGCTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72510	CTTCCCTTGACCTTATCCCACCCCAGGGAGAGCTGCAATCTGAGTGCTCT	72559

BX927189.6	1551	GAGTCATTGAGGGCCAGGCTTCTGCTCTGAGGGCCACTTCTCTGGGTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72560	GAGTCATTGAGGGCCAGGCTTCTGCTCTGAGGGCCACTTCTCTGGGTGCA	72609

BX927189.6	1601	TTAGGAAAAGGCACCCCTCCGGGCAAACACAATGGATTTCAGCCCCACCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72610	TTAGGAAAAGGCACCCCTCCGGGCAAACACAATGGATTTCAGCCCCACCA	72659

BX927189.6	1651	CATCCTCAGCTGTGTGCCTCTGTTCCACACAGTAGGCATTCACACATGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72660	CATCCTCAGCTGTGTGCCTCTGTTCCACACAGTAGGCATTCACACATGGC	72709

BX927189.6	1701	AGGGGCGTGAGGAGAGGAAGGAGAAGAGAAACGGGCAAAAGGAGATGCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72710	AGGGGCGTGAGGAGAGGAAGGAGAAGAGAAACGGGCAAAAGGAGATGCAG	72759

BX927189.6	1751	AAAATGACCCAGTCAAAGAGTATGACGAGAGAAATCTGAGAGAACAGAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72760	AAAATGACCCAGTCAAAGAGTATGACGAGAGAAATCTGAGAGAACAGAAT	72809

BX927189.6	1801	GACATCTGGAGGAAAAGAGGGGGCCAGAGAGACATTCTGGACAAAATAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72810	GACATCTGGAGGAAAAGAGGGGGCCAGAGAGACATTCTGGACAAAATAAG	72859

BX927189.6	1851	AACAAGAGCTCAGAGCCCAGGAGTCAGGACATCTGGGCTCAAGCTGTGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72860	AACAAGAGCTCAGAGCCCAGGAGTCAGGACATCTGGGCTCAAGCTGTGAC	72909

BX927189.6	1901	CTGACACCCACCCCATGGCCTGGGACAAACTCCTCCCACTCTCTGGACCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72910	CTGACACCCACCCCATGGCCTGGGACAAACTCCTCCCACTCTCTGGACCT	72959

BX927189.6	1951	CAGTGACTTCATCAGTAGGGGCTGAACTGGAAGGTCTAAAATCCCTGCCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927221.6	72960	CAGTGACTTCATCAGTAGGGGCTGAACTGGAAGGTCTAAAATCCCTGCCA	73009

Overview

Query
BX927189.6 - 124330 bps
Hit
BX927221.6 - 73009 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link