<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908728.7	1	GGCCATTTTTCTTAAGAGTTAGACTGGGGAGATGGGTTTGGAAAGTAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80725	GGCCATTTTTCTTAAGAGTTAGACTGGGGAGATGGGTTTGGAAAGTAAAA	80774

BX908728.7	51	TGCAAATGGTGGGTAGTGGTATTAGGTGGTGATGTGCAAGGCGTGCTGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80775	TGCAAATGGTGGGTAGTGGTATTAGGTGGTGATGTGCAAGGCGTGCTGTA	80824

BX908728.7	101	GAAACCTGCAGGGTGAAGCCCATAACTTTTGTTACGGGAATGGGGTAACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80825	GAAACCTGCAGGGTGAAGCCCATAACTTTTGTTACGGGAATGGGGTAACT	80874

BX908728.7	151	GAATCCTAAACTAGCTAGGGGAGATAGGGATGGAAAGAGCAGATGTGGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80875	GAATCCTAAACTAGCTAGGGGAGATAGGGATGGAAAGAGCAGATGTGGAG	80924

BX908728.7	201	GTTGGGGAGAAGGGAGTGACAGGAGATATATCCAGTTCCAGAGGGAATAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80925	GTTGGGGAGAAGGGAGTGACAGGAGATATATCCAGTTCCAGAGGGAATAG	80974

BX908728.7	251	GGAGAGCTGTGTGGCTAAGATTTAACTGTTTGGACATTTAATTTGGGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	80975	GGAGAGCTGTGTGGCTAAGATTTAACTGTTTGGACATTTAATTTGGGGAA	81024

BX908728.7	301	ATTGTTTTCCAGCCAAGTGAATAAATAATACTGGACTTCAAGTACAAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81025	ATTGTTTTCCAGCCAAGTGAATAAATAATACTGGACTTCAAGTACAAGCT	81074

BX908728.7	351	TCATACAGGAAGTGAAGTTTTGGTGTGGAGATAGCTGCATAGTCAGGGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81075	TCATACAGGAAGTGAAGTTTTGGTGTGGAGATAGCTGCATAGTCAGGGAA	81124

BX908728.7	401	CACTCTAAATTAAAAATAAGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81125	CACTCTAAATTAAAAATAAGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAA	81174

BX908728.7	451	TCCCAGCACTTTGGGAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81175	TCCCAGCACTTTGGGAGGCGGGCAGATCATGAGGTCAGGAGTTCGAGAGC	81224

BX908728.7	501	ACCCTGACCAACATATTGAAACCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81225	ACCCTGACCAACATATTGAAACCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAAAAT	81274

BX908728.7	551	TAGCCGAGCGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81275	TAGCCGAGCGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTG	81324

BX908728.7	601	AGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGTGGTTGCAGTGAGCCGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81325	AGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGTGGTTGCAGTGAGCCGAG	81374

BX908728.7	651	GTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81375	GTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAA	81424

BX908728.7	701	ACAAAAACCAAAAGACATCAGGAAACATGCCTCTTATGGAATTTGAGGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81425	ACAAAAACCAAAAGACATCAGGAAACATGCCTCTTATGGAATTTGAGGGG	81474

BX908728.7	751	GAAAAGTCAGGGTCTTGGCAGTGACCTTGGACAAGCCATTAGCCTCTTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81475	GAAAAGTCAGGGTCTTGGCAGTGACCTTGGACAAGCCATTAGCCTCTTGA	81524

BX908728.7	801	TACCTCTTTTCTCATCTGTAAAATGAAGGTGGTAGTTACCTACTTCACAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81525	TACCTCTTTTCTCATCTGTAAAATGAAGGTGGTAGTTACCTACTTCACAG	81574

BX908728.7	851	GGTTATTAGGGGATTCAATGTGTAATAATACGTAAAGTGCCTTAAATTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81575	GGTTATTAGGGGATTCAATGTGTAATAATACGTAAAGTGCCTTAAATTCT	81624

BX908728.7	901	GTTGCTTTTGTTATATGTATTTCATATTATATATATATATATATATTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81625	GTTGCTTTTGTTATATGTATTTCATATTATATATATATATATATATTTTT	81674

BX908728.7	951	TTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTACTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81675	TTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTACTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCTG	81724

BX908728.7	1001	TGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTAATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81725	TGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTAATT	81774

BX908728.7	1051	CTGCTGTCTCACCCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCACGTGCCACCAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81775	CTGCTGTCTCACCCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCACGTGCCACCAC	81824

BX908728.7	1101	GCCCGGCTAAGTTTTGTACTTTTGGTAGAGATCAGGTTTTGCCATGTTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81825	GCCCGGCTAAGTTTTGTACTTTTGGTAGAGATCAGGTTTTGCCATGTTGG	81874

BX908728.7	1151	CCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACTTCGGCCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81875	CCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACTTCGGCCT	81924

BX908728.7	1201	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTATACTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81925	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCTATACTT	81974

BX908728.7	1251	TTGCATTTTTAAGTTTTTACTTCGCTAGTCTAGTTGAGATGATACATAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	81975	TTGCATTTTTAAGTTTTTACTTCGCTAGTCTAGTTGAGATGATACATAAA	82024

BX908728.7	1301	ATATATAGGAATGTTATTTATAAAGTGAATACCAGCTTGCATTTCAAATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82025	ATATATAGGAATGTTATTTATAAAGTGAATACCAGCTTGCATTTCAAATA	82074

BX908728.7	1351	TTTGGTCACTAATTTCACTACTTCAAACATAAGTGAGAAAAGTACTTTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82075	TTTGGTCACTAATTTCACTACTTCAAACATAAGTGAGAAAAGTACTTTAA	82124

BX908728.7	1401	GTACTCCAAAATAACTTTCCGCCACAGGCATAAATTTCATTTCTCTCTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82125	GTACTCCAAAATAACTTTCCGCCACAGGCATAAATTTCATTTCTCTCTCT	82174

BX908728.7	1451	GTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGATGAGGCCTTGCTATATTGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82175	GTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGATGAGGCCTTGCTATATTGCC	82224

BX908728.7	1501	CAGGCTGGTCCCAAACTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTTTCTCCTAGGCTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82225	CAGGCTGGTCCCAAACTCCTGGCCTCAAGCAGTCCTTTCTCCTAGGCTCC	82274

BX908728.7	1551	CCAAAGTGCTGGGATTACAGGAATGAGCCACGGCACCTGGCCACAAACTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82275	CCAAAGTGCTGGGATTACAGGAATGAGCCACGGCACCTGGCCACAAACTT	82324

BX908728.7	1601	TATCTCCTCCCGTGTATGTTTTAACTTCTGTGATCCCTGTAGCCGATCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82325	TATCTCCTCCCGTGTATGTTTTAACTTCTGTGATCCCTGTAGCCGATCAT	82374

BX908728.7	1651	ATGTGCTGTTAATGGAATTAATAATTCACCTAAATGTGGGCAAAAGTATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82375	ATGTGCTGTTAATGGAATTAATAATTCACCTAAATGTGGGCAAAAGTATG	82424

BX908728.7	1701	CCCTCCAAAAAGCAGCATAGAAATGGAACACGAAAGGGAAACATTTCCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82425	CCCTCCAAAAAGCAGCATAGAAATGGAACACGAAAGGGAAACATTTCCAT	82474

BX908728.7	1751	GGTAGCGCATGGAAATTTCATTAACCAAATTAAATTGTTTTATTTATAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82475	GGTAGCGCATGGAAATTTCATTAACCAAATTAAATTGTTTTATTTATAAA	82524

BX908728.7	1801	CAGCTTATTACCTACAAGTGATGCACATATGTGGTACACAGTAAACATCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82525	CAGCTTATTACCTACAAGTGATGCACATATGTGGTACACAGTAAACATCG	82574

BX908728.7	1851	TAGAAATGTGTTTTTTGTTGTTTTGAGATGTGGTCTCCCTCTGTTTCCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82575	TAGAAATGTGTTTTTTGTTGTTTTGAGATGTGGTCTCCCTCTGTTTCCCA	82624

BX908728.7	1901	GGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCCTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82625	GGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCCTCTG	82674

BX908728.7	1951	GACTCAAGTGATCCTCCTACCTCAGCTTCTCAAGTAGCTGGGACTACAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927220.8	82675	GACTCAAGTGATCCTCCTACCTCAGCTTCTCAAGTAGCTGGGACTACAAG	82724

Overview

Query
BX908728.7 - 104755 bps
Hit
BX927220.8 - 82724 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link